Detection and genetic characterization of enteric viruses in diarrhoea outbreaks from swine farms in Spain

Background The aim of this work was to study the prevalence and distribution of Porcine astrovirus (PAstV), Porcine kobuvirus (PKoV), Porcine torovirus (PToV), Mammalian orthoreovirus (MRV) and Porcine mastadenovirus (PAdV) as well as their association with widely recognized virus that cause diarrhoea in swine such as coronavirus (CoVs) and rotavi‑ rus (RVs) in diarrhoea outbreaks from Spanish swine farms. Furthermore, a selection of the viral strains was genetically characterized. Results PAstV, PKoV, PToV, MRV and PAdV were frequently detected. Particularly, PAstV and PKoV were detected in almost 50% and 30% of the investigated farms, respectively, with an age-dependent distribution; PAstV was mainly detected in postweaning and fattening pigs, while PKoV was more frequent in sucking piglets. Viral co-infections were detected in almost half of the outbreaks, combining CoVs, RVs and the viruses studied, with a maximum of 5 dif‑ ferent viral species reported in three investigated farms. Using a next generation sequencing approach, we obtained a total of 24 ARN viral genomes (>90% genome sequence), characterizing for frst time the full genome of circulating strains of PAstV2, PAstV4, PAstV5 and PToV on Spanish farms. Phylogenetic analyses showed that PAstV, PKoV and PToV from Spanish swine farms clustered together with isolates of the same viral species from neighboring pig producing countries. Conclusions Although further studies to evaluate the role of these enteric viruses in diarrhoea outbreaks are required, their wide distribution and frequent association in co-infections cannot be disregard. Hence, their inclusion into routine diagnostic panels for diarrhoea in swine should be considered. Keywords Swine, Multiplex RT-PCR, Phylogenetic analysis, Porcine astrovirus, Porcine kobuvirus, Porcine torovirus, Mammalian orthoreovirus, Porcine mastadenovirusThis work was supported by the program of the National Institute of Agricultural and Food Research and Technology (INIA project E-RTA2015-0003-C02-01 and E-RTA2015-0003-C02-02) of Spanish Government. H. Puente, O. Mencía-Ares, L. Pérez-Pérez, M. Cortey and H. Argüello were supported by Spanish Government (FPU17/00466, FPU16/03485, PRE2020-093762, RYC-2015-1715-4 and BEAGAL- 18-106, respectively) and M. Gómez-García by Junta de Castilla & León (LE131-18)info:eu-repo/semantics/publishedVersio

First identification and characterization of rotavirus H in swine in Spain

Rotaviruses (RVs) are classified into nine species or groups (RVA-RVD and RVF-RVJ). RVA, RVB and RVC are well-recognized as etiological agents of enteric disease on swine farms and have been identified in all countries with a relevant pork production. Contrarily, RVH has only been identified on swine farms from Japan and more recently from Brazil, USA, South Africa and Vietnam but not yet in Europe. The occurrence of RVH was investigated in 103 Spanish pig herds. Nine farms were positive and we achieved a complete nucleotide sequences in three isolates while another RVH isolate was partially sequenced. Mean nucleotide identities with the RVH sequences available in GenBank ranged between 69.4 and 93.7 %. Phylogenetically, all genomic segments of Spanish RVH isolates clustered closely with other porcine RVH strains but were distantly related to human RVH as well as bat RVH strain. To the best of our knowledge this is the first report of RVH on swine farms in Europe including its characterization by means of complete genome sequencing.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) clones from Paraguayan children

