Determination of Meteorological and Hydrological Drought Maps with Various Interpolation Methods in the Euphrates Basin

Kuraklık hidroelektrik enerji üretimi, sağlık, sanayi, turizm, ekonomi, tarım ve hayvancılık gibi çeşitli sektörleri olumsuz etkileyen bir doğal afettir. Bu nedenle izlenmesi, zamansal ve mekânsal dağılımının belirlenmesi ve önlemler alınarak kuraklık risklerinin yönetilmesi büyük öneme sahiptir. Bu çalışmada, Fırat Havzası’ndaki çeşitli meteorolojik ve hidrolojik kuraklıkların Kriging, Radyal Tabanlı Fonksiyon (RTF) ve Ters Mesafe Ağırlıklandırma (TMA) enterpolasyon yöntemleri ile zamansal ve mekânsal değişimleri kuraklık sınıflarına göre renklendirilerek haritalandırması ve havzadaki kuraklık risk durumunun değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bunun için Fırat Havzası ve çevresinde bulunan 16 adet Meteoroloji Gözlem İstasyonu ve 18 adet Akım gözlem istasyonuna ait Standartlaştırılmış Yağış İndeksi, İstatistiksel Z-Skoru İndeksi, Yağış Anomalisi İndeksi, Standardize Yağış Evapotranspirasyon İndeksi, Keşif Kuraklık İndeksi ve Standart Akım İndeksi değerleri kullanılmıştır. Analizler sonucunda havzada meteorolojik kuraklıkların tahmininde Kriging metodu, hidrolojik kuraklıkların tahmininde ise RTF en etkili yöntemler olduğu tespit edilmiştir. Havzanın kuraklık risk düzeyi yüksek tespit edildiği için çalışma alanında kuraklık yönetim planının yapılması, olumsuz kuraklık etkilerinin azaltılması, erken uyarı ve kuraklık önlemlerinin alınması önerilmektedir.Drought is a natural disaster that adversely affects various sectors such as hydroelectric power generation, health, industry, tourism, economy, agriculture and animal husbandry. For this reason, monitoring, determining the spatio-temporal distribution, and managing drought risks by taking precautions are of great importance. In this study, it is aimed to map the spatio-temporal changes of various meteorological and hydrological droughts in the Euphrates Basin according to drought classes with Kriging, Radial Based Function (RBF) and Inverse Distance Weighting (IDW) interpolation methods and to evaluate the drought risk situation in the basin. For this, Standardized Precipitation Index, Statistical Z-Score Index, Precipitation Anomaly Index, Standardized Precipitation Evapotranspiration Index, Reconnaissance Drought Index and Standardized Runoff Index values were used for 16 Meteorology Observation Stations and 18 stream-gauging stations in the Euphrates Basin. As a result of the analyses, it has been determined that the Kriging method is the most effective method in predicting meteorological droughts in the basin, and RBF is the most effective method in predicting hydrological droughts. Since the drought risk level of the basin is determined to be high, it is recommended to make a drought management plan in the study area, to reduce negative drought effects, and to take early warnings and drought precautions

Izolacija iz periferne krvi i analiza funkcija heterofila kokoši protočnom citometrijom – metodološko istraživanje

