Flow cytometry approach for studying the interaction between Bacillus mojavensis and Alternaria alternata

Tomato, Solanum lycopersicum is one of the most important vegetable crops consumed in Algeria. Tomato crops are often infected by Alternaria alternata, which causes early blight disease. Chemical pesticides are intensively used to protect this plant, which lead to environmental pollution that might endanger animal and human health. The main objective of this study is to select potential biocontrol agents from arid soil as an alternative to chemical products. The phytopathogenic fungus which was isolated from infested tomato leaves, stems and fruits cultured in Constantine-Algeria, was identified as Alternaria cf. alternata. Thirty five bacteria isolates were obtained from arid soil in the south of Algeria. Three of the isolates inhibited the growth of A. alternata. However, the most potent isolate, E1B3 reached a 75% inhibition rate. The molecular identification of this isolate showed that it was closely related to Bacillus mojavensis (KC977492). This strain does not produce chitinase, but does produce lipase, protease and lipopeptides. The interaction between A. alternata and B. mojavensis was investigated for the first time in this work by flow cytometric analysis. In conclusion, B. mojavensis strain was antagonistic to A. alternata which could possibly be exploited as a biopesticide in tomato crops management.Keywords: Tomato, Bacillus mojavensis, early blight, Alternaria alternata, flow cytometr

L’élevage caprin dans la région montagneuse d’Ath Waghlis dans la wilaya de Bejaia: typologie et caractérisation morpho-biométrique

Le cheptel caprin algérien est estimé à 3,8 millions de têtes dont 2,2 millions de femelles adultes. Comptant 400000 têtes, la race caprine kabyle représente un dixième du cheptel national. Afin de caractériser cette race et son élevage dans la région d’Ath Waghlis, une enquête a été menée auprès de 69 éleveurs (dont 22 femmes) de chèvres répartis sur les communes d’Akfadou, Chemini, Souk Oufella et Tibane. Les questionnaires portaient sur le profil socio-économique du ménage et ses activités agricoles, ainsi que les données techniques se rapportant à la production de chèvres. Il a également été procédé à la caractérisation morpho-biométrique des chèvres (18 mensurations corporelles, 3 variables qualitatives). L’analyse des structures d’élevage par classification hiérarchique ascendante (CHA) a permis de retenir quatre groupes d’élevages conservant 55,7% de la variabilité totale. Les variables considérées étaient le nombre d’animaux par espèce (chèvre, bovin, ovin, lapin, poule, dinde, ruches) et le nombre d’arbres (oliviers et figuiers) détenus. Le nombre moyen de chèvres pour chaque groupe est de 7,2±2,8, 11,1±3,5, 22,3±1,4 et 3,4±1,0. Le groupe 3, démontrant les plus grands effectifs caprins, est composé de personnes âgées en moyenne de 67 ans et ne pratiquant pas l’arboriculture. Ils possèdent également les plus importants effectifs d’ovins (48,67), de lapins (50,83), de poules (48,33) et de dindes (42). Le groupe 4, qui a les effectifs caprins les plus faibles, représente le groupe des jeunes éleveurs (moyenne ~39 ans), orientés vers l’élevage bovin (~52 têtes) et la production d’oliviers (~207 oliviers) et de figuiers (~47 figuiers). Les 18 variables morpho-biométriques étaient significativement plus élevées chez les mâles que chez les femelles (p<0,05). La chèvre kabyle est de petite taille (mâle : 68,23 cm vs femelle : 65,41 cm) et à poil long (mâle : 12 cm vs femelle 9 cm). Ses oreilles sont tombantes, le profil convexe à cassure nasale peu accentuée et sa robe va du brun foncé au noir. La riche diversité génétique des caprins locaux à Ath Waghlis souffre du manque de coordination des efforts de sélection des éleveurs, notamment du fait de l’absence de standard de la race et par l’introduction de races exotiques. Cette richesse devrait représenter un vivier utile où puiser les gènes d’intérêt pour la valorisation de la production locale, basée sur un engagement fort des éleveurs dans la production d’individus correspondant à un idéal collectivement déterminé

Ressources génétiques animales en Kabylie (Algérie)

