Grozon (Jura) : rapport de prospections géophysiques 2012

Résultats de la première campagne de prospections géophysiques menée sur l'agglomération gallo-romaine de Grozon (Jura)

Montbéliard – Le Grand Chenois

Le secteur de la Petite Hollande à Montbéliard a livré depuis une cinquantaine d’années des traces d’occupation humaine disparates : fond de cabane de l’âge du Bronze final lors du creusement d’un grand bassin de la piscine (Pétrequin 1966 : 40), éléments de soutènement de galerie d’exploitation de mine. Ces découvertes ont incité à surveiller les travaux de construction des différents bâtiments du Pôle universitaire. Au total, deux surveillances ont été effectuées en septembre 1999 et févrie..

Lavans-lès-Dole – Bois de la Bussière

Le bois de la Bussière est formé par deux parcelles adoptant grossièrement la forme d’un rectangle allongé dans le sens nord-ouest/sud-est. Les fouilles de sauvetage précédentes, ainsi que les sondages de l’été 2000 ont eu lieu dans la parcelle 16, à proximité de l’angle sud. Les limites ouest et sud suivent les courbes de niveau, marquées sur le terrain par des affleurements rocheux qui provoquent des ressauts de très faible hauteur, mis à profit par les constructeurs de l’Antiquité. Les fou..

Vesoul – Rocade ouest

Le terrain se situe à l’extrémité ouest du territoire de la commune de Vesoul, au pied du versant ouest de la colline de la Motte qui culmine à 375 m. À l’Ouest, au Sud et au Nord, la zone, essentiellement des pâturages, est bordée par la plaine inondable de la rivière Durgeon. Le sous-sol est constitué de marnes du Trias recouvertes de limon argileux renfermant du minerai de fer pisolithique. L’intervention est justifiée par le projet de mise en quatre voies de la rocade ouest de Vesoul. Les..

Besançon – 2bis rue Victor-Delavelle

L’intervention a été motivée par la découverte fortuite d’éléments antiques, liés à une probable incinération, lors de travaux rue Victor-Delavelle. Contrainte par le maintien demandé des réseaux existants, l’opération s’est limitée à trois sondages dans une emprise exploitée de 20,2 m2. Si l’existence d’un site stratifié complexe dans l’emprise menacée par le projet immobilier paraît, au terme du diagnostic, constituer une hypothèse à rejeter, la superficie réduite des travaux exploratoires ..

Besançon – Voie des Montboucons

Le projet de rocade contourne Besançon sur environ un quart de son périmètre, de la route de Vesoul au nord jusqu’au boulevard Kennedy au sud-ouest. Bien que passant dans une zone extérieure à la ville antique et médiévale, il pourrait toucher plusieurs axes de circulation, existants dès l’Antiquité, et dont certains ont été repris aux époques médiévales et modernes. Les sondages ont été effectués en tranchées de 20 m à 30 m de long, disposées en quinconce, jusqu’à la roche. Environ 3 km de t..

Lure – Devant contre l’Étang Mollet

Le projet de carrière se situe sur la commune de Lure, au sud-ouest du territoire communal, au lieu-dit « Devant contre l’Étang Mollet ». L’évaluation, effectuée en 3 phases, a nécessité la réalisation de 288 sondages de 2 m de large. La première phase n’a révélée aucun vestige d’origine clairement anthropique. Les deux dernières phases ont permis de mettre en évidence 3 structures fossoyées (sondage 88). La présence de charbons de bois (structure 1), de graviers brûlés (structure 2), d’ossem..

Vincent – Le Dessus de la Pierre levée

L’entreprise Orsat Granulats, qui exploite la gravière de Vincent, a déposé auprès de la préfecture du jura, une demande d’extension, sur une zone d’environ 18 0000 m2. Compte tenu de l’environnement archéologique dans la plaine d’Arlay, il était nécessaire d’effectuer des opérations d’évaluation sur les futures nouvelles parcelles exploitées. 52 sondages ont été effectués en tranchées d’une largeur de godet (2 m) sur des longueurs variant entre 10 m et 50 m. La surface sondée en cumulé repré..

