New perspectives on the epidemiology of citrus stubborn disease in California orchards

Scope and Method of Study:California is the major citrus fresh fruit producer in the US and citrus stubborn disease (CSD), caused by Spiroplasma citri, has been present in that state for a long period of time. CSD impact and epidemiology are not fully understood or quantified limiting the possibilities for science based management strategies. In this study, we evaluated symptom severity, disease incidence, pathogen diversity, and pathogen titer in symptomatic trees, thereby providing information useful to the improvement of disease management.Findings and Conclusions: Incidence of CSD in two commercial citrus orchards varied from low to high. Citrus fruit receptacles were more suitable than other tissues for spiroplasma cultivation. Molecular comparison of S. citri strains from different citrus orchards, carrot fields and weeds, collected from 1980 to 2007, showed that S. citri populations have a high degree of genetic variability, but strain identities were not correlated with the date or location of collection.A two year field evaluation in one commercial sweet orange orchard showed that CSD severely symptomatic trees had a smaller tree canopy and yielded less fruit than mildly symptomatic trees. Fruits produced on severely symptomatic trees were also smaller, and more of them had sunburn than fruits from mildly symptomatic or healthy trees. Using a variety of molecular markers, no genetic differences were detected between S. citri strains from severely symptomatic trees and mildly symptomatic trees. However, bacterial titer, quantified by q-PCR, was higher in severely symptomatic than in mildly symptomatic trees.The natural vector of S. citri, Circulifer tenellus, was able to acquire and transmit S. citri strains from feeding sachets to carrot plants, confirming the spiroplasma as the causal agent of carrot purple leaf disease. No strain-host specificity was identified

Produtos alternativos na inibição de Sclerotinia sclerotiorum "in vitro"

O mofo-branco, causado por Sclerotinia sclerotiorum, é uma doença importante na cultura do tomateiro. O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de extratos de plantas, resíduos animais e subprodutos industriais no desenvolvimento micelial e na produção de escleródios do fungo "in vitro". Os tratamentos testados foram diferentes concentrações de licor pirolenhoso, óleo de nim, glutamato monossódico, biossólido e composto orgânico [(borra de café (50%) cinza de carvão (10%), resíduo de milho (25%), esterco de aves (12,5%) e farinha de aves (2,5%)], além de duas testemunhas, sem adição de produtos ao meio e com adição do fungicida procimidone. O fungo submetido aos diferentes tratamentos foi incubado à temperatura de 22ºC e luminosidade constante de 260 lux. Foram avaliadas o crescimento micelial, a produção de escleródios e a viabilidade dos mesmos aos 7 e 17 dias após a repicagem do fungo para meio de neon. O composto orgânico a 30 % mostrou-se eficiente na inibição do crescimento micelial e na produção de escleródios. Este tratamento, assim como o óleo de nim a 0,5%, foi analisado com relação à sua influência na microbiota no solo por meio de uma análise de respirometria, que indicou que ambos os tratamentos foram degradados rapidamente, não causando assim malefícios à mesma.The white mold, caused by Sclerotinia sclerotiorum, is a very important disease in tomato crops. The objective of this work was to study the effect of plant extracts, animal residues and industrial by-products extracts on the fungus in vitro growth. Treatments consisted of different concentrations of pyrolignous oil, neem oil, monosodium glutamate, sewage sludge and organic compost [coffee residue (50%) coal residue (10%), maize residue (25%), poultry waste (12.5%), poultry meal (2.5%)]. Positive control consisted of Petri dishes with PDA medium and negative control treatment consisted of PDA medium with procymidone. Fungus colonies were incubated at 22ºC and light intensity of 260 lux. Variables such as mycelium growth rate, sclerotia production, and viability 7 and 17 days after the transfer of mycelium disc to neon media were assessed. The extract of organic compost at 30% was effective in controlling mycelial growth and sclerotia production. This treatment, as well as neem oil at 0.5% increased soil respiration

Desenvolvimento de Colletotrichum gloeosporioides isolado de pimentão em diferentes meios de cultura, temperaturas e regimes de luz

