Cost-effectiveness analysis of a rapid test for the detection of the inoculum effect to Cefazolin in Methicillin Susceptible Staphylococcus aureus (Rapid - MSSA-CzIE) causing bacteremia in Colombia

La Resistencia Antimicrobiana (RAM) constituye un riesgo y una amenaza a la salud pública mundial, debido a que los tratamientos tradicionales se vuelven ineficaces y la transmisión de infecciones es persistente. Además, el aumento de la gravedad o la duración de las infecciones conllevan a pérdidas de productividad y la reducción de la calidad de vida. S. aureus, es una bacteria que hace parte del microbiota normal del ser humano, colonizando entre 20-30% de la población humana de forma asintomática. Sin embargo, este microorganismo también actúa como patógeno causando una amplia gama de infecciones, como infecciones de piel y tejidos blandos, óseas, articulares, en implantes, neumonía, bacteriemia y diversas enfermedades por toxinas, como el síndrome de shock tóxico. Las infecciones por S. aureus susceptible a la meticilina (MSSA) representan una carga significativa para el sistema de salud, debido a las altas tasas de mortalidad. En Colombia, la prevalencia de infecciones complicadas causadas por MSSA esta alrededor del 70%. La cefazolina se ha convertido en una terapia importante para las infecciones por Staphylococcus aureus sensible a la meticilina.(MSSA) debido a su buena tolerabilidad, menores efecto adversos y menor costo a diferencia de la isoxazilpenicilinas. Sin embargo, una preocupación importante para el tratamiento con cefazolina, es el efecto del inóculo de cefazolina (CzIE), un fenómeno aparentemente mediado por las betalactamasas estafilocócicas.Universidad El BosqueDoctor en Salud PúblicaDoctoradoAntimicrobial Resistance (AMR) constitutes a risk and threat to global public health, as traditional treatments become ineffective and transmission of infections is persistent. In addition, the increased severity or duration of infections leads to productivity losses and reduced quality of life. S. aureus is a bacterium that is part of the normal human microbiota, colonizing between 20-30% of the human population asymptomatically. However, this microorganism also acts as a pathogen causing a wide range of infections, such as skin and soft tissue infections, bone and joint infections, implant infections, pneumonia, bacteremia and various diseases caused by toxins, such as toxic shock syndrome. Methicillin-susceptible S. aureus infections (MSSA) represent a significant burden for the health system, due to high mortality rates. In Colombia, the prevalence of complicated infections caused by MSSA is around 70%. Cefazolin has become an important therapy for methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) infections due to its good tolerability, lower adverse effects and lower cost than isoxazylpenicillins. A major concern for cefazolin treatment, however, is the cefazolin inoculum effect (CzIE), a phenomenon apparently mediated by staphylococcal beta-lactamases

Formulación de la documentación del programa de saneamiento en la empresa Coloma Ltda

Microbiólogo (a) IndustrialPregrad

Detection of heterogeneous vancomycin intermediate resistance in MRSA isolates from Latin America

Background:Vancomycin is a common first-line option for MRSA infections. The heterogeneous vancomycin-intermediateStaphylococcus aureus(hVISA) phenotype is associated with therapeutic failure. However, hVISAisolates are usually reported as vancomycin susceptible by routine susceptibility testing procedures.Objectives:To detect and characterize the hVISA phenotype in MRSA isolates causing infections in nine LatinAmerican countries.Methods:We evaluated a total of 1189 vancomycin-susceptible MRSA isolates recovered during 2006–08 and2011–14. After an initial screening of hVISA using glycopeptide-supplemented agar strategies, the detection ofhVISA was performed by Etest (GRD) and Macro-method (MET). Isolates deemed to be hVISA were subjectedto population analysis profile/AUC (PAP/AUC) and WGS for further characterization. Finally, we interrogatedalterations in predicted proteins associated with the development of the VISA phenotype in both hVISA andvancomycin-susceptibleS. aureus(VSSA) genomes.Results:A total of 39 MRSA isolates (3.3%) were classified as hVISA (1.4% and 5.6% in MRSA recovered from2006–08 and 2011–14, respectively). Most of the hVISA strains (95%) belonged to clonal complex (CC) 5. Only6/39 hVISA isolates were categorized as hVISA by PAP/AUC, with 6 other isolates close (0.87–0.89) to the cut-off(0.9). The majority of the 39 hVISA isolates exhibited the Leu-14!Ile (90%) and VraT Glu-156!Gly (90%) aminoacid substitutions in WalK. Additionally, we identified 10 substitutions present only in hVISA isolates, involvingWalK, VraS, RpoB and RpoC proteins.Conclusions:The hVISA phenotype exhibits low frequency in Latin America. Amino acid substitutions in proteinsinvolved in cell envelope homeostasis and RNA synthesis were commonly identified. Our results suggest thatEtest-based methods are an important alternative for the detection of hVISA clinical isolates

