62 research outputs found

    On the relevance of two manual tumor volume estimation methods for diffuse low-grade gliomas

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    International audienceManagement of Diffuse Low-Grade Glioma (DLGG) relies extensively on tumor volume estimation from MRI datasets. Two methods are currently clinically used to define this volume: the commonly used three-diameters solution and the more rarely used software-based volume reconstruction from the manual segmentations approach. We conducted an initial study of inter-practitioners' variability of software-based manual segmentations on DLGGs MRI datasets. A panel of 13 experts from various specialties and years of experience delineated 12 DLGGs' MRI scans. A statistical analysis on the segmented tumor volumes and pixels indicated that the individual practitioner, the years of experience and the specialty seem to have no significant impact on the segmentation of DLGGs. This is an interesting result as it had not yet been demonstrated and as it encourages cross-disciplinary collaboration. Our second study was with the three-diameters method, investigating its impact and that of the software-based volume reconstruction from manual segmentations method on tumor volume. We relied on the same dataset and on a participant from the first study. We compared the average of tumor volumes acquired by software reconstruction from manual segmentations method with tumor volumes obtained with the three-diameters method. We found that there is no statistically significant difference between the volumes estimated with the two approaches. These results correspond to non-operated and easily delineable DLGGs and are particularly interesting for time-consuming CUBE MRIs. Nonetheless, the three-diameters method has limitations in estimating tumor volumes for resected DLGGs, for which case the software-based manual segmentation method becomes more appropriate

    Evaluation statistique de la segmentation manuelle de données IRM de gliomes diffus de bas grade

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    National audienceLes gliomes diffus de bas grade sont des tumeurs cérébrales primitives rares des adultes. La segmentation manuelle est essentielle pour le suivi des patients atteints de cette tumeur et pour le choix du traitement optimal. Cette méthode étant chronophage, il semble difficile de l'inclure dans la routine clinique. La segmentation automatique apparaît donc comme une solution potentielle pour répondre à cette problématique. Cependant, les algorithmes actuels de segmentation automatique n'ont pas encore prouvé leur efficacité pour les gliomes diffus de bas grade en raison de la spécificité de ce type de tumeurs. De ce fait, la segmentation manuelle demeure, aujourd'hui, la seule vérité terrain dans ce domaine. Une alternative pour contourner la perte en temps liée à la segmentation manuelle serait de partager la tâche entre différents praticiens, à condition que cette dernière soit reproductible. Le but de notre travail est d'évaluer la reproductibilité de la segmentation manuelle des examens IRM de gliomes diffus de bas grade, en fonction des praticiens, de leur expérience et de leur spécialité. Dans ce travail, nous avons conduit une étude statistique sur les volumes tumoraux d'un panel de 14 experts ayant manuellement segmenté 12 examens IRM de gliomes diffus de bas grade en utilisant le logiciel OsiriX. La plupart des études de segmentation de tumeurs cérébrales publiées mélangent différents types de tumeurs et comparent la segmentation automatique à la segmentation manuelle. Notre étude, au contraire, se focalise uniquement sur les gliomes diffus de bas grade et sur leur segmentation manuelle, car ce sont les plus difficiles à délimiter en raison de leur nature invasive. Une analyse statistique a fourni des résultats prometteurs en démontrant que les facteurs praticien, spécialité médi-cale et nombre d'années d'expérience n'ont pas d'impact significatif sur les valeurs moyennes de la variable volume tumoral

    Statistical evaluation of manual segmentation of a diffuse low-grade glioma MRI dataset

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    International audienceSoftware-based manual segmentation is critical to the supervision of diffuse low-grade glioma patients and to the optimal treatment’s choice. However, manual segmentationbeing time-consuming, it is difficult to include it in the clinicalroutine. An alternative to circumvent the time cost of manualsegmentation could be to share the task among different practitioners, providing it can be reproduced. The goal of our work is to assess diffuse low-grade gliomas’ manual segmentation’s reproducibility on MRI scans, with regard to practitioners, their experience and field of expertise. A panel of 13 experts manually segmented 12 diffuse low-grade glioma clinical MRI datasets using the OSIRIX software. A statistical analysis gave promising results, as the practitioner factor, the medical specialty and the years of experience seem to have no significant impact on the average values of the tumor volume variable

