Identification of Pathogenic Leptospira in Rat and Shrew Populations Using RpoB Gene and Its Spatial Distribution in Boyolali District

Leptospirosis becomes health problem in Indonesia. Until April 2014, cases of leptospirosis transmitted by rats were reported in Boyolali with case fatality rate (CFR) 83.3%. Leptospira genus consists of various serovars and genetic types living in different environment. Classification of Leptospira species based on rpoB gene could be used as this gene has high level of polymorphism. This study aimed to identify Leptospira serovars in rat population using kinship analysis based on rpoB gene polymorphism and to describe spatial distribution of rats with Leptospira positive in Boyolali District. A cross sectional study was conducted on April 2014 at Sindon Village in Ngemplak Subdistrict and Jeron Village in Nogosari Subdistrict, Boyolali District. Polymerase Chain Reaction test was performed on 104 rat kidney samples from the two locations of study. Spatial analysis was conducted to map distribution of rats with Leptospira positive. There were six positive rpoB gene samples in Rattus tanezumi, Rattus argentiventer and Suncus murinus. Five of six positive samples showed the closest genetic kinship to Leptospira borgpetersenii serovar Sejroe based on rpoB gene. One isolate did not have a close genetic kinship to any serovar included in the cluster. Spatial analysis based on home range buffer zone showed that rats with Leptospira positive were found in 30 meter and 150 meter from leptospirosis patients

The First Case of Laboratory-confirmed Dengue Virus Infection in Mimika, Papua Province, Indonesia

Background: Dengue is the most important vector-borne disease that poses serious health problem both in tropical and subtropical countries. Since the first outbreak in Surabaya in 1968, dengue infection has spread in all provinces in Indonesia. Mimika district in Papua province, Indonesia, is a non-endemic dengue area with no laboratory-confirmed case reported. However, until 2012 there were 13 suspected dengue infection admitted to local General Hospital in Mimika district, Papua province, Indonesia. This study described the genetic characteristics of first laboratory-confirmed dengue virus (DENV) infection in Mimika district, Papua province, Indonesia. Methods: Viral isolation in C6/36 cell line, RT-PCR and serotyping were carried out to confirm the presence of DENV within serum patient of suspected DENV cases from Mimika district, Papua Province, Indonesia. Direct sequencing and phylogenetic analysis of complete coding sequence (CDS) of E gene was performed to the samples that have already confirmed positive DENV for viral genotyping. Results: Four cases were confirmed to be DENV by RT-PCR while only 2 samples were able to be culture in C6/36 mosquito cell line. Serotyping confirmed that the DENV from Mimika district, Papua province were DENV3 serotype. The genotyping showed that the DENV3 from Mimika district were belonged to genotype I. Conclusion: This study reported the first laboratory-confirmed of DENV cases in non-endemic dengue area, Mimika district, Papua Province, Indonesia

PENGEMBANGAN DESAIN E-KOMIK TEMATIK BERBASIS PADA PENDIDIKAN LINGKUNGAN HIDUP DENGAN APLIKASI MACROMEDIA-FLASH UNTUK KELAS PERMULAAN SEKOLAH DASAR

Abstrak. Penelitian ini termasuk penelitian pengembangan, karena dalam penelitian ini dikembangkan desain e-komik tematik berbasis pada pendidikan lingkungan hidup dengan aplikasi macromedia-flash untuk kelas permulaan sekolah dasar. Dalam mengembangkan perangkat pembelajaran, mengacu pada unsur-unsur model pengembangan perangkat pembelajaran Tiagarajan yang disebut four-D Models. Pada penelitian ini fokus pengembangan adalah pada media pembelajaran yang berupa desain e-komik tematik berbasis pada pendidikan lingkungan hidup dengan aplikasi macromedia-flash untuk kelas permulaan sekolah dasar. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan dan mendeskripsikan hasil pengembangan yang berupa desain e-komik tematik berbasis pada pendidikan lingkungan hidup dengan aplikasi macromedia-flash untuk kelas permulaan sekolah dasar. Rancangan penelitian yang digunakan pada saat pengembangan penerapan perangkat pembelajaran adalah mengacu pada tahapan pengembangan four-D models yang meliputi empat tahapan yaitu define, design, develope dan diseminate. Urgensi penelitian ini dapat dilihat dari kebermanfaatannya bagi beberapa pihak. Pihak-pihak tersebut adalah siswa, guru, sekolah, masyarakat dan bagi kelestarian lingkungan. Hasil yang dicapai,  menunjukkan bahwa pengembangan pembelajaran baru sampai pada tahap pengembangan e-komik tematik berbasis pada pendidikan lingkungan hidup dengan aplikasi macromedia-flash untuk SD kelas permulaan. Berdasarkan hasil pengembangan perangkat pembelajaran menunjukkan bahwa kualitas desain e-komik tematik berbasis pada pendidikan lingkungan hidup dengan aplikasi macromedia-flash  untuk kelas permulaan sekolah dasar yang dikembangkan adalah baik dan telah memenuhi kelayakan sebagai perangkat pembelajaran di kelas permulaan sekolah dasar serta efektif menunjang pembelajaran. Kata kunci: pengembangan desaine-komik, pendidikan lingkungan hidup, aplikasi macromediaflsa

