Comparison of a Flow Assay for Brucellosis Antibodies with the Reference cELISA Test in West African Bos indicus

Brucellosis is considered by the Food and Agricultural Organisation and the World Health Organisation as one of the most widespread zoonoses in the world. It is a major veterinary public health challenge as animals are almost exclusively the source of infection for people. It is often undiagnosed in both human patients and the animal sources and it is widely acknowledged that the epidemiology of brucellosis in humans and animals is poorly understood, particularly in sub-Saharan Africa. It is therefore important to develop better diagnostic tools in order to improve our understanding of the epidemiology and also for use in the field for disease control and eradication. As with any new diagnostic test, it is essential that it is validated in as many populations as possible in order to characterise its performance and improve the interpretation of its results. This paper describes a comparison between a new lateral flow assasy (LFA) for bovine brucellosis and the widely used cELISA in a no gold standard analysis to estimate test performance in this West African cattle population. A Bayesian formulation of the Hui-Walter latent class model incorporated previous studies' data on sensitivity and specificity of the cELISA. The results indicate that the new LFA is very sensitive (∼87%) and highly specific (∼97%). The analysis also suggests that the current cut-off of the cELSIA may not be optimal for this cattle population but alternative cut-offs did not significantly change the estimates of the LFA. This study demonstrates the potential usefulness of this simple to use test in field based surveillance and control which could be easily adopted for use in developing countries with only basic laboratory facilities

Développement d'une détection par SPC pour la recherche de la désintégration double bêta sans émission de neutrinos

The determination of the nature of neutrino (Majorana or Dirac) is one of the fundamentalsopen questions in particle physics. To answer it, the most sensitive way is the observation of aneutrinoless double beta decay . In this framework the R2D2 (Rare Decays with RadialDetector) R&D project is assessing if the SPC (Spherical Proportional Counter) detector conceptcould meet the requirements of a decay experiment.The advantages of such a detector are its simplicity in terms of mechanics and electronics (single readoutchannel), a large mass in a small volume (at 40 bar, 1 ton of Xe is reached in a 1m radius sphere), andthe possibility to meet the extremely low background requirements for rare events searches.A first step of the R&D is to optimize a SPC prototype looking for an energy resolution at the levelof 1% FWHM at 2.5 MeV, mandatory to be competitive in the searches. The prototype in useis a 40 cm radius sphere, installed in the LP2I-Bordeaux facility.The following document give a quick review of the state of the art in the field followed by apresentation of the R2D2 prototype. To evaluate the behaviour of the detector under various conditions,the outcomes of a computer simulation are presented. Then, experimental results of energy resolutionmeasurements and simultaneous detection of light and charge signals are presented. Notably, an energyresolution as good as 1.1% FWHM for a 5.3 MeV alpha source is reported.Établir la nature du neutrino, comme particule de Majorana ou de Dirac, est l’une desinterrogations fondamentales de la physique des particules contemporaine. A ce jour, l’observationd’une double désintégration bêta sans émission de neutrinos est le moyen le plus sensible pourlever cette indétermination.Le programme de Recherche et Développement R2D2 (Rare Decays with Radial Detector) a pourobjectif d’adapter un détecteur SPC (Spherical Proportional Counter) à la recherche de ce processusde désintégration extrêmement rare, en utilisant l’isotope 136 du xénon porté à haute pression (40bars). Les atouts de ce détecteur sont multiples : simplicité mécanique et électronique (un seul canalde lecture), confinement d’une grande masse d’isotope dans un petit volume et très bas bruit de fondpossible.Considéré comme des attributs essentiels à la recherche d’événements rares, les objectifs de cedéveloppement sont de démontrer que les SPC peuvent atteindre une résolution en énergie de 1%FWHM à 2.46 MeV et permettent la reconstruction de la position radiale de ladésintégration. Pour y parvenir, un prototype de SPC de 40 cm de diamètre a été réalisé puis testé auLaboratoire de Physique des 2 Infinis de Bordeaux.Après la présentation des enjeux et de l’état des recherches de la désintégration, ce travail décritle détecteur développé, les travaux de simulation, ainsi que l’exploitation des mesures expérimentales.Il y est notamment démontré que pour un gaz d’argon, une résolution en énergie de 1.1% FWHM estatteinte, mais aussi que l’exploitation coïncidente des signaux d’ionisation et des signaux de scintillationpour la reconstruction de la position est possible dans ce type de détecteur

Development of a Spherical Proportional Counter (SPC) for the neutrinoless double beta decay search

