Divergência genética entre híbridos de tangerina 'Cravo' com laranja 'Pêra'

Os marcadores moleculares têm sido utilizados como ferramentas em programas de melhoramento por hibridação sexual, permitindo a caracterização genética de grande número de genótipos. Os marcadores moleculares RAPD são os mais utilizados pois as técnicas empregadas são simples e de baixo custo. Avaliou-se a divergência genética entre híbridos F1 de tangerina 'Cravo' (Citrus reticulata Blanco) com laranja 'Pêra' (C. sinensis (L.) Osbeck) e estudou-se a variabilidade e a similaridade desses materiais entre si e em relação aos parentais. Reações RAPD, com 102 primers, foram realizadas em uma população de 94 híbridos e nos parentais. As análises multivariadas de divergência genética de componentes principais e agrupamento de Tocher foram realizadas, considerando-se, somente, os fragmentos polimórficos. As distâncias genéticas foram obtidas por meio do complemento aritmético do índice de Jaccard. Gráficos bidimensionais de dispersão das distâncias dos híbridos e parentais e da análise de divergência por meio de componentes principais foram construídos. Verificou-se elevada similaridade genética entre as variedades Cravo e Pêra e seus híbridos, demonstrando uma distribuição praticamente aleatória dos híbridos em relação aos parentais, porém em posições intermediárias. A análise de componentes principais apresentou aplicabilidade reduzida no estudo da divergência genética dos híbridos. O método de otimização de Tocher possibilitou a classificação dos híbridos e parentais em função de sua similaridade genética.Molecular markers have been used as tools in breading programs of sexual hybridation, allowing the genetic characterization of a large number of genotypes. The RADP markers are the most used since the employed techniques are simple and of low cost. To evaluate the genetic divergence among F1 hybrids of 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck), this study analyses the variability and similarity of the hybrids among themselves and with their parents. Random Amplified Polimorfic DNA marker analysis, with 102 primers, were applied to a population composed of 94 hybrids and their parents. Multivariate genetic divergence analysis of the principal components and Tocher grouping were carried out only considering the polymorphic fragments. Genetic distances were calculated by the arithmetic complement of the Jaccard index. Bidimensional dispersion graphs among hybrid and parent distances and of the divergence analysis by principal components were constructed. High genetic similarity among Cravo and Pêra varieties and their hybrids was verified, showing a casual distribution from the hybrids in relation to the parents, but in intermediary positions. The principal component analysis showed little applicability in the study of hybrid genetic divergence. The hybrids and parents were classified in groups based on the genetic similarity, using the Tocher optimization method

Processos de seleção em uma população de híbridos de citros usando marcadores RAPD

The objective of this work was to evaluate the processes of selection in a citrus hybrid population using segregation analysis of RAPD markers. The segregation of 123 RAPD markers between 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck) was analysed in a F1 progeny of 94 hybrids. Genetic composition, diversity, heterozygosity, differences in chromosomal structure and the presence of deleterious recessive genes are discussed based on the segregation ratios obtained. A high percentage of markers had a skeweness of the 1:1 expected segregation ratio in the F1 population. Many markers showed a 3:1 segregation ratio in both varieties and 1:3 in 'Pêra' sweet orange, probably due to directional selection processes. The distribution analysis of the frequencies of the segregant markers in a hybrid population is a simple method which allows a better understanding of the genetics of citrus group.O objetivo deste trabalho foi avaliar processos de seleção em uma população híbrida de citros, por meio de análise da segregação de marcadores RAPD. A segregação de 123 marcadores RAPD entre tangerina 'Cravo' (Citrus reticulata Blanco) e laranja 'Pêra' (C. sinensis (L.) Osbeck) foi analisada em uma progênie F1 composta por 94 híbridos. Composição genética, diversidade, heterozigosidade, diferenças estruturais dos cromossomos e presença de genes deletérios recessivos nos parentais foram discutidas com base nos tipos de segregação obtidos. Uma porcentagem elevada de marcadores com segregação distorcida em relação à proporção 1:1 esperada foi obtida na população F1. Muitos marcadores apresentaram segregação 3:1 em ambas as variedades e 1:3 em laranja 'Pêra' provavelmente decorrente de um processo de seleção direcional. A análise de distribuição da freqüência dos marcadores segregantes na população híbrida é um método simples que possibilita uma melhor compreensão da genética do grupo citros

