Epigenetikai összetevők szerepe embrionális őssejtek differenciációjában = The role of epigenetic components in the differentiation of embrionic stem cells

Az elmúlt évek során a pályázat keretében részletesem vizsgáltuk, a PRMT1 és az arginin metiláció szerepét az őssejtek differenciációjában. Az elvégzett kísérletek szerint a PRMT1 hiányos egér embrionális őssejtek bár eltérnek a vad típusú őssejtektől, ez az eltérés nem jelenti a differenciációs képesség eltünését. Ez az eredmény ellentmond az eredetileg megfoglamazott hipotézisünknek és néhány publikált adatnak is. Ennek ellenére kiterjedt és alapos vizsgálataink szerint a PRMT1 hiányos sejtek képesek a három csíra vonal sejtdifferenciációs programjait végigjárni. Eredményeink alapján a fehérjék arginin metilációja PRMT1 hiányában jelentősen csökken és ez a hiány sejtszintű zavarokhoz vezethet (pl sejt migracio). Ez okozhatja a PRMT1 hiányos embrio pusztulását. | During our studies we analysed in details the role of PRMT1 and arginine methylation in the differentiation of mouse embryonic stem cells. Based on the performed experiments we can conclude that, although PRMT1 null mouse embryonic stem cells show dstinct features from wild type embryonic stem cells, their differentiation capacity is not changed signifficantly. This result is contradicting our original hypothesis and some of the published data in the literature. Our results show that PRMT1 null cells can differentiate along all the three differentiation pathways. The methylation of proteins is significantly altered by the silencing of PRMT1 and this might cause changes on cellular level (e.g. migration). This effects might be responsible for the deat of PRMT1 null embryos

NR2F2 Orphan Nuclear Receptor is Involved in Estrogen Receptor Alpha-Mediated Transcriptional Regulation in Luminal-A Breast Cancer Cells

K

Magreceptorok működésének genomszintü vizsgálata kromatin immunprecipitációval primer humán immun sejtekben = Decoding nuclear hormone receptor activity using chromatin immunoprecipitation in human primary immune cells

A kutatómunka során szisztematikusan feltérképeztük az un RXR heterodimer típusú receptorok szerepét a humán monocita eredetű dendritikus sejtek differenciálódása és immunfunkciói során. Ezek a receptorok a PPARg, LXR, VDR és RAR receptorok volta, melyeket kiegészítettünk az RXR receptorral is. A specikus utvonalak azonosítása mellett általános megállapításként elmondhattuk, hogy ez a receptorcsalad olyan molekuláris szenzorként működik, mely képes átprogramozni a sejt genkifejeződését külső és belső lipid szintek változása során. Összefüggést talaltunk az IL4 STAT6-on kerestüli szignalizációja és a PPARg receptor között és legújabban feltérképeztük a az RXR receptor genomi kötőhelyeit ls cisztromikus kölcsönhatásait is. | During our work we have systematically mapped the so called RXR heterodimeric receptors roles in monocyte derived dendritic cells during differentiation and immune function. These receptors included PPARg, LXR, VDR and RXR and also included their heterodimeric partner RXR. Based on the data obtained one can conclude that besides the specialized pathways identified, these receptors act as molecular sensors in detecting changing extra and intracellular lipid levels. We have also identified an interaction between IL4 mediated STAT6 signaling and PPARg and most recently we have detrained the RXR cistrome and its interactions

Lyophilized human cells stored at room temperature preserve multiple RNA species at excellent quality for RNA sequencing

K

Alternatively Constructed Estrogen Receptor Alpha-Driven Super-Enhancers Result in Similar Gene Expression in Breast and Endometrial Cell Lines

L

Extensive epigenetic and transcriptomic variability between genetically identical human B-lymphoblastoid cells with implications in pharmacogenomics research

L