Depressão endogâmica na produção de leite no dia do controle de bovinos Gir leiteiro

The objective of this work was to estimate the effect of inbreeding on milk yield and its persistency during lactation, in Gyr dairy cattle, as well as to determine the impact of considering or not the effect of inbreeding on the genetic evaluation of this trait. Test‑day records (89,490) for milk yield from 11,675 dairy cows at first lactation were used. The individual inbreeding coefficient, the individual increase of inbreeding, and the number of equivalent complete generations of each individual were computed. Inbreeding depression was estimated by including the effect of individual increase of inbreeding in a random regression model. The solutions for inbreeding depression, according to the class of individual increase of inbreeding and stage of lactation, ranged between ‑1.238 and ‑0.135 kg, which indicates a reduction of milk yield with the increase of inbreeding. At higher levels of inbreeding, the persistence of milk yield was reduced. The inclusion of the inbreeding effect in the genetic evaluation model did not affect the genetic parameter estimates, with practically no change of the predicted breeding values and rank of animals. The inbreeding effect can be included in the statistical model for the genetic evaluation of milk yield.O objetivo deste trabalho foi estimar o efeito da endogamia sobre a produção de leite e sua persistência durante a lactação, em bovinos Gir leiteiro, bem como determinar o impacto de se considerar ou não o efeito da endogamia na avaliação genética dessa característica. Utilizaram-se 89.490 registros de produção no dia do controle, de 11.675 vacas em primeira lactação. O coeficiente e o incremento de endogamia individuais e o número equivalente de gerações completas de cada indivíduo foram computados. A depressão por endogamia foi estimada pela inclusão do efeito do incremento individual de endogamia, em um modelo de regressão aleatória. As soluções para a depressão por endogamia, de acordo com a classe de incremento individual de endogamia e a quinzena da lactação, variaram entre ‑1,238 e ‑0,135 kg, o que indica a redução da produção de leite com o aumento da endogamia. Em níveis mais elevados, a endogamia reduziu a persistência da produção de leite. A inclusão do efeito da endogamia no modelo de avaliação genética não afetou as estimativas de parâmetros genéticos e, praticamente, não alterou a predição dos valores genéticos e a classificação dos animais. Pode-se incluir o efeito da endogamia no modelo estatístico para a avaliação genética da característica produção de leite

Test-day or 305-day milk yield for genetic evaluation of Gir cattle

O objetivo deste trabalho foi comparar as avaliações genéticas da produção de leite na raça Gir, em termos dos valores genéticos preditos e de suas acurácias, por meio de modelo de regressão aleatória aplicado aos registros de produção de leite no dia do controle ou de modelo tradicional aplicado às estimativas de produção de leite acumulada em até 305 dias de lactação, bem como predizer tendências genéticas para parâmetros de interesse. Um total de 10.576 primeiras lactações, que correspondem a 81.135 registros de produção de leite no dia do controle (PLDC), foi utilizado. As correlações de ordem entre os valores genéticos preditos (VGP) com os dois modelos foram de 0,96. O percentual de animais em comum foi de 67 ou 82%, respectivamente, quando 1 ou 5% dos touros foram escolhidos, de acordo com os VGP das avaliações genéticas utilizando um ou outro modelo. Foram observados ganhos médios em acurácia de 2,7, 3,0 e 2,6% para todos os animais, vacas com fenótipo e touros (pais de vacas com fenótipo), respectivamente, quando o modelo de regressão aleatória (MRA) foi utilizado. O ganho genético médio anual para a produção de leite acumulada em até 305 dias de lactação foi de 56 kg após 1993. Entretanto, menores incrementos na média dos VGP foram observados para o segundo coeficiente de regressão, relacionado à persistência. O MRA aplicado às PLDC é eficiente para as avaliações genéticas da produção de leite na raça Gir Leiteiro.The objective of this work was to compare genetic evaluations of milk yield in the Gir breed, in terms of breeding values and their accuracy, using a random regression model applied to test-day records or the traditional model (TM) applied to estimates of 305-day milk yield, as well as to predict genetic trends for parameters of interest. A total of 10,576 first lactations, corresponding to 81,135 test-day (TD) records, were used. Rank correlations between the breeding values (EBVs) predicted with the two models were 0.96. The percentage of animals selected in common was 67 or 82%, respectively, when 1 or 5% of bulls were chosen, according to EBVs from random regression model (RRM) or TM genetic evaluations. Average gains in accuracy of 2.7, 3.0, and 2.6% were observed for all animals, cows with yield record, and bulls (sires of cows with yield record), respectively, when the RRM was used. The mean annual genetic gain for 305-day milk yield was 56 kg after 1993. However, lower increases in the average EBVs were observed for the second regression coefficient, related to persistency. The RRM applied to TD records is efficient for the genetic evaluation of milk yield in the Gir dairy breed