Genetic diversity among hybrids of 'Cravo' mandarin and 'Pêra' sweet orange

Marcadores moleculares RAPD foram utilizados para avaliar a diversidade genética em uma população de 94 híbridos de tangerina 'Cravo' (Citrus reticulata Blanco) com laranja 'Pêra' (C. sinensis (L.) Osbeck), obtidos por polinização controlada. Nas reações de amplificação foram usados 102 "primers" decâmeros de seqüência arbitrária, que amplificaram 640 fragmentos, sendo 77,2% monomórficos entre os parentais. Utilizou-se o coeficiente de Jaccard para estimar a similaridade genética entre os híbridos, o método UPGMA para gerar o fenograma (NTSYS 1,7) e o software BOOD para determinar a consistência de cada agrupamento. Verificou-se que a laranja 'Pêra' apresenta maior heterozigosidade que a tangerina 'Cravo', sendo, respectivamente, 180 e 126 os números observados de loci em heterozigose. Houve alta similaridade genética entre os parentais, caracterizada pelo baixo polimorfismo de marcadores RAPD. Não houve a formação de agrupamentos estatisticamente significativos dos híbridos entre si e com os parentais, demonstrando que a constituição genética dos híbridos foi originada pela segregação independente das marcas RAPD, sendo quebrado o efeito de ligação em função do tamanho amostral em estudo. Híbridos com maior similaridade genética em relação à tangerina 'Cravo' e laranja 'Pêra' podem ser facilmente selecionados a partir de marcadores RAPD.RAPD molecular markers were used to evaluate the genetic diversity in a progeny of 94 hybrids between 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck), obtained by controlled pollination. One hundred two random decamer primers were screened, amplifying 640 fragments, 77.2% monomorphics between the parents. The Jaccard coefficient was used to estimate the genetic similarity among the hybrids, the UPGMA method to establish the phenogram (NTSYS 1.7) and the software BOOD to determine the significance of each cluster. The results indicated that 'Pêra' sweet orange heterozygosity degree is higher than 'Cravo' mandarin, with 180 and 126 loci in heterozygose, respectively. It was observed high genetic similarity between the parents, characterized by the low degree of RAPD polymorphism. Significant statistic groups were not established among the hybrids and the parents, showing that the hybrid genetic constitution was originated by independent RAPD markers segregation. Then, the ligation effect was broken because of the sample size. Hybrids with high genetic similarity degree in relation to 'Cravo' mandarin and 'Pêra' sweet orange could be easily selected using RAPD markers

not available

Culturas monozoospóricas de Phytophthora, num total de dezesseis, originárias do Estado de São Paulo, foram estudadas quanto as suas características morfológicas, culturais, moleculares e sensibilidade ao fungicida metalaxyl. Todos os isolados foram identificados como P. parasitica pelas suas características morfológicas, culturais e fisiológicas. Houve diferenças estatísticas entre os isolados quanto a suas dimensões no comprimento (c), largura (l) e relação c/l dos esporângios em meio cenoura-dextrose, incubados a 25ºC; assim como na capacidade de produção de clamidósporos no mesmo meio. Todos os isolados foram sensíveis ao metalaxul, todos crescendo na concentração de 1 ppm, a maioria na concentração de 10 ppm e alguns isolados a 100 ppm, apesar que no último caso ao redor do disco que continha micélio do patógeno. O qual vem a demonstrar que há genótipos com alguma tolerância ao produto no Estado de São Paulo. Essa tolerância teve uma distribuição independente do local de isolamento e a análise molecular com a técnica de RAPD não foi suficientemente sensível par detectar grupos com similaridade genética com essa característica. A técnica de RAPD conseguiu distinguir os isolados, mas observou-se uma baixa diversidade genética entre eles, apesar de terem sido isolados em diferentes pontos do Estado. Mesmo assim houve diferenças entre isolados provindos da mesma cultura originalnot availabl

