Population status of Centrolene savagei (Anura: Centrolenidae) in the Western and Central Andes of Colombia

determinar el estado de las poblaciones de Centrolene savagei (Centrolenidae) in la cordillera central y occidental de los Andes colombianos. Alcance: promover el estudio de las poblaciones de especies endémicas de ranas de cristal en Colombia. Metodología: C. savagei (Centrolenidae) ha sido registrada únicamente en la cordillera central y occidental de los Andes Colombianos. Realizamos muestreos por encuentro visual en ocho localidades en donde C. savagei ha sido previamente registrada: Alto Bonito, Florencia, La Pastora, Santa Rosa de Cabal, Filandia, Boquía, Alto el Otoño and Chicoral, con un esfuerzo efectivo de muestreo de 54 h por localidad. Cada individuo capturado fue marcado y sexado, registrando la altura sobre el nivel de agua de su percha. Además, todas las posturas detectadas durante cada muestreo también fueron marcadas y se registró su altura sobre el nivel del agua. Utilizamos un modelo estándar de captura-recaptura para estimar el tamaño de la población en cada uno de los sitios de estudio asumiendo condicione de población cerrada. Principales resultados: C. savagei estuvo ausente en La Pastora y Florencia. En todas las localidades en donde C. savagei fue registrada, los machos y las posturas se encontraron generalmente entre 1.5-2 m de altura, mientras que las hembras estuvieron la mayor parte del tiempo por arriba de los 6 m de altura, bajando solo para actividades reproductivas. El tamaño de la población de C. savagei en la zona de estudio del Alto del Otoño fue de 132 ± 13 ind, en Chicoral fue de 41 ± 8 ind y en Santa Rosa de Cabal fue de 37 ± 6 ind. En Filandia, Boquía y Alto Bonito, no se realizaron recapturas, por lo que no se pudo estimar el tamaño de las poblaciones. Conclusiones: La presencia de C. savagei en el 75% de las localidades donde previamente había sido reportada, sugiere que las condiciones bióticas y abióticas en estos sitios aún son adecuadas para sostener poblaciones de esta especie endémica.to determine the population status of Centrolene savagei (Centrolenidae) in the Western and Central Andes of Colombia. Scope: promotion of the population study of the endemic glassfrogs species of Colombia. Methodology: C. savagei (Centrolenidae) has only been registered in the Central and Western Andes of Colombia. We conducted a visual encounter survey in eight different localities where C. savagei was previously reported: Alto Bonito, Florencia, La Pastora, Santa Rosa de Cabal, Filandia, Boquía, Alto el Otoño and Chicoral, with an effective sampling effort of 54 h per locality. Each captured individual was marked, sexed and the height above water level of the perch was registered. Furthermore, all detected clutches in each survey were also marked and height above water level was recorded. We use a standard capture-recapture model to estimate the size of the population in each study site assuming closed population conditions. Main Results: C. savagei was absent at La Pastora and Florencia. In all localities where C. savagei was registered, male individuals and clutches were usually found between 1.5-2.0 m, while female individuals remain most of the time above 6 m height, and only go down for reproduction. The population size of C. savagei in the study area of Alto del Otoño was 132 ± 13 ind, in Chicoral was 41 ± 8 ind and in Santa Rosa de Cabal was 37 ± 6 ind. In Filandia, Boquia and Alto Bonito, recaptures were not carried out, so the size of the population could not be estimated. Conclusions: The presence of C. savagei in 75% of the localities where it had previously been reported suggests that the biotic and abiotic conditions in these sites are still adequate to sustain populations of this endemic species

Anura assemblages in three areas with human intervention in the national natural park Los Katíos (Colombia)

