Protease inhibitors targeting coronavirus and filovirus entry.

In order to gain entry into cells, diverse viruses, including Ebola virus, SARS-coronavirus and the emerging MERS-coronavirus, depend on activation of their envelope glycoproteins by host cell proteases. The respective enzymes are thus excellent targets for antiviral intervention. In cell culture, activation of Ebola virus, as well as SARS- and MERS-coronavirus can be accomplished by the endosomal cysteine proteases, cathepsin L (CTSL) and cathepsin B (CTSB). In addition, SARS- and MERS-coronavirus can use serine proteases localized at the cell surface, for their activation. However, it is currently unclear which protease(s) facilitate viral spread in the infected host. We report here that the cysteine protease inhibitor K11777, ((2S)-N-[(1E,3S)-1-(benzenesulfonyl)-5-phenylpent-1-en-3-yl]-2-{[(E)-4-methylpiperazine-1-carbonyl]amino}-3-phenylpropanamide) and closely-related vinylsulfones act as broad-spectrum antivirals by targeting cathepsin-mediated cell entry. K11777 is already in advanced stages of development for a number of parasitic diseases, such as Chagas disease, and has proven to be safe and effective in a range of animal models. K11777 inhibition of SARS-CoV and Ebola virus entry was observed in the sub-nanomolar range. In order to assess whether cysteine or serine proteases promote viral spread in the host, we compared the antiviral activity of an optimized K11777-derivative with that of camostat, an inhibitor of TMPRSS2 and related serine proteases. Employing a pathogenic animal model of SARS-CoV infection, we demonstrated that viral spread and pathogenesis of SARS-CoV is driven by serine rather than cysteine proteases and can be effectively prevented by camostat. Camostat has been clinically used to treat chronic pancreatitis, and thus represents an exciting potential therapeutic for respiratory coronavirus infections. Our results indicate that camostat, or similar serine protease inhibitors, might be an effective option for treatment of SARS and potentially MERS, while vinyl sulfone-based inhibitors are excellent lead candidates for Ebola virus therapeutics

Inhibitors of SARS-CoV entry--identification using an internally-controlled dual envelope pseudovirion assay.

Severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-CoV) emerged as the causal agent of an endemic atypical pneumonia, infecting thousands of people worldwide. Although a number of promising potential vaccines and therapeutic agents for SARS-CoV have been described, no effective antiviral drug against SARS-CoV is currently available. The intricate, sequential nature of the viral entry process provides multiple valid targets for drug development. Here, we describe a rapid and safe cell-based high-throughput screening system, dual envelope pseudovirion (DEP) assay, for specifically screening inhibitors of viral entry. The assay system employs a novel dual envelope strategy, using lentiviral pseudovirions as targets whose entry is driven by the SARS-CoV Spike glycoprotein. A second, unrelated viral envelope is used as an internal control to reduce the number of false positives. As an example of the power of this assay a class of inhibitors is reported with the potential to inhibit SARS-CoV at two steps of the replication cycle, viral entry and particle assembly. This assay system can be easily adapted to screen entry inhibitors against other viruses with the careful selection of matching partner virus envelopes

