Bakteriyel Vajinal Mikrobiyotanın Metagenomik Yaklaşımla Tanımlanması

Amaç: Bu çalışmanın amacı, alem düzeyinden tür düzeyine kadar farklı taksonomik seviyelerde yüksek verimli yeni nesil dizileme ve metagenomik yaklaşım kullanarak 38 Türk kadınının vajinal bakteriyel mikrobiyotasını belirlemektir. Gereç ve Yöntem: Yeditepe Üniversitesi Hastanesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği’nde Haziran 2021’de DNA/RNA koruma toplama tüplerine vajinal sürüntü örnekleri (n=38) alındı ve ZymoBIOMICS DNA miniprep kiti ile DNA ekstraksiyonu yapıldı. Hastaların yaşı, medeni durumu, ön tanı ve anamnez durumu ile ilgili bilgiler toplandı. Vajinal mikrobiyotayı belirlemek için 16S rRNA amplikon DNA dizilimi kullanılarak metagenomik bir yaklaşım uygulandı. Bulgular: Vajinal örneklerde baskın filum Firmicutes’i Proteobacteria, Actinobacteria, Tenericutes, Fusobacteria ve Synergistetes izledi. Lactobacillus en fazla bulunan “cins düzeyinde bakteri” olup onu Prevotella, Enterobacter, Gardnerella ve Dialister izledi. Vajinal sürüntü örneklerinde tür düzeyinde Lactobacillus iners baskın bulundu, bunu Gardnerella vaginalis, Enterobacter tabaci, Prevotella timonensis, Prevotella bivia ve Lactobacillus jensenii izledi. Kanonik uyum analizi (CCA), filum düzeyinde Proteobacteria ve Fusobacteria’nın en yüksek yüzdelerle evli/bekar değişkeni ile ilişkili olduğunu, ancak Actinobacteria ve Tenericutes’in yaş değişkeni ile ilişkili olduğunu gösterdi. Campylobacter, Atopobium, Enterobacter ve Lactococcus en yüksek yüzdelerle evli/bekar değişkeni ile ilişkili bulunurken, Anaerococcus, Streptococcus, Sutterella ve Veillonella en yüksek yüzdelerle yaşla ilişkili bulundu. Ayrıca, CCA, Campylobacter ureolyticus, Lb. jensenii ve Atopobium vajinae türlerinin evli/bekar değişkeni ile en yüksek yüzdelerle ilişkilendirirken, Lactobacillus johnsonii ve G. vaginalis en yüksek yüzdelerle yaş değişkeninde ilişkili bulundu. Sonuç: Vajinal hastalıklar hala önemli bir halk sağlığı sorunudur. Son yıllarda teknolojik gelişmeler sayesinde daha derinlemesine çalışılan vajinal mikrobiyotanın sanıldığından daha karmaşık olduğu keşfedilmiştir. Bu bulguları doğrulamak ve geliştirmek için daha fazla hasta araştırmasına ihtiyaç vardır

Cultural labor market in İstanbul: An analysis on the lighting design subfield

This thesis aims to analyze lighting designers and technicians working with alternative theaters in Istanbul from the perspective of cultural labor. The field of theater in Turkey is divided into two categories: subsidized/institutional theaters and nonsubsidized/ independent theaters. Within the unpaid/independent theaters, alternative theaters have gained a significant position in the Istanbul theater field since the mid-2000s with their artistic productions. Distinct from conventional forms of theater production, alternative theaters engage in contemporary artistic explorations of the theater space, and the performance considering the design elements of a theater play. Among these design elements, lighting design holds particular importance in terms of its contribution to a play. In this thesis, I will examine the lighting designers working with alternative theaters in Istanbul in the context of labor relations with an ethnographic method. I will focus on my own profession, in which I have been working with alternative theaters as a lighting technician since 2014 and as a lighting designer since 2022, from an autoethnographic perspective.In Turkey, there is no academic study conducted with particular attention to theater professions and the experiences of those who work in this field. Therefore, with this study, on the one hand, I aim to contribute to the academic literature in this sense, and on the other hand, I will describe the field of theater, where labor relations are mostly neglected, through the words and working experiences of its individuals whose profession is to make visible rather than to be visible

Rainfall intensity-duration-frequency (IDF) model using an artificial neural network approach

198-202Multilayer perceptron (MLP) artificial neural network (ANN) model was trained and used to model rainfall intensityduration- frequency (IDF) relationship for short duration rainfall (SDR), in a catchment located in a semiarid climate in Turkey. Trained ANN model has been found more suitable to predict SDR than classical statistical model

Kortikosteron ve Glukokortikoid Reseptör İnhibitörü Mifepristonun Epileptik Sıçanların Nöbetler ve Anksiyete Düzeyleri Üzerine Etkileri