Se evaluó la estructura y composición de los ensamblajes de anuros en tres zonas con diferente grado de intervención humana en el PNN Los Katíos, las cuales fueron el bosque El Tendal (bosque sucesión tardía), un bosque de Teca (bosque transformado) y el Poblado Sautatá (bosque urbanizado). Se evaluó la representatividad del muestreo utilizando el estimador no paramétrico Jackknife 1, y se describió el patrón de diversidad utilizando los índices de riqueza de especie, dominancia de Simpson (Ds), equitabilidad de Pielou (J) e incertidumbre de Shannon-Wiener (H). Se utilizó la técnica de re-muestreo (bootstrapping) para comparar los atributos de diversidad establecidos, y se evaluó la similitud entre los ensamblajes mediante un análisis de agrupamiento pareado no ponderado (UPMGA) utilizando el índice de similitud de Bray-Curtis. Se registraron 507 individuos pertenecientes a 20 especies, incluidas en nueve familias y 14 géneros. Con el esfuerzo de muestreo realizado se registró el 68% de especies esperadas en el Poblado Sautatá, el 72% en el bosque de Teca y el 87% en el bosque El Tendal. La mayor riqueza, menor dominancia, mayor equitabilidad y mayor diversidad de anfibios se registró en el bosque El Tendal (13 especies; Ds = 0,22; J = 0,75; H'=1,91 bits ind-1), seguida por el bosque de Teca (10 especies; Ds = 0,22; J =0,76; H'=1,75 bits ind-1), siendo mayor la dominancia y significativamente menor la diversidad en el Poblado Sautatá (10 especies; Ds = 0,44; J = 0,55; H'=1,26 bits ind-1). Rhaebo haematiticus, Rhaebo hypomelas, Espadarana callistomma, Hypsiboas rosenbergiy, Lithobates vaillanti solo fueron capturadas en el bosque El Tendal, mientras que Smilis casordida solo fue capturada en el bosque de Teca, y Rhinella marina, Scinax boulengeri y Leptodactylus insularum en el Poblado Sautatá. La mayor diversidad y el mayor número de especies exclusivas que fueron registradas en el bosque El Tendal probablemente estén relacionados con una mayor heterogeneidad de hábitat, lo que proporciona una mayor oferta de recursos y protección contra la desecación.The structure and composition of anuran assemblages were evaluated in three zones with differing degree of human intervention at Los KatíosNational Natural Park. The zones were the forest of El Tendal (late successional forest), a forest of teak (intervened forest) and the village of Sautatá (urbanized forest). Sample representativeness was evaluated using the non-parametric estimator Jackknife 1. The diversity pattern was described using species richness indices, Simpson's dominance (Ds), Pielou's equitability (J) and Shannon-Wiener (H) uncertainty index. The assemblage attributes were compared using bootstrapping techniques and similitude among assemblages was evaluated withan UPMGA hierarchical clustering method using the Bray-Curtis index. A total of 507 individuals belonging to 20 species were recorded, including nine families and 14 genera. The sampling effort yielded 68% of expected species in the village of Sautatá, 72% of expected species in the teak plantation and 87% of expected species in El Tendal forest. The highest richness, lowest dominance, highest equitability and highest amphibian diversity were recorded at El Tendal forest (13 species; Ds = 0.22; J = 0.75; H'=1.91 bits ind-1), followed by the teak forest (10 species; Ds = 0.22; J =0.76; H'=1.75 bits ind-1). Dominance was higher and diversity was significantly lower at the village of Sautatá (10 species; Ds = 0.44; J = 0.55; H'=1.26 bits ind-1). Rhaebo haematiticus, Rhaebo hypomelas, Espadarana callistomma, Hypsiboas rosenbergi and Lithobates vaillanti were captured only at the Tendal forest, Smilis casordida was only captured at the teak forest, and Rhinella marina,Scinax boulengeri and Leptodactylus insularum were only captured at the village of Sautatá. The highest diversity and highest number of exclusive species were recorded at the El Tendal forest. This result is probably related to a higher habitat heterogeneity, which would provide a higher number of refuges and protection against desiccation for anurans

La integridad biológica como herramienta de valoración cuantitativa del estado de conservación del bosque seco en Colombia