Semilleros de Investigación 2017

Con esta publicación de los resultados de investigación elaborados por semilleros compuestos por estudiantes de pregrado, pertenecientes a sus dos unidades académicas, la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales de la Universidad Nacional de Colombia celebra los veinte años de una política académica que ha permitido, dentro de sus programas curriculares básicos, la integración entre la docencia y la investigación, y favorecido la interrelación con la sociedad colombiana. Los semilleros de investigación han constituido una actividad multiforme que aparte de ofrecerle a los y las estudiantes de los programas académicos de Derecho y Ciencia Política la posibilidad de empezar a transitar por el camino de la investigación académica les permite diseñar e implementar programas propios de autoformación en áreas específicas del conocimiento, orientados por docentes de planta u ocasionales y por docentes de posgrado. Asimismo, ha permitido la incorporación de dichos estudiantes a los grupos de investigación, la sistematización de procesos de reflexión iniciados en una o varias asignaturas o la participación en proyectos que buscan responder a los problemas políticos y sociales que afectan a la sociedad colombiana, latinoamericana y, en ocasiones, a las de otros continentes o que tienen una dimensión global. Por tal razón, constituyen escenarios alternos e informales de docencia y extensión. Investigaciones en Construcción incluye los artículos escritos por las y los participantes de nueve semilleros. Cuatro de ellos del Departamento de Derecho, conformados por once estudiantes, y cinco del Departamento de Ciencia Política, conformados por veintiún estudiantes. Aunque la mayor parte de las investigaciones tienen una orientación interdisciplinaria, llama la atención que en ninguno de los semilleros se haya logrado la articulación entre alumnos de Derecho y Ciencia Política. La sinergia entre estos dos campos del conocimiento, como un criterio para las convocatorias de los próximos años, podría ser un mecanismo de integración académica destinado a evitar la hiperespecialización que tiende a fragmentar e individualizar las investigaciones universitarias y a trivializar las reformas curriculares que buscan desarrollar capacidades intelectuales complejas. Los temas escogidos por los semilleros ilustran los intereses de las nuevas generaciones de estudiantes. El análisis crítico de la jurisprudencia constitucional y de la dogmática jurídica, en temas relacionados con la teoría de la sustitución (pp. 17-45) o con las Zonas de Interés de Desarrollo Rural, Económico y Social (Zidres) (pp. 47-79) demuestran la pretensión de realizar investigaciones que, sin abandonar la especificidad de lo jurídico, estén guiadas por preguntas sobre los efectos y las casusas sociales y políticas de las normas positivas y los fallos judiciales. En estos artículos resulta clara la preocupación por encontrar metodologías que permitan responder a los interrogantes generados en el campo del derecho y, simultáneamente, orientar las investigaciones hacia análisis social, más allá de las dicotomías artificiales entre lo técnico-jurídico y lo sociojurídico. Al mismo tiempo, la perspectiva intercultural invita a superar el eurocentrismo jurídico y político, predominante en la academia colombiana. La dualidad entre la norma social y la jurídica, resaltada en el artículo sobre el pueblo indígena murui muina (pp. 81- 116), refleja la inexistencia en la sociedad colombiana de purismos culturales, más allá de los reivindicados por ciertos sectores indigenistas que ven en ellos una estrategia política para proteger a las comunidades amenazadas desde las posiciones culturales hegemónicas o por corrientes que, dentro de ópticas racistas, pretenden imponer la cultura occidental como arquetipo de la civilización. Algo similar, en términos del descentramiento cultural, sucede en el estudio decolonial que, desde la participación de la comunidad campesina en el debate sobre las delimitaciones del páramo de Sumapaz, dialoga con la filosofía rawlsiana, para encontrarle alternativas deliberativas al régimen político colombiano (pp. 117-146). El carácter pluriétnico y pluricultural consagrado en la Constitución Política colombiana exige, de acuerdo con estos textos, la superación de un multiculturalismo que se fundamenta en el reconocimiento de la diversidad, sin propugnar por la igualdad dentro de la diferencia. Dentro del campo de la cultura política, otro de los semilleros analiza, desde la teoría de las redes sociales, las representaciones de los actores estatales y no gubernamentales sobre la seguridad y defensa de líderes sociales y defensores de derechos humanos en Colombia (pp. 147-176). Su trabajo evidencia cómo la desarticulación gubernamental en este campo