Établir la nature du neutrino, comme particule de Majorana ou de Dirac, est l’une desinterrogations fondamentales de la physique des particules contemporaine. A ce jour, l’observationd’une double désintégration bêta sans émission de neutrinos est le moyen le plus sensible pourlever cette indétermination.Le programme de Recherche et Développement R2D2 (Rare Decays with Radial Detector) a pourobjectif d’adapter un détecteur SPC (Spherical Proportional Counter) à la recherche de ce processusde désintégration extrêmement rare, en utilisant l’isotope 136 du xénon porté à haute pression (40bars). Les atouts de ce détecteur sont multiples : simplicité mécanique et électronique (un seul canalde lecture), confinement d’une grande masse d’isotope dans un petit volume et très bas bruit de fondpossible.Considéré comme des attributs essentiels à la recherche d’événements rares, les objectifs de cedéveloppement sont de démontrer que les SPC peuvent atteindre une résolution en énergie de 1%FWHM à 2.46 MeV et permettent la reconstruction de la position radiale de ladésintégration. Pour y parvenir, un prototype de SPC de 40 cm de diamètre a été réalisé puis testé auLaboratoire de Physique des 2 Infinis de Bordeaux.Après la présentation des enjeux et de l’état des recherches de la désintégration, ce travail décritle détecteur développé, les travaux de simulation, ainsi que l’exploitation des mesures expérimentales.Il y est notamment démontré que pour un gaz d’argon, une résolution en énergie de 1.1% FWHM estatteinte, mais aussi que l’exploitation coïncidente des signaux d’ionisation et des signaux de scintillationpour la reconstruction de la position est possible dans ce type de détecteur.The determination of the nature of neutrino (Majorana or Dirac) is one of the fundamentalsopen questions in particle physics. To answer it, the most sensitive way is the observation of aneutrinoless double beta decay . In this framework the R2D2 (Rare Decays with RadialDetector) R&D project is assessing if the SPC (Spherical Proportional Counter) detector conceptcould meet the requirements of a decay experiment.The advantages of such a detector are its simplicity in terms of mechanics and electronics (single readoutchannel), a large mass in a small volume (at 40 bar, 1 ton of Xe is reached in a 1m radius sphere), andthe possibility to meet the extremely low background requirements for rare events searches.A first step of the R&D is to optimize a SPC prototype looking for an energy resolution at the levelof 1% FWHM at 2.5 MeV, mandatory to be competitive in the searches. The prototype in useis a 40 cm radius sphere, installed in the LP2I-Bordeaux facility.The following document give a quick review of the state of the art in the field followed by apresentation of the R2D2 prototype. To evaluate the behaviour of the detector under various conditions,the outcomes of a computer simulation are presented. Then, experimental results of energy resolutionmeasurements and simultaneous detection of light and charge signals are presented. Notably, an energyresolution as good as 1.1% FWHM for a 5.3 MeV alpha source is reported

Développement d'une détection par SPC pour la recherche de la désintégration double bêta sans émission de neutrinos

The determination of the nature of neutrino (Majorana or Dirac) is one of the fundamentalsopen questions in particle physics. To answer it, the most sensitive way is the observation of aneutrinoless double beta decay . In this framework the R2D2 (Rare Decays with RadialDetector) R&D project is assessing if the SPC (Spherical Proportional Counter) detector conceptcould meet the requirements of a decay experiment.The advantages of such a detector are its simplicity in terms of mechanics and electronics (single readoutchannel), a large mass in a small volume (at 40 bar, 1 ton of Xe is reached in a 1m radius sphere), andthe possibility to meet the extremely low background requirements for rare events searches.A first step of the R&D is to optimize a SPC prototype looking for an energy resolution at the levelof 1% FWHM at 2.5 MeV, mandatory to be competitive in the searches. The prototype in useis a 40 cm radius sphere, installed in the LP2I-Bordeaux facility.The following document give a quick review of the state of the art in the field followed by apresentation of the R2D2 prototype. To evaluate the behaviour of the detector under various conditions,the outcomes of a computer simulation are presented. Then, experimental results of energy resolutionmeasurements and simultaneous detection of light and charge signals are presented. Notably, an energyresolution as good as 1.1% FWHM for a 5.3 MeV alpha source is reported.Établir la nature du neutrino, comme particule de Majorana ou de Dirac, est l’une desinterrogations fondamentales de la physique des particules contemporaine. A ce jour, l’observationd’une double désintégration bêta sans émission de neutrinos est le moyen le plus sensible pourlever cette indétermination.Le programme de Recherche et Développement R2D2 (Rare Decays with Radial Detector) a pourobjectif d’adapter un détecteur SPC (Spherical Proportional Counter) à la recherche de ce processusde désintégration extrêmement rare, en utilisant l’isotope 136 du xénon porté à haute pression (40bars). Les atouts de ce détecteur sont multiples : simplicité mécanique et électronique (un seul canalde lecture), confinement d’une grande masse d’isotope dans un petit volume et très bas bruit de fondpossible.Considéré comme des attributs essentiels à la recherche d’événements rares, les objectifs de cedéveloppement sont de démontrer que les SPC peuvent atteindre une résolution en énergie de 1%FWHM à 2.46 MeV et permettent la reconstruction de la position radiale de ladésintégration. Pour y parvenir, un prototype de SPC de 40 cm de diamètre a été réalisé puis testé auLaboratoire de Physique des 2 Infinis de Bordeaux.Après la présentation des enjeux et de l’état des recherches de la désintégration, ce travail décritle détecteur développé, les travaux de simulation, ainsi que l’exploitation des mesures expérimentales.Il y est notamment démontré que pour un gaz d’argon, une résolution en énergie de 1.1% FWHM estatteinte, mais aussi que l’exploitation coïncidente des signaux d’ionisation et des signaux de scintillationpour la reconstruction de la position est possible dans ce type de détecteur