    Predictive models for diffuse low-grade glioma patients under chemotherapy

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    International audienceDiffuse low-grade gliomas are rare primitive cerebral tumours of adults. These tumors progress continuously over time and then turn to a higher grade of malignancy associated with neurological disability, leading ultimately to death. Tumour size is one of the most important prognostic factors. Thus, it is of great importance to be able to assess the volume of the tumor during the patients’ monitoring.MRI is nowadays the recommended modality to achieve this. Furthermore, if surgery remains the first option for diffuse low-grade gliomas, chemotherapy is increasingly used (before or after a possible surgery). However, crucial and difficult questions remain to be answered: identifying subgroups ofpatients who could benefit from chemotherapy, determining the best time to initiate chemotherapy, defining the duration of chemotherapy and evaluating the optimal time to perform surgery, or otherwise radiotherapy. In this study, we propose to help clinicians in decision-making, by designing new predictivemodels dedicated to the evolution of the diameter of the tumor. Two proposed statistical models (linear and exponential) have been validated on a database of 16 patients whose temozolomide-based chemotherapy lasted between 14 and 32 months, with an average duration of 22.8 months. The selection of the most appropriate model has been achieved with the corrected Akaike’s Information Criterion. The results are very promising, with coefficients of determination varying from 0.79 to 0.97 with an average value of 0.90 for the linear model. This shows it is possible to alert the clinician to a change in the tumor diameter’s dynamics

    Towards a decision-aid tool in the case of chemotherapy treatment for low-grade glioma

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    International audienceDiffuse low-grade gliomas are rare brain tumors of young adults. Several treatments are used by the neuro oncologist (surgery, chemotherapy, radiotherapy). Our goal is to create a decision-aid tool to ensure an individualized treatment strategy.In clinical practice, the monitoring of gliomas is based on the estimation of tumor volume, obtained from MRI. This is done either through the three diameters method, or through a manual segmentation followed by a software reconstruction ; a subjective test helped us to compare statistically the two methods. We explore also semi-automatic segmentation algorithms which seem to be a promising way.Once we studied the reliability in the calculation of the interest variable, we are interested in the modeling of the evolution of the tumor’s size, in order to help oncologists in decision making. Crucial questions include identifying subgroups of patients who could benefit from chemotherapy, determining the best time to initiate or end chemotherapy, ... Our aim is to design new predictive models dedicated to the evolution of the tumor. Preliminary but very promising results have been obtained by regression models on a database of 55 patients under neoadjuvant chemotherapy treatment. Two statistical models (linear and exponential) have been identified

    Modèles prédictifs pour les gliomes diffus de bas grade sous chimiothérapie

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    National audienceLes gliomes diffus de bas grade sont des tumeurs cérébrales primitives rares des adultes. Ces tumeurs progressent de manière continue au cours du temps et se trans-forment, par la suite, en tumeurs de grade supérieur dont la malignité est associée à un handicap neurologique et à une issue fatale. La taille de la tumeur est l'un des facteurs pronostiques les plus importants. De ce fait, il est d'une grande importance d'évaluer le volume tumoral pendant le suivi des patients. On recommande, pour ce faire, l'utilisation de l'IRM comme modalité. En outre, si la chirurgie reste la première option thérapeutique pour les gliomes diffus de bas grade, la chimiothérapie est de plus en plus utilisée (avant ou après une chirurgie potentielle). Ce-pendant, des questions cruciales et difficiles restent à ré-soudre : l'identification de sous-groupes de patients qui pourraient bénéficier de la chimiothérapie, la détermination du meilleur moment pour entamer une chimiothérapie, la définition de la durée de la chimiothérapie et l'évaluation du meilleur moment pour effectuer une chirurgie ou, le cas échéant, une radiothérapie. Dans ce travail, nous nous proposons d'aider les cliniciens dans la phase de prise de décision, en concevant de nouveaux modèles prédictifs dédiés à l'évolution du diamètre tumoral. Nous proposons deux modèles statistiques (linéaires et exponentiels) que nous avons testés sur une base de données de 16 patients dont la chimiothérapie a duré entre 14 et 32 mois, avec une durée moyenne de 22,8125 mois. Le choix du modèle le plus approprié a été réalisé avec le critère d'information d'Akaike corrigé. Les résultats sont très prometteurs, avec des coefficients de détermination, pour le modèle linéaire, variant entre 0,79 et 0,97 et une valeur moyenne de 0,90. Cela montre qu'il est possible d'alerter le clinicien sur un changement de la dynamique du diamètre tumoral

