Optimized cell systems for the investigation of hepatitis C virus E1E2 glycoproteins

Great strides have been made in understanding and treating hepatitis C virus (HCV) thanks to the development of various experimental systems including cell-culture-proficient HCV, the HCV pseudoparticle system and soluble envelope glycoproteins. The HCV pseudoparticle (HCVpp) system is a platform used extensively in studies of cell entry, screening of novel entry inhibitors, assessing the phenotypes of clinically observed E1 and E2 glycoproteins and, most pertinently, in characterizing neutralizing antibody breadth induced upon vaccination and natural infection in patients. Nonetheless, some patient-derived clones produce pseudoparticles that are either non-infectious or exhibit infectivity too low for meaningful phenotyping. The mechanisms governing whether any particular clone produces infectious pseudoparticles are poorly understood. Here we show that endogenous expression of CD81, an HCV receptor and a cognate-binding partner of E2, in producer HEK 293T cells is detrimental to the infectivity of recovered HCVpp for most strains. Many HCVpp clones exhibited increased infectivity or had their infectivity rescued when they were produced in 293T cells CRISPR/Cas9 engineered to ablate CD81 expression (293TCD81KO). Clones made in 293TCD81KO cells were antigenically very similar to their matched counterparts made parental cells and appear to honour the accepted HCV entry pathway. Deletion of CD81 did not appreciably increase the recovered titres of soluble E2 (sE2). However, we did, unexpectedly, find that monomeric sE2 made in 293T cells and Freestyle 293-F (293-F) cells exhibit important differences. We found that 293-F-produced sE2 harbours mostly complex-type glycans whilst 293T-produced sE2 displays a heterogeneous mixture of both complex-type glycans and high-mannose or hybrid-type glycans. Moreover, sE2 produced in 293T cells is antigenically superior; exhibiting increased binding to conformational antibodies and the large extracellular loop of CD81. In summary, this work describes an optimal cell line for the production of HCVpp and reveals that sE2 made in 293T and 293-F cells are not antigenic equals. Our findings have implications for functional studies of E1E2 and the production of candidate immunogens

Diseño y simulación de hidroturbina con álabes superpuestos para generar electricidad en rio Ucayali

Clean and renewable energy, such as hydro, are essential to mitigate climate change and are essential to banish the thermoelectric power. It is regarded as the potential energy source. In the present study it was possible to design an optimal model that fits the reality of Ucayali, an experimental prototype was also built and the feasibility of operation of the turbine is determined in slow and flowing flow power generation. Tests with large and small blade is made in the Ucayali River with the respective dimensions were measured forces deep in river, computer parts, and the length forming a grid design to prevent excessive accumulation of masses of algae trunks, branches and other bulky waste. Calculations show that the blade angle does not vary evenly along the radius, and the contribution to power generation considering the angular speed of the turbine.Las energías limpias y renovables, como la hidráulica, son esenciales para mitigar el cambio climático, y son imprescindibles para desterrar la energía termoeléctrica. Es considerada como la fuente energética potencial. En el presente estudio se logró diseñar un modelo óptimo que se adapta a la realidad de Ucayali, también se construyó un prototipo experimental y se determinó la factibilidad de funcionamiento de la turbina en flujo lento y caudaloso con generación de energía eléctrica. Las pruebas con álabe grande y pequeño se realizaron en el río Ucayali con las dimensiones respectivas, se midieron las fuerzas en la profundidad de río, las piezas de equipo, y la longitud formando un diseño de rejilla que evite el acumulamiento excesivo de masas de algas, troncos, ramas grandes y otros desechos voluminosos. Los cálculos muestran que el ángulo del álabe no varía uniformemente a lo largo del radio, así como el aporte a la generación de potencia si se considera la velocidad angular de la turbina

We should not light an Open Access lamp and then hide it under a bushel!

The rapid growth of hybrid journals in the last few years has seen an unfortunate side effect: the majority of Open Access (OA) articles published in those journals cannot be recognized as OA beyond the publishers' websites, or by the discovery services used by researchers to access full-text articles. This reality has been demonstrated in the literature and solutions have been proposed. This paper explains the causes behind the problem, examines each of the proposed solutions, discusses the few implementations made with those solutions, and estimates whether the potential benefits merit the efforts required to implement the available solutions. Each of the solutions is analyzed from standardization and pragmatic perspectives. In particular, we critically analyze the solution proposed by NISO (RP-22-2015), and compare it with the solution offered by the JEMO project, which is based on using metadata elements from namespaces and XML schemas already being used by publishers. The contribution presents a number of case studies which show that research published as OA ends up erroneously being labelled as non-OA on the electronic services used by the end-user, when one of the components of the supply and delivery chain for e-journals fails to include OA information in its metadata. Furthermore, the case studies demonstrate that publishers of hybrid journals should not be the only ones being answerable for the problem. In fact, during the study, some publishers were actually not allowed to enable OA identification, at the article level, by key components of the supply chain. In those case studies, we worked with a sample of publishers that implemented the JEMO solution. From those experiences we draw answers to the main question of this presentation: which solution should be used to enable OA discovery from hybrid journals? What becomes apparent is that publishers are prepared and willing to implement any of the available solutions in their publishing workflow. The paper proposes that the simplest option is the best solution to provide standardized means to identify OA at the article level

ANALISIS DE CRECIMIENTO EN Zea mays L. y Arachis hypogaea L.