Introduction: Staphylococcus aureus is considered one of the most important human pathogens, and its levels of resistance to methicillin have increased even in strains isolated from people without nosocomial risk factors. Molecular analysis is essential for understanding the patterns of dissemination. The objective of this study was to identify community-acquired methicillin-resistant S. aureus (CA-MRSA) clones that infected Paraguayan children patients in two periods of time. Methodology: An observational, descriptive study was designed to determine the genetic variability of 115 isolates of CA-MRSA recovered from children who attended four reference centers in Paraguay between 2009-2010 and 2012-2013. Results: The combined use of Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE), Multi-Locus Sequencing Typing, Multi-Locus Variable Analysis (MLVA) and Spa typing techniques allowed the identification of two dominant clones: ST30-IV-t019 (77%) and ST5-IV-t311 (10%), and the establishment of the former as the leading cause of CA-MRSA infections in children during the study period. Conclusions: This is the first study that provides epidemiological information as well as microbiological and molecular characteristics of CA-MRSA isolates recovered from children from Asunción and the Central Department of Paraguay.Fil: Rodríguez, Fátima. Universidad Nacional de Asunción; ParaguayFil: Salinas, Claudia. Universidad Nacional de Asunción; ParaguayFil: Fernández, Silvina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Haim, Maria Sol. Universidad de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Mollerach, Marta Eugenia. Universidad de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Basualdo, Wilma. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; Paraguay. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social; ParaguayFil: Castro, Héctor. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; Paraguay. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social; ParaguayFil: Quiñónez, Beatriz. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social; ParaguayFil: Arguello, Rocío. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social; ParaguayFil: Rodríguez, Mónica. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; ParaguayFil: Grau, Lorena. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; ParaguayFil: Espínola, Carmen. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; ParaguayFil: Velázquez, Gladys. Hospital Central Instituto de Previsiín Social; ParaguayFil: Samudio, Gloria. Hospital Nacional, Panama; PanamáFil: Gómez, Gloria. Hospital Nacional, Panama; PanamáFil: Campuzano, Ana. Hospital de Clínicas; ParaguayFil: Ortellado, Juana. Hospital de Clínicas; ParaguayFil: Almada, Patricia. Hospital de Clínicas; ParaguayFil: Guillén, Rosa. Universidad Nacional de Asunción; Paragua

School of Public Accounting. Volume 16 No. 22 November 1991

Este informe es un estudio mundial, patrocinado por AICPA, que analiza el estado actual de la preparación y presentación de información financiera, a partir de lo cual propone los cambios que se requieren implementar.Editorial. Documentos. Profesores. Estudiantes.This report is a worldwide study, sponsored by AICPA, that analyzes the current state of the preparation and presentation of financial information, based on which it proposes the changes that need to be implemented

La magia de tus pensamientos : poesías & cuentos

Recopilación de poesías y cuentos realizados por aprendices del SENA de los programas de Mantenimiento de Motores Diesel, Técnico en Sistemas, Automatización Industrial, Electricidad Industrial, Diseño e Integración de Automatismos Mecatrónicos, Mantenimiento de Equipo Biomédico, Animación 3D, Manejo Ambiental, Diseño e integración de Automatismos Mecatrónicos y Mantenimiento mecatrónico automotriz, entre 2015 y 2017.Poesías 2018 -- Dándome tu vida / Brayan Orlando Jaimes Chaparro -- Tierra infinita / Christian Ricardo Caballero Villamizar -- Lamento a la tierra / Jeferson Alexis Montoya Moreno -- Conciencia por favor / Daniel Rincón -- Salvar un hogar llamado tierra / William Gamboa Arguello -- Planeta tierra / Iván Arley jurado -- Salvemos nuestro planeta / Jonathan David Silva -- Tierra bella / Martin Santiago -- Mi planeta / Fabián Moreno -- Generando conciencia / José Alberto Lizarazo -- Añoranza / Javier Casanova -- Sin tierra… / Gustavo Andrés Rodríguez Mendoza -- Planeta vivo y limpio / Yesid Serrano -- Palabras del destino / Osneider David Hernández Otalvaro -- Planeta tierra / Luis Fernando Isidro -- Medio ambiente / Yorgin David Hernández -- Prevenir / Brayan Mauricio Sanmiguel Luengas -- Nada será cómo antes / Jaime Andres Rodriguez Parrado -- Yo…Sol / Jonathan Bautista -- Lamento / Héctor Mauricio Parra Cuesta -- Nuestro hogar / Juan José Amaya -- Te agradecemos / Edwin Andrés Navarro Rozo, Anderson Cardozo Villamizar -- HErmoso milagro / Jhonatan Jaimes Solano -- El creador / Ana Rosa Hernández Santana -- Cuentos 2015 -- Juventud en la zona azul / Jeniffer Solano Ardila -- Los Ucayali y los Cubeo / Oscar Ivan Rueda Quintero -- Vientos de armonía / Ever Edinson Monsalve Salcedo -- El nacimiento de una nueva era / Carlos Leonardo Ardila Alvarado -- Luz de sueños / Hugo Andrés Álvarez -- Sol de medio día / Claudia Ramírez Guarín -- Cuentos 2016 -- Mucha verraquera mano / Héctor Josué Amado Sandoval -- El viaje de irse y nunca volver / Dayana Marcela Fuentes Duran -- “Santander es hermosa” / Kelly Tatiana Pabón Blanco -- Los valores del SENA / Ana Rosa Hernandez Santana -- La fuerza del espiritu y el deseo de cambiar / Pablo Andrés Capera Rodríguez -- SENA, paz y reconciliación / Adrián Benítez R., Rubén Darío Martínez -- Cuentos 2017 -- Cartas a un pasado / Angelita Delgado Pérez -- ¿Por qué así? ¿por qué tan blanco? ¿por qué no de otra manera? / Cristian Felipe Vargas Buenahora -- El gato pacho pacho, el gato más pacho de todos los pachos / Edwin Matajira García -- Freeland “el paraíso perdido” / Dámaso Antonio Morales Palacin -- Un mundo al revés / Fabio Eduardo Contreras Piñeresna91 página