Cefazolin high-inoculum effect in methicillin-susceptible Staphylococcus aureus from South American hospitals

Objectives Clinical failures with cefazolin have been described in high-inoculum infections caused by methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) producing type A β-lactamase. We investigated the prevalence of the cefazolin inoculum effect (InE) in MSSA from South American hospitals, since cefazolin is used routinely against MSSA due to concerns about the in vivo efficacy of isoxazolyl penicillins. Methods MSSA isolates were recovered from bloodstream (n = 296) and osteomyelitis (n = 68) infections in two different multicentre surveillance studies performed in 2001–02 and 2006–08 in South American hospitals. We determined standard-inoculum (105cfu/mL) and high-inoculum (107 cfu/mL) cefazolin MICs. PFGE was performed on all isolates that exhibited a cefazolin InE. Multilocus sequence typing (MLST) and sequencing of part of blaZ were performed on representative isolates. Results The overall prevalence of the cefazolin InE was 36% (131 isolates). A high proportion (50%) of MSSA isolates recovered from osteomyelitis infections exhibited the InE, whereas it was observed in 33% of MSSA recovered from bloodstream infections. Interestingly, Ecuador had the highest prevalence of the InE (45%). Strikingly, 63% of MSSA isolates recovered from osteomyelitis infections in Colombia exhibited the InE. MLST revealed that MSSA isolates exhibiting the InE belonged to diverse genetic backgrounds, including ST5, ST8, ST30 and ST45, which correlated with the prevalent methicillin-resistant S. aureus clones circulating in South America. Types A (66%) and C (31%) were the most prevalent β-lactamases. Conclusions Our results show a high prevalence of the cefazolin InE associated with type A β-lactamase in MSSA isolates from Colombia and Ecuador, suggesting that treatment of deep-seated infections with cefazolin in those countries may be compromised

Novel insights into the classification of staphylococcal β-lactamases in relation to the cefazolin inoculum effect

Cefazolin has become a prominent therapy for methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) infections. However, an important concern is the cefazolin inoculum effect (CzIE), a phenomenon mediated by staphylococcal β-lactamases. Four variants of staphylococcal β-lactamases have been described based on serological methodologies and limited sequence information. Here, we sought to reassess the classification of staphylococcal β-lactamases and their correlation with the CzIE. We included a large collection of 690 contemporary bloodstream MSSA isolates recovered from Latin America, a region with a high prevalence of the CzIE. We determined cefazolin MICs at standard and high inoculums by broth microdilution. Whole-genome sequencing was performed to classify the β-lactamase in each isolate based on the predicted full sequence of BlaZ. We used the classical schemes for β-lactamase classification and compared it to BlaZ allotypes found in unique sequences using the genomic information. Phylogenetic analyses were performed based on the BlaZ and core-genome sequences. The overall prevalence of the CzIE was 40%. Among 641 genomes, type C was the most predominant β-lactamase (37%), followed by type A (33%). We found 29 allotypes and 43 different substitutions in BlaZ. A single allotype, designated BlaZ-2, showed a robust and statistically significant association with the CzIE. Two other allotypes (BlaZ-3 and BlaZ-5) were associated with a lack of the CzIE. Three amino acid substitutions (A9V, E112A, and G145E) showed statistically significant association with the CzIE (P β <0.01). CC30 was the predominant clone among isolates displaying the CzIE. Thus, we provide a novel approach to the classification of the staphylococcal β-lactamases with the potential to more accurately identify MSSA strains exhibiting the CzIE

Genomic epidemiology of vancomycin-resistant enterococcus faecium (VREfm) in Latin America: revisiting the global VRE population structure

