Spatiotemporal Characteristics of the Largest HIV-1 CRF02_AG Outbreak in Spain: Evidence for Onward Transmissions

Background and Aim: The circulating recombinant form 02_AG (CRF02_AG) is the predominant clade among the human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) non-Bs with a prevalence of 5.97% (95% Confidence Interval-CI: 5.41–6.57%) across Spain. Our aim was to estimate the levels of regional clustering for CRF02_AG and the spatiotemporal characteristics of the largest CRF02_AG subepidemic in Spain.Methods: We studied 396 CRF02_AG sequences obtained from HIV-1 diagnosed patients during 2000–2014 from 10 autonomous communities of Spain. Phylogenetic analysis was performed on the 391 CRF02_AG sequences along with all globally sampled CRF02_AG sequences (N = 3,302) as references. Phylodynamic and phylogeographic analysis was performed to the largest CRF02_AG monophyletic cluster by a Bayesian method in BEAST v1.8.0 and by reconstructing ancestral states using the criterion of parsimony in Mesquite v3.4, respectively.Results: The HIV-1 CRF02_AG prevalence differed across Spanish autonomous communities we sampled from (p < 0.001). Phylogenetic analysis revealed that 52.7% of the CRF02_AG sequences formed 56 monophyletic clusters, with a range of 2–79 sequences. The CRF02_AG regional dispersal differed across Spain (p = 0.003), as suggested by monophyletic clustering. For the largest monophyletic cluster (subepidemic) (N = 79), 49.4% of the clustered sequences originated from Madrid, while most sequences (51.9%) had been obtained from men having sex with men (MSM). Molecular clock analysis suggested that the origin (tMRCA) of the CRF02_AG subepidemic was in 2002 (median estimate; 95% Highest Posterior Density-HPD interval: 1999–2004). Additionally, we found significant clustering within the CRF02_AG subepidemic according to the ethnic origin.Conclusion: CRF02_AG has been introduced as a result of multiple introductions in Spain, following regional dispersal in several cases. We showed that CRF02_AG transmissions were mostly due to regional dispersal in Spain. The hot-spot for the largest CRF02_AG regional subepidemic in Spain was in Madrid associated with MSM transmission risk group. The existence of subepidemics suggest that several spillovers occurred from Madrid to other areas. CRF02_AG sequences from Hispanics were clustered in a separate subclade suggesting no linkage between the local and Hispanic subepidemics

Análisis de la evolución de los censos y sistemas de producción del cerdo ibérico

En el presente trabajo se analiza la evolución de los sistemas de produción y los censos del cerdo ibérico, desde las primeras referencias, hasta los últimos datos disponibles, para ello se ha realizado una profunda revisión bibliográfica. Se analiza la crisis del ibérico de mediados de siglo, causada por la concurrencia de una serie de factores que dieron lugar a una notable caída de los efectivos, menor que la reiteradamente señalada, debido a una errónea interpretación del censo general de la ganadería española de 1955. A mediados de la década de los ochenta se inició la recuperación del ibérico, que ha continuado en la última década, con una diversificación de los sistemas productivos. En los últimos años el sector del ibérico está experimentando un fuerte impulso debido a una fuerte demanda capaz de absorber a precios crecientes la limitada producción de ibéricos de bellota, lo que unido a la eliminación de las barreras comerciales exteriores, está generando grandes expectativas......The present paper analyses the evolution of the production system in iberian pig census from the first references up to the latest data. An extensive bibliographic research has been carried out on this purpose. The mid-century iberian pig crisis was due to several factors producing a heavy fall in units, caused by a mistaken interpretation on the general census of the Spanish Cattle in 1955. In the mid-eighties, the iberian pig started to recover, continuing throughout the last decade with a diversification of the production system. During the last years, the iberian sector is showing an important impulse due to a strong demand able to offset, at increasing prices, the limited production of acorn iberian pigs. Together with this, the market globalization is creating great expectations

Análisis socioeconómico de la peste porcina africana en Extremadura

En los últimos 10 años ha experimentado un gran desarrollo la denominada "economía de la sanidad animal", disciplina que tiene por objeto estudiar las condiciones óptimas de utilización de los recursos disponibles para asegurar el mantenimiento y mejora del aspecto sanitario de las colectividades ganaderas. Independientemente del aspecto sanitario, existe uno de orden comercial que tiene tanta importancia como el primero.In the last 10 years, the so-called "economics of animal health" has experienced great development, a discipline that aims to study the optimal conditions for using available resources to ensure the maintenance and improvement of the health aspect of livestock communities. Regardless of the health aspect, there is a commercial aspect that is as important as the first.peerReviewe

Evolución intercensal del número y dimensión de las explotaciones agrarias en Extremadura (1972-1982)

Se trata de analizar las modificaciones que el tiempo ha introducido en el número y en los distintos tamaños de las explotaciones. Nos referimos en este estudio a los años 1972 y 1982 debido a que son los dos últimos censos agrarios efectuados.It is about analyzing the modifications that time has introduced in the number and in the different sizes of the farms. We refer in this study to the years 1972 and 1982 because they are the last two agrarian censuses carried out.peerReviewe

