Detecção molecular e análise filogenética da sequência parcial do gene da proteína do capsídeo do vírus da faixa das nervuras do morangueiro

The cultivated strawberry, Fragaria x ananassa Duch. (Rosaceae) is a hybrid from the crossing of American species Fragaria chiloensis and Fragaria virginiana, belonging to the Rosaceae family. Strawberry plants have vegetative reproduction and, therefore, it is common the propagation of viruses and other diseases. One of the four most important viruses in strawberry is the Strawberry vein banding virus (SVBV), which is transmitted by aphids in a semi-persistent manner. Molecular techniques are recommended to improve genome knowledge and classification of the SVBV isolates. The coat protein (CP) is a primary determinant of aphid transmissibility and specificity, critically important to infection establishment. In the present work, we sequenced the SVBV coat protein partial gene of a German strain, inoculated in strawberry plants maintained in green house in Brazil for ten years. It was performed phylogenetic analysis comparing to SVBV coat protein sequences from the GenBank database. Aiming to elucidate evolutionary relationships in this species, phylogenetic analysis showed that our SVBV sequence is closely related to USA and Egypt virus strains. These results will contribute to a better elucidation of evolutionary mechanisms and the SVBV-strawberry pathosystem in question.O morango cultivado (Fragaria x ananassa Duch. (Rosaceae) é um híbrido originado pelo cruzamento das espécies americanas Fragaria chiloensis e Fragaria virginiana e pertence à família Rosaceae. O morangueiro possui reprodução vegetativa e, por isso, é comum o acúmulo de viroses e outras doenças de difícil controle. Uma das quatro viroses mais importantes na cultura do morango é causada pelo vírus da faixa das nervuras (Strawberry vein banding virus – SVBV), que é transmitido no campo por afídeos, de maneira semipersistente. Para melhorar o conhecimento genômico, são recomendadas técnicas moleculares e a classificação de isolados de SVBV. Um dos determinantes primários da transmissibilidade e especificidade por afídeos é a proteína do capsídeo, que possui importância crítica para o estabelecimento da infecção. Neste trabalho, foi sequenciada parcialmente a proteína do capsídeo do gene do SVBV de um isolado alemão, inoculado em morangueiros e mantido em casa de vegetação no Brasil, por mais de dez anos. Foi realizada a análise filogenética comparando as sequências contidas no GenBank com o objetivo de elucidar as relações evolutivas nesta espécie. As análises filogenéticas mostraram que a sequência do isolado está mais próxima dos isolados dos EUA e Egito. Estes resultados contribuem para a melhor elucidação dos mecanismos de evolução do vírus e do patossistema em questão

Morfo-histodiferenciação de culturas nodulares de morangueiro (Fragaria ananassa x Duch.) e análise molecular do "vírus da faixa das nervuras do morangueiro"