dificulta la construcción de una política pública coherente, para responder al asesinato de líderes y lideresas, y a la denuncia de las organizaciones populares y de derechos humanos, orientada a solucionar una de las principales fallas de la democracia colombiana, la relacionada con la más elemental protección de la vida de quienes dirigen o conforman las organizaciones populares y la protesta que estas promueven. Desde otra perspectiva, la relacionada con el análisis crítico del discurso en los medios de comunicación digital, específicamente en El Tiempo y El Espectador, otro grupo de estudiantes analiza las ambigüedades de ambos periódicos frente a la Jurisdicción Especial para la Paz (jep) (pp. 177-205), la cual, según el artículo, lleva a enfatizar en el manejo de las noticias, los temas relativos a la justicia punitiva y a los beneficios y garantías a los victimarios, sobre los referentes a la reparación de las víctimas, como parte de la reconstrucción del tejido social, y al tránsito de los excombatientes a la vida civil. El único texto teórico de la publicación trabaja la recepción de la teoría política de Gramsci en América Latina, y su retroalimentación, alrededor de tres ejes analíticos: 1) los procesos de constitución de los sujetos políticos; 2) la relación entre “estructura y super-estructura”, y 3) el economicismo en el análisis de los procesos revolucionarios (pp. 207-226). La lectura crítica que hace el semillero, sin caer en anacronismos, y el análisis de las interpretaciones latinoamericanas de la obra gramsciana, demuestra la fertilidad de las investigaciones que permitan entender no solo la recepción de teorías producidas en otros contextos culturales, sino también la posibilidad de enriquecerlas y transformarlas mediante la mutación de sus conceptos y de su articulación sistemática, de acuerdo con ámbitos espaciales y temporales diferentes a los de las sociedades y las relaciones sociales en los que tuvieron origen. La corriente denominada poscolonial no puede limitarse a la afirmación de la otredad frente a las formas de pensamiento dominantes, sin importar el espectro político, sino que debe deconstruirlas críticamente para comprender, en medio de diálogos interculturales, sus potencialidades o limitaciones. La clausura cultural en tono a una identidad cerrada y reactiva sea esta teórica, analítica, académica o meramente subjetiva, es una herencia negativa de la experiencia colonial. Finalmente, como corolario de un eje que resulta transversal a todas las investigaciones, la alteridad social y política frente a los actores o sujetos hegemónicos en la vida política y social colombiana, adquiere relevancia en los artículos sobre la concepción de la democracia en las farc (pp. 227-249) y sobre la participación y representación de las mujeres en la rama legislativa colombiana entre 2010 y 2018 (pp. 251-297). En ambos casos, se intenta hacer visibles elementos de una organización insurgente o de la lucha de las mujeres por la igualdad en la diferencia, que tienden a quedar en la penumbra del conocimiento académico colombiano. Más allá de los esquemas interpretativos sobre las clases sociales y las diferencias de género o sexo, los artículos intentan ilustrar el ideario democrático de una de las principales organizaciones insurgentes de la historia colombiana o la importancia, en lo atinente a las luchas de las mujeres por el reconocimiento y la equidad, del ejercicio de la representación política institucional en el poder legislativo colombiano. Dentro de la universidad colombiana, en términos generales, solo los docentes tienen la oportunidad de apreciar la riqueza de los análisis de los dicentes, aunque con frecuencia, en medio de las limitaciones que tienen los trabajos dentro de las asignaturas ofrecidas en el currículo formal. Por el contrario, publicaciones como Investigaciones en Construcción les permite a los lectores interesados en el derecho y la ciencia política conocer la riqueza analítica e interpretativa de los estudiantes de una institución pública como la Universidad Nacional de Colombia. Como resulta obvio dentro de un proceso de formación, junto a las fortalezas académicas y heurísticas de los textos, y las investigaciones que los soportan, hay debilidades en lo atinente a la relación entre los métodos y los marcos teóricos, las generalizaciones no sustentadas, el enriquecimiento argumentativo de prejuicios previos o la ausencia de estados de arte sistemáticos sobre los temas tratados. Sin embargo, estos problemas, que incluso se presentan en los documentos de investigadores con un largo recorrido académico, no socavan la vitalidad y creatividad del trabajo de los estudiantes de la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales, que, posteriormente van a cualificar la vida académica, social y política del país

