The molecular dimension of microbial species: 1. Ecological distinctions among, and homogeneity within, putative ecotypes of Synechococcus inhabiting the cyanobacterial mat of Mushroom Spring, Yellowstone National Park

© 2015 Becraft, Wood, Rusch, Kühl, Jensen, Bryant, Roberts, Cohan and Ward. Based on the Stable Ecotype Model, evolution leads to the divergence of ecologically distinct populations (e.g., with different niches and/or behaviors) of ecologically interchangeable membership. In this study, pyrosequencing was used to provide deep sequence coverage of Synechococcus psaA genes and transcripts over a large number of habitat types in the Mushroom Spring microbial mat. Putative ecological species (putative ecotypes), which were predicted by an evolutionary simulation based on the Stable Ecotype Model (Ecotype Simulation), exhibited distinct distributions relative to temperature-defined positions in the effluent channel and vertical position in the upper 1 mm-thick mat layer. Importantly, in most cases variants predicted to belong to the same putative ecotype formed unique clusters relative to temperature and depth in the mat in canonical correspondence analysis, supporting the hypothesis that while the putative ecotypes are ecologically distinct, the members of each ecotype are ecologically homogeneous. Putative ecotypes responded differently to experimental perturbations of temperature and light, but the genetic variation within each putative ecotype was maintained as the relative abundances of putative ecotypes changed, further indicating that each population responded as a set of ecologically interchangeable individuals. Compared to putative ecotypes that predominate deeper within the mat photic zone, the timing of transcript abundances for selected genes differed for putative ecotypes that predominate in microenvironments closer to upper surface of the mat with spatiotemporal differences in light and O2 concentration. All of these findings are consistent with the hypotheses that Synechococcus species in hot spring mats are sets of ecologically interchangeable individuals that are differently adapted, that these adaptations control their distributions, and that the resulting distributions constrain the activities of the species in space and time

O uso das tecnologias de informação e comunicação no ensino da disciplina de histologia / The use of information and communication technologies in teaching Histology discipline

As redes sociais e a internet se tornaram parte da vida dos jovens da atualidade e os métodos de ensino devem se adequar a essa realidade. O trabalho tem como objetivo entender o benefício que essas ferramentas podem trazer ao aprendizado do jovem estudante. Foram utilizadas redes sociais e plataformas disponíveis na faculdade para o compartilhamento de conteúdos pertinentes à disciplina de Histologia com os estudantes de medicina, sendo contabilizado o número de participantes, a nota que cada um deu para a atividade e a quantidade de interação e discussão gerada a partir de cada publicação feita pelos monitores. Podemos perceber que a associação de meios alternativos, mais adaptados à realidade dos estudantes, com os métodos tradicionais de ensino permitiu uma maior motivação aos alunos e a formação de uma rede mais forte entre alunos, monitores e professor

Temperature Dependence of Damping and Frequency Shifts of the Scissors Mode of a trapped Bose-Einstein Condensate

We have studied the properties of the scissors mode of a trapped Bose-Einstein condensate of $^{87}$Rb atoms at finite temperature. We measured a significant shift in the frequency of the mode below the hydrodynamic limit and a strong dependence of the damping rate as the temperature increased. We compared our damping rate results to recent theoretical calculations for other observed collective modes finding a fair agreement. From the frequency measurements we deduce the moment of inertia of the gas and show that it is quenched below the transition point, because of the superfluid nature of the condensed gas.Comment: 5 pages, 4 figure

Tratamento químico, durabilidade e lixiviação de bambu tratado e submetido a ensaio em campo de apodrecimento

