Draft genome of Haloarcula rubripromontorii strain SL3, a novel halophilic archaeon isolated from the solar salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico.

The genus Haloarcula belongs to the family Halobacteriaceae which currently has 10 valid species. Here we report the draft genome sequence of strain SL3, a new species within this genus, isolated from the Solar Salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico. Genome assembly performed using NGEN Assembler resulted in 18 contigs (N50 = 601,911 bp), the largest of which contains 1,023,775 bp. The genome consists of 3.97 MB and has a GC content of 61.97%. Like all species of Haloarcula, the genome encodes heterogeneous copies of the small subunit ribosomal RNA. In addition, the genome includes 6 rRNAs, 48 tRNAs, and 3797 protein coding sequences. Several carbohydrate-active enzymes genes were found, as well as enzymes involved in the dihydroxyacetone processing pathway which are not found in other Haloarcula species. The NCBI accession number for this genome is LIUF00000000 and the strain deposit number is CECT9001

Draft genome of Haloarcula rubripromontorii strain SL3, a novel halophilic archaeon isolated from the solar salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico

The genus Haloarcula belongs to the family Halobacteriaceae which currently has 10 valid species. Here we report the draft genome sequence of strain SL3, a new species within this genus, isolated from the Solar Salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico. Genome assembly performed using NGEN Assembler resulted in 18 contigs (N50 = 601,911 bp), the largest of which contains 1,023,775 bp. The genome consists of 3.97 MB and has a GC content of 61.97%. Like all species of Haloarcula, the genome encodes heterogeneous copies of the small subunit ribosomal RNA. In addition, the genome includes 6 rRNAs, 48 tRNAs, and 3797 protein coding sequences. Several carbohydrate-active enzymes genes were found, as well as enzymes involved in the dihydroxyacetone processing pathway which are not found in other Haloarcula species. The NCBI accession number for this genome is LIUF00000000 and the strain deposit number is CECT9001. Keywords: Halophilic archaea, Henome sequence, Puerto Ric

Draft genome of Haloarcula rubripromontorii strain SL3, a novel halophilic archaeon isolated from the solar salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico.

The genus Haloarcula belongs to the family Halobacteriaceae which currently has 10 valid species. Here we report the draft genome sequence of strain SL3, a new species within this genus, isolated from the Solar Salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico. Genome assembly performed using NGEN Assembler resulted in 18 contigs (N50 = 601,911 bp), the largest of which contains 1,023,775 bp. The genome consists of 3.97 MB and has a GC content of 61.97%. Like all species of Haloarcula, the genome encodes heterogeneous copies of the small subunit ribosomal RNA. In addition, the genome includes 6 rRNAs, 48 tRNAs, and 3797 protein coding sequences. Several carbohydrate-active enzymes genes were found, as well as enzymes involved in the dihydroxyacetone processing pathway which are not found in other Haloarcula species. The NCBI accession number for this genome is LIUF00000000 and the strain deposit number is CECT9001

Draft genome sequence of Halorubrum tropicale strain V5, a novel halophilic archaeon isolated from the solar salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico.

The genus Halorubrum is a member of the family Halobacteriaceae which currently has the highest number of described species (31) of all the haloarchaea. Here we report the draft genome sequence of strain V5, a new species within this genus that was isolated from the solar salterns of Cabo Rojo, Puerto Rico. Assembly was performed and rendered the genome into 17 contigs (N50 = 515,834 bp), the largest of which contains 1,031,026 bp. The genome consists of 3.57 MB in length with G + C content of 67.6%. In general, the genome includes 4 rRNAs, 52 tRNAs, and 3246 protein-coding sequences. The NCBI accession number for this genome is LIST00000000 and the strain deposit number is CECT9000

Microbial diversity in a military impacted lagoon (Vieques, Puerto Rico) and description of “Candidatus Biekeibacterium resiliens” gen. nov., sp. nov. comprising a new bacterial family