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2018.O morango é uma fruta amplamente consumida por seu aroma único, sabor adocicado, coloração e pelo seu valor nutricional. A produção do morangueiro gera grande rentabilidade econômica para os pequenos agricultores e tem expressiva relevância na pequena agricultura familiar do Estado de SC. Para uma produção de alta qualidade atributos associados ao valor genético e qualidade sanitária são fundamentais. Para a produção de mudas de morangueiro é recomendada a aquisição de plantas matrizes oriundas de técnicas de micropropagação. Estas técnicas permitem a produção massal de mudas com alta qualidade genética e fitossanitária. A cultura do morangueiro é atingida por cerca de 26 vírus e similares, sendo os vírus com maior importância no Brasil: vírus da clorose marginal, vírus do encrespamento, vírus da faixa-das-nervuras e vírus do mosqueado. Esses vírus também são relatados como os mais importantes nas áreas produtoras dos EUA. Atualmente o método mais utilizado para a detecção de viroses em morangueiro é a RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction), baseada em métodos moleculares. Porém ainda existem alguns problemas a cerca da detecção, devido a grande dificuldade de extração em morangueiro e amplificação de fragmentos virais fazendo com que os métodos sejam muitas vezes imprecisos e ineficazes. Desta forma, para a produção de mudas com alto padrão genético e fitossanitário, é necessário que sejam desenvolvidos protocolos eficazes de micropropagação de morangueiro e detecção eficiente das principais viroses que acometem essa cultura. Com isso o objetivo do trabalho foi o de estudar a indução de culturas nodulares de morangueiro Fragaria x ananassa Duch. e caracterizar filogeneticamente através de técnicas moleculares o vírus SVBV.Abstract : Strawberry is a fruit widely consumed for its unique aroma, sweet taste, coloring and for its nutritional value. Strawberry production generates great economic for small farmers and has high demand from the consumer market. For this reason, there is needed high quality fruit for commercialization, seedlings of high standard and in sufficient quantity because demand. In the production of strawberry seedlings is recommended the acquisition of matrices originating from micropropagation techniques. These techniques allow the mass production of seedlings with high genetic and phytosanitary quality, meeting the standards required for the production of strawberry matrices. The problem with viruses is not of great importance for plants propagated through seeds, but is aggravated when it comes to vegetative propagation, making up one of the main phytosanitary problems for the production of high quality and quantity seedlings. The strawberry crop is affected by about 26 viruses and the like, being the most important viruses in Brazil: strawberry mild yellow edge virus, strawberry crinkel virus, strawberry vein banding virus and strawberry mottle virus. These viruses are also reported as the most important in the USA producing areas. Currently the most widely used method for the detection of strawberry virus is the RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction), based on molecular methods. However, there are still some problems about detection, due to the great difficulty of extraction in strawberry and amplification of viral fragments making the methods are often imprecise and ineffective. Thus, for the production of seedlings with high genetic and phytosanitary standards, it is necessary to develop efficient protocols for micropropagation of strawberry and efficient detection of the main viruses that affect this crop. The objective of the work was to study the induction of nodular cultures of strawberry Fragaria x ananassa Duch. and characterize phylogenetically through molecular techniques the SVBV virus

Detecção molecular e análise filogenética da sequência parcial do gene da proteína do capsídeo do vírus da faixa das nervuras do morangueiro

O morango cultivado (Fragaria x ananassa Duch. (Rosaceae) é um híbrido originado pelo cruzamento das espécies americanas Fragaria chiloensis e Fragaria virginiana e pertence à família Rosaceae. O morangueiro possui reprodução vegetativa e, por isso, é comum o acúmulo de viroses e outras doenças de difícil controle. Uma das quatro viroses mais importantes na cultura do morango é causada pelo vírus da faixa das nervuras (Strawberry vein banding virus – SVBV), que é transmitido no campo por afídeos, de maneira semipersistente. Para melhorar o conhecimento genômico, são recomendadas técnicas moleculares e a classificação de isolados de SVBV. Um dos determinantes primários da transmissibilidade e especificidade por afídeos é a proteína do capsídeo, que possui importância crítica para o estabelecimento da infecção. Neste trabalho, foi sequenciada parcialmente a proteína do capsídeo do gene do SVBV de um isolado alemão, inoculado em morangueiros e mantido em casa de vegetação no Brasil, por mais de dez anos. Foi realizada a análise filogenética comparando as sequências contidas no GenBank com o objetivo de elucidar as relações evolutivas nesta espécie. As análises filogenéticas mostraram que a sequência do isolado está mais próxima dos isolados dos EUA e Egito. Estes resultados contribuem para a melhor elucidação dos mecanismos de evolução do vírus e do patossistema em questão.</jats:p

Reproductive Biology of Varronia curassavica Jacq. (Boraginaceae)

ABSTRACT Varronia curassavica, a subshrubby medicinal species associated with restinga in the Atlantic Forest, has been exploited by local people and the pharmaceutical industry. Indeed, restingas have experienced a continuous process of degradation, and thus, with species and ecosystem both at risk, efforts to support conservation actions are required. The present study aimed to evaluate aspects of V. curassavica reproductive biology. To accomplish this, morphological characterization was performed by monitoring flowering events. The availability of nectar and pollen, as well as the frequency and behavior of floral visitors and dispersers, was also evaluated. This species exhibits both heterostyly and protogyny. Anthesis is diurnal, and flowers last less than a day. The high number of flower and fruit abortions suggests that mechanisms, such as self-incompatibility intra-morphs and easily detached flowers, contribute to reduced fruit production. The high diversity of floral visitors indicate a generalist pollination syndrome. Diptera, Hymenoptera and Lepidoptera were the main pollinators, and nectar was the main resource sought by these insects. Fruits were dispersed by birds and ants. It can be concluded that the interaction of V. curassavica with several species is a key factor in its own survival and for maintaining the biological diversity of restinga