Trematominae and Artedidraconinae: contrasted mitogenome evolution for two Antarctic radiations

Cellular respiration has been widely studied in Antarctic teleost fishes because of their peculiar adaptations to an extreme environment. In parallel mitochondrial sequence markers have become highly popular for molecular systematics. However, there are few whole mitochondrial genome sequences published, and none available for some of the subfamilies. Here, we present two large mitogenome datasets including most species and multiple sequences for many species of two subfamilies, Trematominae and Artedidraconinae (Duhamel et al. 2014). These include two highly diverse but very different adaptative radiations, with contrasting divergence dates, morphological polymorphism, and habitat dominance. The sampling is based on a well identified, extensive collection resulting from the 2008 CEAMARC survey and the subsequent REVOLTA surveys in Terre Adélie (IPEV), already DNA barcoded and sequenced in previous studies. The mitogenome sequences for these two subfamilies differ in composition, gene order, and relative divergence of mitochondrial markers, with strong, taxon-specific biases like very high C contents in some regions. The gene order change provides a synapomorphy for the subfamily Trematominae and an interesting development in teleost mitogenomes. The complete Artedidraconinae mitogenomes provide a much higher amount of variable sites (approx*30), while previous sequence datasets were plagued by low informativeness (Lecointre et al. 2011). As already established on single mitochondrial genes, intraspecific variability is lower than interspecific variability within each subfamily, however interspecific variability in Artedidraconinae is lower or similar to intraspecific variability in Trematominae. This expanded dataset confirms the unusual evolution of the mitochondrial coded sequences involved in the cellular respiration in Antarctic Nototheniidae, as well as the usefulness of complete mitochondrial genomes for their systematics. The two level multiplexing (Timmermans et al. 2010) and next generation sequencing of long PCR amplicons (following Hinsinger et al. 2015) is efficient to obtain large mitogenomic datasets representative of both inter- and intraspecific variability, key to the understanding of mitochondrial evolution and a step closer to resolving the relationships among these taxa.RECTO (Refugia and Ecosystem Tolerance in the Southern Ocean, BR/154/A1/RECTO

Viol Des Mineurs De 10 A 15 Ans Recus Au Chu-So De Lome

Minors of both sexs ages 10 to 15 are most at risk of sexual assault Objective: To determine the prevalence of sexual assault by rape among children aged 10 to 15 years and describe their management at the gynecology and obstetrics clinic of the CHU SO .Patients and methods: 134 files of rape victims were collected from September 1, 2010 to March 31, 2017 at the gynecology and obstetrics clinic of the CHU SO Results: Rape of minors aged 10 to 15 accounted for 26.6% of sexual assaults. There were 91% of girls. Most of our patients (54.5%) were raped between 7pm and 6am. Sixty eight (68) patients (40.3%) were referred for consultation between the 2nd day and the 8th day after the rape. Fifty-five point two percent of the victims had never had sexual intercourse before the rape. The perpetrator was known to the victim in 92.5% of cases. The tear of the hymen was old in 79.5% of the victims. HIV serology was positive in 1.6%. The rate of β HCG was positive in a 15-year-old patient. All our patients had psychological care. Conclusion: The rape of minors of both sexes is a reality in our developing society. The taboo of the sex must be raised for the fast denunciation of the rape and of an adequate care

Aspects epidemiologiques et chirurgicaux de fibromes uterins operes a l’hopital du district n° III de Lome

