Gait characterization in golden retriever muscular dystrophy dogs using linear discriminant analysis

Background: Accelerometric analysis of gait abnormalities in golden retriever muscular dystrophy (GRMD) dogs isof limited sensitivity, and produces highly complex data. The use of discriminant analysis may enable simpler andmore sensitive evaluation of treatment benefits in this important preclinical model.Methods: Accelerometry was performed twice monthly between the ages of 2 and 12 months on 8 healthy and20 GRMD dogs. Seven accelerometric parameters were analysed using linear discriminant analysis (LDA). Manipulationof the dependent and independent variables produced three distinct models. The ability of each model to detect gaitalterations and their pattern change with age was tested using a leave-one-out cross-validation approach.Results: Selecting genotype (healthy or GRMD) as the dependent variable resulted in a model (Model 1) allowing agood discrimination between the gait phenotype of GRMD and healthy dogs. However, this model was not sufficientlyrepresentative of the disease progression. In Model 2, age in months was added as a supplementary dependentvariable (GRMD_2 to GRMD_12 and Healthy_2 to Healthy_9.5), resulting in a high overall misclassification rate (83.2%).To improve accuracy, a third model (Model 3) was created in which age was also included as an explanatory variable.This resulted in an overall misclassification rate lower than 12%. Model 3 was evaluated using blinded data pertainingto 81 healthy and GRMD dogs. In all but one case, the model correctly matched gait phenotype to the actualgenotype. Finally, we used Model 3 to reanalyse data from a previous study regarding the effects ofimmunosuppressive treatments on muscular dystrophy in GRMD dogs. Our model identified significant effect ofimmunosuppressive treatments on gait quality, corroborating the original findings, with the added advantages ofdirect statistical analysis with greater sensitivity and more comprehensible data representation.Conclusions: Gait analysis using LDA allows for improved analysis of accelerometry data by applying adecision-making analysis approach to the evaluation of preclinical treatment benefits in GRMD dogs

Étude crâniométrique des bovins de l'île Amsterdam : modélisation du dimorphisme sexuel.

The cattle from Amsterdam Island (South of Indian Ocean) had been initially introduced as domesticated animals into the island during the XVII century. Later abandoned, the cattle reverted to the wild state (feral animals). This old and hardy livestock has proved to be a reference population on which to do an osteometric study. The skulls of 91 adults (SO females and 41 males) were collected and measured by the anatomy laboratory of the Nantes Veterinary Faculty - France. The data allowed us to do a uni-and multivaried statistical study (single statistics, principal component analysis, disciminate analysis). This study permitted us to define osteomorphometric characteristics of the Amsterdam Island cattle skull : a small long- horned head with a sub-concave profile. A method to a global and comparative approach and a sexual dimorphism study has been proposed thanks to this large skull sample. For the most discriminant variables, a logistic regression allows us to modelise the sexual dimorphism.Les bovins de l'île Amsterdam (Sud de l'Océan indien) ont été initialement introduits domestiqués dans l'île au XVIIème siècle, puis suite à l'abandon du troupeau, sont retournés à l'état sauvage (animaux dits harets ou marrons). Ce cheptel rustique et ancien s'avère être une population de référence pour une étude ostéométrique. Les têtes osseuses de 91 individus adultes (50 femelles et 41 mâles) ont été récupérées par le laboratoire d'Anatomie Comparée de l'Ecole Nationale Vétérinaire et ont été mesurées. Les données acquises ont fait l'objet d'une étude statistique uni-et multivariée (statistiques simples, analyse en composantes principales, analyse discriminante). Cette étude a permis de définir les caractères ostéo-morphométriques de la tête osseuse du bovin de l'île Amsterdam : une tête à profil sub-concave de petite taille avec de grandes cornes. Grâce à un échantillon de taille assez importante, une méthodologie pour une approche ostéométrique globale et ainsi que pour une étude du dimorphisme sexuel a été proposée. Pour les variables les plus discriminantes, une régression logistique a permis une modélisation du dimorphisme sexuel.Guintard Claude, Betti Éric, Thorin Savarit Chantal, Antonot Philippe. Étude crâniométrique des bovins de l'île Amsterdam : modélisation du dimorphisme sexuel.. In: Revue d'Archéométrie, n°25, 2001. pp. 157-177

Etude ostéométrique des principaux os des membres et de la ceinture du membre thoracique chez le Faisande Colchide (Phasianus colchicus L., 1758)

Avian osteometric repositories have been traditionally elusive research tools, particularly in zooarchaeology. Here we offer an osteometrical baseline for the main bones of the limbs and thoracic girdle of the Common Pheasant (Phasianus colchicus L. 1758). The database consists of a sample of 54 individuals, that includes 26 males and 28 females, aged from 12 to 24 months. In addition to the basic uni- and bivariate statistical data, multivariate analyses (PCA) were used to treat the 72 linear measurements chosen from among the 81 starting measurements also to highlight sexual dimorphism. The 22 most discriminating measurements, or the 18 most relevant measurements for zooarchaeology, yield information as reliable as the 72 initial measurements, providing a far simpler methodology for zooarchaeological purposes. This study evidences the very clear sexual dimorphism existing in the analyzed elements of the Common Pheasant, providing statistically-significant threshold values between males and females for each of the variables.Les référentiels ostéométriques conséquents pour les oiseaux font globalement défaut, notamment en archéozoologie. Un référentiel ostéométrique pour les principaux os des membres et de la ceinture du membre thoracique du Faisan de Colchide (Phasianus colchicus L., 1758) a été réalisé. Ce travail repose sur un échantillon de 54 individus, 26 mâles et 28 femelles, âgés de 12 à 24 mois. Au-delà des données statistiques de base uni- et bivariées, des analyses multivariées (ACP) ont permis de traiter les 72 mesures linéaires retenues, parmi les 81 de départ, et de faire ressortir le dimorphisme sexuel. Les 22 mesures les plus discriminantes ou les 18 mesures les plus pertinentes pour l’archéozoologie apportent une information aussi fiable que les 72 mesures initiales, mais rendent la méthodologie de travail pour l’archéozoologue plus simple. Cette étude met en évidence un dimorphisme sexuel trèsnet et propose des valeurs seuil, statistiquement significatives entre les mâles et les femelles,pour chaque variable