Little is known about the population structure of vancomycin-resistant Enterococcus faecium (VREfm) in Latin America (LATAM). Here, we provide a complete genomic characterization of 55 representative Latin American VREfm recovered from 1998–2015 in 5 countries. The LATAM VREfm population is structured into two main clinical clades without geographical clustering. Using the LATAM genomes, we reconstructed the global population of VREfm by including 285 genomes from 36 countries spanning from 1946 to 2017. In contrast to previous studies, our results show an early branching of animal related isolates and a further split of clinical isolates into two sub-clades within clade A. The overall phylogenomic structure of clade A was highly dependent on recombination (54% of the genome) and the split between clades A and B was estimated to have occurred more than 2,765 years ago. Furthermore, our molecular clock calculations suggest the branching of animal isolates and clinical clades occurred ~502 years ago whereas the split within the clinical clade occurred ~302 years ago (previous studies showed a more recent split between clinical an animal branches around ~74 years ago). By including isolates from Latin America, we present novel insights into the population structure of VREfm and revisit the evolution of these pathogens

A prospective cohort multicenter study of molecular epidemiology and phylogenomics of Staphylococcus aureus bacteremia in nine Latin American countries

Staphylococcus aureus is an important pathogen causing a spectrum of diseases ranging from mild skin and soft tissue infections to life-threatening conditions. Bloodstream infections are particularly important, and the treatment approach is complicated by the presence of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolates. The emergence of new genetic lineages of MRSA has occurred in Latin America (LA) with the rise and dissemination of the community-associated USA300 Latin American variant (USA300-LV). Here, we prospectively characterized bloodstream MRSA recovered from selected hospitals in 9 Latin American countries. All isolates were typed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and subjected to antibiotic susceptibility testing. Whole-genome sequencing was performed on 96 MRSA representatives. MRSA represented 45% of all (1,185 S. aureus) isolates. The majority of MRSA isolates belonged to clonal cluster (CC) 5. In Colombia and Ecuador, most isolates (≥72%) belonged to the USA300-LV lineage (CC8). Phylogenetic reconstructions indicated that MRSA isolates from participating hospitals belonged to three major clades. Clade A grouped isolates with sequence type 5 (ST5), ST105, and ST1011 (mostly staphylococcal chromosomal cassette mec [SCCmec] I and II). Clade B included ST8, ST88, ST97, and ST72 strains (SCCmec IV, subtypes a, b, and c/E), and clade C grouped mostly Argentinian MRSA belonging to ST30. In summary, CC5 MRSA was prevalent in bloodstream infections in LA with the exception of Colombia and Ecuador, where USA300-LV is now the dominant lineage. Clonal replacement appears to be a common phenomenon, and continuous surveillance is crucial to identify changes in the molecular epidemiology of MRSA

Transferable vancomycin resistance in a community-associated MRSA lineage

We report the case of a patient from Brazil with a bloodstream infection caused by a strain of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) that was susceptible to vancomycin (designated BR-VSSA) but that acquired the vanA gene cluster during antibiotic therapy and became resistant to vancomycin (designated BR-VRSA). Both strains belong to the sequence type (ST) 8 community-associated genetic lineage that carries the staphylococcal chromosomal cassette mec (SCCmec) type IVa and the S. aureus protein A gene (spa) type t292 and are phylogenetically related to MRSA lineage USA300. A conjugative plasmid of 55,706 bp (pBRZ01) carrying the vanA cluster was identified and readily transferred to other staphylococci. The pBRZ01 plasmid harbors DNA sequences that are typical of the plasmid-associated replication genes rep24 or rep21 described in community-associated MRSA strains from Australia (pWBG745). The presence and dissemination of community-associated MRSA containing vanA could become a serious public health concern