Tropical dry forest is a critically endagered ecosystem in Colombia and more information is requierd about its dynamics, functioning and health to create effective management strategies for conservation. In this study, we use the index of biological integrity as an analytical tool to establish the conservation status of dry forest fragments and transformed natural landscapes in the middle sector of the Magdalena River Valley.  An eight level index of biological integrity was established, associated with attributes of composition, structure and scosystem function, and biodiversity and connectivity within landscape units. 615 species of flora and fauna were recorded in the study area, of which 10 are cataloged by IUCN in some level of threat. The results of the IIB classify the fragment of dry forest as in fair condition, while the silvopastoril system without management was listed as a critical habitad and the sector with mining activity was listed as a habitat in poor condition. In conclusion, the ecological attributes of the selected taxonomic groups adecquately represented the degree of local distrurbance and the IIB established could be used as a tool for analysis of the conservation status of the dry forests fragments in Colombia.El bosque seco tropical es un ecosistema críticamente amenazado en Colombia y se requiere incrementar el conocimiento sobre su dinámica, funcionamiento y salud, con el propósito de delinear estrategias de manejo para su conservación. En este trabajo se utilizó el Índice de Integridad Biológica (IIB) como herramienta analítica para establecer el estado de conservación de los fragmentos de bosque seco y ecosistemas naturales transformados en una localidad del valle medio del río Magdalena, Colombia. Se construyó un IIB de ocho niveles considerando atributos de composición, estructura y función del ecosistema, así como de biodiversidad y conectividad. En el área de estudio se registraron 615 especies de flora y fauna, de las cuales 10 se encuentran catalogadas en algún nivel de amenaza por la UICN. De acuerdo con el IIB, la zona de bosque fue clasificada como hábitat en estado regular, mientras que la zona silvopastoril sin manejo fue catalogada como hábitat en estado crítico y la zona de minería como hábitat en estado pobre. En conclusión, los grupos taxonómicos seleccionados representaron adecuadamente el grado de perturbación local y el IIB establecido podría ser utilizado como herramienta de análisis del estado de conservación de los fragmentos de bosque seco en Colombia

La integridad biológica como herramienta de valoración cuantitativa del estado de conservación del bosque seco en Colombia

El bosque seco tropical es un ecosistema críticamente amenazado en Colombia y se requiere incrementar el conocimiento sobre su dinámica, funcionamiento y salud, con el propósito de delinear estrategias de manejo para su conservación. En este trabajo se utilizó el Índice de Integridad Biológica (IIB) como herramienta analítica para establecer el estado de conservación de los fragmentos de bosque seco y ecosistemas naturales transformados en una localidad del valle medio del río Magdalena, Colombia. Se construyó un IIB de ocho niveles considerando atributos de composición, estructura y función del ecosistema, así como de biodiversidad y conectividad. En el área de estudio se registraron 615 especies de flora y fauna, de las cuales 10 se encuentran catalogadas en algún nivel de amenaza por la UICN. De acuerdo con el IIB, la zona de bosque fue clasificada como hábitat en estado regular, mientras que la zona silvopastoril sin manejo fue catalogada como hábitat en estado crítico y la zona de minería como hábitat en estado pobre. En conclusión, los grupos taxonómicos seleccionados representaron adecuadamente el grado de perturbación local y el IIB establecido podría ser utilizado como herramienta de análisis del estado de conservación de los fragmentos de bosque seco en Colombia