Objectifs: Décrire les caractéristiques épidémiologiques, les différents aspects de la prise en charge chirurgicale et le pronostic immédiat des cas de fibromes utérins.Patientes et méthodes : Etude prospective descriptive ayant porté sur 100 cas de fibromes utérins opérés de septembre 2009 à avril 2010 à l’Hôpital du District sanitaire N°III de Lomé. Les données ont été recueillies par observation et interview directes et traitées par le logiciel Sphinx Plus 4.5.Résultats : Le traitement chirurgical des fibromes utérins a occupé 60% de la pratique chirurgicale gynécologique dans le service. L’âge moyen des patientes opérées était de 40,54 ans. La myomectomie (dans 53%) et l’hystérectomie (dans 47%), tous deux par voie abdominale, ont été au centre de la prise en charge chirurgicale. Les suites opératoires immédiates ont été simples et la durée moyenne du séjour hospitalier a été de 6 jours.Conclusion : Il y a besoin d’amélioration du plateau technique du centre et de renforcement des compétences en chirurgie du fibrome utérin par voie vaginale et par voie endoscopique.Mots clés : Fibrome utérin, traitement chirurgical.Objectives: To describe the epidemiological characteristics, different aspects of surgical management and immediate prognosis of cases of uterine fibroids.Patients and methods: A prospective study that examined 100 cases of uterine fibroids operated from September 2009 to April 2010 at the Hospital of District No III of Lomé. Data were collected by direct observation and interview and processed using Sphinx Plus 4.5Results: The surgical treatment of uterine fibroids has occupied 60% of gynecological practice in the service. The average age of operated patients was 40.54 years. Myomectomy (53%) and hysterectomy (47%), both abdominally, were the focus of surgical management. The immediate postoperative outcome was uneventful and the average length of hospital stay was 6 days.Conclusion: There is need for improvement of the center’s technics and performing skills in surgery of uterine fibroids by vaginal and endoscopical ways.Key words: Uterine fibroid, epidemiological and surgical aspects

La crise éclamptique a la maternité du Chu de Lomé-Tokoin de 2007 a 2009 : Pronostic maternel

Objectifs : Décrire les aspects épidémiologiques, cliniques et le pronostic maternel de la crise éclamptique à la maternité du CHU de Lomé-Tokoin sur ces trois dernières années.Patientes et méthodes : Etude rétrospective portant sur 170 cas d’éclampsie survenus dans le service de janvier 2007 à décembre 2009. Les renseignements ont été recueillis à partir des registres et des dossiersd’accouchements et consignés sur une fiche d’enquête préétablie et traités par informatique (Logiciel SPSS 12.0.). Nous mesuré la force d’association de certaines variables ave le test de YATES dont le seuil de significativité était de p < 0,05Résultats : La prévalence de l’éclampsie au cours de notre période d’étude était de 1,13%. L’éclampsie était survenue dans 71,8% de cas chez la nullipare jeune (13-24ans), au 3ème trimestre de la grossesse etdans 20% de cas pendant le post-partum. Le sulfate de magnésium était utilisé en perfusion dans presque la majorité des cas de notre étude. L’accouchement a été fait par césarienne chez 58,2% des patientes. Letaux de mortalité maternelle était de 8,8%. La morbidité maternelle était dominée par l’oedème aigu du poumon, l’insuffisance rénale, et les accidents vasculaires cérébraux.Conclusion : L’éclampsie comporte encore une mortalité maternelle élevée dans nos milieux. Une meilleure qualité des consultations prénatales, la subvention des urgences obstétricales et le renforcement du plateau technique en matière de réanimation médicale d’urgence devraient permettre d’améliorer le pronostic maternel de cette affection.Mots clés : Eclampsie, aspects épidémio-cliniques, pronostic maternel.Objectives: The aims of this study are to describe the epidemiological and clinical aspects and the maternal outcome of eclampsia crisis at the maternity of Lomé-Tokoin Teaching Hospital on these last three years.Patients and methods: Retrospective study of 170 files of eclampsia cases in the service from January 2007 to December 2009. The data have been collected from registers and files of childbirths and have been consigned on a card of investigation pre-established and treated by data processing (SPSS 12.0 Software.). The crossing of some variables had undergone YATES statistic test with significance at p < 0, 05.Results: The prevalence of the eclampsia during our period of survey was 1.13%. Eclampsia had occurred in 71.8% of case at the young nulliparous (13-24ans), to the 3rd quarter of pregnancy and in 20% of case during post-partum. Magnesium sulfate was used in drips in nearly the majority of cases. Childbirth has been made by caesarean section of 58.2% patients. Maternal death rate was 8.8%. Maternal morbidity was dominated by acute lung edema, renal insufficiency, and cerebral vascular accidents.Conclusion: Eclampsia still includes high maternal mortality rate in our fields. A better quality of antenatal care, a real subsiding of obstetrics emergencies and a good medical resuscitation emergency unitcare should permit to improve the maternal outcome of this affection.Key words: Eclampsia, epidemiological and clinical aspects, maternal outcome

