Identificación de hongos por MALDI-TOF MS

La tecnología de Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) ha revolucionado el campo de la microbiología, incluyendo la identificación de hongos. Esta nueva tecnología se basa en la obtención de un espectro proteico del microorganismo en estudio y su comparación con los espectros proteicos de cepas de referencia almacenados en base de datos.Trabajo publicado en Cagliada, Maria del Pilar Lilia y Galosi, Cecilia Mónica (comps.). I Congreso de Microbiología Veterinaria. Libro de resúmenes. La Plata: Facultad de Ciencias Veterinarias, 2021.Facultad de Ciencias Veterinaria

First case report of bloodstream infection due to a Candida species closely related to the novel species Candida pseudorugosa

Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Fernández, Norma. Hospital de Clínicas José de San Martín. División Infectología. Sección Micología; Argentina.Fil: García, Susana. Hospital de Clínicas José de San Martín. Departamento de Bioquímica Clínica. División Bacteriología; Argentina.Fil: Mazza, Mariana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Murisengo, Omar Alejandro. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Szusz, Wanda. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Tiraboschi, Iris Nora. Hospital de Clínicas José de San Martín. División Infectología. Sección Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Candida pseudorugosa is a novel species closely related to Candida rugosa for which only one case has been reported. We report the first case of a bloodstream infection in humans caused by a Candida sp. closely related to C. pseudorugosa. We contribute evidence to show this organism as a potential human pathogen that may be misidentified by conventional methods, also pointing out its lower sensitivity to azoles and other antifungal agents

The status of cryptococcosis in Latin America

Cryptococcosis is a life-threatening fungal infection caused by the encapsulated yeasts Cryptococcus neoformans and C. gattii, acquired from the environment. In Latin America, as occurring worldwide, C. neoformans causes more than 90% of the cases of cryptococcosis, affecting predominantly patients with HIV, while C. gattii generally affects otherwise healthy individuals. In this region, cryptococcal meningitis is the most common presentation, with amphotericin B and fluconazole being the antifungal drugs of choice. Avian droppings are the predominant environmental reservoir of C. neoformans, while C. gattii is associated with several arboreal species. Importantly, C. gattii has a high prevalence in Latin America and has been proposed to be the likely origin of some C. gattii populations in North America. Thus, in the recent years, significant progress has been made with the study of the basic biology and laboratory identification of cryptococcal strains, in understanding their ecology, population genetics, host-pathogen interactions, and the clinical epidemiology of this important mycosis in Latin America.Fil: Firacative, Carolina. University of Sydney; AustraliaFil: Lizarazo, Jairo. Universidad de Pamplona; EspañaFil: Illnait Zaragozí, María Teresa. Tropical Medicine Institute Pedro Kourí; CubaFil: Castañeda, Maria Elizabeth. Instituto Nacional de Salud; Colombia. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Arechavala, Alicia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas "Dr. Francisco Javier Muñiz"; Argentina. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Córdoba, Susana Beatríz. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Mazza, Mariana. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentina. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Taverna, Constanza Giselle. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentina. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Isla, Guillermina. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Chiapello, Laura Silvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Córdoba. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; Argentina. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Vergara, Mario León Silva. Universidade Federal do Triangulo Mineiro; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Melhem, Marcia S. C.. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Szeszs, Maria Walderez. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Martins, Marilena dos Anjos. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; BrasilFil: Bonfietti, Lucas Xavier. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; BrasilFil: Oliveira, Rogério Antonio de. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Oliveira, Lidiane de. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Santos, Dayane Christine Silva. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Governo do Estado de São Paulo. Secretaria da Saúde. Instituto Adolfo Lutz; BrasilFil: Lazera, Marcia S.. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Fundación Oswaldo Cruz; BrasilFil: Wanke, Bodo. Fundación Oswaldo Cruz; Brasil. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Díaz, María Cristina. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Universidad de Chile; ChileFil: Escandón, Patricia. Instituto Nacional de Salud; Colombia. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Noguera, María Clara. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasil. Universidad Metropolitana; ColombiaFil: Andreu, Carlos Manuel Fernández. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Castril­Lón, Laura. Universidad Nacional Autónoma de México; México. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Bustamante, Beatriz. Hospital Cayetano Heredia. Instituto de Medicina Tropical Alexander von Humboldt; Perú. Hospital Cayetano Heredia; Perú. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Dolande, Maribel. Universidad Central de Venezuela; Venezuela. Latin American Cryptococcal Study Group; BrasilFil: Ferrara, Giussepe. Universidad Central de Venezuela; Venezuela. Latin American Cryptococcal Study Group; Brasi

Utilidad de tres métodos por difusión para detectar resistencia a Fluconazol y Voriconazol en Candida spp de origen clínico

Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Szusz, W. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Las infecciones fúngicas invasoras en pacientes hospitalizados son causadas en su mayoría, por levaduras del Género Candida (3,5 ). El uso de antifúngicos, epidemiología de las micosis con la aparición de especies menos susceptibles. Ante estos cambios, la determinación de la susceptibilidad in vitro frente a los antifúngicos es prioritaria (3,5). Los métodos de referencia (MR) E.Dis 7.1 del EUCAST (2) y M27-A del Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI) (7), permiten detectar la concentración inhibitoria mínima (CIM) in vitro y muestran cierta correlación con la evolución clínica de los enfermos. Además, aportan información útil para vigilar la de los pacientes con infecciones severas. Sin embargo, son onerosos y muy laboriosos para los laboratorios clínicos. Por otra parte, existen técnicas comerciales, asequibles uso en la rutina diaria. Objetivos: a-Determinar la susceptibilidad in vitro de especies de Candida frente con Tabletas y Discos cargados con antifúngicos. b-Comparar los resultados y determinar la concordancia entre los métodos

Frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes in Argentina

Fil: Taverna, CG. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, ME. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Mazza, M. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Vivot, ME. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Canteros, Cristina Elena. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.The aim of this work was to know the frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes isolated from human infections in Argentina during the period from April 2009 to April 2011. A multicenter study was conducted, in which 372 isolates were obtained from 61 laboratories throughout the country. Of those, 98.8% of the isolates belonged to the C. neoformans species complex and 1.1% to the C. gattii species complex. Genotype VNI (MATα) was the most frequently isolated (n=326, 87.6%), followed by VNII (MATα) (n=22, 5.9%), the recently described VNII-VNIV (aADα) hybrid (n=14, 3.8%), VNIV (MATα) (n=4, 1.1%), VNIII (αADa) hybrid (n=1, 0.3%), and VNIII (αADα) hybrid (n=1, 0.3%). The Argentine Central region showed the greatest number of cases and genotype diversity. Interestingly, a relative high frequency was observed in genotype VNII (MATα) in the Cuyo, Northeast and Northwest regions and, also in VNII-VNIV (aADα) hybrids in the Northwest region. C. gattii species complex was isolated at a low rate; 3 VGI (MATα) and 1 VGII (MATα) isolates were obtained from the Northwest and Central regions. In conclusion, this study shows that genotype frequencies seem to vary among regions in Argentina and reveals a relatively high frequency of rare hybrids in the Northwest region. Further regional clinical and environmental studies may help to elucidate if those variations in frequencies are associated with the existence of regional ecological niches or any other regional factors.Genotipificación; Genotyping; Hybrids; Híbridos; Mating type; Tipo sexua

First case report of cryptococcosis due to Cryptococcus decagattii in a pediatric patient in Argentina

Fil: Berejnoi, Ana. Hospital Público Materno Infantil; Argentina.Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Mazza, Mariana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Matías. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.We report the first case of cryptococcosis due to Cryptococcus decagattii in an immunocompetent pediatric patient from an indigenous community in Argentina with a successful outcome. Two isolates (blood, cerebrospinal fluid) were genotyped by restriction fragment length polymorphism of the orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5) gene as VGIV and identified by multi-locus sequence typing as C. decagattii. Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry identification indicated genotype VGIII. The minimum inhibitory concentration of amphotericin B, fluconazole, itraconazole, and voriconazole was determined (cerebrospinal fluid: 0.25, 16, 0.12, and 0.12, blood: 0.25, 4, 0.12, and 0.06, respectively, all in mg/L)

Amino acid substitution in Cryptococcus neoformans lanosterol 14-α-demethylase involved in fluconazole resistance in clinical isolates

Fil: Bosco-Borgeat, María E. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Mazza, Mariana. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Murisengo, Omar A. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.The molecular basis of fluconazole resistance in Cryptococcus neoformans has been poorly studied. A common azole resistance mechanism in Candida species is the acquisition of point mutations in the ERG11 gene encoding the enzyme lanosterol 14-α-demethylase, target of the azole class of drugs. In C. neoformans only two mutations were described in this gene. In order to evaluate other mutations that could be implicated in fluconazole resistance in C. neoformans we studied the genomic sequence of the ERG11 gene in 11 clinical isolates with minimal inhibitory concentration (MIC) values to fluconazole of ≥16μg/ml. The sequencing revealed the G1855A mutation in 3 isolates, resulting in the enzyme amino acid substitution G484S. These strains were isolated from two fluconazole-treated patients. This mutation would not intervene in the susceptibility to itraconazole and voriconazole

Reidentification and antifungal susceptibility profile of Candida guilliermondii and Candida famata clinical isolates from a culture collection in Argentina

Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Matias Ezequiel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Szusz, Wanda. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.The aim of this work was to reidentify strains previously identified as Candida guilliermondii and Candida famata by conventional phenotypic methods conserved in a culture collection from Argentina using ribosomal DNA sequencing, ACT1 gene sequencing, and matrix-assisted laser desorption ionization - time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). In addition, we performed antifungal susceptibility tests of eight antifungal drugs commonly used in clinical treatment. We identified 68 isolates belonging to the Candida guilliermondii species complex (59 C. guilliermondii, 8 C. fermentati, and 1 Candida carpophila), 16 isolates belonging to the Candida famata species complex (8 C. famata, 6 Debaryomyces nepalensis, 1 Debaryomyces fabryi, and 1 Debaryomyces tyrocola). Although sequencing of ITS region was able to identify C. guilliermondii and D. nepalensis isolates, sequencing of ACT1 gene seems to be the most appropriate technique for differentiation between C. fermentati and C. carpophila and between members of the C. famata species complex others than D. nepalensis. MALDI-TOF MS has a good potential for the identification of these yeasts, particularly in clinical laboratories since is a rapid and easy to perform technique. Here, we report the first isolation of D. tyrocola from a human patient and the first isolation of D. nepalensis from lungs and blood of human patients. Finally, correct identification and determination of antifungal susceptibility of those closely related species could be a useful tool for clinicians to choose the most effective antifungal treatment