Desarrollo e implementación de un aplicativo móvil que se adapta al proceso de conservación de demillas en el programa de recursos genéticos (Allianza Bioversity Ciat), basados en los aplicativos de recepción_tablet y inventario_tablet garantizando la comunicación a la base de datos Gringlobal

La diversidad de los cultivos es fundamental para luchar contra el hambre y para el futuro de la agricultura, por eso es indispensable la producción, adquisición e intercambio de información en esta área, todo esto hace necesario el desarrollo de productos y servicios de información que permitan lograrlo. Bajo esta premisa, el presente trabajo tiene como objetivo la realización de un aplicativo móvil para la empresa Allianza Bioversity CIAT, que permita el procesamiento de la información de una forma centralizada y automatizada más eficiente que los métodos manuales, llamado GGRecepciónConteo. Este trabajo se realiza mediante la metodología ICONIX, que corresponde una metodología pesada-ligera de Desarrollo del Software y que tiene como objetivo tener control del todo el ciclo de vida del producto a realizar, cuenta con una secuencia de pasos que se deben seguir y determina claramente las actividades a desarrollar en cada etapa del ciclo de vida del proyecto que la utilice, cuyo resultado arroja, dos aplicaciones móviles dispuestos para uso inmediato.Ing: The diversity of crops is essential for fighting hunger and for the future of agriculture, which is why the production, acquisition and exchange of information in this area is essential, for this purpose it is necessary to develop information products and services to achieve these objectives. Under this premise, this paper aims to realize one mobile application for the company Allianza Bioversity CIAT, that allows the processing of information in a centralized and automated way more efficient than manual methods, GGRecepcionConteo. This work is carried out using the ICONIX methodology, which corresponds to a heavy-light methodology of Software Development, and which aims to have control of the entire life cycle of the product to be performed, this has a sequence of steps to follow and clearly identifies the activities to be developed at each stage of the life cycle of the project using it, resulting in two mobile applications ready for immediate use.PregradoIngeniero(a) de Sistema

Software Quality Assurance Model Based on Bank Depositary Files Input Validation

Los altos estándares de calidad en el producto entregado (software) son esenciales para satisfacer las necesidades y requerimientos del cliente, reducir los costos operaciones, optimizar los procesos existentes en una organización e incrementar la competitividad de una compañía, garantizando así un alto nivel de confianza y credibilidad por parte de los Usuarios, Patrocinador e Interesados hacia los proyectos de tecnología de una organización. Considerando lo anterior, por medio de este proyecto se pretende diseñar un Modelo de Aseguramiento de Calidad de Software en el Módulo de Cargue de Archivos de Depósitos Bancarios en una Empresa del sector financiero*, con base a los lineamientos definidos por la metodología ISTQB (ISQI, 2010), certificación reconocida como marco de referencia en el proceso Calidad de Software desde el año 1998 (ISEB, 1998). ISTBQ surge en 2002 como un comité conformado por ocho países: Austria, Dinamarca, Finlandia, Alemania, Suecia, Suiza, Holanda y Reino Unido y cuyo propósito es la mejora continua en la profesión de las pruebas de software a través de la definición y mantenimiento de la base de conocimiento que provea a los probadores o testers estar certificados en las mejores prácticas (www.istqb.org). Con dicho modelo se pretende proveer una solución que permita disminuir el volumen de defectos e inconsistencias presentadas en el ambiente de productivo del Módulo de Cargue de Archivos de Depósitos Bancarios.The high-quality standards at a delivered product (software) are essential in order to satisfy the client requirements and needs, to reduce the operational cost, to optimize the existent process in a company and to increase the company competitiveness, guarantee the highest trust level and credibility in users and other stakeholders on technology projects. Considering the previously named, it is pretending in this project to design a Software Quality Assurance on Upload Module for Bank Depositary Files in a financial company sector*, based on defined alignments by ISTQB methodology (ISQI, 2010), recognized certification as a reference in Software Quality process since 1998 (ISEB, 1998). ISTQB appears in 2002 as a committee confirmed by eight countries: Austria, Denmark, Finland, Germany, Sweden, Switzerland, Holland and the United Kingdom. It is purpose is the continued improvement in software testing profession through knowledge base definition and maintenance provided to testers being certified at best practices (www.istqb.org). With the model is pretending to provide a solution that allows reducing the number of defects and issues presented at Upload Module for Bank Depositary Files production environment

Cultura escolar em áreas de conflito armado: do âmbito individual ao trabalho colaborativo

