Reinitiation of protein synthesis in Escherichia coli can be induced by mRNA cis-elements unrelated to canonical translation initiation signals

AbstractIn Eubacteria, de novo translation of some internal cistrons may be inefficient or impossible unless the 5′ neighboring cistron is also translated (translational coupling). Translation reinitiation is an extreme case of translational coupling in which translation of a message depends entirely on the presence of a nearby terminating ribosome. In this work, the characteristics of mRNA cis-elements inducing the reinitiation process in Escherichia coli have been investigated using a combinatorial approach. A number of novel translational reinitiation sequences (TRSs) were thus identified, which show a wide range of reinitiation activities fully dependent on a translational coupling event and unrelated to the presence/absence of secondary structure or mRNA stability. Moreover, some of the isolated TRSs are similar to intercistronic sequences present in the E. coli genome

The 2019 and 2021 International Workshops on Alport Syndrome

In 1927 Arthur Cecil Alport, a South African physician, described a British family with an inherited form of kidney disease that affected males more severely than females and was sometimes associated with hearing loss. In 1961, the eponymous name Alport syndrome was adopted. In the late twentieth century three genes responsible for the disease were discovered: COL4A3, COL4A4, and COL4A5 encoding for the α3, α4, α5 polypeptide chains of type IV collagen, respectively. These chains assemble to form heterotrimers of type IV collagen in the glomerular basement membrane. Scientists, clinicians, patient representatives and their families, and pharma companies attended the 2019 International Workshop on Alport Syndrome, held in Siena, Italy, from October 22 to 26, and the 2021 online Workshop from November 30 to December 4. The main topics included: disease re-naming, acknowledging the need to identify an appropriate term able to reflect considerable clinical variability; a strategy for increasing the molecular diagnostic rate; genotype-phenotype correlation from monogenic to digenic forms; new therapeutics and new therapeutic approaches; and gene therapy using gene editing. The exceptional collaborative climate that was established in the magical medieval setting of Siena continued in the online workshop of 2021. Conditions were established for collaborations between leading experts in the sector, including patients and drug companies, with the aim of identifying a cure for Alport syndrome

Strumenti GIS per la gestione del rischio di caduta massi

Una delle problematiche principali dell’arco alpino e delle aree montane in generale è rappresentata dai fenomeni di crolli di roccia, che prevedono il distacco con conseguente movimentazione per caduta libera, rimbalzo e rotolamento di blocchi di roccia anche di centinaia di metri cubi. Con l’aumento delle reti viarie e dei volumi turistici, risulta sempre più incalzante l’esigenza di provvederealla pubblica incolumità, attraverso una corretta pianificazione territoriale nell’ambito della protezione geo-idrologica. In questo contesto, si configura la necessità di fornire uno strumento di supporto alla decisione multi-scala e multi-temporale perla raccolta dei dati relativi ai crolli e la relativa analisi, in cui sia possibile definire i diversi scenari di rischio ed elaborare analisi di pericolosità e di rischio. In risposta a tale esigenza il progetto RED (Risk Evaluation Dashboard), finanziato dalla Regione Valle d’Aosta nell’ambito del Programma investimenti per la crescita e l’occupazione 2014/20 (FESR) e del Programma investimenti in favore della crescita e dell’occupazione 2014/20 (FSE), prevede lo sviluppo di un Cruscotto/Dashboard, checon l’applicazione di appositi algoritmi, effettui valutazioni speditive e ponderate a supportare la gestione del rischio di crolli in roccia. All’interno delle attività di progetto, è stato quindi condotto uno studio dello stato dell’arte dei sistemi informativi utilizzati e degli open data già resi disponibili per la documentazione dei fenomeni di crolli in roccia da un lato, e dall’altro uno studio sugli end-user requirementsper la progettazione di un modello dati a supporto del Cruscotto. Nel presente lavoro si propone la descrizione della dashboard e della struttura dati del GIS, ponendo l’attenzione sugli aspetti di interoperabilità e armonizzazione necessari per migliorare l’interscambio dati provenienti da diverse fonti e favorire la collaborazione di tutte le risorse (gestionali e operative) coinvolte per la gestione del rischio di caduta massi