Confidence intervals of prediction accuracy measures for multivariable prediction models based on the bootstrap-based optimism correction methods

In assessing prediction accuracy of multivariable prediction models, optimism corrections are essential for preventing biased results. However, in most published papers of clinical prediction models, the point estimates of the prediction accuracy measures are corrected by adequate bootstrap-based correction methods, but their confidence intervals are not corrected, e.g., the DeLong's confidence interval is usually used for assessing the C-statistic. These naive methods do not adjust for the optimism bias and do not account for statistical variability in the estimation of parameters in the prediction models. Therefore, their coverage probabilities of the true value of the prediction accuracy measure can be seriously below the nominal level (e.g., 95%). In this article, we provide two generic bootstrap methods, namely (1) location-shifted bootstrap confidence intervals and (2) two-stage bootstrap confidence intervals, that can be generally applied to the bootstrap-based optimism correction methods, i.e., the Harrell's bias correction, 0.632, and 0.632+ methods. In addition, they can be widely applied to various methods for prediction model development involving modern shrinkage methods such as the ridge and lasso regressions. Through numerical evaluations by simulations, the proposed confidence intervals showed favourable coverage performances. Besides, the current standard practices based on the optimism-uncorrected methods showed serious undercoverage properties. To avoid erroneous results, the optimism-uncorrected confidence intervals should not be used in practice, and the adjusted methods are recommended instead. We also developed the R package predboot for implementing these methods (https://github.com/nomahi/predboot). The effectiveness of the proposed methods are illustrated via applications to the GUSTO-I clinical trial

Errors in Relative Risks Reported in Figure 3 in a Network Meta-analysis of Cognitive Behavior Therapy Delivery Formats in Adults with Depression

To the Editor: The authors regret to report that Figure 3B was not represented correctly in their Original Investigation, “Effectiveness and Acceptability of Cognitive Behavior Therapy Delivery Formats in Adults With Depression: A Network Meta-analysis,”1 published in the July 2019 issue. In reviewing the article for a presentation, a coauthor detected the errors. In the original Figure 3B, we had shown the dropouts of care as usual over each of the treatment formats, instead of dropouts of the formats over care as usual. But Figure 3B supposed care as usual to be the common comparator, so the correct representation should give the dropouts of the various formats over care as usual. We therefore had to reverse the relative risks. Because of this adjustment, we had to change a number in the text and add a phrase for context, but none of these changes affect the interpretations or conclusions of the study. Thus, we have requested that our article be corrected.2 The authors apologize for any inconvenience caused. This article was previously corrected on July 17, 2019, to fix a label error in Figure 3B.

Milz und Kohlehydratstoffwechsel. V. Mitteilung: Über die Glykogenbildung

Über den Einfluss der Milz auf die Glykogenbildung der Leber und des Muskels ist es bisjetzt wenig beachtet worden. Da es in den vorangegangenen Mitteilungen gezeigt wurde, dass die Milz im Mechanismus der Ausschwemmung des künstlich in die Blutbahn eingebrachten Traubenzuckers aus der Blutbahn eine gewisse Rolle spielt, so habe ich auch an Kaninchen, vor der Splenektomie sowie auch danach zu verschiedenen Zeiten, die folgenden Versuch angestellt: 1) Bei zahlreichen, 4 Tage lang hungernden Kaninchen wurde der Glykogengehalt in Leberu nd in Muskel nach Kojima bestimmt, unmittelbar nachdem man Kaninchen bald vor, bald in verschiedenen Zeitabständen im Laufe von der 1/4. bis zur 6. Stunde nach der intravenösen Injektion sowohl von Glukose (1g pro 1Kg Körpergewicht) allein als auch von derselben und Elektrargol, abtötete, und ebenso an Hungerkaninchen auch der Zuckergehalt im Blute nach Bang und der im Harn nach Momose bei denjenigen Manipulationen. 2) Bei normal gefütterten Kaninchen wurde es zur 2. Stunde nach denjenigen Injektionen abgetötet, indem man aber diesmal von Glukose 2g pro 1Kg Körpergewicht injizierte, und dann ebenso auf den Leberglykogen geprüft. Der Blutzucker wurde auch als Kontrolle beobachtet. 3) Endlich unter Benützung von vielen gut genährten Kaninchen wurde an jedem einigemals hintereinander in Abständen von etwa 1 Monate, während dessen die Einflüsse des vorangegangenen Eingriffes auf Grund der Peobachtungen betreffs Körpergewicht und Blutzuckerverhalten usw. schon vorbeigegangen angenommen würden, je ein Stück aus der Leber herausgeschnitten und dessen Glykogengehalt bestimmt, um dadurch die Einflüsse von der Elektrargolinjektion und auch der Splenektomie darauf zu untersuchen. Aus diesen Untersuchungen ergaben sich die folgenden Ergebnisse: 1) Bei den Hungerkaninchen betrug der Glykogengehalt in der Mitte 0.3% in der Leber und 0.25% im Muskel. Jener erhöhte sich auf 1% zur 1.-1 1/2. Stunde und auf 1.5% zur 2.-3. Stunde nach der Injektion von Glukose allein. Auf den Glykogenstand der Leber übten die Splenektomie sowie die Elektrargolinjektion keinen nennenswerten Einfluss aus. Doch scheint die Zunahme des Leberglykogens infolge von der Traubenzuckerinjektion in einigen Tagen nach der Splenektomie, etwa dem Blut- und Harnzuckerspiegel entsprechend, etwas geringer und auch etwas später als bei den nicht operierten Kaninchen aufzutreten. Nach dem Ablauf von 10 oder noch mehr einigen Tagen nach der Operation ähnelten sich aber die Resultate denjenigen vor der Operation. Das Muskelglykogen wurde weder von Elektrargol noch nach Splenektomie beeinflusst. 2) Bei den Hungerkaninchen war der nüchterne Blutzuckerwert niedriger, und die künstliche Hyperglykämie durch die Traubenzuckerinjektion stärker und länger dauernd als bei den nornalgefütterten, aber die wurde von der Splenektomie nur ein wenig, von der Elektrargolinjektion kaum beeinflusst. 3) Was es die künstliche Glykosurie durch die Traubenzuckerinjektion betrifft, wurde es bei den Hungerkaninchen von der Splenektomie ebenso anscheinend nur ein wenig, von der Elektrargolinjektion aber kaum beeinflusst. 4) Bei den normal gefütterten Kaninchen wurde die Zunahme des Leberglykogens durch die Traubenzuckerinjektion in einigen Tagen nach der Splenektomie mässig erheblich, und von der Elektrargolinjektion ein wenig gestört, aber die Resultate ähnelten sich immer mehr denjenigen vor der Operation, je nachdem es nach der Operation verging. Nach den obigen Beobachtungen spielt die Milz für die Glykogenbildung in der Leber mit Wahrscheinlichkeit insofern eine mehr oder weniger gewisse Rolle, als bei den milzlosen, normalgefütterten Kaninchen der künstlich in die Blutbahn injizierte und dann aus derselben ausgeschwemmte, freie Zucker in der Leber seine Transformations-wirkung weniger als bei den milzhaltigen ausübt