Caracteristiques epidemiologiques, cliniques et pronostiques de la mortinaissance par cesarienne : etude de 97 cas colliges de Janvier 2008 a Decembre 2012 au chu Kara. Epidemiological, clinical and pronostical characteristics of stillbirth by cesarean se

La césarienne peut s’avérer nécessaire, malgré le décès du foetus, pour sauver la vie de la femme.Objectif : déterminer le profil épidémiologique, clinique et pronostique de la mortinaissance par césarienne.Patientes et méthodes : étude rétrospective et descriptive, menée de janvier 2008 à décembre 2012 au service de Gynécologie Obstétrique du CHU-Kara. Cette étude a porté sur tous les cas de césariennes sur mort-né pré ou perpartum.Résultats : 123 patientes ont été enregistrées sur 8764 cas d’accouchement dont 2308 cas par césarienne, soit 5,33 % des césariennes. L’âge des patientes variait de 17 à 43 ans et la parité, de 1 à 10. 77,24% des patientes avaient réalisé moins de 4 consultations prénatales. Les patientes étaient référées dans 97,56% des cas. Le décès foetal était prépartum dans 17,07% et perpartum dans 82,93 % des cas. Les principales indications de césarienne étaient l’épaule négligée (47,97 %), la rupture utérine (21,14 %), l’éclampsie ou la prééclampsie sévère (13,82%) et le placenta prævia hémorragique (10,57%). Le nouveau-né était frais dans 86,18% et macéré dans 13,82 % des cas. Des complications maternelles ont été observées dans 33,33% des cas dont l’hystérectomie (13,82%), l’infection de paroi (8,13%) et le décès maternel (4,07%)Conclusion : La plupart des cas des césariennes pratiqués sur mort-né sont évitables s’il existait de service de soins obstétricaux de qualité, accessibles et utilisés par les gestantes et parturientes. D’où la nécessité d’améliorer la qualité, l’accessibilité et l’utilisation des services de soins obstétricaux actuels pour réduire son incidence.Mots clés : Césarienne, mort-né, CHU Kara.ABSTRACTCesarean section can be necessary despite stilli birth to save mother.Objective: To determine epidemiological, clinical and pronostical profile of still birth by cesarean section.Patients and methods: Retrospective and descriptive study, leaded from January 2008 to 2012 december at the Obstetric and Gynaecology service of Kara teaching hospital. This study concerned all cases of cesarean section despite still birth in prepartum or intrapartum.Results: 123 patients were registered out of 8764 birth (14/1000 birth) and out of 2308 cesarean section (5.33%). Patient age varieted from 17 to 43 years, and parity variated from 1 to 10.77. 24% of patients had less than four antenatal care. Patients were referred in 97.56% of cases. Fetal death occurred in prepartum in 17.07% andperpartum in 82.93%. The leadind indications of cesarean section were shoulder neglet presentation (47.97%), uterus ruptured (21.14%), Eclampsia or severe preeclampsia (13.82%) and haemorrhage placenta praevia (10.57%). Newborn was maceredin 13.82% and non macered in 86.18%. Maternal complications were observed in 33.33% of cases such as hysterectomy (13.82%), wound of wall (8.13%) and maternal death (4.07%).Conclusion: Several cases of stillbirth by cesarean section was preventable if quality obstetric care service existed and used. It is so necessary to perform the quality, the accessibility and the use of the actual obstetric care in other to reduce the incidence.Keywords: Cesarean section, stillbirth, CHU Kara

Connaissances, attitudes et pratiques des etudiantes de L’Universite de Lome (Togo) sur la contraception d’urgence

