EFFECTS OF NH4CI INGESTION ON PHOSPHOCREATINE METABOLISM DURING MODERATE- AND HEAVY-INTENSITY PLANTAR-FLEXION EXERCISE

Eight male subjects performed moderate- and heavy-intensity plantar-flexion exercise in both a control (CON) and NH4CI ingestion (ACID) trial. Intracellular 11 metabolism was examined using P-magnetic resonance spectroscopy. During the middle and late stages of heavy-intensity exercise, ACID resulted in a lower (P\u3c0.05) intracellular pH (middle: ACID 6.63 vs. CON 6.70; late: ACID 6.64 vs. CON 6.70). Phosphocreatine [PCr] (P\u3c0.05) was lower in ACID during the early [ACID 18.14 vs. CON 20.40 mmol/1] and middle [ACID 14.12 vs. CON 16.73 mmol/1] stages of heavy- intensity exercise. ACID did not affect the magnitude of the PCr slow component [ACID 2.7 vs. CON 4.0 mmol/1] (P\u3e0.05). Fundamental phase PCr breakdown kinetics demonstrated greater amplitude (P\u3c0.05) during heavy-intensity exercise in ACID [ACID: 14.54 vs. CON: 11.31 mmol/1] with no difference in the time constant. In summary, NH4CI ingestion increased PCr breakdown during heavy-intensity exercise with no affect on the PCr slow component

The potential of fractional diagonal chromatography strategies for the enrichment of post-translational modifications

More than 450 post-translational modifications (PTMs) are known, however, currently only some of those can be enriched and analyzed from complex samples such as cell lysates. Therefore, we need additional methods and concepts to improve our understanding about the dynamic crosstalk of PTMs and the highly context-dependent regulation of protein function by so-called ‘PTM codes’. The mere focus on affinity-based enrichment techniques may not be sufficient to achieve this ambitious goal. However, the complementary use of two-dimensional chromatography-based strategies such as COFRADIC and ChaFRADIC might open new avenues for enriching a variety of so far inaccessible PTMs for large-scale proteome studies

Research Brief No. 17 - Rethinking Retirement

Current pension policies in Canada do not take into account rising life expectancy. A Canadian worker in 1950 who retired at age 65 could expect to live 4 years in retirement. In 2006, a Canadian retiring at age 65 can now expect to have 16 years in retirement. Older workers can be a valuable resource with their years of experience that can be used to train younger replacement workers through the use of partial retirement schemes. Since many older workers would prefer to keep working after age 65, employers would benefit by offering flexible retirement schemes, such as a reduced work week. Age discrimination and rigid pension and retirement plans can force many older workers to stop working before they are ready. Public policy should make it easier for older workers to remain in the workforce, creating flexible policies that help workers at all ages to succeed

The Impact of Compressed Workweek on Absenteeism: The Case of Ontario Prison Guards on a Twelve-hour Shift