Parasites associated with Ophidia of the Colombian Pacific

This study describes the diversity of parasites in ophidian species from four ecoregions of Valle del Cauca and Gorgona Island (Colombian Pacific). For this, samples from necropsies, blood and feces were collected from 37 snakes belonging to the species Bothrops asper (terrestrial), Leptodeira annulata (semiarboreal), Imantodes cenchoa (arboreal), Sibon nebulatus (arboreal), Boa constrictor (semiarboreal), Clelia clelia (terrestrial), Mastigodryas boddaerti (terrestrial) and Micrurus mipartitus (terrestrial). Parasite detection was performed using stereoscopic and optical microscopy, and/or concentration and staining methods depending on the sample type; parasites were identified by morphological keys. Eleven snakes (29.7%) belonging to four species were infected with at least one of seven parasite taxa identified (six nematodes and one hemoparasite). Among nematodes, the families Rhabditidae and Oxyuridae, and the genus Kalicephalus were found for the first time in L. annulata. Worms of the order Strongylida, and the genera Kalicephalus and Ophidascaris were identified in B. asper. Hepatozoon spp. (hemoparasite) presented the highest prevalence of infection, which was only infecting arboreal and semi-arboreal snakes (L. annulata, I. cenchoa and B. constrictor), showing in addition morphological variability of the gametocytes. Our findings suggest that transmission of this parasite may be associated with snake habits and lifestyle.El presente estudio describe la diversidad de endoparásitos en ocho especies de ofidios de las cuatro ecorregiones del Valle del Cauca e Isla Gorgona en Colombia. Para la detección e identificación de parásitos, se obtuvieron muestras de sangre, materia fecal, órganos y tejidos de 37 serpientes pertenecientes a las especies Bothrops asper (terrestre), Leptodeira annulata (semi-arborícola), Imantodes cenchoa (arborícola), Sibon nebulatus (arborícola), Boa constrictor (semi-arborícola), Clelia clelia (terrestre), Mastigodryas boddaerti (terrestre) y Micrurus mipartitus (terrestre). La búsqueda e identificación de parásitos se realizó mediante el uso de microscopia óptica y esteroscópica, y/o métodos de concentración y coloración dependiendo del tipo de muestra; los parásitos fueron identificados mediante claves morfológicas. Once serpientes (29,7%) pertenecientes a cuatro especies estuvieron infectadas con al menos uno de siete taxones parásitos identificados (seis nematodes y un hemoparásito). Entre los nematodes se reportan por primera vez las familias Rhabditidae y Oxyuridae y el género Kalicephalus en L. annulata; en B. asper se identificaron parásitos del orden Strongylida y de los géneros Kalicephalus y Ophidascaris. Hepatozoon spp. (hemoparásito) presentó la prevalencia de infección más elevada, y sólo se halló en I. cenchoa, L. annulata y B. constrictor, de hábitos arbóreo y semiarbóreo, evidenciándose además variabilidad morfológica de los gametocitos. Los hallazgos indican que la transmisión de esta parasitosis puede estar relacionada con el hábito y modo de vida de estas serpientes.Asociación Parasitológica Argentin

The role of Central American barriers in shaping the evolutionary history of the northernmost glassfrog, Hyalinobatrachium fleischmanni (Anura: Centrolenidae)

The complex geological history of Central America has been useful for understanding the processes influencing the distribution and diversity of multiple groups of organisms. Anurans are an excellent choice for such studies because they typically exhibit site fidelity and reduced movement. The objective of this work was to identify the impact of recognized geographic barriers on the genetic structure, phylogeographic patterns and divergence times of a wide-ranging amphibian species, Hyalinobatrachium fleischmanni. We amplified three mitochondrial regions, two coding (COI and ND1) and one ribosomal (16S), in samples collected from the coasts of Veracruz and Guerrero in Mexico to the humid forests of Chocó in Ecuador. We examined the biogeographic history of the species through spatial clustering analyses (Geneland and sPCA), Bayesian and maximum likelihood reconstructions, and spatiotemporal diffusion analysis. Our data suggest a Central American origin of H. fleischmanni and two posterior independent dispersals towards North and South American regions. The first clade comprises individuals from Colombia, Ecuador, Panama and the sister species Hyalinobatrachium tatayoi; this clade shows little structure, despite the presence of the Andes mountain range and the long distances between sampling sites. The second clade consists of individuals from Costa Rica, Nicaragua, and eastern Honduras with no apparent structure. The third clade includes individuals from western Honduras, Guatemala, and Mexico and displays deep population structure. Herein, we synthesize the impact of known geographic areas that act as barriers to glassfrog dispersal and demonstrated their effect of differentiating H. fleischmanni into three markedly isolated clades. The observed genetic structure is associated with an initial dispersal event from Central America followed by vicariance that likely occurred during the Pliocene. The southern samples are characterized by a very recent population expansion, likely related to sea-level and climatic oscillations during the Pleistocene, whereas the structure of the northern clade has probably been driven by dispersal through the Isthmus of Tehuantepec and isolation by the Motagua–Polochic–Jocotán fault system and the Mexican highlands

