Optimization and evaluation of surface-enhanced laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry for protein profiling of cerebrospinal fluid

Cerebrospinal fluid (CSF) potentially carries an archive of peptides and small proteins relevant to pathological processes in the central nervous system (CNS) and surrounding brain tissue. Proteomics is especially well suited for the discovery of biomarkers of diagnostic potential in CSF for early diagnosis and discrimination of several neurodegenerative diseases. ProteinChip surface-enhanced laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) is one such approach which offers a unique platform for high throughput profiling of peptides and small proteins in CSF. In this study, we evaluated methodologies for the retention of CSF proteins < 20 kDa in size, and identify a strategy for screening small proteins and peptides in CSF. ProteinChip array types, along with sample and binding buffer conditions, and matrices were investigated. By coupling the processing of arrays to a liquid handler reproducible and reliable profiles, with mean peak coefficients of variation < 20%, were achieved for intra- and inter-assays under selected conditions. Based on peak m/z we found a high degree of overlap between the tested array surfaces. The combination of CM10 and IMAC30 arrays was sufficient to represent between 80–90% of all assigned peaks when using either sinapinic acid or α-Cyano-4-hydroxycinnamic acid as the energy absorbing matrices. Moreover, arrays processed with SPA consistently showed better peak resolution and higher peak number across all surfaces within the measured mass range. We intend to use CM10 and IMAC30 arrays prepared in sinapinic acid as a fast and cost-effective approach to drive decisions on sample selection prior to more in-depth discovery of diagnostic biomarkers in CSF using alternative but complementary proteomic strategies

La ville numérique exposée : internet au service de la flânerie

Ce mémoire porte sur la capacité du numérique à poétiserla ville. Alors que la ville industrielle du XIXème siècle offraitau flâneur toutes sortes d'intérêts visuels neufs, notamment autravers des passages parisiens, la mégapole contemporaines’enferme dans une uniformisation et un contrôle de toutes sesdonnées. Sous l'impulsion du numérique, on est en mesure demaîtriser, spatialement et temporellement, tous nos déplacements: trouver le chemin le plus rapide, les meilleures concordances.L’expérience urbaine est raccourcie au maximum et lehasard en est exclu. Internet, d’abord terrain mystérieux d’explorationa connu pareil transformation et est aujourd’hui principalementperçu dans sa fonction utilitaire. Plutôt que d’opposerespaces virtuel et tangible, est défendue l’idée que l’un et l’autres’augmentent. La pluralité des regards numériques est une ported’entrée vers un renouvellement de la dimension poétique de laville et de sa capacité à nous émerveiller et nous surprendre. Iln’est pas tant question de renouveler la figure du flâneur quede renouveler le regard du citadin. Cette recherche, au traversdes écrits de Walter Benjamin ou Thierry Davila et des pratiquesdu laboratoire d’art urbain Stalker ou du designer Bill Gaver,revient à s’intéresser au basculement du numérique, depuis uneutilisation rationnelle et restreinte, à une ouverture aux devenirsmultiples de la ville, ou comment le numérique peut réaffirmer ladimension sensible de la mégapole, ainsi que la sienne

Cell wall proteins: a new insight through proteomics

Cell wall proteins are essential constituents of plant cell walls; they are involved in modifications of cell wall components, wall structure, signaling and interactions with plasma membrane proteins at the cell surface. The application of proteomic approaches to the cell wall compartment raises important questions: are there technical problems specific to cell wall proteomics? What kinds of proteins can be found in Arabidopsis walls? Are some of them unexpected? What sort of post-translational modifications have been characterized in cell wall proteins to date? The purpose of this review is to discuss the experimental results obtained to date using proteomics, as well as some of the new questions challenging future research

Devenir géopolitique d’une terre présidentielle : la Nièvre, « fief électoral » ou « fief politique » (1945-2009) ?

Trois décennies après l’accession de François Mitterrand à la présidence de la République française, la Nièvre reste attachée, pour beaucoup de Français, et a fortiori pour ceux qui observent la vie politique, au nom du 21e président de la République. Jusqu’à la fin de sa vie, François Mitterrand était beaucoup plus associé géographiquement à la Nièvre qu’à la Charente dont il était originaire et où il a finalement décidé d’être inhumé. Il eut une vie et une action politiques complexes, y com..

Contributions à l'amélioration de la résolution en résonance magnétique nucléaire à l'état solide

LYON-ENS Sciences (693872304) / SudocSudocFranceF

Choisir l'amour : roman d'amour inédit / par Philippe Charmont

Collection : Le Livre favori ; n° 1223Contient une table des matièresAvec mode text

Le raisin de table

National audienc