Depuis quelques décennies, on remet en question la semaine normale de travail par une série d'innovations dans les horaires de travail, notamment la semaine de travail comprimée (STC). L'horaire d'une STC reflète une relation d'arbitrage entre des jours de travail plus longs et moins de jours travaillés par semaine. La version la moins populaire de la STC (impliquant un peu plus de 3 % de la main-d’œuvre canadienne) est celle du quart de travail de 12 heures qu'on retrouve d'habitude pour des opérations continues.Nous inventorions d'abord les recherches pertinentes qui ont été publiées. Les premières recherches sur la STC, au début des années 70 étaient truffées d'un certain nombre de problèmes que les recherches ultérieures ont tenté de résoudre (v.g. petite taille des échantillons, manque de preuves empiriques, manque de données longitudinales et absence de groupe contrôle).Une recherche typique de ces années impliquait des perceptions ex post facto sans groupe contrôle. Ici, nous utilisons une méthodologie qui vise à mesurer l'impact d'un horaire de STC de 12 heures sur l'absentéisme au moyen d'un ensemble de données longitudinales et d'un groupe de comparaison dans un contexte d'avant et d'après. Contrairement aux recherches précédentes, nous utilisons une mesure empirique de performance avec un plan de recherche solide. Cette étude s'attarde sur les expériences d'un centre de détention provincial qui a mis sur pied une STC pour ses gardiens syndiqués durant la fin des années 80. Le syndicat local recherchait activement un horaire de STC permettant la prise de plus de fins de semaines complètes par année. Un comité patronal-syndical fut instauré pour examiner la journée de travail de 12 heures. Vu qu'un centre de détention est caractérisé par une haute intensité de main-d’œuvre, on a porté une attention particulière à l'absentéisme surtout avant et après l'implantation du nouvel horaire de travail.Pour ces gardiens, on a colligé des données sur l'absentéisme un an avant et deux ans après l'instauration de la STC. Les autres gardiens, exclus de cette expérience, ont servi de groupe de comparaison. Nous avons ensuite exploré différents modèles. Le développement de cadres de références permettant des prédictions en ce domaine est encore à l'étape de balbutiement. Le plus développé de ces cadres préliminaires prédit l'absence de forts effets sur l'absentéisme. Ici nous utilisons des modèles d'analyse transversale, diachronique et de comparaison de groupes pour examiner l'impact de la STC sur l'absentéisme des gardiens. Les études avec des données pour une seule période de STC (ex post seulement) utiliserait un modèle d'analyse transversale. Dans le modèle diachronique, la valeur de l'absentéisme dans la période pré-STC est utilisée pour évaluer ce que l'absentéisme des gardiens dans la période STC aurait été si un tel horaire n'avait pas été instauré. Le modèle de comparaison des groupes rend variable dépendante le changement dans l'absentéisme entre les périodes pré-STC et STC. Avec le modèle d'analyse transversale, la variable STC a un grand impact positif sur l'absentéisme. Pour le modèle diachronique, ce même impact est la moitié du précédent. Et pour le modèle de comparaison des groupes, la variable STC a relativement peu d'impact. Considérant que l'absentéisme de base des gardiens est d'environ 9 jours, l'impact de STC sur cet absentéisme est approximativement de 5 jours, 2,5 jours et 1 jour pour chacun des trois modèles.Donc, ces trois modèles produisent des résultats substantiellement différents. La variable STC perd de sa puissance à mesure que le modèle est mieux spécifié. Ces modèles démontrent l'importance d'utiliser une recherche méthodologique solide. En termes pratiques, nos résultats sont similaires à ceux des recherches précédentes et les prédictions faites à partir du cadre utilisé sont vérifiées. C'est donc dire qu'en utilisant différents modèles pour l'étude d'une même question, on en arrive à des conclusions différentes.The study consists of absenteeism measures for a group of prison guards who switched from an 8-hour work day to a 12- hour day compressed workweek (CWW) schedule with absenteeism measures for one year prior to the onset of the schedule and two years on the new schedule. Absenteeism data were compared between the CWW group and a comparison group of regular schedule guards and between the pre-CWW and CWW periods. Absenteeism leuels were higher for the CWW group compared to the comparison group, and were higher over the CWW period when compared to the pre-CWWperiod. In the best specified models, those guards on the CWW had higher absenteeism than the comparison group, though the latter difference was not statistically significant.El estudio consiste en la medida del ausentismo de un grupo de guardias de prisiòn que cambiaron de un horario de 8 horas por dìa a un horario comprimido de 12 horas por dìa. El estudio se extiende a partir de un ano antes del cambio de horario e incluye los dos anos subsecuentes al cambio de horario. Los porcentajes de ausentismo fueron comparados entre el grupo de guardias en el horario comprimido y un grupo de guardias en un horario regular asì como entre el mismo grupo de guardias antes de y después del cambio de horario. El porcentaje de ausentismo fue mas elevado para el grupo en el horario comprimido en comparaciòn con el grupo en el horario normal, el porcentaje de ausentismo fue también mas elevado en el grupo con horario comprimido después del cambio de horario que antes de este. En el mejor de los modelos especificados los guardias en el grupo con horario comprimido tuvieron un porcentaje mas elevado de ausentismo que el grupo de guardias en el horario normal aun y cuando la diferencia no es estadìsticamente importante