Based on the implementation of lived experience narratives, this article intends to recognize the professional and pedagogical cultures of those teachers who live in distant regions affected by the armed conflict. For that reason, a qualitative research project was conducted following a biographical narrative perspective. As to reconstruct the information generated, an analysis matrix was designed to identify recurrent and relevant issues emerging from the participants’ voices. These issues became thematic axes and emergent categories. Concerning the findings, three major significant topics were identified, that is, the close relationships between teachers’ professional exercise and their school realities of fear and anxiety, the necessity to nurture the collaborative cultures, and the importance of transforming the school into a suitable scenario for resilient identities.El presente artículo pretende reconocer la cultura profesional pedagógica de los maestros que habitan zonas de conflicto armado, a partir de relatos de experiencia; particularmente hacemos alusión a los que desempeñan su labor en la subregión del Bajo Cauca antiqueño. Para lograr el objetivo propuesto, se diseñó una investigación de corte cualitativo, enmarcada en una perspectiva biográfica narrativa. A su vez, y en procura de reconstruir la información generada, se elaboró una matriz de análisis, en la cual se advirtieron aquellos asuntos que, por su presencia y relevancia en las voces de los participantes de la investigación, se configuraron en ejes temáticos y categorías emergentes. Entre los hallazgos más significativos se ubican tres asuntos, a saber: las estrechas relaciones que se tejen entre el ejercicio profesional del maestro, las realidades cercanas al miedo y la zozobra en las que se circunscribe la vida en la escuela misma; la necesidad de favorecer el tránsito de una cultura escolar individualista a una cultura escolar colaborativa; y finalmente, la importancia de hacer de la escuela un escenario que forme a todos los sujetos en ella inmersos, en posturas resilientes.Este artigo pretende reconhecer a cultura pedagógica profissional dos professores que vivem em áreas do conflito armado, a partir de relatos da sua experiência; em particular, referimo-nos àqueles que desenvolvem o seu trabalho na sub-região do Bajo Cauca antioqueño. Para alcançar o objetivo proposto, foi elaborada uma pesquisa qualitativa, enquadrada em uma perspectiva biográfica narrativa. Por sua vez, e na tentativa de reconstruir as informações geradas, foi elaborada uma matriz de análise, na qual se constataram aquelas questões que, por sua presença e relevância nas vozes dos participantes da pesquisa, se configuraram em eixos temáticos e categorias emergentes. Entre os achados mais significativos estão três questões, a saber: as relações estreitas que se tecem entre a prática profissional do professor e as realidades próximas ao medo e à ansiedade em que a vida se circunscreve na própria escola, a necessidade de favorecer a transição de uma cultura escolar individualista para uma cultura escolar colaborativa; por fim, a importância de fazer da escola um ambiente que forme todos os sujeitos nela imersos, em posturas resilientes

Protease inhibitors targeting coronavirus and filovirus entry.

In order to gain entry into cells, diverse viruses, including Ebola virus, SARS-coronavirus and the emerging MERS-coronavirus, depend on activation of their envelope glycoproteins by host cell proteases. The respective enzymes are thus excellent targets for antiviral intervention. In cell culture, activation of Ebola virus, as well as SARS- and MERS-coronavirus can be accomplished by the endosomal cysteine proteases, cathepsin L (CTSL) and cathepsin B (CTSB). In addition, SARS- and MERS-coronavirus can use serine proteases localized at the cell surface, for their activation. However, it is currently unclear which protease(s) facilitate viral spread in the infected host. We report here that the cysteine protease inhibitor K11777, ((2S)-N-[(1E,3S)-1-(benzenesulfonyl)-5-phenylpent-1-en-3-yl]-2-{[(E)-4-methylpiperazine-1-carbonyl]amino}-3-phenylpropanamide) and closely-related vinylsulfones act as broad-spectrum antivirals by targeting cathepsin-mediated cell entry. K11777 is already in advanced stages of development for a number of parasitic diseases, such as Chagas disease, and has proven to be safe and effective in a range of animal models. K11777 inhibition of SARS-CoV and Ebola virus entry was observed in the sub-nanomolar range. In order to assess whether cysteine or serine proteases promote viral spread in the host, we compared the antiviral activity of an optimized K11777-derivative with that of camostat, an inhibitor of TMPRSS2 and related serine proteases. Employing a pathogenic animal model of SARS-CoV infection, we demonstrated that viral spread and pathogenesis of SARS-CoV is driven by serine rather than cysteine proteases and can be effectively prevented by camostat. Camostat has been clinically used to treat chronic pancreatitis, and thus represents an exciting potential therapeutic for respiratory coronavirus infections. Our results indicate that camostat, or similar serine protease inhibitors, might be an effective option for treatment of SARS and potentially MERS, while vinyl sulfone-based inhibitors are excellent lead candidates for Ebola virus therapeutics