Composición y estructura vegetal de fragmentos de bosque seco tropical y de dos zonas con actividad antrópica en La Dorada y Victoria, Caldas

La excesiva degradación de los ecosistemas de la formación de bosque seco tropical, obliga a su inmediato estudio como estrategia para conservar la biodiversidad en Colombia. Se caracterizó la composición y estructura vegetal de fragmentos de estos ecosistemas en el Magdalena Medio, para aportar a la evaluación de su estado. Se delimitaron zonas de minería (ZM), sistema silvopastoril sin manejo (ZS) y bosque (ZB). Se ubicaron al azar 20 trayectos lineales (50x2m) por zona. Se censaron árboles, arbustos, lianas (DAP≥1cm) y también hierbas en cinco cuadrantes (1m²) por trayecto; se completó el inventario de especies con colectas libres. Se registraron 506 especies en 90 familias. Fabaceae tuvo la mayor riqueza específica en las tres zonas. Cyperaceae y Poaceae le siguieron en ZM, mientras que en ZS fueron Malvaceae y Euphorbiaceae y en ZB Rubiaceae. ZB presentó una mayor riqueza de especies y abundancia de individuos que las zonas intervenidas. ZM no tiene una estructura vertical definida, ZS presenta una composición y estructura vegetal de sitios sucesionales tempranos y ZB tiene una composición y estructura más compleja. ZB registra una mayor riqueza de especies que bosques secos al sur del valle del Magdalena, pero menor que bosques húmedos al norte, por lo que puede ser un punto de conexión ecológico potencial importante

Sustancias alternativas para el control del caracol africano (Achatina fulica) en el Valle del Cauca, Colombia

The presence of the giant African snail Achatina fulica (Bowdich 1822) was confirmed in Colombia in 2008. Due to economic and health implications of this species and the difficulties in controlling it, it is essential to establish the relevance of protocols and alternative inexpensive substances used to control the snail. In this research, the effectiveness of manual removal and manual removal with spray of calcium oxide was analyzed. Both techniques had similar efficiencies, so it is recommended that calcium oxide should be implemented only for the disposal of the collected individuals in order to reduce costs and decrease the impact on arthropofauna. In addition, we evaluated the molluscicide ability of commercial sodium hypochlorite, two plant extracts (Tabebuia rosea and Jatropha curcas), and commercial molluscicide (metaldehyde). We found that the three alternative substances were effective as molluscicides, but with lower effectiveness than the commercial substance. Implementation of the extracts of T. rosea and J. curcas is recommended because they have low cost, and do not present negative effects on the environment.La presencia del caracol gigante africano Achatina fulica (Bowdich 1822) fue confirmada en Colombia en 2008. Debido a las implicaciones económicas y sanitarias que representa esta especie, así como las dificultades de su control y el alto costo que esté representa, se ha generado la necesidad de cuantificar la efectividad de los protocolos implementados para su control y el uso de sustancias alternativas de bajo costo. En la presente investigación se analizó la eficacia de la remoción manual y la remoción manual con aspersión de cal (óxido de calcio). Ambas técnicas presentaron eficacias similares, por lo cual se recomienda que la cal solo sea implementada para la disposición final de los individuos colectados, disminuyendo costos y repercusiones en la artropofauna. Adicionalmente, se evaluó la actividad molusquicida del hipoclorito de sodio comercial y el extracto vegetal de Tabebuia rosea y Jatropha curcas, comparándose con una sustancia molusquicida comercial (metaldehído). Las tres sustancias alternativas presentaron actividad molusquicida, con una eficacia menor a la sustancia comercial. La implementación del uso de los extractos de T. rosea y J. curcas en los programas de control del caracol africano podría ser relevante, debido a su bajo costo y la ausencia de efectos ambientales negativos