Large-R jets in Atlas Tile Calorimeter current and upgraded geometry

This report describes a comparative study of two different geometries of the Atlas Tile Calorimeter to assess the performance of an increased granularity upgrade. The current geometry is compared to the upgraded one, needed because of the luminosity increase in the High-Luminosity LHC. Those geometries had been simulated in Geant4 to provide Monte-Carlo events simulations allowing us to compare the behaviour of the upgraded geometry with the current one. Data analysis is made from this simulation to compare the behaviour of the reconstructed jets substructure in the two different geometries

Phenological timing in French temparate forests - A study on stands in the Renecofor network

The spatial and temporal variability of bud burst (838 observations) and yellowing (449) of 103 coniferous and broadleaved stands (10 species) sampled in the Renecofor network were studied over the period 1997- 2006. For oak stands, the growing season starts in mid-April and stops in mid-October. The growing season is shorter in eastern France as a result of later bud burst (roughly 2 days delay per degree of longitude) and earlier yellowing (5 to 10 days). The growing season for beech begins somewhat later towards the end of the third week of April. Yellowing is seen in early October, making for an average growing season duration of 180 days. Bud burst is even later for coniferous stands and mainly depends on altitude (roughly 1.5 days delay per 100 m). Apart from species, modelling processes highlight the influence of topographic and geographic parameters (longitude, altitude, distance from the sea) and of spring and autumn weather conditions (Turc PET and/or mean temperature in March and October depending on the phenological stage). A 10-mm increase in PET in March advances budbreak from 4 to 9 days depending on species (mean: 6.8 days). For temperature, a 1°C increase in March speeds up bud burst by 2 to 5 days. The overall models predict the three phases — leaf unfolding, yellowing and duration of the growing season — within 8, 10 and 12 days respectively. The resulting equations were used to generate phenological timing maps for the whole of France. Results are discussed, in particular in the context of global warming.La variabilité spatiale et temporelle et le déterminisme du débourrement (838 observations) et du jaunissement (449) de 103 peuplements feuillus et résineux (10 espèces) du réseau RENECOFOR ont été étudiés sur la période 1997-2006. Pour les chênaies, le débourrement commence en moyenne vers la mi-avril et le jaunissement apparaît vers la mi-octobre. Le gradient ouest-est correspond à une saison de végétation plus courte à l’est (180-190 jours contre 210-220 jours) en conséquence d’un débourrement plus tardif (retard de 2 jours par degré de longitude) et d’un jaunissement plus précoce (5-10 jours). Pour le Hêtre, la saison de végétation débute plus tard vers la fin de la troisième semaine d’avril. Le jaunissement des feuilles intervenant début octobre, la saison de végétation est en moyenne de 180 jours. Le débourrement est plus tardif pour les résineux et dépend fortement de l’altitude (retard d’environ 1,5 jour par 100 m). Outre l’espèce, les dates des phénophases dépendent des facteurs topo-géographiques (longitude, altitude, distance à la mer) et des régimes printanier ou automnal (ETP Turc ou température de mars ou d’octobre selon le stade considéré). Une augmentation de l’ETP en mars de 10 mm se traduit par une avancée du débourrement entre 4 et 9 jours selon les espèces (moyenne : 6,8 jours). Concernant la température, une augmentation de 1°C pendant cette période se traduit par une précocité de 2 à 5 jours environ. Les modèles globaux permettent de prédire avec une précision de 8, 10 et 12 jours les trois phases considérées (débourrement, jaunissement et longueur de la saison de végétation). Les modèles ont été utilisés pour générer les cartes des dates moyennes des phénophases sur l’ensemble du territoire. Les résultats sont discutés notamment vis-à-vis du réchauffement climatique

Changes in budburst and leaf colouring dates in Franch Oak and beech stands in the 21st century