The Anones Lagoon, located in the Island Municipality of Vieques, Puerto Rico (PR), received extensive bombing by the US Navy during military exercises for decades until 2003 when military activities ceased. Here, we employed shotgun metagenomic sequencing to investigate how microbial communities responded to pollution by heavy metals and explosives at this lagoon. Sediment samples (0–5 cm) from Anones were collected in 2005 and 2014 and compared to samples from two reference lagoons, i.e., Guaniquilla, Cabo Rojo (a natural reserve) and Condado, San Juan (PR's capital city). Consistent with low anthropogenic inputs, Guaniquilla exhibited the highest degree of diversity with a lower frequency of genes related to xenobiotics metabolism between the three lagoons. Notably, a clear shift was observed in Anones, with Euryarchaeota becoming enriched (9% of total) and a concomitant increase in community diversity, by about one order of magnitude, after almost 10 years without bombing activities. In contrast, genes associated with explosives biodegradation and heavy metal transformation significantly decreased in abundance in Anones 2014 (by 91.5%). Five unique metagenome-assembled genomes (MAGs) were recovered from the Anones 2005 sample that encoded genetic determinants implicated in biodegradation of contaminants, and we propose to name one of them as “Candidatus Biekeibacterium resiliens” gen. nov., sp. nov. within the Gammaproteobacteria class. Collectively, these results provide new insights into the natural attenuation of explosive contaminants by the benthic microbial communities of the Anones lagoon and provide a reference point for assessing other similarly impacted sites and associated bioremediation efforts

Comprensión y Producción de Lenguaje II - HU544 - 202102

Descripción: Comprensión y Producción de Lenguaje 2 es un curso en el que el estudiante desarrolla sus habilidades para la comprensión lectora y la redacción de textos formales argumentativos en situaciones comunicativas determinadas. Para ello, emplea recursos de redacción que le permitirán una organización coherente, un desarrollo sólido y convincente (a partir de la lectura crítica de fuentes diversas), y una escritura respetuosa de la normativa y de la ortografía vigentes. Propósito: Este curso tiene como requisito Comprensión y Producción de Lenguaje 1. Desarrolla, siguiendo la política educativa propuesta por la UPC en SICA, la competencia Comunicación escrita en el nivel de logro 1. El propósito es que el estudiante pueda producir textos argumentativos coherentes y sustentados a partir de una evaluación crítica de la información. Esas habilidades le permitirán comunicarse de manera escrita para convencer acerca de sus propios puntos de vista en los demás cursos de sus carreras. Además, en el mundo laboral, le permitirá sustentar textualmente sus propuestas y proyectos de manera eficiente

Comprensión y Producción de Lenguaje I - HU543 - 202101

Descripción: Comprensión y Producción de Lenguaje 1 es un curso de primer ciclo, que busca desarrollar las habilidades vinculadas con la comprensión lectora y la redacción de textos escritos formales y adecuados a una situación comunicativa determinada. Por ello, durante el curso, las actividades posibilitarán que el estudiante reflexione sobre cómo el lenguaje es una herramienta que nos permite entender la realidad (comprensión) y comunicar adecuadamente nuestras ideas sobre ella (producción). Esta reflexión se realizará con énfasis en el uso del lenguaje en las redes sociales, espacio que se ha constituido como un nuevo lugar para la divulgación de asuntos diversos: desde temas de ocio o entretenimiento hasta temas académicos, científicos y políticos. En ese sentido, este curso propone que el alumno asuma el rol de un ciudadano crítico, es decir, aquella persona que no solo consume información, sino que produce contenido a partir de una investigación en fuentes confiables. Considerando lo explicado, nuestros alumnos no solo serán capaces de redactar un texto escrito formal de acuerdo con las necesidades comunicativas del ámbito universitario y de la sociedad actual, sino que podrán transformarlo en un texto multimodal (el cual involucra diferentes medios de comunicación: visual, auditivo, imagen, texto, entre otros) que tenga sentido en las redes sociales, lugar de interacción real con sus lectores. Estos productos comunicativos deberán presentar una organización conveniente, un desarrollo sólido y suficiente (lo que implica una lectura crítica de las fuentes de información), y una escritura acorde con la normativa vigente. 3 Propósito: El curso desarrolla la competencia de comunicación escrita, en el nivel 1; es decir, el estudiante es capaz de construir mensajes coherentes y sólidos que se adecúan a la situación y propósito comunicativo. Este desarrollo le permite la generación y construcción de nuevas ideas, lo cual es relevante para su vida académica y profesional. La actual sociedad de la información y el conocimiento, caracterizada por la disrupción, la innovación y la complejidad en las formas de comunicación mediadas por la tecnología, enfrenta al estudiante y al profesional a nuevos retos en las maneras de comunicar aquello que conoce y que construye. En este escenario, la competencia comunicativa escrita adquiere protagonismo como herramienta para transmitir el conocimiento creado. El curso se alinea con esta exigencia, pues contribuye a que el estudiante responda exitosamente a las demandas comunicativas del contexto académico, y a que el egresado pueda desenvolverse idóneamente en el campo profesional y laboral