The aim of this study was to modify the flow cytometric method, which is used for analyzing neutrophils, to analyse the functions of avian heterophils. The blood samples used in the experiments were obtained from hens in slaughterhouses. Blood samples were collected from 10 hens for each trial. Within the scope of the present study, trials were carried out regarding the amount of blood, cell suspension, dihydrorodamine-123 (DHR-123), phorbol-12-myristate-13-acetate (PMA), and N-formyl-methionyl-leucyl-phenylalanine (fMLP), as well as the storage duration of blood samples and incubation time. The results showed that 0.5-3 ml of blood could be used to detect heterophil functions, and it would be ideal to conduct analyses using fresh blood samples. In addition, the results showed that blood stored at +4 °C for up to 8 hours may be also used if necessary. In order to isolate the cells, centrifugation for 30 minutes is sufficient, and it is appropriate to use a 30μL cell suspension. 2μL of DHR-123 should be used as a chemical probe to measure heterophil functions. Excessive use of DHR-123 affected the heterophil functions negatively. In addition, it was observed that using 2μL of fMLP, which is used as an oxidative burst stimulant, and 2μL of PMA as a stimulant of chemotaxic activity, were sufficient. It was concluded that incubation at 41 °C for 5 minutes after stimulating the heterophils is also sufficient. We conclude that the methods established in this study could be used to isolate heterophils and to analyze them by flow cytometry. Therefore, this study would contribute to further research and clinical studies in poultry.Cilj je istraživanja bio prilagoditi metodu protočne citometrije, koja se inače primjenjuje u analizi neutrofila, za analizu funkcija ptičjih heterofila. Uzorci krvi 10 kokoši dobiveni su iz klaonica. Uzevši u obzir količinu krvi, kao i trajanje pohrane krvnih uzoraka odnosno vrijeme inkubacije, analizirana su stanična suspenzija, dihidrorodamin-123 (DHR-123), forbol-12-miristat-13-acetat (PMA) i N-formil-metionil-leucil-fenilalanin (fMLP). Rezultati su pokazali da se 0,5 – 3 mL krvi može upotrijebiti za otkrivanje funkcija heterofila te da bi idealno bilo analizirati svježe uzorke krvi. Osim toga rezultati su pokazali da se i krv pohranjena na temperaturi od +4 °C, u vremenu do 8 sati, može upotrijebiti ako je to potrebno. Kako bi se stanice izolirale, dovoljno je centrifugirati 30 minuta uz primjenu stanične suspenzije od 30 μL. Kao kemijsku probu za mjerenje funkcija heterofila trebalo bi upotrijebiti 2 μL DHR-123. Prekomjerna upotreba DHR-123 negativno je utjecala na funkcije heterofila. Također, uočeno je da je bila dovoljna primjena 2 μL fMLP-a, koji služi kao stimulans oksidacijskog izgaranja, kao i primjena 2 μL PMA-a kao stimulansa kemotaktičke aktivnosti. Zaključeno je da je inkubacija na temperaturi od 41 °C, tijekom 5 minuta poslije stimulacije heterofila također dovoljna. Rezultati su pokazali da se metode ustanovljene u ovom radu mogu primijeniti za izolaciju heterofila i njihovu analizu protočnom citometrijom, čime se doprinosi daljnjim istraživanjima i kliničkim studijama u peradi

Specific anion effects on urease activity: A Hofmeister study

: The effects of a range of electrolytes on the hydrolysis of urea by the enzyme urease is explored. The autocatalytic behavior of urease in unbuffered solutions and its pH clock reactions are studied. The concentration dependence of the experimental variables is analyzed in terms of specific ion-enzyme interactions and hydration. The results offer insights into the molecular mechanisms of the enzyme, and on the nature of its interactions with the electrolytes. We found that urease can tolerate mild electrolytes in its environment, while it is strongly inhibited by both strong kosmotropic and strong chaotropic anions. This study may cast light on an alternative therapy for Helicobacter pylori infections and contribute to the design of innovative materials and provide new approaches for the modulation of the enzymatic activity

Ortaokul Öğrencilerinde Matematik Kaygısı ile Duygu Düzenleme ve Psikolojik Sağlamlık Arasındaki İlişkinin İncelenmesi

Mathematics anxiety is seen as one of the important obstacles to students' learning mathematics. Because when the feeling of anxiety is experienced at an intense level, it can affect brain functionality and inhibit learning. Therefore, regulating intense emotions such as anxiety, in other words, recognizing, naming, expressing and reducing them to a tolerable level, can eliminate this obstacle to learning. Psychological resilience is defined as a person's ability to successfully cope with stressful and challenging situations. Another reason for math anxiety may be low levels of psychological resilience. In this study, the relationship between emotional regulation skills and psychological resilience level and mathematics anxiety was examined. Data was collected from 937 students continuing their education in secondary schools in Bayraklı district of Izmir province. The data collection tools used in this research are the Emotion Regulation Scale for Adolescents (EDRS), Mathematics Anxiety Scale, Child and Youth Psychological Resilience Scale and Personal Information Form. The data was analyzed with the Multiple Regression Analysis technique using the SPSS 23 package program. The results showed that emotional regulation skills and psychological resilience variables explained 25% of mathematics anxiety. Additionally, there is a negative relationship between having internal functional emotion regulation skills and math anxiety; A positive relationship was found between having dysfunctional emotion regulation skills and mathematics anxiety

