Proteome changes in the skin of the grape cultivar Barbera among different stages of ripening

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Grape ripening represents the third phase of the double sigmoidal curve of berry development and is characterized by deep changes in the organoleptic characteristics. In this process, the skin plays a central role in the synthesis of many compounds of interest (<it>e.g</it>. anthocyanins and aroma volatiles) and represents a fundamental protective barrier against damage by physical injuries and pathogen attacks. In order to improve the knowledge on the role of this tissue during ripening, changes in the protein expression in the skin of the red cultivar Barbera at five different stages from <it>véraison </it>to full maturation were studied by performing a comparative 2-DE analysis.</p> <p>Results</p> <p>The proteomic analysis revealed that 80 spots were differentially expressed throughout berry ripening. Applying a two-way hierarchical clustering analysis to these variations, a clear difference between the first two samplings (up to 14 days after <it>véraison</it>) and the following three (from 28 to 49 days after <it>véraison</it>) emerged, thus suggesting that the most relevant changes in protein expression occurred in the first weeks of ripening. By means of LC-ESI-MS/MS analysis, 69 proteins were characterized. Many of these variations were related to proteins involved in responses to stress (38%), glycolysis and gluconeogenesis (13%), C-compounds and carbohydrate metabolism (13%) and amino acid metabolism (10%).</p> <p>Conclusion</p> <p>These results give new insights to the skin proteome evolution during ripening, thus underlining some interesting traits of this tissue. In this view, we observed the ripening-related induction of many enzymes involved in primary metabolism, including those of the last five steps of the glycolytic pathway, which had been described as down-regulated in previous studies performed on whole fruit. Moreover, these data emphasize the relevance of this tissue as a physical barrier exerting an important part in berry protection. In fact, the level of many proteins involved in (a)biotic stress responses remarkably changed through the five stages taken into consideration, thus suggesting that their expression may be developmentally regulated.</p

High-throughput 18K SNP array to assess genetic variability of the main grapevine cultivars from Sicily

The viticulture of Sicily, for its vocation, is one of the most important and ancient forms in Italy. Autochthonous grapevine cultivars, many of which known throughout the world, have always been cultivated in the island from many centuries. With the aim to preserve this large grapevine diversity, previous studies have already started to assess the genetic variability among the Sicilian cultivars by using morphological and microsatellite markers. In this study, simple sequence repeat (SSR) were utilized to verify the true-to-typeness of a large clone collection (101) belonging to 21 biotypes of the most 10 cultivated Sicilian cultivars. Afterwards, 42 Organization Internationale de la Vigne et du Vin (OIV) descriptors and a high-throughput single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping array (Vitis18kSNP) were applied to assess genetic variability among cultivars and biotypes of the same cultivar. Ampelographic traits and high-throughput SNP genotyping platforms provided an accuracy estimation of genetic diversity in the Sicilian germplasm, showing the relationships among cultivars by cluster and multivariate analyses. The large SNP panel defined sub-clusters unable to discern among biotypes, previously classified by ampelographic analysis, belonging to each cultivar. These results suggested that a very large number of SNP did not cover the genome regions harboring few morphological traits. Genetic structure of the collection revealed a clear optimum number of groups for K = 3, clustering in the same group a significant portion of family-related genotypes. Parentage analysis highlighted significant relationships among Sicilian grape cultivars and Sangiovese, as already reported, but also the first evidences of the relationships between Nero d’Avola and both Inzolia and Catarratto. Finally, a small panel of highly informative markers (12 SNPs) allowed us to isolate a private profile for each Sicilian cultivar, providing a new tool for cultivar identification

Influence de la densité de plantation et du porte-greffe sur la production et la qualité du moût de Pinot blanc et de Chardonnay cultivés en Italie dans le Trentin

De nombreux chercheurs ont montré l'influence, soit quantitative soit qualitative, de la diminution du nombre de pieds à l'hectare. Les auteurs, dans une série d'expériences conduites de 1983 à 1986 dans le Trentin en Italie, ont mis en relief l'effet de la densité de plantation sur le bois de taille, sur la production de raisin par pied, ainsi que sur les teneurs en sucres, en acidité et en acides aminés; ces données ont été complétées par des microvinifications et par une analyse sensorielle des vins. Le portegreffe, employé comme moyen pour réduire la vigueur, s'est révélé comme peu important pour les hautes densités, même s'il est à noter une signification de l'interaction « année x portegreffe ». En définitive, ce sont les densités moyennes (3.333 et 4.167 pieds par hectare) qui fournissent les meilleurs résultats dans la pratique viticole de la région (mode de conduite en pergola)

Utilisation de l'analyse sensorielle comme instrument d'évaluation des choix viticoles. Application pour déterminer les sites aptes a la culture du cépage Chardonnay pour la production de vins mousseux en Trentin