Inhibitors of SARS-CoV entry--identification using an internally-controlled dual envelope pseudovirion assay.

Severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-CoV) emerged as the causal agent of an endemic atypical pneumonia, infecting thousands of people worldwide. Although a number of promising potential vaccines and therapeutic agents for SARS-CoV have been described, no effective antiviral drug against SARS-CoV is currently available. The intricate, sequential nature of the viral entry process provides multiple valid targets for drug development. Here, we describe a rapid and safe cell-based high-throughput screening system, dual envelope pseudovirion (DEP) assay, for specifically screening inhibitors of viral entry. The assay system employs a novel dual envelope strategy, using lentiviral pseudovirions as targets whose entry is driven by the SARS-CoV Spike glycoprotein. A second, unrelated viral envelope is used as an internal control to reduce the number of false positives. As an example of the power of this assay a class of inhibitors is reported with the potential to inhibit SARS-CoV at two steps of the replication cycle, viral entry and particle assembly. This assay system can be easily adapted to screen entry inhibitors against other viruses with the careful selection of matching partner virus envelopes

Política e identidad

Primera entrega de una serie dedicada a la "Diáspora afrodescendiente en México y América Central", este volumen analiza los procesos políticos contemporáneos que atañen a las sociedades, grupos organizados, colectivos sociales e individuos calificados o autoconsiderados como "negros" o afrodescendientes. Los autores parten de estudios de caso y análisis teóricos, con textos que analizan la dimensión política de las organizaciones afrodescendientes y sus estrategias para afirmarse como sujetos políticos y culturales en sus respectivos ámbitos. El libro defiende una tesis que resulta simple: el derecho a decidir y a organizarse con base en el respeto a la "diferencia" y la "ciudadanía multicultural" se asocia con su contrario, es decir, con la libertad de no escoger, el respeto a la identidad no-étnica y la ciudadanía "sin adjetivo". Odile Hoffmann, geógrafa del Institut de Recherche pour le Développement (IRD, Francia), ha trabajado en México y Colombia sobre procesos identitarios desde una perspectiva geográfica y política, en particular con poblaciones afrodescendientes.in memoriam Georgés Priestley Para Melesio P., por los caminos andados y los que faltan explora

Inhibitors of SARS-CoV entry – Identification using an internally-controlled dual envelope pseudovirion assay

Severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-CoV) emerged as the causal agent of an endemic atypical pneumonia, infecting thousands of people worldwide. Although a number of promising potential vaccines and therapeutic agents for SARS-CoV have been described, no effective antiviral drug against SARS-CoV is currently available. The intricate, sequential nature of the viral entry process provides multiple valid targets for drug development. Here, we describe a rapid and safe cell-based high-throughput screening system, Dual Envelope Pseudovirion (DEP) Assay, for specifically screening inhibitors of viral entry. The assay system employs a novel dual envelope strategy, using lentiviral pseudovirions as targets whose entry is driven by the SARS-CoV Spike glycoprotein. A second, unrelated viral envelope is used as an internal control to reduce the number of false positives. As an example of the power of this assay a class of inhibitors is reported with the potential to inhibit SARS-CoV at two steps of the replication cycle, viral entry and particle assembly. This assay system can be easily adapted to screen entry inhibitors against other viruses with the careful selection of matching partner virus envelopes