Use of microhabit by anurans in an intervened dry forest fragment of the Magdalena medio area in Guarinocito, Caldas

Se compararon los ensamblajes de anuros de tres hábitats (bosque, lago y cantera) con diferente grado de perturbación antrópica presentes en un fragmento de bosque seco en la hacienda La Española, corregimiento de Guarinocito, Caldas. Se realizaron muestreos de recorridos extensivos usando el método de registro por relevamiento por encuentros visuales (REV), a partir de los cuales se registró la abundancia y uso del microhábitat para cada una de las especies dentro de los diferentes hábitats, y se realizó el registro de variables ambientales descriptoras del sitio de muestreo, tales como temperatura, humedad relativa y perímetro de espejos de agua. Se encontraron 13 especies de anuros, entre las cuales Engystomops pustulosus registró la mayor abundancia relativa, con una tasa de captura de 5,16 individuos por hora. Se registraron diferencias significativas en la diversidad entre los hábitats de estudio, siendo menor en el bosque, en donde hubo menor riqueza, pero mayor dominancia. La tasa de recambio de especies entre hábitats fue del 71%, exhibiendo Lago y Cantera la mayor similitud en composición de la anurofauna. El uso de sustrato por parte de cada especie en los diferentes hábitats registró diferencias significativas (X², p<0,05) y solo dos especies (Leptodactylus fragilis y L. colombiensis) presentaron alta variabilidad en los sustratos usados.The anuran assemblages in three habitats (forest, lake and quarry) with different degrees of human disturbance present in a dry forest fragment in the Farm La Española, Guarinocito, Caldas, were compared. Extensive routes samplings were conducted using visual encounter surveys (VES), from which abundance and microhabitat use were recorded for each one of the species within the different habitats, and the record of environmental variables describing the sampling area such as temperature, relative humidity, and water ponds perimeter, was carried out. A total of 13 anurans species were found, among which Engystomops pustulosus recorded the most relative abundance with a catch rate of 5.16 individuals per hour. Significant differences were found in diversity between the studied habitats being lower in the forest where there were lower richness but better dominance. The rate of replacement of species between habitats was 71%, showing pond and quarry the greater similarity in anurofauna composition. The use of substrate by each species was different between habitats (X², p<0.05) and only two species (Leptodactylus fragilis and L. colombiensis) showed high variability in the modified habitats

La integridad biológica como herramienta de valoración cuantitativa del estado de conservación del bosque seco en Colombia

El bosque seco tropical es un ecosistema críticamente amenazado en Colombia y se requiere incrementar el conocimiento sobre su dinámica, funcionamiento y salud, con el propósito de delinear estrategias de manejo para su conservación. En este trabajo se utilizó el Índice de Integridad Biológica (IIB) como herramienta analítica para establecer el estado de conservación de los fragmentos de bosque seco y ecosistemas naturales transformados en una localidad del valle medio del río Magdalena, Colombia. Se construyó un IIB de ocho niveles considerando atributos de composición, estructura y función del ecosistema, así como de biodiversidad y conectividad. En el área de estudio se registraron 615 especies de flora y fauna, de las cuales 10 se encuentran catalogadas en algún nivel de amenaza por la UICN. De acuerdo con el IIB, la zona de bosque fue clasificada como hábitat en estado regular, mientras que la zona silvopastoril sin manejo fue catalogada como hábitat en estado crítico y la zona de minería como hábitat en estado pobre. En conclusión, los grupos taxonómicos seleccionados representaron adecuadamente el grado de perturbación local y el IIB establecido podría ser utilizado como herramienta de análisis del estado de conservación de los fragmentos de bosque seco en Colombia.Bogotá, Colombi