Objectifs: contribuer à la réduction de la morbi-mortalité maternelle liée à l’avortement provoquée clandestineMéthodes: Nous avons mené une enquête transversale prospective descriptive du 19 juin 2017 au 23 juin 2017 à l’université de Lomé (Togo). Un échantillonnage aléatoire simple a été réalisé. Les facultés ont été tirées au hasard. Sur la base d’un questionnaire préétabli, nous avons interviewé 230 étudiantes de droit, présentes au moment de l’enquête et qui ont acceptées de participer. Les données recueillies ont été saisies et analysées avec le logiciel Epi info 7. La comparaison des variables effectuée avec le test de Khi-carré et un seuil de signification de 5%.Résultats: deux cent trente questionnaires ont été distribués tandis que 221 ont été remplis donnant un taux de réponse de 96,08%. L’âge moyen des étudiantes était de 20 ans. Quarante-sept pourcent étaient sexuellement active. Plus des trois quart des étudiantes (76,02%) avaient déjà entendu parler de la contraception d’urgence et avaient été informées par les amis (28,66%) et les médias (24,39%). La quasi-totalité (97,02%) des répondants avaient une bonne connaissance du délai d’efficacité. Le quart des répondants (25,33%) l’avait utilisé le plus souvent à la suite de déchirure de préservatif (47,02%).Conclusion: les étudiantes connaissaient la contraception d’urgence. Cependant la crainte pour les effets secondaires freine son utilisation, ce qui souligne le besoin d’information de ces étudiantes.Mots clés: contraception d’urgence, étudiantes, TogoEnglish Title: Knowledge, attitudes and practices of University of Lome (togo) students on emergency contraceptionEnglish AbstractObjective: contribute to reducing the maternal morbidity and mortality associated with clandestine abortionMaterial and Method: this was a transversal and descriptive survey from June 19, 2017 to June 23, 2017 at the University of Lomé (Togo). A simple random sampling was performed. The faculties were drawn at random. Based on a pre-established questionnaire, we interviewed 230 law students who were present at the time of the survey and who agreed to participate. The data collected were entered and analyzed using the Epi info 7 software. The comparison of the variables performed with the chisquare test and a significance level of 5%.Results: Two hundred and thirty questionnaires were distributed while 221 were filled  giving a response rate of 96.08%. The average age of female students was 20 years. Forty-seven percent were sexually active. More than three-quarters of the students (76.02%) had already heard about emergency contraception and had been informed by friends (28.66%) and the media (24.39%). Almost all (97.02%) of the respondents had a good knowledge of the time to effectiveness. A quarter (25.33%) had used it most often as a result of condom tearing (47.02%).Conclusion: Students were aware of emergency contraception. However, the fear of side effects slows down its use, which underlines the need for information of these students.Keywords: emergency contraception, students, Tog

Aspects epidemiologiques, cliniques et pronostiques de l’accouchement des adolescentes a Lome en 2010

Objectifs: Décrire les aspects épidémiologiques, cliniques de l’accouchement chez les adolescentes à Lomé. Analyser le pronostic maternel et néonatal immédiat.Patientes et méthodes: Etude rétrospective descriptive et analytique sur une période de 12 mois (janvier à décembre 2010) portant sur 387 dossiers d’accouchement d’adolescentes réalisés dans les quatre maternités de référence de Lomé. Les données ont été traitées à l’aide du logiciel Epi-Info 3.5.1Résultats: La fréquence des accouchements chez les adolescentes était de 3,66 %. L’âge moyen des adolescentes était de 17ans. Dans 71,6 %, l’accouchement a été effectué par voie basse contre 28,4% d’accouchements par césarienne. Les principales indications des césariennes d’urgence étaient la dystocie mécanique, la souffrance foetale et l’éclampsie. La mortalité périnatale était de 90,43‰ et le taux mortalité maternelle liée à l’accouchement des adolescentes était de 127,73 pour 100 000 naissances vivantes.Conclusion: L’accouchement chez les adolescentes semble comporter plus de risques néonatals que maternels. Il faut subventionner les soins obstétricaux chez cette tranche d’âge et améliorer le plateau technique en matière d’accueil des nouveau-nés de petits poids.Mots clés: Accouchement adolescentes, pronostic, LoméEnglish AbstractObjectives: Describing epidemiological and clinical aspects of teenage’ childbirth in Lomé. To analyze immediate maternal and neonatal prognosis. Patients and methods: Retrospective descriptive and analytic study, over a period of 12 months (January-December 2010) on 387 records of teenage’ deliver in the four reference maternities of Lomé. The data were processed using Epi-Info 3.5.1Results: Frequency of teenage’ childbirths was 3.66%. The average age of mothers was 17 years old. In 71.6%, the delivery was performed vaginally against 28.4% cesarean section. Main indications of caesarean section in emergency were obstructed labor, fetal distress and eclampsia. Perinatal mortality rate was 90.43 ‰ and the mortality rate related to maternal childbirth adolescents was 127.73 per 100 000 live births.Conclusion: Teenage’ childbirth seems more risky for neonatal outcome than maternal one. There is a need to totally subsidize obstetrics’ care in this age group and to improve technical platform in small weight newborns management.Keywords: Teen delivery, prognosis, Lom