O controle da antracnose causada por Colletotrichum gloeosporioides em pimentão, envolve o emprego de variedades resistentes e/ou fungicidas. A seleção de variedades e de produtos eficientes demanda grande quantidade de inóculo. Assim, é necessário otimizar a produção de conídios em laboratório, estabelecendo as melhores condições para tal. O presente trabalho teve por objetivo determinar o meio de cultura, a temperatura e o regime de luz mais favoráveis à produção de inóculo do fungo. O isolado fúngico foi obtido de frutos de pimentão e cultivado em quatro meios de cultura (BDA, aveia, extrato de pimentão filtrado e extrato de pimentão autoclavado), sob diferentes temperaturas (15, 20, 25, 30 e 35 ºC) e regimes de luz (24 h de escuro, 24 h de luz). O crescimento da colônia foi avaliado aos 7 e 12 dias, não sendo observadas diferenças entre os meios, aos 12 dias após a incubação. Entretanto, maior produção de conídios foi obtida de colônias crescidas em aveia a 25ºC. As temperaturas de 20 e 25ºC foram as mais favoráveis para o crescimento da colônia e para esporulação do fungo. A produção de conídios foi maior quando em incubação sob luz contínua diferindo da incubação sob escuro total, aos 12 dias. Para obtenção de inóculo, indica-se o cultivo de C. gloeosporioides em meio de aveia, a 25ºC, sob luz contínua, por 12 dias.Control of anthracnose in green pepper involves the use of resistant varieties and/or fungicides. The selection of varieties and efficient products demands great amounts of conidia as inoculum. It is thus necessary to optimize the production of Colletotrichum gloeosporioides conidia in the laboratory, establishing the best conditions for fungus development. The present study aimed at determining the most favorable culture media, temperature, and light conditions for the production of fungus inoculum. The fungus was isolated from green pepper fruits (Capsicum annuum L.) and transferred to four culture media (PDA, oat, filtered pepper extract, and autoclaved pepper extract), under different temperatures (15, 20, 25, 30, and 35ºC) and light conditions (24h dark, and 24h light). Colony growth was evaluated after 7 and 12 days of incubation. No differences were found between the culture media. However, the greatest number of conidia was obtained from colonies grown in oat medium at 25ºC. Temperatures of 20 and 25ºC were the most favorable for colony growth and sporulation. Higher sporulation was obtained under incubation in constant light. Cultivation of C. gloeosporioides in oat medium, at 25ºC, and constant light is recommended

A social and ecological assessment of tropical land uses at multiple scales: the Sustainable Amazon Network

Science has a critical role to play in guiding more sustainable development trajectories. Here, we present the Sustainable Amazon Network (Rede Amazonia Sustentavel, RAS): a multidisciplinary research initiative involving more than 30 partner organizations working to assess both social and ecological dimensions of land-use sustainability in eastern Brazilian Amazonia. The research approach adopted by RAS offers three advantages for addressing land-use sustainability problems: (i) the collection of synchronized and co-located ecological and socioeconomic data across broad gradients of past and present human use; (ii) a nested sampling design to aid comparison of ecological and socioeconomic conditions associated with different land uses across local, landscape and regional scales; and (iii) a strong engagement with a wide variety of actors and non-research institutions. Here, we elaborate on these key features, and identify the ways in which RAS can help in highlighting those problems in most urgent need of attention, and in guiding improvements in land-use sustainability in Amazonia and elsewhere in the tropics. We also discuss some of the practical lessons, limitations and realities faced during the development of the RAS initiative so far.Keywords: Social–ecological systems, Tropical forests, Land use, Interdisciplinary research, Sustainability, Trade-off

ATLANTIC EPIPHYTES: a data set of vascular and non-vascular epiphyte plants and lichens from the Atlantic Forest