    Estimation du volume tumoral dans les gliomes diffus de bas grade à partir de la base de données nancéienne

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    Diffuse Low-grade Gliomas are rare tumors, mainly affecting young active patients (median age 40 years). In 90% of cases, first symptom is seizure. Often considered as “benign” tumors, for many years, the wait and see attitude was advocated. However, DLGGs inexorably evolve into a high-grade tumor (anaplastic transformation) on average 7-8 years, leading to death (overall survival 13-15 years). Functional surgery is the treatment of choice. this treatment imprives survival. The place of chemotherapy raises many questions concerning the timing, the duration, and its onco-functional effects. In order to specify its impact, a database of DLGG patients from CHRU Nancy has been created. The series include 339 patients with overall survival comparable to literature data. Subgroups analysis could be performed. Database implementation will be optimized in collaboration with the CHRU / TELECOM Nancy. This database integrates numerous data (clinical, radiological, anatomopathological and molecular). Modeling of the response to temozolomide chemotherapy has been studied from the database. A prediction tool has been proposed to help clinician in decision treatment. This tool was created from a data training set and could predict the evolution of tumor diameter. Longitudinal assessment of tumor volume is a central point in follow-up. This parameter is one of the parameters modulating onco-functional strategy. Different methods of tumor volume estimation (one-dimensional, two-dimensional, three-dimensional and segmentation) were analyzed, criticized (advantage / limitations) and compared. An inter-operator reproducibility test was performed revealing that manual segmentation of GDBGs is feasible, relevant and reproducible.Les Gliomes Diffus de Bas Grades sont des tumeurs rares, touchant essentiellement des patients jeunes (âge médian 40 ans), actifs. Dans 90% des cas, le symptôme révélateur est une crise épileptique . Souvent considérés comme des tumeurs « bénignes », ces tumeurs évoluent inexorablement vers une tumeur de haut grade (transformation anaplasique) en moyenne 7-8 ans, conduisant au décès des patients (survie globale 13-15 ans). Le traitement chirurgical (exérèse fonctionnelle) est le traitement de choix. La place de la chimiothérapie suscite de nombreuses interrogations concernant le timing, la durée, ses effets. Afin de préciser son impact, une base de données BDD de patients atteints d'une GDBG et suivis au CHRU de Nancy a été créée. L'analyse de la série globale (339 patients) a donné des informations de survie comparable aux données de la littérature. Des analyses de sous-groupes de patients ont pu être réalisées. La structuration de cette base est en cours d'optimisation en collaboration avec le CHRU/TELECOM Nancy. Cette BDD intègre de nombreuses données (clinique, radiologiques, anatomopathologiques et moléculaires). Des travaux de modélisation de la réponse à la chimiothérapie par témozolomide, à partir de cette BDD ont été réalisés afin de répondre aux interrogations des cliniciens. Un outil d'aide à la décision thérapeutique destiné au clinicien a été créé à partir d'un jeu d'apprentissage de données, permettant de prédire l'évolution du diamètre tumoral. L'évaluation longitudinale du volume tumoral est un point central dans le suivi des patients. Ce paramètre est un des éléments modulant la stratégie thérapeutique. Les différentes méthodes d'estimation du volume tumoral (unidimensionnelle, bidimensionnelle, tridimensionnelle et segmentation) ont été analysées, critiquées (avantage/limites) et comparées. Un test de reproductibilité inter-opérateur a été réalisé révélant que la segmentation manuelle des GDBG est faisable, pertinente et reproductible

    Estimation du volume tumoral dans les gliomes diffus de bas grade à partir de la base de données nancéienne