La Kabylie est une région côtière montagneuse du nord-est algérien. Ce poster présente les principales espèces et races élevées dans cette région. Les ovins sont représentés par la race Tazegzawt, répertoriée récemment. Elle est reconnaissable à ses tâches noires à reflets bleuâtres, son nom kabyle signifiant bleu. Son poids peut dépasser 30 kg à 6 mois. La population locale de chèvres n’a pas fait l’objet de descriptions. Toutefois, la chèvre locale est adaptée aux massifs montagneux. Elle est de petite taille avec un poids vif d’environ 25 kg. Elle présente de longs poils et différentes couleurs de robe. La race bovine locale est issue de l’adaptation de la race brune de l’Atlas à un climat tempéré. Elle possède un petit gabarit (de 250 à 300 kg) et une robe grise ou allant du fauve brunâtre au rouge-brun. Par l’industrialisation de la production de volailles, les poules locales ont subi une érosion génétique sévère. Elles présentent ainsi une grande variabilité phénotypique et sont de taille moyenne (autour de 1,5kg). Le lapin local connaît une situation similaire et présente un poids de 2 à 3 kg. Il existe une tradition apicole importante en Kabylie. Les types d’abeilles exploitées ne sont toutefois pas encore caractérisés. Toutes les races citées ici sont menacées par le croisement ou l’abandon. Leur caractérisation génétique et zootechnique est nécessaire pour l’amélioration des systèmes de production familiaux, plus particulièrement en régions montagneuses, et la conservation de la biodiversité

Effect of Dried Mealworms (Tenebrio molitor), Larvae andOlive Leaves (Olea europaeaL.) on Growth Performance,Carcass Yield and Some Blood Parameters of Japanese Quail (Coturnix coturnix japonica

peer reviewedThe aim of this study was to investigate the effect ofTenebrio molitormeal (TM) and/or oliveleaf powder (OL) supplementation to quail diet on animal performance, carcass yield and some bloodparameters. One hundred and forty-four 1-day-old Japanese quails (body weight:29.9±0.46 g) weredivided into four groups of 36 chicks, receiving four different diets, i.e., G1: Standard commercial(SCD); G2: SCD + 3% TM; G3: SCD + 3% OL; and G4: SCD + 3% TM + 2% OL. Feed and water wereprovidedad-libitum. The results showed that TM and OL inclusion promoted quail body weight at5 weeks of age;p= 0.001. Feed conversion ratio (FCR) of G3 was significantly (p< 0.01) reducedcompared to the other groups. Overall mortality was not different, at around 6.25%, between groups.Carcass [(71.5–74.3%)], gizzard [(2.5–2.7%)], heart [(1.1–1.2%)] and giblet [(6.8–6.9%)] yields were notinfluenced by the diet. No significant effect of the diet was observed for serum proteins, creatinine,urea and lipids. To conclude, the mixture of an incorporation of TM and OL in quail diet showed noadverse effects on growth performance, carcass constituent yields and serum constituent

Performances de productions de la poule locale kabyle

peer reviewedCette étude a pour objectif d’évaluer le potentiel productif de la poule locale Kabyle en caractérisant d’une part les performances de croissance, et d’autre part les performances de ponte. Le suivi de la croissance des poulets a été effectué sur 204 poussins durant 17 semaines d’élevage (de mars à juin 2011). A 16 semaines d’âge, le taux de mortalité était de 9,31 % et l’indice de consommation était de 6,78. La modélisation de la courbe de croissance au moyen des équations de Gompertz a permis d’obtenir les relations suivantes : pour les mâles : y ═ 2409 × exp (-3,68 × exp (-0,0260 × t)) ; pour les femelles : y ═ 1835 × exp (-3,71 × exp (-0,0294 × t)) ; avec y, le poids corporel en grammes et t, l’âge des animaux en jours. Les performances de ponte ont été étudiées chez 38 poules durant 52 semaines (d’août 2011 à août 2012). En moyenne, la ponte débute à l’âge de 166 jours à un poids corporel de 1334g. La poule pond en moyenne 173 oeufs par an d’un poids moyen variant avec l’âge de la poule, de 44 à 53g. Au vu de ces résultats, il apparaît que la poule Kabyle constitue une race locale prometteuse tant pour ses performances de croissance que de ponte. A partir des données obtenues, il pourrait être envisagé de développer un programme de sélection afin d’améliorer encore davantage son potentiel productif

recherche de nouvelles potentialités des bacteries du genre Bacillus pour l'agriculture et l'agroalimentaire