Spectral unmixing approach in hyperspectral remote sensing: a tool for oil palm mapping

Oil palm plantations typically span large areas; therefore, remote sensing has become a useful tool for advanced oil palm monitoring. This work reviews and evaluates two approaches to analyze oil palm plantations based on hyperspectral remote sensing data: linear spectral unmixing and spectral variability. Moreover, a computational framework based on spectral unmixing for the estimation of fractional abundances of oil palm plantations is proposed in this study. Such approach also considers the spectral variability of hyperspectral image signatures. More specifically, the proposed computational framework modifies the linear mixing model by introducing a weighting vector, so that the spectral bands that contribute the least to the estimation of erroneous fractional abundances can be identified. This approach improves palm detection as it allows to differentiate them from other materials in terms of fractional abundances. Experimental results obtained from hyperspectral remote sensing data in the range 410-990 nm show improvements of 8.18 % in User Accuracy (Uacc) in the identification of oil palms by the proposed framework with respect to traditional unmixing methods. Thus, the proposed method achieved a 95% Uacc. This confirms the capabilities of the proposed computational framework and facilitates the management and monitoring of large areas of oil palm plantations.Las plantaciones de palma de aceite típicamente abarcan grandes áreas, por esto, la teledetección remota se ha convertido en una herramienta útil para el monitoreo avanzado de este cultivo. Este trabajo revisa y evalúa dos enfoques para analizar las plantaciones de palma de aceite a partir de datos de teledetección remota hiperespectral: desmezclado espectral lineal y variabilidad espectral. Además, se propone un marco computacional basado en el desmezclado espectral para la estimación de las fracciones de abundancias de cultivos de palma de aceite. Este enfoque también considera la variabilidad espectral de las firmas en las imágenes hiperespectrales. El marco computacional propuesto modifica el modelo de mezcla lineal mediante la introducción de un vector de pesos, de manera que se puedan identificar las bandas espectrales que menos contribuyen a la estimación de fracciones de abundancias erróneas. Este enfoque aprovecha la detección de los árboles de palma de aceite, ya que permite diferenciarlos de otros materiales en términos de fracciones de abundancia. Los resultados experimentales obtenidos a partir de datos de teledetección remota hiperespectral en el rango de 410-990 nm, muestran mejoras de un 8.18 % en la métrica de Precisión del Usuario (Uacc) en la identificación de palmas de aceite por el marco propuesto con respecto a los métodos tradicionales de desmezclado espectral; el método propuesto logró un 95 % de Uacc. Esto confirma las capacidades del marco computacional formulado y facilita la gestión y el monitoreo de grandes áreas de plantaciones de palma de aceite

Probability of correct reconstruction in compressive spectral imaging

Coded Aperture Snapshot Spectral Imaging (CASSI) systems capture the 3-dimensional (3D) spatio-spectral information of a scene using a set of 2-dimensional (2D) random coded Focal Plane Array (FPA) measurements. A compressed sensing reconstruction algorithm is then used to recover the underlying spatio-spectral 3D data cube. The quality of the reconstructed spectral images depends exclusively on the CASSI sensing matrix, which is determined by the statistical structure of the coded apertures. The Restricted Isometry Property (RIP) of the CASSI sensing matrix is used to determine the probability of correct image reconstruction and provides guidelines for the minimum number of FPA measurement shots needed for image reconstruction. Further, the RIP can be used to determine the optimal structure of the coded projections in CASSI. This article describes the CASSI optical architecture and develops the RIP for the sensing matrix in this system. Simulations show the higher quality of spectral image reconstructions when the RIP property is satisfied. Simulations also illustrate the higher performance of the optimal structured projections in CASSI