Se realizó análisis de crecimiento en maíz (Zea mays L.) y maní (Arachis hypogaea L.) en suelo aluvial de Selva Baja de Iquitos, Perú. La máxima altura de plantas fue en maíz 282 cm. y maní 94 cm. El mayor número de hojas fue de 15 y 94 respectivamente. El peso Seco por planta en maíz estuvo comprendido de 0, 11 a 217,90 g.; en maní de 0,32 a 53,50 g.Los valores superiores encontrados de ciertos índices en maíz y maní, se expone a continuación: área foliar 169,67 y 32,11 dm2 de hoja; índice de área foliar óptima 5,59 y 3,71; índice de crecimiento absoluto 79,08 y 7,68 g.sem-1; índice de crecimiento del cultivo 439,33 y 96,00 g.m-2 de suelo. sem-1; indice de crecimiento relativo para ambas especies fue de 1,12 g.g.-1.sem-1; índice de asimilación neta 234 y 76 g.m-2 hoja. sem-2; cociente de área foliar 310 y 198 cm2 de hoja. g-1 y duración del área foliar 1,93 y 0,44 m2 de hoja. sem-1; correspondientemente.Se obtuvo índices de cosecha de 36% y 25% en maíz y maní respectivamente; eficiencias fotosintéticas medias de 1,27% y 0,75%; además eficiencias foliares medias de 0,59 y 0,67 g.dm-2 de hoja, en las especies estudiadas

Una evaluación de la fauna silvestre y su aprovechamiento de la Reserva Nacional Pacaya-Samiria, Perú

Con el objetivo de conocer mejor la diversidad, distribución, importancia y situación actual de la fauna silvestre de la Reserva Nacional Pacaya Samiria, y así poder plantear algunas acciones orientadas a la conservación de la diversidad faunística y el aprovechamiento sustentable de este recurso por los pobladores del lugar, los 'autores del presente trabajo realizaron, entre octubre de 1992 y setiembre de 1993, un inventario y evaluación rápida de la fauna y de su aprovechamiento por los pobladores del lugar en la reserva y su periferia

Una evaluación de la fauna silvestre y su aprovechamiento de la Reserva Nacional Pacaya-Samiria, Perú

Con el objetivo de conocer mejor la diversidad, distribución, importancia y situación actual de la fauna silvestre de la Reserva Nacional Pacaya Samiria, y así poder plantear algunas acciones orientadas a la conservación de la diversidad faunística y el aprovechamiento sustentable de este recurso por los pobladores del lugar, los 'autores del presente trabajo realizaron, entre octubre de 1992 y setiembre de 1993, un inventario y evaluación rápida de la fauna y de su aprovechamiento por los pobladores del lugar en la reserva y su periferia

Conocimientos y actitud de padres de niños con fiebre en una población amazónica

Introducción: la fiebre es uno de los problemas médicos más comunes que experimentan los niños. Clínicamente se define como una temperatura corporal de 1°C o más por encima de la desviación estándar media en el sitio de registro. Objetivo: determinar la relación entre el nivel de conocimientos y creencias con las actitudes de los padres con respecto a la fiebre en niños menores de 5 años que acuden a los servicios de emergencia y pediatría. Método: se realizó un estudio observacional, descriptivo y transversal en 335 padres que asistieron en dos ocasiones o más al Hospital “MINSA II-2 Tarapoto” por presencia de fiebre en sus hijos. Las variables estudiadas fueron el nivel de conocimiento, actitudes ante la fiebre y variables sociodemográficas. Resultados: el 63,6 % de los acompañantes se encontraron en edades entre los 20 y 29 años y el 77 % fueron del sexo femenino. Se reportó predominio de la instrucción secundaria (33,7 %) y superior Universitaria (33,7 %). El 53,4 % de ellos reportó tener sólo uno, y el 60 % de los desempeñaban actividad laboral. El 95,2 % de los padres mostraron conocimientos insuficientes y el 62,4 % presentó una actitud no óptima ante la presencia de fiebre en sus hijos. Se encontró asociación entre la actitud y el nivel de conocimiento (p<0,02). Conclusiones: en su mayoría los padres con fiebre-fobia fueron féminas jóvenes y padres primerizos, con estudios universitarios. Existieron conocimientos insuficientes por parte de los padres, así como actitudes no óptimas, encontrándose relacionadas ambas variables

Optimization of the pseudoparticle system for standardized assessments of neutralizing antibodies against hepatitis C virus

A better understanding of the antibody response during natural infection and the effect on disease progression and reinfection is necessary for the development of a protective hepatitis C virus (HCV) vaccine. The HCV pseudoparticle (HCVpp) system enables the study of viral entry and inhibition by antibody neutralization. A robust and comparable neutralization assay is crucial for the development and evaluation of experimental vaccines.With the aim of optimizing the HCVpp-murine leukaemia virus (MLV) system, we tested the neutralization of HCVpp-harbouring E1E2 from 21 HCV isolates representing 6 different genotypes by several monoclonal antibodies (mAbs). HCVpps are generated by expressing functional envelope glycoproteins (E1E2) onto pseudoparticles derived from env-deleted MLV. Adjustments of E1E2, gag-pol and luciferase plasmid ratios resulted in increased yields for most HCVpps and recovery of one non-infectious HCVpp. We simplified and improved the protocol to achieve higher signal/noise ratios and minimized the amount of HCVpps and mAbs needed for the detection of neutralization. Using our optimized protocol, we demonstrated comparable results to previously reported data with both diluted and freeze-thawed HCVpps.In conclusion, we successfully established a simplified and reproducible HCVpp neutralization protocol for studying a wide range of HCV variants. This simplified protocol provides highly consistent results and could be easily adopted by others to evaluate precious biological material. This will contribute to a better understanding of the antibody response during natural infection and help evaluate experimental HCV vaccines