L’exploration des échantillons en provenance de divers environnements de l’Est Algérien (du lac salé de Ain M’lila et de la rhizosphère d’une plante adjacente ; de l’eau de la source thermale d’Oued El-Athmanya et du sol environnant ; de la rhizosphère de la plante Calendula officinalis, cultivée en serre à Setif) a abouti à l’obtention de 39 isolats de Bacillus et de Paenibacillus, dont 28 % sont sélectionnés pour leur capacité à inhiber la croissance de certaines moisissures phytopathogènes comme : Alternaria alternata, Aspergillus niger, Botrytis cinerea, Cladosporium cucumerinium, Fusarium oxysporium et Fusarium sp. Le calcul du taux d’inhibition de la croissance fongique par les isolats sélectionnés, réalisé, à titre d’exemple, sur F. oxysporium et B. cinerea, a permis d’obtenir des valeurs variant entre 39% et 84% suivant l’isolat. L’identification moléculaire des isolats sélectionnés par l’analyse d’ADN-16S et du gène « gyrase-A » a montré que les isolats de Ain M’lila appartiennent à Bacillus amyloliquefaciens, ceux isolés d’Oued El Athmanya sont : B. amyloliquefaciens, B. atrophaeus et B. mojavensis, enfin, les bactéries isolées de la rhizosphère de C. officinalis, sont : Paenibacillus polymyxa, B. velezensis, B. amyloliquefaciens et B. subtilis subsp. spizezenii. Les souches de Bacillus sélectionnées développent, dans les conditions de culture en fioles, des taux de sporulation importants variant entre 8 .108 et 27.108 spores/ml., alors que, le taux de sporulation chez P. polymyxa est insignifiant. Seuls les isolats de B. amyloliquefaciens sont capables de produire de la protéase. Cependant, l’activité cellulasique est observée chez toutes les espèces de Bacillus étudiées exceptant le B. atrophaeus qui a été le seul à produire de la chitinase. Toutes les espèces étudiées ont les mêmes capacités à produire les trois familles de lipopeptides (iturines, fengycines et surfactine), les siderophores et l’indole 3 acide acétique (IAA). Toutefois, le P. polymyxa (18SRTS) produit, dans les conditions expérimentales, une meilleure concentration d’IAA (54µg/ml). Par ailleurs, il est à mettre en exergue que, les B. amyloliquefaciens isolés du lac salé et de la source thermale produisent de nouvelles variantes de fengycines. En effet, il a été mis en évidence que le B. amyloliquefaciens (ET), produit de nouveaux homologues de fengycines A et B, ayant des chaines d’acides gras à 20 et à 18 atomes de carbone, respectivement, et deux nouvelles variantes de fengycines (fengycine X et Y) à cycles peptidiques dont la structure diffère de celle des fengycines conventionnelles. L’activité antifongique de certains isolats (B. amyloliquefaciens (ET), B. atrophaeus (6SEL), B. mojavensis (9SEL), B. amyloliquefaciens (9SRTS) et B. subtilis subsp. spizezenii (23SRTS)) sur milieux gélosés à base d’exsudats racinaires de tomate, de courgette et d’haricot, obtenus à différentes températures a été observée, vis-à-vis d’Alternaria alternata et de F. oxysporium. En complément, les souches B. atrophaeus (6SEL), B. amyloliquefaciens (9SRTS) et B. subtilis sub sp spizezenii (23SRTS), ont fait l’objet d’une production industrielle avec un taux de survie, après lyophilisation, très appréciable et leurs test in situ en serre et en champs sur le pois chiche a révélé une capacité intéressante de biofertilisation, de phytostimulation et de biocontrôle, ce qui justifie largement l’objectif assigné à cette recherche