After modelling the large-scale climate response patterns of leaf unfolding, leaf colouring and growing season length of oak and beech trees, we predicted the effects of eight future climate scenarios on phenological events. We used the ground observations on 29 oak stands (21 sessile oak stands and 9 pedunculate oak stands) and 22 beech stands from the French Renecofor Network for the period 1997-2006. We applied RandomForest algorithms to predict phenological events from climatic variables. With the resulting models, we drew maps of phenological events throughout France under present climate and under two climatic change scenarios (A2, B2) and four general circulation models (HadCM3, CGCM2, CSIRO2 and PCM). We compared current observations and predicted values for the periods 2041-2070 and 2071-2100. On average, spring development of oaks precedes that of beech. Growing season length ranges from 170-180 days in northeastern areas to more than 210 days in southwestern regions. Annual cycles in budburst and leaf colouring are highly correlated with January, March-April and October-November weather conditions through temperature, overall sun radiation or potential evapotranspiration depending on species. At the end of the 21st century, earlier budburst (mean for the eight scenarios and both genera: 5.6 days), later leaf colouring (mean: 8.6 days) and an increase in the growing season (10.6 days are anticipated). The changes are greater with the more pessimistic A2-HadCM3 hypothesis and considerably different climatic response patterns were observed at a regional scale and between species.Nous avons étudié l’évolution au XXIe siècle des dates de débourrement, de jaunissement et la longueur de la saison de végétation des chênaies et des hêtraies françaises. Pour cela, nous avons utilisé les observations effectuées entre 1997 et 2006 sur 21 chênaies sessiliflores, 8 chênaies pédonculées et 22 hêtraies du réseau RENECOFOR. Les modèles bioclimatiques prédictifs ont été réalisés à partir de la méthode statistique des forêts d’arbres aléatoires (RandomForest). Les scénarios climatiques utilisés pour le XXIe siècle correspondent à deux scénarios de développement économique (A2 et B2) et quatre modèles de circulation atmosphérique (HadCM3, CGCM2, CSIRO2 et PCM). Les modèles bioclimatiques ont été utilisés pour cartographier les dates moyennes pour la période récente 1991-2000 et sur les périodes futures 2041-2070 et 2071-2100. Les dates moyennes actuelles et futures ont été comparées pour mettre en évidence les dérives globales mais également les spécificités régionales de chaque espèce. Actuellement, le débourrement des Chênes précède celui du Hêtre. Pour les deux espèces, la durée de la saison de végétation varie de 170 à 180 jours dans le quart Nord-Est de la France à plus de 210 jours dans le Sud-Ouest. Les cycles annuels de développement sont fortement liés aux conditions climatiques des mois de janvier, mars-avril et octobre-novembre à travers la température, le rayonnement solaire global et l’évapotranspiration potentielle. À la fin du XXIe siècle, nos modèles prédisent par rapport aux moyennes 1991-2000 une avance moyenne de la date de débourrement de 5,3 et 5,9 jours respectivement pour les Chênes et le Hêtre (moyenne pour les 8 scénarios), un retard de jaunissement de 10,9 et 7 jours et un rallongement de la saison de végétation de 10,3 et 10,9 jours. Les changements sont plus importants selon le scénario le plus pessimiste HadCM3-A2 et varient également très fortement selon la région considérée et, pour une même région, entre les deux espèces

Pflanzen im Rhythmus der Jahreszeiten beobachten: Der phänologische Naturführer

Originalausgabe „Les plantes au rythme des saisons“ bei Biotope éditions, FrankreichWie reagiert die Natur auf den Klimawandel? Pflanzen im Rhythmus der Jahreszeiten beobachten. Mit 60 ausgewählten Pflanzen, deren Beobachtung phänologisch besonders interessant ist. Mit detaillierten Fotografien und Zeichnungen. Wann blüht das Busch-Windröschen, wann färben sich die Blätter des Feld-Ahorns? Dieser Beobachtungsführer bietet sämtliche Informationen, um in die phänologische Beobachtung der Pflanzen einzusteigen. Denn im Gegensatz zu den meteorologischen Jahreszeiten unterscheiden sich Anfang und Ende der phänologischen Jahreszeiten von Jahr zu Jahr sowie nach Region. Die charakteristischen Entwicklungsstadien typischer Pflanzen zeigen an, wo wir uns im phänologischen Jahr befinden. Jede der 60 Arten, die als phänologischer Marker dienen, wird detailliert vorgestellt: Identifikationsmerkmale, Ökologie und Verbreitung, Kalender des Jahreszyklus, Fotografien der Stadien

Plants from Season to Season: A phenological observation guidebook.

International audienc

Plants from Season to Season: A phenological observation guidebook.

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