XIII Jornada de Investigación 2022

Los desafíos en las dinámicas económicas, sociales, políticas y psicológicas han puesto de relieve la importancia de involucrar en la enseñanza universitaria actividades que conecten a los estudiantes con las realidades del contexto en el que se desarrollan; simultáneamente, hoy más que nunca se hace evidente que la ciencia, la tecnología y la innovación (CTI) son cruciales para atender los retos sociales, ambientales y económicos de las sociedades actuales. En este contexto, la Jornada de Investigación de la Universidad Católica de Colombia es quizás uno de los espacios institucionales más emblemáticos en el que se visibilizan las actividades en CTI de estudiantes, jóvenes investigadores y profesores, que buscan contribuir a la solución de problemáticas relevantes del entorno. En esta oportunidad, aproximadamente 177 autores y más de 250 espectadores se dieron cita en un escenario virtual que permitió el intercambio de saberes y conocimientos en torno a muchos temas con un lenguaje común: el bienestar de la humanidad y la respuesta efectiva a los retos que tenemos como comunidad. Esta cuarta versión de las Memorias compila las ponencias presentadas en la XIII Jornada de Investigación de 2022, enmarcadas en los tres ejes temáticos de investigación que tiene la Universidad Católica de Colombia: i) Derecho, Cultura y Sociedad, ii) Desarrollo Humano y Sostenible, y iii) Gestión de la Tecnología al Servicio de la Sociedad. Desde la Dirección Central de Investigaciones nos encontramos profundamente agradecidos con todos y cada uno de los participantes, y nos sentimos aún más orgullosos por la calidad de los trabajos presentados. Sea esta la oportunidad para hacer extensiva una felicitación a los autores y a las diferentes Unidades Académicas que, con su compromiso e invaluable labor, permitieron que este evento se desarrollara con éxito.Persona, hospitalidad y construcción de comunidad desde la fraternidad. José Martí: acerca de la libertad en la condición humana. Moda, imagen y alimentación: una tríada para el bien y para el mal. Lecciones de la pandemia de covid-19: conflictos entre la protección jurídica de las patentes farmacéuticas y el interés general de la salud pública. Psicología y sexualidad: propuesta para la formación de psicólogos colombianos. Estrategias para el desarrollo de herramientas que fomentan el aprendizaje para el reconocimiento y la apropiación del patrimonio cultural. Análisis descriptivo de relatos honestos y deshonestos por medio del sistema de evaluación global. El uso de la herramienta LIWC para el estudio de relatos altruistas y prosociales. ¿De qué manera influyen las redes sociales como medio de información en campañas políticas?. Sistema de Seguridad Social en Colombia: una crisis deficitaria que se refuerza con el tiempo. Turismo sexual en menores de edad: problemática endémica en el territorio colombiano. Transgresión de los derechos humanos en relación con los asesinatos de líderes sociales en el Estado colombiano. El nuevo escenario para la procedencia de la eutanasia en Colombia: una mirada desde los derechos humanos. Protección de los derechos de la infancia frente a los grupos al margen de la ley. El derecho a un nivel de vida adecuado: un enfoque hacia el desplazamiento forzado de los pueblos indígenas. Tráfico de órganos humanos: delito transnacional que vulnera los derechos humanos y su regulación en el marco jurídico colombiano. Transgresión de los derechos a la vida y la libertad en el sistema penitenciario como consecuencia de la violencia social. Acceso a la justicia colombiana en tiempos de SARS-CoV-2. Prioridades para la administración de justicia penal en Colombia: ¿balanceando espectáculo e indicadores de eficacia? Desarrollo de competencias para la investigación en neuropsicología: experiencia del semillero experimental. La dificultad al ingreso de los centros geriátricos. Principio de realidad sobre la formalidad constitucional en contrato verbal laboral en un satélite del Consultorio Jurídico de la Universidad Católica de Colombia. La pena de muerte en colisión con los derechos fundamentales. Maternidad subrogada: objetificación y vulneración de los derechos de la mujer. Una dieta inconsciente hacia el vegetarianismo. Sistema de evaluación del bienestar gerontológico para un diseño arquitectónico sostenible. Caso de estudio: hogar de paso San Francisco de Asís, Villavicencio, Meta. Revisión sistemática interacción líder-colaborador: futuras investigaciones. Análisis conceptual del talento académico desde los modelos teóricos que lo sustentan. Identificación de potenciales factores de riesgo suicida: una