Enhancing resistance to Vibrio aestuarianus in Crassostrea gigas by selection

Ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) and Vibrio aestuarianus are the two main pathogens affecting the production of French oyster (Crassostrea gigas). The absence of genetic correlation between the two diseases is promising for the development of stocks with dual resistance. Using unselected and selected oysters concerning enhanced resistance to OsHV-1 infection, we investigated the first generation of mass selection and the response to selection to increase the resistance to V. aestuarianus for two stocks. For each stock, four groups were produced in June 2013 using either parents unchallenged with the bacteria or counterparts that survived experimental infections by the bacteria. Thus, groups were unselected oysters for both pathogens, selected for either the virus or the bacteria, and dually selected for both pathogens. All groups of each stock were evaluated at the spat and juvenile sizes following experimental infection by V. aestuarianus in May 2014. Regardless of their level of selection for OsHV-1, oysters produced from parents that survived V. aestuarianus showed similar mortalities (47% and 53% for stocks A and B, respectively) during the bacterial challenge than those produced from unchallenged parents (43% and 56%, respectively). Thus, no positive response to selection at the first generation to increase the bacterial resistance was found at the spat and juvenile sizes. At the adult stage and with experimental infection with V. aestuarianus, only stock B showed a positive response to selection for increasing the bacterial resistance with a decrease in mortality of 14% in comparison with unselected oysters. Similar results were observed when oysters were tested for 27 months in the field with the absence of response to selection for stock A, while a 13% decrease in mortality was observed for stock B. For stock B, mortality at endpoint after 27 months in the field reached 89% for the control not selected at all, decreased to 84% for oysters selected for their resistance to the bacteria, was 53% for the oysters selected for their resistance to OsHV-1, and was 32% for oysters selected for dual resistance. Realized heritability estimated at the first generation of mass selection for stock B was higher for oysters selected for dual resistance, ranging from 0.47 to 0.80, than those only selected for V. aestuarianus, ranging from 0.05 to 0.30. Selection for dual resistance in C. gigas could limit the impact of both OsHV-1 and V. aestuarianus on oyster production

Topographie, représentation et analyse morphologique 3D de drains, de conduits et de parois du Karst

L'analyse morphologique des drains, des conduits et des parois du karst passe traditionnellement par des représentations graphiques 2D (plan et coupes) qui ne rendent pas toujours compte de la complexité géométrique de cet objet éminemment 3D. L'apparition et la démocratisation d'outils informatiques, de traitement et de rendu 3D permettent aujourd'hui de revisiter cette analyse morphologique. Les relevés souterrains filaires (coordonnées polaires successives) sont désormais traités en squelette 3D. De même les relevés lasergrammétriques permettent maintenant de générer des modèles denses de portion de conduits ou de parois. Après avoir présenté les différents modes de discrétisation de l'espace souterrain, nous proposons trois exemples d'application à trois échelles différentes : (i) à l'échelle du massif, avec le réseau de Foussoubie où un modèle à maille décamétrique permet de rendre compte de la géométrie des drains ; (ii) à l'échelle d'un conduit avec le réseau de Midroï où un relevé laser dense à échelle pluri-centimétrique permet de reconstituer les étapes du remplissage sédimentaire et enfin (iii) à l'échelle du panneau avec le réseau de Baume Latrône où un modèle dense à échelle millimétrique permet d'analyser la géométrie des vagues d'érosion mis en place en régime noyé

Revue systématique de la littérature relative aux facteurs de risque de mortalité des moules exploitées en France - Rapport du Conseil scientifique et technique du programme de recherche en santé des coquillages : étude éco-épidémiologique