Genetic parameters for production traits of dairy Gyr (Bos indicus) x Holstein cattle estimated with a random regression model

A total of 104,135 test-day records from 13,314 first lactations of daily Gyr x Holstein cows were used. Test-day yields of milk, fat and protein were analyzed using a three-trait random regression model. Heritabilities for daily milk, fat and protein yield ranged from 0.12 to 0.24, 0.13 to 0.21 and 0.12 to 0.26, respectively. For daily yields, the additive genetic correlations ranged from 0.38 to 0.99 (milk), 0.25 to 0.99 (fat) and 022 to 0.99 (protein) and were higher among adjacent test days, decreasing gradually with increasing distance between days of lactation. The additive genetic correlations between the traits at different stages of lactation were high (always > 0.70). The heritabilities for cumulative yield and persistency were 0.21 and 0.14 (milk), 024 and 0.16 (fat) and 0.20 and 0.18 (protein), respectively. The additive genetic correlations for cumulative yield were 0.96 (milk-fat), 0.93 (milk-protein) and 0.90 (fat-protein), and those for persistency were 0.73 (milk-fat), 0.85 (milk-protein) and 0.87 (fat-protein). The correlations between cumulative yield and persistency were negative, but low, for the three traits studied. The random regression model proposed in this study can be applied to the genetic evaluation of dairy Gyr (Bos indiais) cattle using test-day yields rather than the traditional estimates of cumulative yield. (C) 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP

Reaction norm model to describe environmental sensitivity across first lactation in dairy cattle under tropical conditions

Reaction norm models have been widely used to study genotype by environment interaction (G × E) in animal breeding. The objective of this study was to describe environmental sensitivity across first lactation in Brazilian Holstein cows using a reaction norm approach. A total of 50,168 individual monthly test day (TD) milk yields (10 test days) from 7476 complete first lactations of Holstein cattle were analyzed. The statistical models for all traits (10 TDs and for 305-day milk yield) included the fixed effects of contemporary group, age of cow (linear and quadratic effects), and days in milk (linear effect), except for 305-day milk yield. A hierarchical reaction norm model (HRNM) based on the unknown covariate was used. The present study showed the presence of G × E in milk yield across first lactation of Holstein cows. The variation in the heritability estimates implies differences in the response to selection depending on the environment where the animals of this population are evaluated. In the average environment, the heritabilities for all traits were rather similar, in range from 0.02 to 0.63. The scaling effect of G × E predominated throughout most of lactation. Particularly during the first 2 months of lactation, G × E caused reranking of breeding values. It is therefore important to include the environmental sensitivity of animals according to the phase of lactation in the genetic evaluations of Holstein cattle in tropical environments

Diversidade genética de estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability. Strategies such as a previous genetic analysis of breeding with its marking, use of a large Ne crossing between the most genetically divergent specimens, and the introduction of new genetic material to broodstocks may maximize genetic diversity and minimize inbreeding within the next generation.A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores. Os resultados obtidos revelam que os estoques de reprodutores estão geneticamente muito relacionados e que ambos os estoques não apresentam alta variabilidade genética. Estratégias como uma prévia análise genética dos reprodutores com sua marcação, utilização de um grande Ne , cruzamento entre indivíduos geneticamente mais divergentes, além da introdução de um novo material genético aos estoques de reprodutores, poderiam ser utilizadas para maximizar a variabilidade genética e minimizar a endogamia na próxima geração