mirada contextual. La regulación emocional en tiempos de coronavirus. GEES: Guía de Evaluación de Edificaciones Sostenibles, vivienda de interés social, clima cálido húmedo. Estructura proyectual y sostenible para el diseño y desarrollo de un modelo de vivienda de madera en San Andrés y Providencia, Colombia. Innovación social para la gestión territorial. Construcción de material didáctico para el entrenamiento en habilidades de regulación emocional e interpersonales dirigidas a poblaciones expuestas a situaciones de violencia política. Alternativas sostenibles de modelos de desarrollo industrial. La ruralidad dentro de los procesos del desarrollo local en Usme. Se ha dejado de dibujar arquitectura con las manos. Calidad de vida, bienestar y felicidad en el trabajo: una revisión sistemática de la literatura científica, 2011-2021. Autonomía, autorregulación y educación moral: reflexiones desde la psicología del desarrollo moral. Características de los niños, niñas y adolescentes expuestos a contextos de conflicto armado en Colombia. Revisión bibliométrica de artículos sobre la crianza en niños, niñas y adolescentes colombianos. Narrativas sociales en el proceso de cualificación de lo público La habitación exterior como extensión de la vivienda. Utilización de nanopartículas magnéticas Fe3O4 y ozono para la degradación/eliminación de azul de metileno en agua residual textil. Estudio paramétrico de un modelo numérico Fem de un ensayo CBR. ¿Cómo construir identidad de manera incluyente a partir del reconocimiento de patrimonio cultural construido?. Veracidad de los resultados del ensayo de penetración dinámica de CONO(PDC). Análisis de texto a partir del procesamiento de lenguaje natural para identificar sintomatología depresiva en redes sociales. Análisis de texto para la detección de depresión en comentarios de usuarios de la red social Instagram. Diseño y desarrollo de un videojuego para evaluar la interacción de las redes atencionales en la sintomatología depresiva. Herramienta tecnológica para el apoyo en la detección de sintomatología ansiosa en jóvenes. Optimización del despliegue de aplicaciones web a partir de computación en nube sin servidor. Prototipo alfa de un videojuego serio para el apoyo en la detección de sintomatología depresiva en adultos jóvenes. La importancia de la visualización de datos en la era del Big Data y sus herramientas. Prototipo de sensor para el registro electroencefalográfico. Prototipo de un algoritmo basado en inteligencia artificial para el apoyo a especialistas en el diagnóstico del Alzheimer. Evaluación posocupacional del confort térmico en la vivienda social: análisis de una revisión sistemática prisma desde el diseño resiliente. Inteligencia artificial, problema u oportunidad para el Derecho. Impacto en el empleo en relación con las TIC y la inteligencia artificial. Neuroprivacidad. El test de asociación implícita, un paradigma que permite abordar nuestras actitudes inconscientes. ¿Cuál es el límite del uso de las tecnologías frente al derecho de información y de la libre expresión?. Tendencias de fijación de precios basados en el valor: un análisis desde la minería de datos. Recorrido virtual de la Universidad Católica de Colombia Sede Claustro para la inducción de estudiantes y docentes. Introducción a la bioarquitectura del paisaje, cartilla Paisaje, ambiente y tecnología. Descripción plan piloto (Choachí). Caracterización de las habilidades específicas para el reconocimiento del patrimonio cultural – Borde urbano sur oriental de Bogotá. Videojuego para estimular la memoria episódica en pacientes con deterioro cognitivo leve: validación de contenido. CONCLUSIONESTercera edició

Rayas de agua dulce (Potamotrygonidae) de Suramérica. Parte II. Colombia, Brasil, Perú, Bolivia, Paraguay, Uruguay y Argentina

El libro es la continuación de una iniciativa de hace ya unos años (2012), donde varios países del área de distribución de la familia, decidieron unirse al ver como este recurso estaba disminuyendo o bien, era prácticamente desconocido. Este grupo tiene un gran impacto principalmente por su importancia como recurso pesquero ornamental, aunque también se usa como alimento, en la pesca deportiva y tiene incidencia en la salud pública. Para poder mitigar la posible sobreexplotación, surgió la necesidad de regular el comercio e intentar convertir la pesca ornamental de rayas en una actividad sostenible. Por ello, desde 2012 el IAvH junto a varios países propusieron la inclusión de varias especies al Apéndice III de Cites. Una de las limitantes de esta propuesta y por la cual no prosperó en su inicio, fue la falta de información sobre las especies.Bogotá, D. C