La recherche bibliographique maximalisée réalisée dans le cadre de cette revue systématique de la littérature a permis de décrire le paysage de la connaissance existante sur les facteurs de risque de mortalité des espèces de moules M. edulis et M. galloprovincialis. Ces travaux ont abouti à la formalisation d’une méthodologie rigoureuse, transparente et reproductible pour la réalisation de revue systématique relative aux facteurs de risque de mortalité chez les coquillages marins.Cette revue a décrit la diversité des définitions de la mortalité des moules et ses facteurs de risque. Elle a également permis d’apprécier la quantité et la qualité des preuves recensées. Cette revue systématique a recensé 125 facteurs étudiés pour leur relation avec la mortalité des moules par 151 études issues de 116 documents. Mais, au regard de la grande hétérogénéité des études, peu de facteurs de risque ont été finalement identifiés.Chez les deux espèces de moules exploitées en France, une variation géographique du risque de mortalité a été mise en évidence de façon globale, sans que des caractéristiques particulières du site expliquant ces variations aient été identifiées. Seule la présence de prédateurs présente une responsabilité évidente en termes de mortalités mytilicoles. De même, une variation saisonnière du risque de mortalité a été mise en évidence, sans que des conditions climatiques particulières aient été identifiées à l’exception de vagues de chaleur. L’augmentation de la température de l’eau de mer (supérieure à 24°C pour M. galloprovincialis et supérieure à 20°C pour M. edulis) était le seul facteur d’exposition commun aux deux espèces de moules et identifié de façon consensuelle comme associé à un risque de mortalité des moules accru. Chez M. galloprovincialis, les facteurs d’exposition suivants ont été identifiés de façon consensuelle comme associés à une augmentation du risque de mortalité :-l’accumulation de sable ou de sédiment sur un gisement ;-la présence de fer dans l’eau de mer ;-la présence de plomb dans l’eau de mer ;-la présence de bactéries du genre Vibrio, de l’espèce aestuarianus ou du groupe Splendidus, associée à une température de l’eau de mer élevée et en conditions d’hypoxie.Chez M. edulis, les moules issues de parents ayant naturellement survécu à un épisode de mortalité, i.e. ayant un génotype intraspécifique « sélectionné », présentaient un risque de mortalité diminué. Les facteurs suivants ont été identifiés de façon consensuelle comme associés à une augmentation du risque de mortalité :-la présence, dans la population, d’une fréquence élevée de moules présentant plus de 10 % d’anomalies cytogénétiques dans leurs cellules hémocytaires (i.e. nombre anormal de chromosomes dans les hémocytes) ;-l’augmentation de la durée d’enfouissement des animaux sur un gisement ; -une augmentation de particules sédimentaires fines et la présence de vase ;-la présence d’un agent infectieux transmissible, non identifié.Si cette revue systématique a identifié plusieurs facteurs de risque de mortalité chez les moules exploitées en France, elle n’a pas permis de hiérarchiser ces facteurs de risque, ni leurs combinaisons. Par conséquent, ce bilan des connaissances existantes n’a pas permis de répondre à la question des commanditaires relative à l’identification et à la hiérarchisation des facteurs de risque de mortalité des moules exploitées en France. Toutefois, cette synthèse pourra orienter utilement la construction d’éventuelles futures études à mener sur le terrain pour compléter la connaissance des facteurs de risque de mortalité de moules. En particulier, elle a souligné la nécessité de prise en compte et d’exploration de l’action conjointe des nombreux facteurs d’exposition intervenant de manière simultanée dans le milieu naturel.Le CST a formulé des recommandations et des propositions pour les recherches à venir, visant à identifier des facteurs de risque de mortalité de moules

Mortality of marine mussels Mytilus edulis and M. galloprovincialis: systematic literature review of risk factors and recommendations for future research

The aim of this study was to summarise the literature reporting the risk factors for mortality in the mussel species Mytilus edulis and Mytilus galloprovincialis in order to identify potential science‐based solutions to prevent or mitigate mussel mortality outbreaks. We followed the PRISMA methodology: Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta‐Analyses. The studied corpus of 91 publications (114 studies) was highly heterogeneous with respect to the methodological approaches used to define or estimate mussel mortality and the related putative risk factors. Results showed that the mortality risk of both mussel species M. edulis and M. galloprovincialis varied across the seasons, increased with an elevated seawater temperature above a thermal threshold of 20 and 24°C, respectively, decreased by protecting mussels from predation, and was associated with the presence of pathogens in M. edulis. For M. galloprovincialis, using mussel spat from the same area where the farming is carried out and farming them together with another mussel species appears to reduce the mortality risk. However, for M. edulis, this could be achieved by using pure crosses and in particular mussel spat having a selected genotype. For wild bed conservation, sand accumulation and anthropogenic sedimentation should be minimised. Our analysis showed that current approaches to this research topic are limited and are unlikely to yield actionable evidence to identify mussel mortality prevention or mitigation strategies. Therefore, recommendations are offered to increase the ability of future eco‐epidemiological research to identify multiple exposures associated with mussel mortality, underpinned by standardised efforts and cooperative initiatives

Comprendre le travail dans les “métiers adressés à autrui”

Dans ce numéro 16-1 de la revue Activités nous publions six articles, un dossier dont le titre est « Comprendre le travail dans les métiers ‘adressés à autrui’ » et, enfin, deux recensions d’ouvrage. Dans l'éditorial nous annonçons la prochaine journée d'étude dont le thème est "Espaces et temps de l'activité à l'ère de la digitalisation". Nous vous souhaitons une bonne lecture