Étude ostéomorphométrique d’ensembles crâniens d’oiseaux sauvages autochtones non captifs de l’Ouest de la France :variabilité intra- et interspécifique

International audienceThe osteology of Western France birds is far from being well known. This study is based on a sample of more than 100 species and 800 individuals collected at the “Centre Vétérinaire de la Faune Sauvage et des Écosystèmes des Pays de la Loire” (Nantes). It is founded on 38 skull dimensions, including jaw bones. The results allowed a uni- and multivariate statistical study. A sexual dimorphism was shown for three species, and species or families could be differentiated within many orders.L’ostéologie des oiseaux de l’Ouest de la France est assez mal connue. Cette étude s’appuie sur un échantillon de plus de 100 espèces pour 800 individus recueillis au sein du Centre Vétérinaire de la Faune Sauvage et des Écosystèmes des Pays de la Loire (Nantes). Elle se fonde sur 38 dimensions crâniennes, intégrant les mandibules. Les résultats obtenus ont permis une analyse statistique uni- et multivariée. Un dimorphisme sexuel a été montré pour trois espèces. Certaines espèces ou familles ont pu être discriminées au sein de nombreux ordres

Etude ostéométrique des principaux os des membres et de la ceinture du membre thoracique chez le Faisande Colchide (Phasianus colchicus L., 1758)

Avian osteometric repositories have been traditionally elusive research tools, particularly in zooarchaeology. Here we offer an osteometrical baseline for the main bones of the limbs and thoracic girdle of the Common Pheasant (Phasianus colchicus L. 1758). The database consists of a sample of 54 individuals, that includes 26 males and 28 females, aged from 12 to 24 months. In addition to the basic uni- and bivariate statistical data, multivariate analyses (PCA) were used to treat the 72 linear measurements chosen from among the 81 starting measurements also to highlight sexual dimorphism. The 22 most discriminating measurements, or the 18 most relevant measurements for zooarchaeology, yield information as reliable as the 72 initial measurements, providing a far simpler methodology for zooarchaeological purposes. This study evidences the very clear sexual dimorphism existing in the analyzed elements of the Common Pheasant, providing statistically-significant threshold values between males and females for each of the variables.Les référentiels ostéométriques conséquents pour les oiseaux font globalement défaut, notamment en archéozoologie. Un référentiel ostéométrique pour les principaux os des membres et de la ceinture du membre thoracique du Faisan de Colchide (Phasianus colchicus L., 1758) a été réalisé. Ce travail repose sur un échantillon de 54 individus, 26 mâles et 28 femelles, âgés de 12 à 24 mois. Au-delà des données statistiques de base uni- et bivariées, des analyses multivariées (ACP) ont permis de traiter les 72 mesures linéaires retenues, parmi les 81 de départ, et de faire ressortir le dimorphisme sexuel. Les 22 mesures les plus discriminantes ou les 18 mesures les plus pertinentes pour l’archéozoologie apportent une information aussi fiable que les 72 mesures initiales, mais rendent la méthodologie de travail pour l’archéozoologue plus simple. Cette étude met en évidence un dimorphisme sexuel trèsnet et propose des valeurs seuil, statistiquement significatives entre les mâles et les femelles,pour chaque variable

Étude crâniométrique d’un échantillon de chiens de races variées

International audienceThe Dog is the oldest domesticatedspecies. Craniometry, with standardized measurements on the skull and mandible, is a useful tool for comparingdogs and other Canids or even dog breeds themselves. This study aims to give reference data for breeds that hadnot been studied yet regarding the canine craniometry technique, to give comparison clues between the breeds thatexist today and to offer a minimal sequence of measurements that makes discrimination between different typesof dogs possible. The experimental study is described with 80 measurements for each of the 139 osseous headsavailable, coming from 46 breeds. In a last part, we offer a methodology reducing the measurements from 80 to 17.Le Chien est l’espèce domestiquée la plus anciennement. La crâniométrie, composée de mesures sur lecrâne et la mandibule standardisées par plusieurs auteurs, est un outil permettant de comparer le Chien aux autresCanidés ou les races de chiens entre elles. Le but de cette étude est de fournir un référentiel de valeurs pour desraces peu étudiées jusqu’à maintenant en crâniométrie canine, de donner des éléments de comparaison entre lesdifférentes races actuelles et de proposer un minimum de mesures crâniométriques suffisant à discriminer les typescanins. L’étude expérimentale comporte 80 mesures réalisées sur 139 têtes osseuses de chiens répartis dans 46 racesdifférentes. Dans la discussion, nous commentons les résultats et une proposition méthodologique visant à réduirede 80 à 17 le nombre de variables mesurées est avancée

A COMPARISON BETWEEN PLANT COMMUNITY COMPOSITION AND BOTANICAL SPECIESGATHERED BY HONEY BEES IN A CULTIVATED LANDSCAPE OF WESTERN FRANCE

International audienc

A COMPARISON BETWEEN PLANT COMMUNITY COMPOSITION AND BOTANICAL SPECIESGATHERED BY HONEY BEES IN A CULTIVATED LANDSCAPE OF WESTERN FRANCE

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