The prediction of Influenza A/H3N2 Vaccine Efficacy using samples obtained from Indonesian Hajj pilgrims in 2013

Abstrak Latar Belakang: Vaksinasi merupakan salah satu cara efektif dalam mengontrol dan mengurangi beban penyakit yang disebabkan oleh Influenza. Akan tetapi, efikasi vaksin bisa bervariasi jika strain yang digunakan untuk vaksin berbeda dengan strain yang bersirkulasi di dunia. Hal ini menunjukan pentingnya melakukan analisa prediksi efikasi vaksin. Pada studi ini, prediksi efikasi vaksin Influenza A/H3N2 dilakukan berdasarkan perhitungan antigenic distance strain vaksin WHO dengan virus influenza yang berasal dari jemaah Haj iIndonesia pada tahun 2013. Metode: Sekuensing gen HA dilakukan terhadap dua sampel tersimpan yang terkonfirmasi positif Influenza A/ H3N2 yang berasal dari jemaah Haji Indonesia tahun 2013. Pepitope Calculator digunakan untuk menghitung antigenic distance dari dua strain virus influenza dan dilanjutkan dengan perhitungan Pepitope value. Vaksin strain yang direkomendasikan oleh WHO; A/Texas/50/2012, A/Switzerland/9715293/2013, A/HongKong/4801/2014 dan dua virus yang diambil dari jemaah Haji Indonesia pada tahun 2013 dianalisa pada studi ini. Hasil: Prediksi efikasi vaksin yang direkomendasikan WHO tahun 2013 (A/Texas/50/2012) dengan sampel yang berasal dari jemaah Haji Indonesia tahun 2013 menunjukkan hasil lebih rendah dibandingkan dengan strain vaksin untuk musim flu pada tahun selanjutnya. Hasil ini sesuai dengan hasil analisis filogenetik dan perbandingan asam amino dimana sampel pada studi ini berkerabat lebih dekat dengan strain vaksin untuk musim flu selanjutnya dengan perbedaan asam amino yang lebih sedikit di bagian epitope protein HA dibandingkan dengan vaksin tahun 2013. Kesimpulan: Perhitungan efikasi vaksin menggunakan antigenic distance antara strain vaksin WHO dan virus yang menginfeksi jemaah haji Indonesia pada tahun 2013 menunjukkan hasil yang rendah. (Health Science Journal of Indonesia 2018;9(1):1-7) Keywords: Efikasi vaksin, Influenza A/H3N2, jemaah Haji, Indonesia Abstract Background: Influenza vaccination is an effective approach to control and reduce the disease burden of influenza viruses. However, the efficacy of influenza vaccine varies every year due to the different antigenic distance between vaccine and the circulating influenza strains globally and therefore necessitates the study of vaccine efficacy (VE). This study describes the prediction of Influenza A/H3N2 VE based on antigenic distances WHO vaccine strains and the virus obtained from Indonesian Hajj pilgrims in 2013. Methods: Coding between Sequence of HA gene of Influenza A/H3N2 virus was obtained from archival samples of Indonesian Hajj Pilgrims in 2013. Pepitope value calculation using Pepitope Calculator to measure the antigenic distance of HA sequences of two influenza strains was implemented. The HA sequences of WHO vaccine strains: A/ Texas/50/2012, A/Switzerland/9715293/2013, A/HongKong/4801/2014 and two influenza viruses from Indonesian Hajj pilgrims in 2013 were analyzed. Results: This study predicted that influenza vaccine strain recommended by WHO for 2013 (A/Texas/50/2012) have low efficacy to the influenza virus obtained from Indonesian Hajj Pilgrim in 2013 while showing higher efficacy to vaccine strain recommended for the following year. This result was in line with phylogenetic analysis and amino acid differences in which the samples in this study were grouped together with vaccine strain in following years and had less amino acid differences in epitope located in HA protein compared with 2013 vaccine strain. Conclusion: The prediction of VE using the antigenic distance measurement between WHO vaccine strain and Indonesian Hajj pilgrim collected in 2013, is considered low. (Health Science Journal of Indonesia 2018;9(1):1-7) Keywords: Vaccine efficacy, influenza A/H3N2 virus, Hajj pilgrim, Indonesi

PENINGKATKAN AKTIVITAS DAN HASIL BELAJAR SISWA DENGAN PENERAPAN PENDEKATAN SAINTIFIK DAN MEDIA BENDA ASLI PADA PEMBELAJARAN IPA KELAS IV DI SDN MARON KIDUL II KECAMATAN MARON KABUPATEN PROBOLINGGO