Topological and semantic Web based method for analyzing TGF-β signaling pathways

International audienceTargeting the deleterious effects of Transforming Growth Factor TGF-β without affecting its physiological role is the common goal of therapeutic strategies aiming at curing fibrosis, the final outcome of all chronic liver disease. The pleiotropic effects of TGF-β are linked to the complex nature of its activation and signaling net- works which understanding requires modeling approaches. Our group recently developed a model of TGF-beta signal propagation based on guarded transitions (ref, Andrieux et al, 2014). In this initial work, we explored the combinatorial complexity of cell signaling, developing a discrete formalism based on guarded transitions. We imported the whole database Pathway Interaction Database into a single unified model of signal transduction. We detected 16,000 chains of reactions linking TGF-β to at least one of 159 target genes in the nucleus. The size and complexity of this model place it beyond current understanding. Its analysis requires automated tools for identifying general patterns.Currently, we focus on designing one reasoning method based on Semantic Web technologies for the analysis of signaling pathways. Our method aims at leveraging external domain knowledge represented in biomedical ontologies and linked databases to rank these candidates. We consider a signaling pathway as a set of proteins involved in the respons of a cell to an external stimulus and influencing at least one gene. The underlying reasoning methods are based on graph topological analysis, formal concepts analysis (FCA) and semantic similarity and particularity measures. First, we determine the formal concepts, maximal bi-cliques, between proteins sets and genes. Then, to determine the biological relevance of theses gene clusters, we calculate a similarity score for each cluster based on Wang semantic similarity. Using such approaches, we identify groups of genes sharing signaling networks.Cibler les effets délétères du Transforming Growth Factor, TGF-β, sans affecter son rôle physiologique est l’objectif commun des stratégies thérapeutiques visant à guérir la fibrose, la conséquence finale de toutes les maladies chroniques du foie. Les effets pléiotropiques du TGF-β sont liés à la nature complexe de son activation et du réseaux de signalisation qu’il induit, et dont la compréhension nécessite des approches de modélisation. Notre équipe a développé un modèle de la propagation du signal induit par le TGF-β base ́ sur les transitions gardées. Le développement d’un formalisme discret base ́ sur les transitions gardées permet d’étudier la complexité combinatoire de la signalisation cellulaire. Nous avons formalise ́ l’intégralité de la base de données Pathway Interaction Database en un unique modèle de la propagation du signal. Nous avons détecté 16 000 chaines de réactions reliant le TGF-β à au moins l’un des 159 gènes cibles d’intérêt Pour identifier des propriétés au sein de ces résultats il est nécessaire d’utiliser des outils automatisés.Nous développons actuellement une méthode basée sur le Web sémantique pour l’analyse des voies de signalisation. Cette méthode vise à tirer parti des connaissances de domaine externe représentées dans les ontologies biomédicales et des bases de données pour classer ces candidats. Nous considérons qu’une voie de signalisation est un ensemble des protéines impliquées dans la réaction d’une cellule à un stimulus externe et qui influence au moins un gène. Les méthodes de raisonnement sous-jacentes sont basées sur l’analyse topologique, l’analyse formelle de concepts et les mesures de similarité et de particularité sémantique. Tout d’abord, nous déterminons les concepts formels, c’est-à-dire les bi-cliques maximales, entre les ensembles de protéines et les gènes. Puis, afin de déterminer la pertinence biologique de ces groupes de gènes, nous calculons un score de similarité pour chacun des groupes, base ́ sur la mesure de Wang. La finalité est d’identifier des groupes de gènes similaires influencés par un même ensemble de voies de signalisation

Marchaux – RD486, contournement de Marchaux (2e tranche)

La deuxième tranche de sondages sur le tracé de la RD486, au nord de la commune de Marchaux a été réalisée en effectuant 50 tranchées à intervalles réguliers (largeur : 180 cm). Comme pour la campagne de sondages précédente, le maillage des sondages n’a révélé aucun indice d’occupation ancienne. L’ensemble du projet étant en grande partie situé dans des zones déjà remaniées ou dans des secteurs à fort pendage sur lesquels sont pratiqués de longue date des labours, explique en partie l’absence..