Diversidade genética de estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability. Strategies such as a previous genetic analysis of breeding with its marking, use of a large Ne crossing between the most genetically divergent specimens, and the introduction of new genetic material to broodstocks may maximize genetic diversity and minimize inbreeding within the next generation.A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores. Os resultados obtidos revelam que os estoques de reprodutores estão geneticamente muito relacionados e que ambos os estoques não apresentam alta variabilidade genética. Estratégias como uma prévia análise genética dos reprodutores com sua marcação, utilização de um grande Ne , cruzamento entre indivíduos geneticamente mais divergentes, além da introdução de um novo material genético aos estoques de reprodutores, poderiam ser utilizadas para maximizar a variabilidade genética e minimizar a endogamia na próxima geração

Susceptibility profile of Aedes aegypti from Santiago Island, Cabo Verde, to insecticides

Submitted by Adagilson Silva ([email protected]) on 2017-09-21T12:23:32Z No. of bitstreams: 1 26307496 2015 roc-sus.oa.wo.pdf.ed.pdf: 857693 bytes, checksum: 88721db53d43c2d2f2e41e119ad1315a (MD5)Approved for entry into archive by Adagilson Silva ([email protected]) on 2017-09-21T12:52:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 26307496 2015 roc-sus.oa.wo.pdf.ed.pdf: 857693 bytes, checksum: 88721db53d43c2d2f2e41e119ad1315a (MD5)Made available in DSpace on 2017-09-21T12:52:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 26307496 2015 roc-sus.oa.wo.pdf.ed.pdf: 857693 bytes, checksum: 88721db53d43c2d2f2e41e119ad1315a (MD5) Previous issue date: 2015-12Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, BrasilIn 2009, Cabo Verde diagnosed the first dengue cases, with 21,137 cases reported and Aedes aegypti was identified as the vector. Since the outbreak, chemical insecticides and source reduction were used to control the mosquito population. This study aimed to assess the susceptibility of A. aegypti populations from Santiago, Cabo Verde to insecticides and identify the mechanisms of resistance. Samples of A. aegypti eggs were obtained at two different time periods (2012 and 2014), using ovitraps in different locations in Santiago Island to establish the parental population. F1 larvae were exposed to different concentrations of insecticides (Bacillus thuringiensis var israelensis (Bti), diflubenzuron and temephos) to estimate the lethal concentrations (LC90) and calculate the respective rate of resistance (RR90). Semi-field tests using temephos-ABATE(®) were performed to evaluate the persistence of the product. Bottle tests using female mosquitoes were carried out to determine the susceptibility to the adulticides malathion, cypermethrin and deltamethrin. Biochemical and molecular tests were performed to investigate the presence of metabolic resistance mechanisms, associated with the enzymes glutathione S-transferases (GSTs), esterases and mixed-function oxidases (MFO) and to detect mutations or alterations in the sodium channel and acetylcholinesterase genes. A. aegypti mosquitoes from Santiago exhibited resistance to deltamethrin, cypermethrin (mortality<80%) and temephos (RR90=4.4) but susceptibility to malathion (mortality≥98%), Bti and diflubenzuron. The low level of resistance to temephos did not affect the effectiveness of Abate(®). The enzymatic analysis conducted in 2012 revealed slight changes in the activities of GST (25%), MFO (18%), α-esterase (19%) and β-esterase (17%), but no significant changes in 2014. Target site resistance mutations were not detected. Our results suggest that the A. aegypti population from Santiago is resistant to two major insecticides used for vector control, deltamethrin and temephos. To our knowledge, this is the first report of temephos resistance in an African A. aegypti population. The low level of temephos resistance was maintained from 2012-2014, which suggested the imposition of selective pressure, although it was not possible to identify the resistance mechanisms involved. These data show that the potential failures in the local mosquito control program are not associated with insecticide resistance