A Sufficient Condition for a Projective Variety to Be the Proj of a Gorenstein Graded Ring

AbstractWe give a sufficient condition for a normal projective variety X to be isomorphic to Proj R for a normal Gorenstein graded ring R, based on a criterion of K.-i. Watanabe. When X is a Gorenstein variety, this condition for X is necessary and sufficient

Visual function and serous retinal detachment in patients with branch retinal vein occlusion and macular edema: a case series

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The influence of serous retinal detachment (SRD) on retinal sensitivity in patients with branch retinal vein occlusion (BRVO) and macular edema remains unclear. This is despite the frequent co-existence of SRD and cystoid macular edema (CME) in BRVO patients on optical coherence tomography (OCT) and the fact that CME is the most common form of macular edema secondary to BRVO. We investigated visual function (visual acuity and macular sensitivity), macular thickness, and macular volume in patients with BRVO and macular edema.</p> <p>Methods</p> <p>Fifty-three consecutive BRVO patients (26 women and 27 men) were divided into two groups based on optical coherence tomography findings. Macular function was documented by microperimetry, while macular thickness and volume were measured by OCT.</p> <p>Results</p> <p>There were 15 patients with SRD and 38 patients with CME. Fourteen of the 15 patients with SRD also had CME. Visual acuity was significantly worse in the SRD group than in the CME group (P = 0.049). Also, macular thickness and macular volume within the central 4°, 10°, and 20° fields were significantly greater in the SRD group (P = 0.008, and P = 0.007, P < 0.001 and P < 0.001, and P < 0.001 and P < 0.001, respectively). However, macular sensitivity within the central 4°, 10°, and 20° fields was not significantly worse in the SRD group than in the CME group.</p> <p>Conclusions</p> <p>SRD itself may decrease visual acuity together with CME, because nearly all SRD patients also had CME. SRD does not seem to influence macular function on microperimetry.</p

Problem Based Learning to Improve HOTS of High School Students

This research aimed to improve the high-order thinking ability of students by applying PBL model in Environment Pollution of 10th MIA 3 graders of SMA Negeri 2 Sukoharjo. This study was a classroom action research followed the Kemmis and Mc. Taggart's, and conducted in two cycles, from April to May 2016. Each cycle consisted of 4 stages: planning, acting, observing, and reflecting. The participants were 31 students (18 female and 13 male students) of 10th MIA 3 graders of SMA Negeri 2 Sukoharjo. Data was obtained using essay test on the high-order thinking ability, interview, observation sheet on the implementation of PBL syntax, observation sheet on affective and psychomotor aspects of students. Essay test of high-order thinking ability includes: analyzing (C4), evaluating (C5), and creating (C6) based on Bloom's revised taxonomy. Data analysis was descriptively. The target of research was the improvement of students' high-order thinking ability in every aspect more than 23% from based line to the end of research cycle. The result shows that the PBL model in environment pollution material is able to improve the high-order thinking ability of students by ≥23% from based line to the end of research cycle. The increase of percentage gain in each aspect of high-order thinking ability from pre-cycle to cycle II was as follows: 1) the analyzing aspect increased by 25.16%, 2) the evaluating aspect increased by 26.66%, and 3) the creating aspect increased by 23.95%