Bakteriyel Vajinal Mikrobiyotanın Metagenomik Yaklaşımla Tanımlanması

Amaç: Bu çalışmanın amacı, alem düzeyinden tür düzeyine kadar farklı taksonomik seviyelerde yüksek verimli yeni nesil dizileme ve metagenomik yaklaşım kullanarak 38 Türk kadınının vajinal bakteriyel mikrobiyotasını belirlemektir. Gereç ve Yöntem: Yeditepe Üniversitesi Hastanesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği’nde Haziran 2021’de DNA/RNA koruma toplama tüplerine vajinal sürüntü örnekleri (n=38) alındı ve ZymoBIOMICS DNA miniprep kiti ile DNA ekstraksiyonu yapıldı. Hastaların yaşı, medeni durumu, ön tanı ve anamnez durumu ile ilgili bilgiler toplandı. Vajinal mikrobiyotayı belirlemek için 16S rRNA amplikon DNA dizilimi kullanılarak metagenomik bir yaklaşım uygulandı. Bulgular: Vajinal örneklerde baskın filum Firmicutes’i Proteobacteria, Actinobacteria, Tenericutes, Fusobacteria ve Synergistetes izledi. Lactobacillus en fazla bulunan “cins düzeyinde bakteri” olup onu Prevotella, Enterobacter, Gardnerella ve Dialister izledi. Vajinal sürüntü örneklerinde tür düzeyinde Lactobacillus iners baskın bulundu, bunu Gardnerella vaginalis, Enterobacter tabaci, Prevotella timonensis, Prevotella bivia ve Lactobacillus jensenii izledi. Kanonik uyum analizi (CCA), filum düzeyinde Proteobacteria ve Fusobacteria’nın en yüksek yüzdelerle evli/bekar değişkeni ile ilişkili olduğunu, ancak Actinobacteria ve Tenericutes’in yaş değişkeni ile ilişkili olduğunu gösterdi. Campylobacter, Atopobium, Enterobacter ve Lactococcus en yüksek yüzdelerle evli/bekar değişkeni ile ilişkili bulunurken, Anaerococcus, Streptococcus, Sutterella ve Veillonella en yüksek yüzdelerle yaşla ilişkili bulundu. Ayrıca, CCA, Campylobacter ureolyticus, Lb. jensenii ve Atopobium vajinae türlerinin evli/bekar değişkeni ile en yüksek yüzdelerle ilişkilendirirken, Lactobacillus johnsonii ve G. vaginalis en yüksek yüzdelerle yaş değişkeninde ilişkili bulundu. Sonuç: Vajinal hastalıklar hala önemli bir halk sağlığı sorunudur. Son yıllarda teknolojik gelişmeler sayesinde daha derinlemesine çalışılan vajinal mikrobiyotanın sanıldığından daha karmaşık olduğu keşfedilmiştir. Bu bulguları doğrulamak ve geliştirmek için daha fazla hasta araştırmasına ihtiyaç vardır

Children in 2077: Designing Children’s Technologies in the Age of Transhumanism

What for and how will we design children’s technologies in the transhumanism age, and what stance will we take as designers? This paper aims to answer this question with 13 fictional abstracts from sixteen authors of different countries, institutions and disciplines. Transhumanist thinking envisions enhancing human body and mind by blending human biology with technological augmentations. Fundamentally, it seeks to improve the human species, yet the impacts of such movement are unknown and the implications on children’s lives and technologies were not explored deeply. In an age, where technologies can clearly be defined as transhumanist, such as under-skin chips or brain-machine interfaces, our aim is to reveal probable pitfalls and benefits of those technologies on children’s’ lives by using the power of design fiction

Alteration of boza microbiota in the fermentation process

Boza is a fermented beverage containing beneficial microorganisms for human health. In our study, microbiota present in raw materials used boza production (corn flour, wheat flour, and mayşe), 1st day, 3rd day of boza fermentation and 4th day final product of boza, has been identified by Next Generation DNA Sequencing and metagenomic analysis. As a result of genus-level analysis directly from corn flour and wheat flour samples contained dominantly Streptophyta and Pleomorphobacterium, while in the 1st day, 3rd day, the final product of boza and boza ferment the dominant bacteria were Leuconostoc and Lactococcus at genus level. In the analysis of the pre-enriched samples, the dominant bacteria in corn flour were Enterococcus, Klebsiella, and Micromonospora and in wheat flour were Pantoea and Bacillus. Boza ferment, boza on the 1st day, boza on the 3rd day and the final product of boza dominantly contained Lactococcus. The bacterial diversity, similarity and differences among samples were analyzed by Principal Coordinate Analysis and dendrogram construction. The contribution of raw materials used in the production of boza change to the products at the fermentation stage and to the microbiota during the fermentation process and their contribution to the final product were determined by metagenomic analysis at DNA level.Boza, insan sağlığı için yararlı mikroorganizmaları içeren fermente bir içecektir. Çalışmamızda boza üretiminde ham madde olarak kullanılan (mısır unu, buğday unu, mayşe) ve boza fermantasyonunun 1. günü, 3. günü ve 4. gün son ürün boza’nın içerdiği mikrobiyota Yeni Nesil DNA Dizileme yöntemi ve metagenomik analiz ile ortaya çıkarılmıştır. Örneklerden doğrudan cins düzeyinde yapılan analiz sonucunda, mısır unu ve buğday ununda dominant olarak Streptophyta ve Pleomorphobacterium bulunurken; bozanın 1. gün, 3. gün ve son ürün ile boza mayasında dominant bakterilerin Leuconostoc ve Lactococcus cinsine ait olduğu tespit edilmiştir. Ön zenginleştirme yapılan örneklerin analizinde, mısır ununda dominant bakteriler Enterococcus, Klebsiella ve Micromonospora, buğday ununda ise Pantoea ve Bacillus olduğu, boza mayası, 1. gün boza, 3. gün boza ve satışa sunulan son üründe dominant bakteri Lactococcus olarak belirlenmiştir. Çalışmamızda örnekler arasındaki bakteriyel çeşitlilik, benzerlik ve farklılıklar Principal Coordinate Analiz ve dendrogram oluşturulması ile ortaya konmuştur. Boza üretiminde kullanılan ham maddelerin bozanın fermantasyon aşamalarındaki ürünler ile fermantasyon sürecinde mikrobiyotasına nasıl değiştiği ve son ürüne olan katkıları, DNA düzeyinde yapılan metagenomik analizler ile belirlenmiştir

Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

Effects of long-term tillage practices on organic carbon of different aggregate sizes and available water content.

TEZ9978Tez (Yüksek Lisans) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 2016.Kaynakça (s. 69-82) var.xi, 83 s. : res. (bzs. rnk.), tablo ; 29 cm.Bu tez çalışmasında, Çukurova koşullarında yaklaşık %50 oranında kil içeren bir toprakta uzun süreli (2006-2014) altı farklı toprak işleme yönteminin agregat büyüklük dağılımı, bu dağılımlardaki organik karbon içeriği ve tutulan su üzerine etkileri araştırılmıştır. Toprak işleme uygulamaları olarak; Anızlı geleneksel toprak işleme (Gİ–1), Anızları yakılmış geleneksel toprak işleme (Gİ–2), Ağır diskli tırmıklı azaltılmış toprak işleme (ATİ–1), Rototillerli azaltılmış toprak işleme (ATİ–2), Ağır diskli tırmıklı azaltılmış sıfır toprak işleme (ASTİ) ve Doğrudan ekimli sıfır toprak işleme (STİ) yöntemleri kullanılmıştır. Bütün işleme uygulamalarında 4.0-2.0 mm boyutlarındaki agregatlar baskın iken 1.0-0.5 mm boyutundaki agregatların en düşük düzeyde olduğu belirlenmiştir. Geleneksel işleme yöntemlerine kıyasla korumalı işleme yöntemlerinde genel olarak >4.0 mm ve 4.0-2.0 mm boyutuna sahip makro agregatların oranının yüksek olduğu bulunmuştur. En yüksek organik karbon değerleri 1.0-0.5 mm boyutundaki agregatlarda; en düşük organik karbon değerleri ise 2.0-1.0 mm boyutundaki agregatlarda saptanmıştır. Agregatlara bağlı organik karbon değerleri 0-15 cm derinlikte korumalı işleme uygulamalarında ve 15-30 cm derinlikte ise geleneksel işleme uygulamalarında daha yüksek olduğu belirlenmiştir. Korumalı işleme yöntemlerinden olan STİ, 0-15 cm derinlikte geleneksel işleme yöntemlerinden olan Gİ-1 ve Gİ-2 yöntemlerine göre ağırlıklı ortalama çap değerlerini sırasıyla %204 ve %137 daha fazla arttırmıştır. Korumalı işleme yöntemlerinden olan ASTİ yönteminde en yüksek yarayışlı su içeriği elde edilmiş ve her ne kadar diğer işleme yöntemleri arasında belirgin bir fark oluşturmasa da bu yöntemin toprakta tutulan su üzerine önemli etkilere sahip olduğu bulunmuştur.In this study, long-term (2006-2014) effects of six different tillage systems on aggregate size distribution, organic carbon distribution among different sized aggregates and water holding were investigated in a soil contained approximately 50% clay under Cukurova conditions. The tillage treatments are; Conventional tillage with stubble (moldboard plowing) (CTS), Conventional tillage with stubbles burned (CTB), Heavy disc harrow reduced tillage (RTD), Rototiller reduced tillage (RTR), Heavy disc harrow zero soil tillage (RNT) and no till or zero tillage (NT). The most frequently encountered aggregates in all tillage systems were at 4.0-2.0 mm size and the 1.0-0.5 mm size aggregates were the least frequently found aggregates. The rate of >4.0 mm and 4.0-2.0 mm macro-aggregates increased in the conservation tillage systems compared to conventional tillage systems. The aggregates with the highest organic C content were at 1.0-0.5 mm size and the aggregates with lowest organic C content were at 2.0-1.0 mm size. Aggregate-associated organic C contents in 0-15 cm depth were higher under conservation tillage systems compared to the conventional tillage systems, though organic C contents at 15-30 cm depth were greater mainly in conventional tillage systems. The mean weight diameter values increased in the conservation tillage practices (NT) compared to the conventional tillage practices (CTS and CTB) 204% and 137%, respectively. Although it wasn’t different specifically among other tillage practices, the highest available water contents were obtained in RNT practice and RNT practice had significant effects on retained water in soil