L'optimisation du rapport entre la vigne et le terroir est une méthode efficace pour obtenir des produits de haute qualité, demandés par un marché toujours plus exigeant. La recherche a pour objectif la consolidation de la vocation du Trentin à élaborer des vins mousseux, car il s'agit d'une région caractérisée par des milieux très différents. En particulier, la recherche a fourni des renseignements de grande importance en ce qui conceme le choix de l'écosystème le mieux adapté à la production de vins mousseux issus exclusivement du cépage Chardonnay. La possibilité de mettre au point une fiche descriptive en adéquation avec les vins à déguster s'est révélée d'une importance toute particulière. Utilisée efficacement, elle est un puissant moyen de diagnostic. Après avoir mis en évidence les causes de variation du profil aromatique et organoleptique des vins mousseux produits en Trentin, on peut affirmer que le terroir conditionne fortement les caractéristiques des vins. Les vignobles situés sur des collines d'altitude moyenne (> 400 m) avec des sols morainiques, mameux et porphyriques, surtout dans la partie septentrionale-centre de la province, garantissent une qualité constante. L'exposition du vignoble et la situation climatique ont un rôle important dans la détermination de la qualité

Influence de la densité de plantation et du porte-greffe sur la production et la qualité du moût de Pinot blanc et de Chardonnay cultivés en Italie dans le Trentin

De nombreux chercheurs ont montré l'influence, soit quantitative soit qualitative, de la diminution du nombre de pieds à l'hectare. Les auteurs, dans une série d'expériences conduites de 1983 à 1986 dans le Trentin en Italie, ont mis en relief l'effet de la densité de plantation sur le bois de taille, sur la production de raisin par pied, ainsi que sur les teneurs en sucres, en acidité et en acides aminés; ces données ont été complétées par des microvinifications et par une analyse sensorielle des vins. Le portegreffe, employé comme moyen pour réduire la vigueur, s'est révélé comme peu important pour les hautes densités, même s'il est à noter une signification de l'interaction « année x portegreffe ». En définitive, ce sont les densités moyennes (3.333 et 4.167 pieds par hectare) qui fournissent les meilleurs résultats dans la pratique viticole de la région (mode de conduite en pergola)

Utilisation de l'analyse sensorielle comme instrument d'évaluation des choix viticoles. Application pour déterminer les sites aptes a la culture du cépage Chardonnay pour la production de vins mousseux en Trentin

L'optimisation du rapport entre la vigne et le terroir est une méthode efficace pour obtenir des produits de haute qualité, demandés par un marché toujours plus exigeant. La recherche a pour objectif la consolidation de la vocation du Trentin à élaborer des vins mousseux, car il s'agit d'une région caractérisée par des milieux très différents. En particulier, la recherche a fourni des renseignements de grande importance en ce qui conceme le choix de l'écosystème le mieux adapté à la production de vins mousseux issus exclusivement du cépage Chardonnay. La possibilité de mettre au point une fiche descriptive en adéquation avec les vins à déguster s'est révélée d'une importance toute particulière. Utilisée efficacement, elle est un puissant moyen de diagnostic. Après avoir mis en évidence les causes de variation du profil aromatique et organoleptique des vins mousseux produits en Trentin, on peut affirmer que le terroir conditionne fortement les caractéristiques des vins. Les vignobles situés sur des collines d'altitude moyenne (> 400 m) avec des sols morainiques, mameux et porphyriques, surtout dans la partie septentrionale-centre de la province, garantissent une qualité constante. L'exposition du vignoble et la situation climatique ont un rôle important dans la détermination de la qualité

Caucasus and Northern Black Sea Region Ampelography

Special Issu

Microsatellite analysis to define genetic diversity of grapevines (<em>Vitis vinifera</em> L.) grown in Central and Western Mediterranean countries

PCR-based microsatellite analysis has been applied to define the relationships among 238 grapevine cultivars selected as representative of local germplasm in the Central and Western Mediterranean regions. The estimation of genetic distances among the five grapevines groups, based on cluster analysis, c2 tests and Principal Component Analysis, was coherent with a common geographic origin of cultivated grapes and of their primordial varietal radiation. In fact, genetic similarity was high among French and Iberian cultivars and among Greek and Balkan cultivars. The Italian grapes clustered in an intermediate position, reflecting its geographical location. Results show that the geographical distribution is consistent with a pattern of viticulture based on the origin of primordial varieties from regions in the Near East, and subsequent and multiple variety flows that linked different viticultural regions through different routes. This is coherent with the model of varietal diffusion proposed on the bases of archaeological and historical evidence, in which population movements and cultural exchange contributed to the phenomenon