Kemirgenlerde var olan doğal Glukokortikoid (GK) kortikoste- ron (CORT) olarak adlandırılmaktadır. Mifepriston (RU 486)(MİF) bir gluko- kortikoid reseptör (GR) antagonistidir ve CORT'un hücre içi reseptörüne bağ- lanmasını önleyerek, etkilerini ortaya koymasını engeller. Epilepsi, kendiliğin- den tekrarlayan nöbetlerle karakterize edilen, sinir sistemini etkileyen nörolojik bir bozukluktur. GK'lerin nöronal uyarılabilirlik, epileptik aktivite ve nöbetler üzerindeki etkileri tartışmalıdır. Diğer taraftan epileptik vakaların üçte biri gibi yüksek bir oranında depresyon eşlik eder ve depresyon, epilepsi hastalarının yaşam kalitesini düşüren önemli nedenlerden biridir. Çalışmamızda sıçanlarda bulunan doğal glukokortikoid olan Kortikosteronun ve glukokortikoid reseptör inhibitörü olan Mifepristonun epileptik nöbet parametreleri ile birlikte hayvan- ların anksiyete düzeylerine etkilerini açıklamayı amaçladık. Çalışmamızda 66 adet erkek Wistar albino sıçan rastgele her grupta 11 hayvan olacak şekilde Kontrol, DMSO, PTZ, CORT+PTZ, MİF+PTZ, MİF+CORT+PTZ olmak üzere 6 gruba ayrıldı. Kindling epilepsi modelinde nöbetler 30 dakika gözlenerek Racine skalasına göre skorlandı. Kindling süreci sonrasında anksiyeteyi test etmek için Yükseltilmiş Artı Labirent ve Açık Alan Testleri uygulandı. Kindling PTZ grubunda sıçanların nöbet latansları azalırken, nöbet fre- kansının ve şiddetinin arttığı görüldü. PTZ ve CORT+PTZ grupları arasında, nöbet latansı, frekansı ve nöbet şiddeti değerleri açısından anlamlı fark görül- medi. MİF+PTZ grubu latans süresinin PTZ grubundan anlamlı olarak daha uzun, nöbetlere ait frekans ve şiddet değerlerinin ise daha düşük olduğu göz- lemlendi. Anksiyete testleri sonuçları incelendiğinde MİF+PTZ ve MİF+CORT+PTZ gruplarının anksiyete düzeylerinin hem kontrol grubundanhem de PTZ ve CORT+PTZ gruplarından daha düşük olduğu görülmüştür. PTZ ile indüklenen kindling epilepsi modelinde, mifepristonun sıçanların nö- bet davranışları ve anksiyete düzeyleri üzerine olumlu etkileri söz konusudur

The effects of regular swimming exercise during sodium valproate treatment on seizure behaviors and EEG recordings in pentylenetetrazole-kindled rats

We investigated the effects of alone/combined regular swimming exercise and sodium valproate on epileptic seizure behaviors and EEG recordings, anti-oxidative mechanism, learning, and memory in pentylenetetrazole (PTZ)-kindled rats. Forty-eight healthy rats were randomly divided into eight equal groups as control (CONT), swimming exercise (EX), sodium valproate (SV), SV+EX, PTZ, EX+PTZ, SV+PTZ and SV+EX+PTZ. The rats were forced to regular swimming exercise for 60 min every other day, 13 doses of PTZ (40 mg/kg) were given to induce epileptic seizures and 200 mg/kg SV was given for 28 days. Epileptic seizures were evaluated by visual observation and EEG recordings (total spike numbers and number of epileptiform discharges). Memory and learning skills were assessed with passive avoidance test. According to our visual seizure observations, seizure latency was prolonged only in SV+EX+PTZ (p < 0.001) group, seizure severity score decreased in SV+PTZ (p < 0.05) and SV+EX+PTZ (p < 0.001) groups and seizure frequency was reduced in SV+PTZ (p < 0,001), EX+PTZ (p < 0,001), and SV+EX+PTZ (p < 0,001) groups. Total spike numbers and number of epileptiform discharges highly increased in PTZ group, whereas they decreased in swimming exercise and/or SV treatment groups. The most effective result was seen in the combined therapy group. Memory deficit was observed in PTZ -kindling group, but it didn't change with exercise or SV. Based on our results, regular swimming exercise had positive effects on PTZ-induced seizure frequency, and combined therapy of regular swimming exercise and SV is the most effective way to ameliorate visual seizure behaviors and decrease spike numbers and number of epileptiform discharges according to EEG recordings. Regular swimming exercise could be an alternative option to reduce the dose of SV and the side effects of SV can be avoided in clinical aspects