The Mediterranean pig breeds and their environmental impact

The Iberian pig and most of Mediterranean pig breeds, have been described as a local pig, traditionally linked to the environment in which it has developed, with freedom of movement and feeding base on natural sources. However, little is known about the environmental role of Mediterranean pig breeds, and organic farming is gaining recognition as a relatively friendly production system. In the future, this issue will be subject to a tighter regulation because the swine intensive production expands rapidly in developing countries. Thirty-four percent of the greenhouse gases generated in the global pork production chains correspond to the animal production stage. Spain has to import corn and soy to supply the cereal base of pig feed, from more than 39 different countries. These trade flows generate a great carbon footprint, and in addition, intensive pig production produces large quantities of manure. At this point, is important to note that the Iberian pig is traditionally characterised by a long duration of the productive cycle with a low concentration of animals (in free range conditions), and in this case, the manure produced don’t involve any environmental pollution source. In conclusion, the environmental implications of Mediterranean pig breeds in free range conditions, are yet to be quantified and should be investigated. Therefore, it will be necessary further more research to stimulate a development of environment friendly farming practices that not causes environmental impacts.El cerdo Ibérico y la mayor parte las razas de cerdos Mediterráneos, han sido consideradas como cerdos autóctonos tradicionalmente vinculados al medio en los que se han desarrollado, con libertad de movimientos y alimentación basada en recursos naturales. Sin embargo, se conoce poco sobre el papel medioambiental desempeñado por estas razas, y en la actualidad, los sistemas productivos respetuosos con el medio están ganado reconocimiento. Además, en el futuro la contaminación generada por las granjas porcinas será objeto de una regulación más rígida de la que existe hoy día, debido a la rápida expansión experimentada por este tipo de producción en los países desarrollados. El 34 % de los gases de efecto invernadero generados en la producción de carne de cerdo, corresponden a las fases de cría y engorde de los animales. Para esta finalidad, España importa maíz y soja de más de 39 países diferentes. Estos flujos de mercado ocasionan una gran cantidad de CO2, y añadido a esto, los sistemas de producción porcina intensivos generan una gran cantidad de purines. En este punto, es importante remarcar los sistemas tradicionales de producción de cerdo Ibérico caracterizados por un ciclo de producción largo y una baja densidad de animales, donde los residuos orgánicos generados no son un problema medioambiental añadido. En conclusión, las implicaciones medioambientales de la producción de cerdos mediterráneos en condiciones extensivas, aún no se han cuantificado y deben ser estudiados. Por tanto, se necesita un mayor número de investigaciones que desarrollen prácticas respetuosas con el medio ambiente evitando así impactos medioambientales innecesarios

Tamaño de las explotaciones porcinas en Extremadura y Santa Fe

En dos modelos de producción porcina alternativa: el cerdo Ibérico en Extremadura (España) y el cerdo a campo en la provincia de Santa Fe (Argentina), se analizan y comparan características relevantes como tamaño de explotación, cantidad promedio de reproductoras, superficie promedio, formación de los responsables y presencia de otras especies en la explotación. Se aprecian similitudes en el número de reproductoras y superficie según tamaño

Tamaño de las explotaciones porcinas en Extremadura y Santa Fe

En dos modelos de producción porcina alternativa: el cerdo Ibérico en Extremadura (España) y el cerdo a campo en la provincia de Santa Fe (Argentina), se analizan y comparan características relevantes como tamaño de explotación, cantidad promedio de reproductoras, superficie promedio, formación de los responsables y presencia de otras especies en la explotación. Se aprecian similitudes en el número de reproductoras y superficie según tamaño

La mano de obra en dos modelos de producción porcina alternativa: Extremadura (España) y en Santa Fe (Argentina)

En el presente trabajo se analiza la mano de obra en dos modelos de producción porcina alternativa: el cerdo Ibérico en Extremadura (España) y el cerdo a campo en la provincia de Santa Fe (Argentina). Se analizan, comparan y categorizan el porcentaje de dedicación según el tipo de mano de obra, el tiempo de dedicación y la antigüedad en el proceso productivo. Se aprecian bastantes similitudes en algunos parámetros analizados, tales como el tamaño medio de las explotaciones por número de reproductoras y la antigüedad media de los titulares de las explotaciones

La mano de obra en dos modelos de producción porcina alternativa: Extremadura (España) y en Santa Fe (Argentina)

En el presente trabajo se analiza la mano de obra en dos modelos de producción porcina alternativa: el cerdo Ibérico en Extremadura (España) y el cerdo a campo en la provincia de Santa Fe (Argentina). Se analizan, comparan y categorizan el porcentaje de dedicación según el tipo de mano de obra, el tiempo de dedicación y la antigüedad en el proceso productivo. Se aprecian bastantes similitudes en algunos parámetros analizados, tales como el tamaño medio de las explotaciones por número de reproductoras y la antigüedad media de los titulares de las explotaciones