Quality assessment of marketed eggs in Eastern Algeria

The objective of this study was to compare eggs quality between industrial and local chickens in four departments of Eastern Algeria (Bejaia, Jijel, Mila and Setif). A total of 4748 eggs were bought from three marketing channels as following: shops (1184), public markets (2757) and supermarkets (807). The percentage of stained eggs was significantly different (P<0.001) between industrial (15.25%) and local eggs (27.61%). A significant difference (P<0.05) was observed between industrial and local egg weight (61.01 vs 53.28g), egg shell weight (7.10 vs 6.30g), albumen weight (37.44 vs 29.69g), albumen percentage (61.34 vs 55.71%), shell thickness (0.381 vs 0.325mm). However, yolk weight (6.10 vs 6.30g), yolk percentage (27.06 vs 32.44%), shell percentage (11.60 vs 11.89%), yolk/albumen ratio (0.44 vs 0.58), albumen height (5.27 vs 5.93mm), Haugh unit (69.12 vs 77.80), yolk color (9.52 vs 10.94) and egg price (7.67 vs 12.84DA) of local chicken were significantly (P<0.01) higher than in the case of industrial hen. Marketing channels affected significantly (P<0.01) egg weight, yolk weight, albumen weight, albumen height and price of a total studied eggs. Egg weight (59.03g) and egg price (10.87DA) from supermarkets were the highest. Eggs of local hens presented according to the national preference, interesting quality criteria such as freshness, yolk/albumen ratio and yolk color

Quality Assessment of Marketed Eggs in Basse kabylie (Algeria)

Quality variations in retail eggs are widely reported. This study aims at assessing the quality of eggs according to the marketing channel in the department of Bejaia (Algeria). In spring and summer 2012, 3330 eggs were bought in 30 stores divided into 3 categories: 10 supermarkets (1146 eggs), 10 public markets (1048 eggs), and 10 shops (1136 eggs). Egg weights differed significantly between marketing channels with 58.9±0.14, 61.2±0.13 and 62.8±0.13 g for public markets, shops and supermarkets, respectively (p<0.001). Although shell thickness was similar for all marketing channels, the proportion of damaged eggs was higher in public markets (9.0%), intermediate in food shops (7.3%) and lower in supermarkets (5.7%; p<0.05). The yolk/albumen ratio was significantly higher for eggs from supermarkets (48.0%) compared with the other channels (around 47.4%; p<0.05). The freshness of the eggs, measured by the Haugh method, was lower in public markets (74.3 units), intermediate in shops (77.6 units) and higher in supermarkets (79.9 units; p<0.05). The price of eggs, expressed in Algerian Dinar (AD) per kg, was significantly lower in public markets (124 AD/kg) compared with the two other channels (around 131 AD/kg; p<0.05). It is possible to conclude that egg quality in Bass Kabylie differs significantly among marketing channels, with higher quality observed in supermarkets. The lower quality of eggs in public markets is associated with lower price. Eggs from shops present an intermediate quality. A one-year study would allow studying both the potential seasonal effect and compare intrinsic variability across marketing channels

Effect of dried mealworms (Tenebrio molitor) larvae and olive leaves (Olea Europeae L.) on growth performance, carcass yield and some blood parameters of Japanese quail

The aim of this study was to investigate the effect of Tenebrio molitor (TM) and/or olive leaves (OL) supplementation to the diet of quail on their growth performance, carcass yield and some blood parameters. One hundred and forty-four 1-day-old Japanese quails (body weight: 29.9±0.46 g, mean ± SE) were divided into four groups of 36 chicks, with three replications. The chicks in Group 1 were fed with a standard commercial diet (Diet1); Group 2 received the Diet1 diluted with 3% replacement of dried Tenebrio molitor (TM) larvae (Diet2); Group 3 received the Diet1 with 3% of olive leaves (Diet3); and Group 4 received the Diet1 with 3% of TM and 2% t of OL (Diet4). Feed and water were provided ad libitum. The results showed that TM and OL inclusion promoted growth performance of quails at 5 weeks of age (205.0 vs. 3). The overall mortality was not significantly different (at around 6.25%; P>0.05) for any of the dietary regimens. Carcass [71.5-74.3%], gizzard [2.5-2.7%], heart [1.1-1.2%] and giblets [6.8-6.9%] yields were not significantly (P>0.05) influenced by the diet. No significant effect of the diet was observed for blood constituents (TP: 3.0-3.2 g/dL; Alb: 1.3-1.4 g/dL; Glob: 1.6-1.7 g/dL; Alb/Glob: 0.76-0.80%; Creatinine: 0.25-0.28mg/dL; Urea: 6.53-6.81g/dL) and lipid profile (TC: 190.7-197.0mg/dL; TG: 214.6-220.2mg/dL; HDL: 54.3-56.1mg/dL; LDL: 91.6-99.1mg/dL; VLDL: 42.4-45.1mg/dL). In conclusion, the results demonstrated that the supplementation with TM (3%) and OL (2%) of quail diet improve body weight at 5 weeks old, reduce FCR and did not negatively influence carcass yield and blood parameters of Japanese quail