Macrofungi in citrus nursery

As mudanças na produção de mudas cítricas, com o uso de compostos a base de casca de pínus, vem levando a uma interação antagônica entre os citros e algumas espécies de cogumelos, ditos saprófitas. Este trabalho caracterizou esta nova interação, identificando e isolando os basidiomicetos associados ao problema e outros macrofungos presentes neste sistema de produção. O principal fungo encontrado foi Leucocoprinus birnbaumii que forma basidiomas de cor creme a amarelo brilhante, ocorrendo dois tipos morfológicos (LB e NTA). O micélio promove a impermeabilização no substrato dependendo das condições hídricas, o qual explica a variação nas perdas. Os esporos são produzidos após a abertura do píleo, sendo que a recomendação da coleta dos cogumelos fechados está sendo uma prática adotada nos viveiros. In vitro, as colônias são brancas para creme, tendo uma taxa de crescimento em diâmetro de 0,41 a 0,72 cm/dia em meio cenoura-ágar (CA), variando em função do isolado e da sua procedência. O pH não teve grande influência, mesmo variando de 4,5 a 8,0. O crescimento das colônias foi decrescendo nos meios de cultura CA, aveia-ágar, V8, BDA, malte-ágar e completo de Pontecorvo; enquanto que nos de composição definida, o meio Czapek (0,56 cm/dia) foi superior ao meio mínimo (0,48 cm/dia). Entre as fontes de carbono, o amido foi o melhor, seguido da galactose, maltose, glicerol, glicose, ágar, sacarose, ácido succínico e lactose, não houve crescimento em acetato de amônio nem em oxalato de sódio. Entre as fontes de nitrogênio, os compostos nítricos foram semelhantes aos aminoácidos (glutamato, glutamina e glicina) e ligeiramente preferenciais aos amoniacais, enquanto a uréia inibiu o crescimento e o nitrito de sódio teve efeito fungicida. Nos experimentos realizados em viveiro comercial, o de controle químico teve aumento da produção de cogumelos para a maioria dos fungicidas avaliados, com exceção da iprodiona; o qual é explicado pelo efeito sobre os fungos agentes do controle biológico, como foram associados aos basidiomas Aspergillus niger, Aureobasidium pullulans e Penicillium olsoni. No experimento de controle biológico, as espécies de Trichoderma foram muito variáveis na sua eficiência, alguns colonizando até o substrato, mas não os cogumelos. O experimento com produtos alternativos teve melhores resultados de controle principalmente com o nitrito de sódio, o qual vem sendo adotado no controle deste basidiomiceto via aplicação no substrato e o vinagre pelo uso superficial. Outros macrofungos foram observados como o ninhode- passarinho (Cyathus stercorius); o cogumelo branco (Leucocoprinus brebissonii); a falsa trufa (Agaricaceae incertae sedis) e o cogumelo vermelho (Gymnopilus dilepis). A presença do cogumelo branco também causou preocupação nos viveiristas, mas não apresentou efeito nas plantas, nem impermeabilização. Entretanto, o cogumelo vermelho vem causando problemas na produção com fibra de coco por dimuir a capacidade de retenção de água. A falsa trufa também provoca prejuízos diretos diminuindo o desenvolvimento das mudas cítricas, tendo menor número de radicelas, provavelmente associado à maior temperatura na decomposição do substrato. Assim, há uma necessidade de um contínuo levantamento dos novos macrofungos que possam se adaptar às condições de substratos e de manejo nos viveiros de mudas cítricas.Changes in the production of citrus nursery, using compounds from pine bark, have led to an antagonistic interaction between the citrus and some species of mushrooms, so-called saprophytes. This study characterized this new interaction, by identifying and isolating basidiomycetes associated to the problem and other macrofungi present in this production system. The main basidiomycete found was Leucocoprinus birnbaumii which has cream-colored to bright yellow, occurring two morphological types (LB and NTA). The mycelium promotes the sealing of the substrate depending on water conditions, for which there is much variation in losses. The spores are produced after the opening of the pileus, and the collection of closed cap has been adopted as a practice in citrus nurseries. In vitro, the colonies vary from cream to yellow, with a growth rate in diameter from 0.41 to 0.72 cm / day in the carrot-agar (CA) medium, depending on the isolate and its origin. The pH was not of great influence, even varying from 4.5 to 8.0. The colony growths was decreasingly in the culture medium CA, oatmeal agar, V8, PDA, malt agar and complete Pontecorvo, whereas the composition set, the Czapek medium (0.56 cm / day) was higher than the minimal medium (0.48 cm / day). Among the carbon sources, starch was the best, followed by galactose, maltose, glycerol, glucose, agar, sucrose, succinic acid and lactose, no growth in ammonium acetate or sodium oxalate. Among the sources of nitrogen, nitric compounds were similar to aminoacids (glicine, glutamate and glutamine) and were slightly preferred to ammonium, whereas urea inhibited the growth and sodium nitrite had fungicidal effect. In the experiments in citrus nursery, the chemical control assay, most fungicides has led to an increased production of mushrooms, except for iprodione, which is explained by the effect on fungal-biological control agents, which have been associated as Aspergillus niger, Aureobasidium pullulans and Penicillium olsoni. In the biological control experiment, Trichoderma species were highly variable in their efficiency, some of them colonized the substrate, but not the mushrooms. The experiment with unconvencional products has led to better results, especially with sodium nitrite, which has been adopted to control the substrate and vinegar in surface application. Other macrofungi were observed as the nest-to-bird (Cyathus stercorius), the white mushroom (Leucocoprinus brebissonii), the false truffle (Agaricaceae incertae sedis) and the Red Mushroom (Gymnopilus dilepis). The presence of the white mushroom has also caused concern in the nursery, but had no effect on plants, or sealing. However, the red mushroom is causing problems in the production of coconut fiber, leaving the fibers, which have no function in water retention. The false truffle also causes direct losses decreasing the development of the citrus trees, and fewer fibrous roots, probably associated to higher temperature in the decomposition of the substrate. Thus, there is a need for a new continuous survey of macrofungi that can adapt to the conditions of substrate and management in citrus nurserie