Epiphytes are hyper-diverse and one of the frequently undervalued life forms in plant surveys and biodiversity inventories. Epiphytes of the Atlantic Forest, one of the most endangered ecosystems in the world, have high endemism and radiated recently in the Pliocene. We aimed to (1) compile an extensive Atlantic Forest data set on vascular, non-vascular plants (including hemiepiphytes), and lichen epiphyte species occurrence and abundance; (2) describe the epiphyte distribution in the Atlantic Forest, in order to indicate future sampling efforts. Our work presents the first epiphyte data set with information on abundance and occurrence of epiphyte phorophyte species. All data compiled here come from three main sources provided by the authors: published sources (comprising peer-reviewed articles, books, and theses), unpublished data, and herbarium data. We compiled a data set composed of 2,095 species, from 89,270 holo/hemiepiphyte records, in the Atlantic Forest of Brazil, Argentina, Paraguay, and Uruguay, recorded from 1824 to early 2018. Most of the records were from qualitative data (occurrence only, 88%), well distributed throughout the Atlantic Forest. For quantitative records, the most common sampling method was individual trees (71%), followed by plot sampling (19%), and transect sampling (10%). Angiosperms (81%) were the most frequently registered group, and Bromeliaceae and Orchidaceae were the families with the greatest number of records (27,272 and 21,945, respectively). Ferns and Lycophytes presented fewer records than Angiosperms, and Polypodiaceae were the most recorded family, and more concentrated in the Southern and Southeastern regions. Data on non-vascular plants and lichens were scarce, with a few disjunct records concentrated in the Northeastern region of the Atlantic Forest. For all non-vascular plant records, Lejeuneaceae, a family of liverworts, was the most recorded family. We hope that our effort to organize scattered epiphyte data help advance the knowledge of epiphyte ecology, as well as our understanding of macroecological and biogeographical patterns in the Atlantic Forest. No copyright restrictions are associated with the data set. Please cite this Ecology Data Paper if the data are used in publication and teaching events. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ

not available

A mancha preta dos citros, causada pelo fungo Guignardia citricarpa Kiely [Phyllosticta citricarpa (McAlp.) Van der Aa.], é uma doença de grande ocorrência no sul do Estado de São Paulo. Estudos epidemiológicos dessa doença ainda são controversos devido principalmente, às diferenças climáticas e do sistema de produção no Brasil, quando comparados com os países pioneiros no estudo da doença. Nesse trabalho, procurou-se elucidar as épocas favoráveis à infecção e a importância relativa de conídios e ascósporos nesse processo por meio de plantas armadilhas. Mudas de limão 'Siciliano' (Citrus limon (L.) Burn. f.), suscetíveis a G. citricarpa, foram colocadas em dois talhões de um pomar de citros em uma propriedade comercial. Num dos talhões as folhas caídas no solo, fonte de inóculo de ascósporos, foram removidas. No outro talhão as folhas permaneceram sobre o solo. Durante os meses de outubro de 2002 a maio de 2003 três mudas permaneceram expostas em cada talhão por um mês, ao final do qual eram substituídas por novas. Não foi possível diferenciar a importância de conídios e de ascósporos por meio de reação de polimerase em cadeia (PCR) nem de sintomatologia das folhas, pois a infecção foi constatada somente em duas das avaliações realizadas. A relação entre a liberação de ascósporos e as condições climáticas também foi avaliada. Armadilhas caça-esporos foram instaladas em campo comercial e semanalmente o número de ascósporos capturados foi relacionado com a temperatura média diária, com a precipitação diária e a precipitação três dias antes da leitura dos ascósporos. Os resultados obtidos demonstram que a precipitação acumulada em três dias foi relacionada com a liberação de ascósporos pela equação L= 6,45 + 0,04 Pp3d - 0,17 T onde L é a leitura de ascósporos, Pp3d é a precipitação três dias antes da leitura de ascósporos e T é a temperatura, com R2= 0,49. Paralelamente, foram conduzidos experimentos in vitro, visando a determinação de sucos cítricos que favorecessem a germinação de conídios, com o objetivo final de realizar experimentos que avaliassem a influência de períodos descontínuos de molhamento na capacidade de germinação de conídios de P. citricarpa. Suco de laranja das cultivares Pêra e Valência na concentração de 4% mostraram-se os mais favoráveis na indução da germinação de conídios com índice de germinação variando entre 23,89 e 41,81 %. A interrupção do período de molhamento independentemente de ser gradativa ou rápida não influenciou na germinação de conídios, mostrando assim a grande capacidade germinativa do fungo.not availabl