Probability of correct reconstruction in compressive spectral imaging

Coded Aperture Snapshot Spectral Imaging (CASSI) systems capture the 3-dimensional (3D) spatio-spectral information of a scene using a set of 2-dimensional (2D) random coded Focal Plane Array (FPA) measurements. A compressed sensing reconstruction algorithm is then used to recover the underlying spatio-spectral 3D data cube. The quality of the reconstructed spectral images depends exclusively on the CASSI sensing matrix, which is determined by the statistical structure of the coded apertures. The Restricted Isometry Property (RIP) of the CASSI sensing matrix is used to determine the probability of correct image reconstruction and provides guidelines for the minimum number of FPA measurement shots needed for image reconstruction. Further, the RIP can be used to determine the optimal structure of the coded projections in CASSI. This article describes the CASSI optical architecture and develops the RIP for the sensing matrix in this system. Simulations show the higher quality of spectral image reconstructions when the RIP property is satisfied. Simulations also illustrate the higher performance of the optimal structured projections in CASSI.El sistema de adquisición de imágenes espectrales de única captura basado en apertura codificada (CASSI), capta información tridimensional (3D) espacio-espectral de una escena, usando un conjunto de medidas bidimensionales (2D) proyectadas en un FPA (Focal Plane Array). Para recuperar el cubo de datos a partir de las proyecciones en el FPA, se usa un algoritmo de reconstrucción basado en la teoría de muestreo compresivo. En CASSI la calidad de la reconstrucción de imágenes espectrales depende exclusivamente de la matriz de sensado, que es determinada por la estructura estadística del código de apertura. La propiedad restringida isométrica (RIP) de la matriz de sensado CASSI es usada para determinar la probabilidad de una correcta reconstrucción de la imagen. Este artículo describe la arquitectura óptima CASSI y desarrolla la RIP para las matrices de muestreo, para la captura de la información del cubo de datos. En efecto, la RIP provee la guía para determinar el mínimo número de capturas FPA necesarias para la reconstrucción de una imagen. Más adelante, la RIP es usada para encontrar la estructura óptima de las proyecciones de los códigos de apertura de CASSI. Las simulaciones muestran alta calidad de la reconstrucción obtenida de las imágenes espectrales cuando se satisface la condición impuesta por la RIP. También muestran el más alto rendimiento obtenido de las estructuras óptimas de las proyecciones CASSI

Probability of correct reconstruction in compressive spectral imaging

Coded Aperture Snapshot Spectral Imaging (CASSI) systems capture the 3-dimensional (3D) spatio-spectral information of a scene using a set of 2-dimensional (2D) random coded Focal Plane Array (FPA) measurements. A compressed sensing reconstruction algorithm is then used to recover the underlying spatio-spectral 3D data cube. The quality of the reconstructed spectral images depends exclusively on the CASSI sensing matrix, which is determined by the statistical structure of the coded apertures. The Restricted Isometry Property (RIP) of the CASSI sensing matrix is used to determine the probability of correct image reconstruction and provides guidelines for the minimum number of FPA measurement shots needed for image reconstruction. Further, the RIP can be used to determine the optimal structure of the coded projections in CASSI. This article describes the CASSI optical architecture and develops the RIP for the sensing matrix in this system. Simulations show the higher quality of spectral image reconstructions when the RIP property is satisfied. Simulations also illustrate the higher performance of the optimal structured projections in CASSI.El sistema de adquisición de imágenes espectrales de única captura basado en apertura codificada (CASSI), capta información tridimensional (3D) espacio-espectral de una escena, usando un conjunto de medidas bidimensionales (2D) proyectadas en un FPA (Focal Plane Array). Para recuperar el cubo de datos a partir de las proyecciones en el FPA, se usa un algoritmo de reconstrucción basado en la teoría de muestreo compresivo. En CASSI la calidad de la reconstrucción de imágenes espectrales depende exclusivamente de la matriz de sensado, que es determinada por la estructura estadística del código de apertura. La propiedad restringida isométrica (RIP) de la matriz de sensado CASSI es usada para determinar la probabilidad de una correcta reconstrucción de la imagen. Este artículo describe la arquitectura óptima CASSI y desarrolla la RIP para las matrices de muestreo, para la captura de la información del cubo de datos. En efecto, la RIP provee la guía para determinar el mínimo número de capturas FPA necesarias para la reconstrucción de una imagen. Más adelante, la RIP es usada para encontrar la estructura óptima de las proyecciones de los códigos de apertura de CASSI. Las simulaciones muestran alta calidad de la reconstrucción obtenida de las imágenes espectrales cuando se satisface la condición impuesta por la RIP. También muestran el más alto rendimiento obtenido de las estructuras óptimas de las proyecciones CASSI