not available

Culturas monozoospóricas de Phytophthora, num total de dezesseis, originárias do Estado de São Paulo, foram estudadas quanto as suas características morfológicas, culturais, moleculares e sensibilidade ao fungicida metalaxyl. Todos os isolados foram identificados como P. parasitica pelas suas características morfológicas, culturais e fisiológicas. Houve diferenças estatísticas entre os isolados quanto a suas dimensões no comprimento (c), largura (l) e relação c/l dos esporângios em meio cenoura-dextrose, incubados a 25ºC; assim como na capacidade de produção de clamidósporos no mesmo meio. Todos os isolados foram sensíveis ao metalaxul, todos crescendo na concentração de 1 ppm, a maioria na concentração de 10 ppm e alguns isolados a 100 ppm, apesar que no último caso ao redor do disco que continha micélio do patógeno. O qual vem a demonstrar que há genótipos com alguma tolerância ao produto no Estado de São Paulo. Essa tolerância teve uma distribuição independente do local de isolamento e a análise molecular com a técnica de RAPD não foi suficientemente sensível par detectar grupos com similaridade genética com essa característica. A técnica de RAPD conseguiu distinguir os isolados, mas observou-se uma baixa diversidade genética entre eles, apesar de terem sido isolados em diferentes pontos do Estado. Mesmo assim houve diferenças entre isolados provindos da mesma cultura originalnot availabl

DIFERENCIAÇÃO MORFOLÓGICA DE 14 VARIEDADES LOCAIS DE MANDIOCA E MACAXEIRA DA REGIÃO DE SANTARÉM-PARÁ

O Brasil vem diminuindo a produção de mandioca e passou de maior produtor no mundo para o quarto lugar, entretanto, o Pará é o principal produtor no país e vem aumentando a sua produção ao longo dos anos. Agricultura familiar destaca-se nesta produção, pelo uso de variedades selecionadas localmente e muitas vezes renomeadas pelos produtores, o que provoca dificuldades para saber o real material que estão sendo usados por eles. O objetivo deste projeto é caracterizar as diferentes variedades de mandioca/macaxeira (Manihot esculenta) cultivadas e comercializadas na região de Santarém por meio de descritores morfológicos. 14 variedades locais foram plantadas para a caracterização pelos descritores aos três meses, seis meses e na colheita. As variedades recebidas na época da estiagem foram plantadas em sacos com duas a três gemas, até seu plantio no local definitivo, já as recebidas na época da chuva foram plantadas no local definitivo com manivas contendo cinco gemas. Todas as manivas foram desinfetadas superficialmente em solução de hipoclorito de sódio a 200 ppm por dois minutos. Esta caracterização ajudará os produtores na descrição certa das variedades, fazendo uma homogeneização da nomenclatura popular com o científico para garantir uma produção mais estável para a agricultura familiar. Palavras-chave: descritores morfológicos; Manihot esculenta; germoplasma

Selection processes in a citrus hybrid population using RAPD markers

The objective of this work was to evaluate the processes of selection in a citrus hybrid population using segregation analysis of RAPD markers. The segregation of 123 RAPD markers between 'Cravo' mandarin (Citrus reticulata Blanco) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis (L.) Osbeck) was analysed in a F1 progeny of 94 hybrids. Genetic composition, diversity, heterozygosity, differences in chromosomal structure and the presence of deleterious recessive genes are discussed based on the segregation ratios obtained. A high percentage of markers had a skeweness of the 1:1 expected segregation ratio in the F1 population. Many markers showed a 3:1 segregation ratio in both varieties and 1:3 in 'Pêra' sweet orange, probably due to directional selection processes. The distribution analysis of the frequencies of the segregant markers in a hybrid population is a simple method which allows a better understanding of the genetics of citrus group