O objetivo do presente trabalho foi avaliar o tratamento químico, a durabilidade e a lixiviação de bambu tratado e submetido a ensaio em campo de apodrecimento. Para isso, foram coletadas hastes de Dendrocalamus asper com diâmetro entre 10 e 15 cm, totalizando 12 amostras. O tratamento químico consistiu de imersão das amostras em solução de borato de cobre cromatado (CCB), nas concentrações de 1 e 3%, e o tratamento controle (imersão em água). Posteriormente, o material foi submetido ao ensaio em campo de apodrecimento por um período de 5 anos. Ao final do período, o material recebeu avaliação visual quanto à deterioração. Foram coletadas amostras representativas dos tratamentos, assim como do solo, para análises de espectrometria. O tratamento com CCB conferiu preservação às hastes de bambu, não apresentando degradação biológica, enquanto o tratamento controle demonstrou estágio elevado de apodrecimento. Quando comparado com estudos semelhantes utilizando madeira, os resultados obtidos se destacaram, sendo que o material de bambu tratado por imersão com CCB apresentou durabilidade elevada. Nas análises de espectrometria, verificou-se que a parte inferior, em contato com o solo, apresentou maior lixiviação de cobre e cromo do que a parte aérea das hastes

Beyond Gross-Pitaevskii Mean Field Theory

A large number of effects related to the phenomenon of Bose-Einstein Condensation (BEC) can be understood in terms of lowest order mean field theory, whereby the entire system is assumed to be condensed, with thermal and quantum fluctuations completely ignored. Such a treatment leads to the Gross-Pitaevskii Equation (GPE) used extensively throughout this book. Although this theory works remarkably well for a broad range of experimental parameters, a more complete treatment is required for understanding various experiments, including experiments with solitons and vortices. Such treatments should include the dynamical coupling of the condensate to the thermal cloud, the effect of dimensionality, the role of quantum fluctuations, and should also describe the critical regime, including the process of condensate formation. The aim of this Chapter is to give a brief but insightful overview of various recent theories, which extend beyond the GPE. To keep the discussion brief, only the main notions and conclusions will be presented. This Chapter generalizes the presentation of Chapter 1, by explicitly maintaining fluctuations around the condensate order parameter. While the theoretical arguments outlined here are generic, the emphasis is on approaches suitable for describing single weakly-interacting atomic Bose gases in harmonic traps. Interesting effects arising when condensates are trapped in double-well potentials and optical lattices, as well as the cases of spinor condensates, and atomic-molecular coupling, along with the modified or alternative theories needed to describe them, will not be covered here.Comment: Review Article (19 Pages) - To appear in 'Emergent Nonlinear Phenomena in Bose-Einstein Condensates: Theory and Experiment', Edited by P.G. Kevrekidis, D.J. Frantzeskakis and R. Carretero-Gonzalez (Springer Verlag

SISTEMA DE CONTROLE PARA PRODUÇÃO DE TENÉBRIOS MOLITORES

Tenébrio molitor é o nome científico do besouro da farinha, sendo mais conhecido por sua fase larval.Nesta fase, a larva tem um corpo alongado que atinge cerca de 2,5 cm de comprimento. Após a últimamuda, a larva entra na fase de pupa, durante esse estágio ocorrem transformações internas significativasenquanto o inseto se prepara para emergir como adulto. A pupa é geralmente de cor branca ou creme epossui uma casca protetora, essa fase dura 21 dias até que vire um besouro. O besouro pode colocar de100 a 500 ovos que demoram cerca de 12 dias para eclodirem, possuem alto teor de proteína funcional,(por volta de 80%) por isso sendo utilizados na alimentação de diversos animais como: aves, répteis e atémesmo dos humanos, o que as torna um suplemento nutricional valioso para esses animais, além dedesempenhar um papel importante na decomposição de materiais orgânicos. Nesta pesquisa, o objetivo édesenvolver um ambiente adequado para o desenvolvimento dos tenébrios em sua fase larval, sendo esteambiente automatizado. Para a automatização será utilizado o Arduino Uno juntamente com a célulaPeltier para regular a temperatura. Além do Arduino, haverá também um sistema de ventilação comcoolers, passando uma mangueira com sílica para auxiliar no controle da umidade. A mangueira estarácercada por uma grade para evitar a entrada de predadores ou parasitas. A aveia em flocos será utilizadacomo substrato, local em que a fêmea adulta deposita seus ovos, e o substrato também será usado comoalimento. Com o sistema automatizado há uma melhor qualidade no desenvolvimento dos Tenébriosmolitores por conta das condições ideais do ambiente e monitoramento diário, assim tendo menos chancede perda. O resultado final esperado do projeto é criar um sistema apto para a construção de uma colônia,com sucesso reprodutivo, garantindo que sejam livres de parasitas e patógenos antes de serem oferecidascomo alimento