Pronostics maternel et perinatal un an apres la subvention de la cesarienne Au CHU Sylvanus Olympio de Lome

Objectifs: Déterminer l’impact de la subvention du kit de césarienne sur les indicateursde santé de la mère et du nouveau-né.Méthodologie: Il s'agit d'une étude transversale, rétrospective, descriptive et comparative des paramètres et des pronostics des accouchements par césarienne effectués à la maternité du CHU Sylvanus Olympio de Lomé, un an avant (mai 2010 à avril 2011) et un an après (mai 2011 à avril 2012) la subvention du kit de césarienne. Les données ont été traitées par le logiciel Epi Info 6. Pour la comparaison des variables il a été utilisé le test de Chi-2 de Fisher avec p < 0,05 comme seuil de signification.Résultats: Le taux de césarienne a connu un accroissement de 3,8% avec la subventiondu kit. Le taux de mortalité maternelle n’a pas baissé de manière significative (0,5% vs 0,3% ; p=0,29) mais le taux de morbidité maternelle a baissé de 4,12% à 1,31% (p<10-6).  La mortinatalité est passée de 5,9% à 3,2% (p<10-6) et le taux de mortalité néonatale périnatale a régressé significativement (9,4% vs 6,1%; p<10-5).Conclusion: La subvention de la césarienne a amélioré la santé de la mère et plus encorecelle du nouveau-né au CHU Sylvanus Olympio. Cette subvention doit être pérennisée et devrait s’étendre à tous les soins obstétricaux et néonataux d’urgence.Mots clés : Subvention, césarienne, mortalité maternelle, mortalité périnatale, Togo,Afrique.English Title: Maternal and perinatal prognosis one year after granting of cesarean section kit at teaching hospital  centre, Sylvanus Olympio LomeEnglish AbstractObjectives: To determine the impact of the granted of caesarean section kit on healthindicators of  maternal and newborn. Methodology: This is a retrospective cross-sectional comparative study parameters andprognosis of cesarean section deliveries performed at the Maternity of Teaching Hospital Centre Sylvanus Olympio of Lome, one year before (May 2010-April 2011) and one year  after (May 2011 to April 2012) granting cesarean section kit. Data were processed by the Epi Info 6. For comparison of variables it was used the Chi-2 test with Fisher p <0.05 as significance level.Results: Compared to the grant time, cesarean section rate had increased by 3.8% with the granted operative kit. Maternal mortality rate did not decreased significantly (0.5% vs 0.3%, p = 0.29) but maternal morbidity rate declined from 4.12% to 1.31% (p <10-6). Stillbirths fell by 5.9% to 3.2% (p <10-6) and rates of perinatal neonatal mortality decreased significantly (9.4% vs 6.1%, p  <10-5).Conclusion: The grant of cesarean section kit has improved the health of the mother and newborn at Sylvanus Olympio Teaching Hospital Centre. This grant policy must be made permanent and should be extended to obstetric and neonatal emergencies.Keywords: Grant, cesarean section, maternal mortality, perinatal mortality, Togo, Africa

Deces par cancer du sein au CHU Sylvanus Olympio de Lome : plaidoyer pour un depistage systematique chez les patientes a risques au Togo