not available

A mancha preta dos citros, causada pelo fungo Guignardia citricarpa Kiely [Phyllosticta citricarpa (McAlp.) Van der Aa.], é uma doença de grande ocorrência no sul do Estado de São Paulo. Estudos epidemiológicos dessa doença ainda são controversos devido principalmente, às diferenças climáticas e do sistema de produção no Brasil, quando comparados com os países pioneiros no estudo da doença. Nesse trabalho, procurou-se elucidar as épocas favoráveis à infecção e a importância relativa de conídios e ascósporos nesse processo por meio de plantas armadilhas. Mudas de limão 'Siciliano' (Citrus limon (L.) Burn. f.), suscetíveis a G. citricarpa, foram colocadas em dois talhões de um pomar de citros em uma propriedade comercial. Num dos talhões as folhas caídas no solo, fonte de inóculo de ascósporos, foram removidas. No outro talhão as folhas permaneceram sobre o solo. Durante os meses de outubro de 2002 a maio de 2003 três mudas permaneceram expostas em cada talhão por um mês, ao final do qual eram substituídas por novas. Não foi possível diferenciar a importância de conídios e de ascósporos por meio de reação de polimerase em cadeia (PCR) nem de sintomatologia das folhas, pois a infecção foi constatada somente em duas das avaliações realizadas. A relação entre a liberação de ascósporos e as condições climáticas também foi avaliada. Armadilhas caça-esporos foram instaladas em campo comercial e semanalmente o número de ascósporos capturados foi relacionado com a temperatura média diária, com a precipitação diária e a precipitação três dias antes da leitura dos ascósporos. Os resultados obtidos demonstram que a precipitação acumulada em três dias foi relacionada com a liberação de ascósporos pela equação L= 6,45 + 0,04 Pp3d - 0,17 T onde L é a leitura de ascósporos, Pp3d é a precipitação três dias antes da leitura de ascósporos e T é a temperatura, com R2= 0,49. Paralelamente, foram conduzidos experimentos in vitro, visando a determinação de sucos cítricos que favorecessem a germinação de conídios, com o objetivo final de realizar experimentos que avaliassem a influência de períodos descontínuos de molhamento na capacidade de germinação de conídios de P. citricarpa. Suco de laranja das cultivares Pêra e Valência na concentração de 4% mostraram-se os mais favoráveis na indução da germinação de conídios com índice de germinação variando entre 23,89 e 41,81 %. A interrupção do período de molhamento independentemente de ser gradativa ou rápida não influenciou na germinação de conídios, mostrando assim a grande capacidade germinativa do fungo.not availabl

Alternative products in the "in vitro" inhibition of Sclerotinia sclerotiorum

The white mold, caused by Sclerotinia sclerotiorum, is a very important disease in tomato crops. The objective of this work was to study the effect of plant extracts, animal residues and industrial by-products extracts on the fungus in vitro growth. Treatments consisted of different concentrations of pyrolignous oil, neem oil, monosodium glutamate, sewage sludge and organic compost [coffee residue (50%) coal residue (10%), maize residue (25%), poultry waste (12.5%), poultry meal (2.5%)]. Positive control consisted of Petri dishes with PDA medium and negative control treatment consisted of PDA medium with procymidone. Fungus colonies were incubated at 22ºC and light intensity of 260 lux. Variables such as mycelium growth rate, sclerotia production, and viability 7 and 17 days after the transfer of mycelium disc to neon media were assessed. The extract of organic compost at 30% was effective in controlling mycelial growth and sclerotia production. This treatment, as well as neem oil at 0.5% increased soil respiration