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    Diffuse Low-grade Gliomas are rare tumors, mainly affecting young active patients (median age 40 years). In 90% of cases, first symptom is seizure. Often considered as “benign” tumors, for many years, the wait and see attitude was advocated. However, DLGGs inexorably evolve into a high-grade tumor (anaplastic transformation) on average 7-8 years, leading to death (overall survival 13-15 years). Functional surgery is the treatment of choice. this treatment imprives survival. The place of chemotherapy raises many questions concerning the timing, the duration, and its onco-functional effects. In order to specify its impact, a database of DLGG patients from CHRU Nancy has been created. The series include 339 patients with overall survival comparable to literature data. Subgroups analysis could be performed. Database implementation will be optimized in collaboration with the CHRU / TELECOM Nancy. This database integrates numerous data (clinical, radiological, anatomopathological and molecular). Modeling of the response to temozolomide chemotherapy has been studied from the database. A prediction tool has been proposed to help clinician in decision treatment. This tool was created from a data training set and could predict the evolution of tumor diameter. Longitudinal assessment of tumor volume is a central point in follow-up. This parameter is one of the parameters modulating onco-functional strategy. Different methods of tumor volume estimation (one-dimensional, two-dimensional, three-dimensional and segmentation) were analyzed, criticized (advantage / limitations) and compared. An inter-operator reproducibility test was performed revealing that manual segmentation of GDBGs is feasible, relevant and reproducible.Les Gliomes Diffus de Bas Grades sont des tumeurs rares, touchant essentiellement des patients jeunes (âge médian 40 ans), actifs. Dans 90% des cas, le symptôme révélateur est une crise épileptique . Souvent considérés comme des tumeurs « bénignes », ces tumeurs évoluent inexorablement vers une tumeur de haut grade (transformation anaplasique) en moyenne 7-8 ans, conduisant au décès des patients (survie globale 13-15 ans). Le traitement chirurgical (exérèse fonctionnelle) est le traitement de choix. La place de la chimiothérapie suscite de nombreuses interrogations concernant le timing, la durée, ses effets. Afin de préciser son impact, une base de données BDD de patients atteints d'une GDBG et suivis au CHRU de Nancy a été créée. L'analyse de la série globale (339 patients) a donné des informations de survie comparable aux données de la littérature. Des analyses de sous-groupes de patients ont pu être réalisées. La structuration de cette base est en cours d'optimisation en collaboration avec le CHRU/TELECOM Nancy. Cette BDD intègre de nombreuses données (clinique, radiologiques, anatomopathologiques et moléculaires). Des travaux de modélisation de la réponse à la chimiothérapie par témozolomide, à partir de cette BDD ont été réalisés afin de répondre aux interrogations des cliniciens. Un outil d'aide à la décision thérapeutique destiné au clinicien a été créé à partir d'un jeu d'apprentissage de données, permettant de prédire l'évolution du diamètre tumoral. L'évaluation longitudinale du volume tumoral est un point central dans le suivi des patients. Ce paramètre est un des éléments modulant la stratégie thérapeutique. Les différentes méthodes d'estimation du volume tumoral (unidimensionnelle, bidimensionnelle, tridimensionnelle et segmentation) ont été analysées, critiquées (avantage/limites) et comparées. Un test de reproductibilité inter-opérateur a été réalisé révélant que la segmentation manuelle des GDBG est faisable, pertinente et reproductible

    Tumor volume estimation of Diffuse Low-Grade Gliomas from the CHRU Nancy database