 Abstrak. Metode Pendekatan Sentifik sangat cocok Untuk meningkatkan aktivitas siswa dalam Kegiatan Pembelajaran kepada siswa sehingga Keaktifan siswa dalam belajar mengajar tidak merasa bosan, dengan demikian siswa akan terlibat secara fisik, emosional dan intelektual, diharapkan konsep membedakan berbagai bentuk energi yang diajarkan guru dapat dipahami oleh siswa, permasalah yang ingin dikaji dalam penelitian ini adalah: (1) peningkatan prestasi belajar IPA dengan Pendekatan Saintifik? (2) bagaimanakah pengaruh menggunakan media asli, kemotivasi belajar siswa? sedangkan tujuan dari penelitian ini adalah: (a) perbandingan kemajuan pembelajaran menggunakan metode saintifik (b) ingin mengetahui pengaruh motivasi belajar siswa setelah diterapkan pendekatan saintifik. Penelitian ini menggunakan penelitian tindakan sebanyak tiga puataran, setiap putaran terdiri dari empat tahap yaitu: rancangan, kegiatan, dan pengamanan, refleksi, dan refisi. Sasaran penelitian ini adalah siswa kelas IV SD Negeri Maron Kidul II Kabupaten Probolinggo tahum Pelajaran 2015/2016. Data yang diperoleh berupa hasil tes formatif, lembar observasi kegiatan belajar mengajar. Dari hasil anaisis di dapatkan bahwa prestasi belajar siswa mengalami peningkatan dari Pra siklus, siklus I sampai siklus II yaitu, Pra siklus (38,89%)  siklus I (60%) dan Siklus II (88,89%). Kesimpulan dari penelitian ini adalah pembelajarn dengan metode saintifik sangat tepat untuk kemajuan dan prestasi siswa dalam pembelajan dan prestasi siswauntuk kelas IV SD Negeri Maron Kidul II Kecamatan Maron Kabupaten Probolinggo tahu Pelajaran 2015/2016. Metode pembelajaran Saintifik ini sangat tepat sekali dilaksanakan untuk pelajaran ilmu pengetahun alam kelas IV. Kata kunci: Mata Pelajaran IPA, Pendekatan Saintifik, Media Asli

Faktor –Faktor Yang Mempengaruhi Nilai Perusahaan Bumn Di Bursa Efek Indonesia Tahun 2011-2015

This study aims to examine the factors that affect the value of state enterprises in the Indonesia Stock Exchange Year 2011-2015. State companies have an important role in the Indonesian economy. State companies also serve to generate revenue for the Indonesian government to fund the Indonesian State Budget. Factors affecting the value of state firms tested in this research are Cash Holding, Leverage, Exchange Rate, Net Working Capital, ROA, Size, and Firm Age. In addition, this study also uses control variables to test the effect of independent variables on the dependent variable of firm value. The control variables used in this study are International Trade, Growth Opportunity, GDP per capita, and Total Asset Turnover Ratio. This study uses a sample of state companies listed on the IDX 2011-2015. This research uses multiple regression analysis to test the influence of independent variable and control variable to Dependent variable. The results show that Cash Holding, Leverage, Exchange Rate, Net Working Capital, ROA, Size, Firm Age, International Trade, Growth Opportunity, GDP per capita, and Total Asset Turnover Ratio simultaneously have significant effect on firm value measured by tobin-q. The t test shows that firm size partially has a significant negative effect on firm value while other variables show insignificant results

PENERAPAN METODE EKSPERIMEN UNTUK MENINGKATKAN AKTIVITAS DAN HASIL BELAJAR IPA SISWA KELAS VI POKOK BAHASAN KONDUKTOR DAN ISOLATOR SDN SEMBORO PROBOLINGGO TAHUN PELAJARAN 2012/2013

Abstrak Metode eksperimen adalah salah satu metode yang dapat digunakan oleh guru sebagai dasar dalam melaksanakan pembelajaran. Penelitian ini termasuk Penelitian Tindakan Kelas (PTK) yang dilakukan untuk meningkatkan aktivitas dan hasil belajar siswa pada pembelajaran IPA melalui metode eksperimen. Penelitian Tindakan Kelas (PTK) ini dilaksanakan sebanyak 2 siklus dan meliputi empat tahap yaitu: kegiatan perencanaan, tindakan, observasi, dan refleksi. Subjek dalam penelitian ini adalah seluruh siswa kelas VI SDN Seboro Probolinggo tahun pelajaran 2012/2013. Metode pengumpulan data yang digunakan adalah: observasi, wawancara, dokumentasi, dan tes. Hasil penelitian menunjukkan bahwa aktivitas belajar siswa dalam pembelajaran IPA melalui metode eksperimen mengalami peningkatan dari siklus I ke siklus II. Hasil observasi menunjukkan persentase rata-rata aktivitas belajar siswa pada siklus I sebesar 65,53% (kategori aktif), meningkat pada siklus II sebesar 80,6% (kategori sangat aktif), sehingga meningkat sebesar 15,07%. Persentase hasil belajar siswa dalam pembelajaran IPA melalui metode eksperimen pada pokok bahasan konduktor dan isolator juga mengalami peningkatan. Pada siklus I mencapai 55% dan pada siklus II mencapai 85%, sehingga meningkat sebesar 30%.   Kata Kunci : metode eksperimen, Penelitian Tindakan Kelas (PTK), aktivitas belajar siswa, hasil belajar siswa. &nbsp