The Time is Right: Voluntary Reduced Worktime and Workforce Demographics

ABSTRACT This applied demography paper assembles diverse literature in demography, economics, sociology, and industrial relations to examine the emergence of intergenerational conflict within labour force groups. First the paper defines the generations based on demographic and economic considerations and reviews the existing literature on intergenerational conflict. Second, using Canadian labour market data, it examines the situation facing groups in the labour force. The paper then reviews potential workplace solutions. The conclusion outlines a practical workforce policy that can ameliorate many of the concerns of younger workers and address the trend toward intergenerational conflict while also taking into account current fiscal and workplace realities. Key words: workforce demographics, reduced worktime, intergenerational conflict. RÉSUMÉ Ce document sur la démographie appliquée assemble une littérature diverse en démographie, économie, sociologie et relations industrielles afin d'examiner la manifestation de conflit entre les générations à l'intérieur des groupes de population active. D'abord, les auteurs définissent les générations en se basant sur des considérations démographiques et économiques et revoient la littérature actuelle sur le conflit entre les générations. Ensuite, ils examinent la situation devant laquelle se trouvent certains groupes dans la population active en utilisant des données du marché canadien du travail. En dernier lieu, ils revoient quelques solutions potentielles en milieu de travail. Leur conclusion présente une politique pratique de population active pouvant améliorer plusieures inquiétudes des jeunes travaillants et pouvant aussi adresser cette tendance de conflit entre les générations. Et ceci, tout en tenant compte des réalités actuelles de fiscalisation et de milieu du travail

Identification of cleavage sites and substrate proteins for two mitochondrial intermediate peptidases in Arabidopsis thaliana

Most mitochondrial proteins contain an N-terminal targeting signal that is removed by specific proteases following import. In plant mitochondria, only mitochondrial processing peptidase (MPP) has been characterized to date. Therefore, we sought to determine the substrates and cleavage sites of the Arabidopsis thaliana homologues to the yeast Icp55 and Oct1 proteins, using the newly developed ChaFRADIC method for N-terminal protein sequencing. We identified 88 and seven putative substrates for Arabidopsis ICP55 and OCT1, respectively. It was determined that the Arabidopsis ICP55 contains an almost identical cleavage site to that of Icp55 from yeast. However, it can also remove a far greater range of amino acids. The OCT1 substrates from Arabidopsis displayed no consensus cleavage motif, and do not contain the classical –10R motif identified in other eukaryotes. Arabidopsis OCT1 can also cleave presequences independently, without the prior cleavage of MPP. It was concluded that while both OCT1 and ICP55 were probably acquired early on in the evolution of mitochondria, their substrate profiles and cleavage sites have either remained very similar or diverged completely

Shedding light on black boxes in protein identification

Performing a well thought-out proteomics data analysis can be a daunting task, especially for newcomers to the field. Even researchers experienced in the proteomics field can find it challenging to follow existing publication guidelines for MS-based protein identification and characterization in detail. One of the primary goals of bioinformatics is to enable any researcher to interpret the vast amounts of data generated in modern biology, by providing user-friendly and robust end-user applications, clear documentation, and corresponding teaching materials. In that spirit, we here present an extensive tutorial for peptide and protein identification, available at http://compomics.com/bioinformatics-for-proteomics. The material is completely based on freely available and open-source tools, and has already been used and refined at numerous international courses over the past 3 years. During this time, it has demonstrated its ability to allow even complete beginners to intuitively conduct advanced bioinformatics workflows, interpret the results, and understand their context. This tutorial is thus aimed at fully empowering users, by removing black boxes in the proteomics informatics pipeline.acceptedVersio

Conservation physiology can inform threat assessment and recovery planning processes for threatened species

Conservation physiology has emerged as a discipline with many success stories. Yet, it is unclear how it is currently integrated into the activities of the IUCN and other bodies which undertake international, national, or regional species threat assessments and work with partners to develop recovery plans. Here we argue that conservation physiology has much to offer for the threat assessment process and we outline the ways in which this can be operationalized. For instance, conservation physiology is effective in revealing causal relationships and mechanisms that explain observed patterns, such as population declines. Identifying the causes of population declines is a necessary precursor to the design of actions to reverse or mitigate such threats. Conservation physiology can also identify complex interactions and support modeling activities that consider emerging threats. When a population or species is deemed threatened and recovery plans are needed, physiology can be used to predict how organisms will respond to the conservation intervention and future threats. For example, if a recovery plan was focused on translocation, understanding how to safely translocate organisms would be necessary, as would ensuring that the recipient habitat provides the necessary environmental characteristics to meet the fundamental physiological needs/tolerances of that organism. Our hope is that this paper will clarify ways in which physiological data can make an important contribution to the conservation activities of bodies like the IUCN that are engaged in threat assess