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    Les Gliomes Diffus de Bas Grades sont des tumeurs rares, touchant essentiellement des patients jeunes (âge médian 40 ans), actifs. Dans 90% des cas, le symptôme révélateur est une crise épileptique . Souvent considérés comme des tumeurs « bénignes », ces tumeurs évoluent inexorablement vers une tumeur de haut grade (transformation anaplasique) en moyenne 7-8 ans, conduisant au décès des patients (survie globale 13-15 ans). Le traitement chirurgical (exérèse fonctionnelle) est le traitement de choix. La place de la chimiothérapie suscite de nombreuses interrogations concernant le timing, la durée, ses effets. Afin de préciser son impact, une base de données BDD de patients atteints d'une GDBG et suivis au CHRU de Nancy a été créée. L'analyse de la série globale (339 patients) a donné des informations de survie comparable aux données de la littérature. Des analyses de sous-groupes de patients ont pu être réalisées. La structuration de cette base est en cours d'optimisation en collaboration avec le CHRU/TELECOM Nancy. Cette BDD intègre de nombreuses données (clinique, radiologiques, anatomopathologiques et moléculaires). Des travaux de modélisation de la réponse à la chimiothérapie par témozolomide, à partir de cette BDD ont été réalisés afin de répondre aux interrogations des cliniciens. Un outil d'aide à la décision thérapeutique destiné au clinicien a été créé à partir d'un jeu d'apprentissage de données, permettant de prédire l'évolution du diamètre tumoral. L'évaluation longitudinale du volume tumoral est un point central dans le suivi des patients. Ce paramètre est un des éléments modulant la stratégie thérapeutique. Les différentes méthodes d'estimation du volume tumoral (unidimensionnelle, bidimensionnelle, tridimensionnelle et segmentation) ont été analysées, critiquées (avantage/limites) et comparées. Un test de reproductibilité inter-opérateur a été réalisé révélant que la segmentation manuelle des GDBG est faisable, pertinente et reproductible.Diffuse Low-grade Gliomas are rare tumors, mainly affecting young active patients (median age 40 years). In 90% of cases, first symptom is seizure. Often considered as “benign” tumors, for many years, the wait and see attitude was advocated. However, DLGGs inexorably evolve into a high-grade tumor (anaplastic transformation) on average 7-8 years, leading to death (overall survival 13-15 years). Functional surgery is the treatment of choice. this treatment imprives survival. The place of chemotherapy raises many questions concerning the timing, the duration, and its onco-functional effects. In order to specify its impact, a database of DLGG patients from CHRU Nancy has been created. The series include 339 patients with overall survival comparable to literature data. Subgroups analysis could be performed. Database implementation will be optimized in collaboration with the CHRU / TELECOM Nancy. This database integrates numerous data (clinical, radiological, anatomopathological and molecular). Modeling of the response to temozolomide chemotherapy has been studied from the database. A prediction tool has been proposed to help clinician in decision treatment. This tool was created from a data training set and could predict the evolution of tumor diameter. Longitudinal assessment of tumor volume is a central point in follow-up. This parameter is one of the parameters modulating onco-functional strategy. Different methods of tumor volume estimation (one-dimensional, two-dimensional, three-dimensional and segmentation) were analyzed, criticized (advantage / limitations) and compared. An inter-operator reproducibility test was performed revealing that manual segmentation of GDBGs is feasible, relevant and reproducible

    Effects of Carbidopa Premedication on 18F-FDOPA PET Imaging of Glioma: A Multiparametric Analysis

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    Purpose: This study aimed to determine the impact of carbidopa premedication on static, dynamic and radiomics parameters of 18F-FDOPA PET in brain tumors. Methods: The study included 54 patients, 18 of whom received carbidopa, who underwent 18F-FDOPA PET for newly diagnosed gliomas. SUV-derived, 105 radiomics features and TTP dynamic parameters were extracted from volumes of interest in healthy brains and tumors. Simulation of the effects of carbidopa on time-activity curves were generated. Results: All static and TTP dynamic parameters were significantly higher in healthy brain regions of premedicated patients (ΔSUVmean = +53%, ΔTTP = +48%, p < 0.001). Furthermore, carbidopa impacted 81% of radiomics features, of which 92% correlated with SUVmean (absolute correlation coefficient ≥ 0.4). In tumors, premedication with carbidopa was an independent predictor of SUVmean (ΔSUVmean = +52%, p < 0.001) and TTP (ΔTTP = +24%, p = 0.025). All parameters were no longer significantly modified by carbidopa premedication when using ratios to healthy brain. Simulated data confirmed that carbidopa leads to higher tumor TTP values, corrected by the ratios. Conclusion: In 18F-FDOPA PET, carbidopa induces similarly higher SUV and TTP dynamic parameters and similarly impacts SUV-dependent radiomics in healthy brain and tumor regions, which is compensated for by correcting for the tumor-to-healthy-brain ratio. This is a significant advantage for multicentric study harmonization
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