Introduction: Le cancer du sein est une tumeur maligne qui se développe au dépend de la glande mammaire. C’est le premier cancer féminin en termes d’incidence et de mortalitéObjectif: Déterminer le nombre de patientes décédées au cours de notre période d’étude.Malades et Méthode: Nous avons collecté 37 dossiers médicaux des patientes décédées pour cancer du sein, du 1er Janvier 2014 au 31 Décembre 2015, soit une période de 24 mois.Résultats: Le cancer du sein était le plus représenté (58,4%), suivi du cancer du col (21,2%). Parmi ces 220 patientes, nous avions enregistré 37 décès par cancer du sein, soit 16,1%. La tranche d’âge de 40 - 49 ans était la plus représentée (35,2%). Dix-neuf (19) patientes (51,3%) étaient multipares. La majorité des patients étaient des revendeuses (45,9%), suivi des femmes au foyer (36,2%). La plupart des patientes avaient présenté un cancer inflammatoire d’aspect peau d’orange (81%). Le stade IV de FIGO était retrouvé chez toutes nos patientes (100%). Trente-deux patientes (32) soit 86,5% ont bénéficié d’un traitement médical (palliatif) ; La chimiothérapie a été administrée à 10 patientes soit 27%. Huit (08) patientes, soit 21,6 %, ont bénéficié d’une chirurgie selon Patey.Conclusion: Le cancer du sein est un véritable problème de santé publique au Togo. Il serait opportun de mieux organiser sa prise en charge, pour déceler les cas à un stade précoce en vue de donner une chance de survie aux malades.Mots clés: sein, cancer, CHU SOEnglish Title: Death from breast cancer at Sylvanus Olympio Teatching Hospital of Lome: advocacy for systematic screening for patients at risk in TogoEnglish AbstractIntroduction: Breast cancer is a malignant tumor that develops at the expense of the mammary gland. It is the first female cancer in terms of incidence and mortality.Objective: To determine the number of patients who died during our study period.Patients and Methods: We collected 37 medical records of deceased breast cancer patients from January 1, 2014 to December 31, 2015, for a period of 24 months.Results: Breast cancer was the most represented (58.4%), followed by cervical cancer (21.2%). Of these 220 patients, we had 37 breast cancer deaths, or 16.1%. The age group 40-49 was the most represented (35.2%).Nineteen (19) patients (51.3%) were multiparous. The majority of patients were female sellers (45.9%) followed by  housewives (36.2%). Most patients had an orange-peel inflammatory cancer (81%). Stage IV of FIGO was found in all our patients (100%). Thirty two patients (32) or 86.5% received medical treatment (palliative); Chemotherapy was administered to 10 patients, ie 27%. Eight (08) patients, or 21.6%, underwent surgery according to PateyConclusion: Breast cancer is a real public health problem in Togo. It would be advisable to better organize its care, to detect cases at an early stage in order to give the patients a chance of survival.Keywords: breast, cancer, CHU S

Aspects épidémio-cliniques et prise en charge des agressions sexuelles chez les sujets de sexe féminin à Lomé.

Il s’agit d’une étude rétrospective qui a pour objectif de décrire les aspects épidémio-cliniques et la prise en charge des agressions sexuelles en milieu noir africain. L’étude a porté sur 373 dossiers de victimes féminines présumées d’agression sexuelle enregistrées dans le service de Gynécologie et d’Obstétrique du CHU Tokoin de Lomé de 2007 à 2009. Les agressions sexuelles ont représenté 4,37 % des motifs de consultation. La victime était souvent une fillette d’un âge moyen de 12 ans. Le viol par pénétration vaginale (62,2%) était le mode prépondérant. Le délai moyen de consultation qui était de 13 jours a considérablement limité certains aspects de la prise en charge. Il y a eu 14,5% de traumatisme génital, 2,4% de séroconversion au VIH et 2,14% de grossesses induites. Les agressions sexuelles ont touché une population jeune et vulnérable. Les pouvoirs publics doivent davantage informer sur ce sujet et créer des centres pluridisciplinaires de prise en charge gratuite.AbstractThis is a retrospective study whose objective is to describe the  epidemiological and clinical aspects of the management of sexual violence in Black Africa. The study included 373 cases of alleged female victims of sexual assault registered in the Department of Obstetrics and Gynecology of the University Teaching Hospital, Tokoin, Lomé, from 2007 to 2009. Sexual assault accounted for 4.37% of reasons for consultation and vaginal penetration (62.2%) was the predominant mode. The victim was often a small girl of an average age of 12 years. The mean reporting delay which was about 13 days has considerably limited some aspects of the management. We found 14.5% signs of genital trauma, nine cases of HIV serological conversions (2.4%) and eight induced pregnancies. Sexual assault among female victims in Lomé affected the young and vulnerable population. Governments must further inform about this issue and create multidisciplinary free management centres. Mots clés: Abus sexuels, Femme, Afrique subsharienn