The role of multiple marks in epigenetic silencing and the emergence of a stable bivalent chromatin state

We introduce and analyze a minimal model of epigenetic silencing in budding yeast, built upon known biomolecular interactions in the system. Doing so, we identify the epigenetic marks essential for the bistability of epigenetic states. The model explicitly incorporates two key chromatin marks, namely H4K16 acetylation and H3K79 methylation, and explores whether the presence of multiple marks lead to a qualitatively different systems behavior. We find that having both modifications is important for the robustness of epigenetic silencing. Besides the silenced and transcriptionally active fate of chromatin, our model leads to a novel state with bivalent (i.e., both active and silencing) marks under certain perturbations (knock-out mutations, inhibition or enhancement of enzymatic activity). The bivalent state appears under several perturbations and is shown to result in patchy silencing. We also show that the titration effect, owing to a limited supply of silencing proteins, can result in counter-intuitive responses. The design principles of the silencing system is systematically investigated and disparate experimental observations are assessed within a single theoretical framework. Specifically, we discuss the behavior of Sir protein recruitment, spreading and stability of silenced regions in commonly-studied mutants (e.g., sas2, dot1) illuminating the controversial role of Dot1 in the systems biology of yeast silencing.Comment: Supplementary Material, 14 page

Experiences of mental illness stigma, prejudice and discrimination: A review of measures

Background: There has been a substantial increase in research on mental illness related stigma over the past 10 years, with many measures in use. This study aims to review current practice in the survey measurement of mental illness stigma, prejudice and discrimination experienced by people who have personal experience of mental illness. We will identify measures used, their characteristics and psychometric properties. Method. A narrative literature review of survey measures of mental illness stigma was conducted. The databases Medline, PsychInfo and the British Nursing Index were searched for the period 1990-2009. Results: 57 studies were included in the review. 14 survey measures of mental illness stigma were identified. Seven of the located measures addressed aspects of perceived stigma, 10 aspects of experienced stigma and 5 aspects of self-stigma. Of the identified studies, 79% used one of the measures of perceived stigma, 46% one of the measures of experienced stigma and 33% one of the measures of self-stigma. All measures presented some information on psychometric properties. Conclusions: The review was structured by considering perceived, experienced and self stigma as separate but related constructs. It provides a resource to aid researchers in selecting the measure of mental illness stigma which is most appropriate to their purpose. © 2010 Brohan et al; licensee BioMed Central Ltd

Violência obstétrica vivenciada por mulheres na hora do parto: uma revisão da literatura: Obstetric violence experienced by women during childbirth: a literature review

A violência obstétrica é considerada questão de saúde pública, abrangendo qualquer atitude desrespeitosa à mulher e seu bebê durante a gestação, parto e período puerperal. A partir do trauma gerado, uma série de consequências surge como desenvolvimento de problemas psicológicos e familiares. Analisar a produção científica mundial a respeito da violência obstétrica sofrida por mulheres durante o parto e suas consequências dolorosas que impactam a qualidade de vida e experiência maternal. Os artigos expuseram a desumanização nos partos existente, o despreparo dos profissionais de saúde, assim como a desvalidação e negligência das necessidades da parturiente. Com a violação de sua integridade física e emocional, sua experiência traz consigo traumas difíceis de serem curados. E, devido à insensibilidade e naturalização deste processo, pouco é feito para esta realidade ser modificada. É necessário haver investimentos em infraestrutura, equipes multiprofissionais, formação de profissionais de saúde de qualidade, além de treinamento e capacitação destes. Para o atual cenário mudar, a abordagem centrada na mulher deve ser reformulada, proporcionando autonomia, respeito, segurança, dignidade e direitos garantidos.&nbsp