위치와 나이를 고려한 뇌실막종의 메틸화 및 분자적 분석

학위논문 (박사)-- 서울대학교 대학원 의과대학 의학과, 2017. 8. 박성혜.뇌실막종은 중추신경에 발생하는 종양으로, 소아에서는 주로 두개내에, 성인에서는 척추와 두개내에 발생한다. 세계보건기구 지침에 따르면, 뇌실막종의 예후에는 환자의 나이, 종양의 절제 범위, 종양의 위치 및 조직병리학적 등급이 고려인자로 작용한다고 하였다. 하지만 최근 발표된 연구에서는 종양의 위치와 환자의 나이에 중점을 두어 유전자전사적 (transcriptomic), 유전적, 그리고 후생유전학적 분석을 시행하여 WHO 등급보다 더 정확한 임상적 예후를 예측할 수 있게 되었다. 본 연구에서는 성인환자 9례, 소아환자 4례로 구성된 한국인 환자의 원발성 두개내 뇌실막종을 대상으로 Infinium HumanMethylation450 BeadChip array를 이용하여 종양의 위치와 환자의 나이에 따른 메틸화 정도와 관련 유전자를 밝히려 하였다. 신경발생과 신경 분화에 관련된 유전자들이 성인에서 과메틸화 표현형을 보였고, 후뇌 발달 경로의 HOX 유전자 활성화 유전자들이 천막상 그룹에서 과메틸화 표현형을 보였다. 또한 전장엑솜시퀀싱 (whole exome sequencing), 포괄적 암패널과 RNA 시퀀싱 분석을 하여 체세포 돌연변이, 복제수변이 (copy number variation) 및 융합유전자들을 찾았다. 이를 통해 소수의 체세포 돌연변이들과 새로운 융합유전자들을 찾아내었고, 이전 연구에서와 같이 예후가 좋은 한 소아 환자에서 YAP1 융합을 관찰하였다. 이러한 포괄적인 분석들을 이용하여 종양의 위치와 환자 나이에 따라 유의하게 차이를 보이는 종양특이 유전자 발현을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구를 통하여 두개내 뇌실막종의 후생학적 및 유전학적 특성에 대한 값진 통찰을 제공하였고, 위치와 나이에 입각한 정확한 뇌실막종 관련 예후 인자를 찾아 잠재적 치료전략을 모색하는데 큰 역할을 할 수 있을 것으로 기대 된다.Ependymomas are tumors of the central nervous system (CNS) that occur in patients of all ages. Important parameters of the World Health Organization (WHO) guidelines to improve the prognosis of CNS-related tumors such as ependymomas include patient age, tumor resection range, tumor location, and histopathology grade. However, recent studies suggest that more focus on tumor location and patient age in relation to transcriptomics, genetics, and epigenetics can provide a more accurate assessment of clinical prognosis compared to adoption of the WHO-delegated grading scheme alone. In this study, we collected primary intracranial ependymoma tumor tissues from 13 Korean patients (nine adults and four children), and performed whole-exome sequencing, analysis of an ion-proton comprehensive cancer panel, RNA sequencing, and methylation analysis with the Infinium HumanMethylation450 BeadChip array to identify somatic mutations, copy number variations, and fusion genes, and determine the methylation status and associated genes exhibiting significant differential expression according to variations in tumor location and patient age. We found some somatic mutations with a YAP1 fusion in a pediatric patient with a good prognosis, in agreement with a previous study, as well as a few novel gene fusions. However, methylation microarray revealed a novel finding: genes associated with neurogenesis and neuron differentiation were significantly hypermethylated in the adult group and genes activated in the HOX genes related to the hindbrain development pathway were significantly hypermethylated in the supratentorial location group. Our collective results from these analyses confirmed the existence of significant differential expression in tumor-specific genes according to tumor location and patient age. These results provide valuable insight into the epigenetic and genetic profiles of intracranial ependymomas and suggest potential novel treatment strategies based on location- and age-based ependymoma-related prognostic factors.Introduction 1 Material and Methods 5 Study subjets and experimental design for molecular analysis 5 DNA methylation 9 WES 13 CCP 14 RNA sequencing 15 Results 17 Histopathologic features 17 Methylation 18 WES 33 CCP 40 RNA sequencing 42 Discussion 46 References 54 Abstract in Korean 58Docto

The Analysis Of Middle School Environment Textbooks and The Investigation Of Decision Making Model's Strategies Considering Environmental Ethics

The purpose of this study is to analyze middle school environment Textbooks and investigate the decision making model's strategies considering environmental ethics. For this study, environmental issues suitable for the decision making model by textbooks analysis were reconstructed and the decision making learning method for reinforcing environment ethic were investigated.The classes for decision making using episode in environmental issues is significant for making environment ethic introspective by stages. We reconstructed the decision making model of the middle school environment Textbooks in a form of local, national, and global issues, researching Stahl's episode model. The conclusion of this study verified by environment education specialist is summarized as follows. First, the reconstruction of environmental issues can increase the efficiency of class, and shows positive change in the student attitude and their participation in practicing the environmental activity. Second, logical environment learning model using episode in student's everyday life can be applied to any field which requires the effective decision-making, and thus it turns out to be effective for the solution of environmental problems and the protection of environment. Third, Systematic decision-making program of environment education is necessary for making environment ethic introspective by stages and making continuous effect in the student attitude and their participation in practicing the environmental activity. Fourth, Self-evaluation is necessary for making qualitative evaluation which shows the change of student after the learning in terms of their attitude, action and participation. In the future, Systematic decision-making program of Stahl's episode model should be verified and the class strategy should be embodied using various learning materials and teaching methods. Lastly, the class model becomes complex, but easy to apply to the class as it gets concrete, and vice versa. The teachers require a concrete model, but the pedagogists or the developers of the class models tend to suggest abstract ones. In this point of view, Stahl's episode model is the most suitable one satisfying these two conditions.;본 연구의 목적은 환경 윤리적 고찰을 통한 중등 환경교과서 분석과 의사결정 교수-학습 전략 연구에 있다. 이 연구의 목적을 달성하기 위해 우선 교재 분석을 통해 의사결정 모델에 적합한 환경 쟁점을 재구성하고, 환경 윤리 강화를 위한 의사결정 교수-학습 전략을 탐구하였다. 환경 윤리 교육의 방법으로 Stahl의 에피소드를 통한 의사결정 모형을 탐구하여 보았는데, 환경 쟁점의 에피소드를 이용한 의사결정 수업은 집단적 의사소통의 경험 즉, 합리적 결정을 내리는 것에 그치는 것이 아니라 의사소통과 의사결정의 ‘과정’을 ‘경험’하고 ‘연습’하는 기회를 제공하며, 환경 윤리를 내면화시키는데 큰 의의가 있는 것으로 판단되었다. 또한, 중학교 환경 교과서의 의사결정 모델을 지방적, 국가적, 지구적 쟁점으로 재구성하여 Stahl의 에피소드를 통한 의사결정 모형을 고안하여 환경교육 전문가들의 여러 검증을 받았다. 그 결과, 일상과 연계된 환경 쟁점의 재구성은 현행 교과서에 제시된 사례연구나 토의수준의 피상적인 의사결정 수업과 달리 수업의 효과성을 높이고, 학생들의 태도 및 참여도를 변화시키는데 효과적이었다. 학생들의 일상과 관련된 환경쟁점을 에피소드로 제시하여 합리적인 의사결정을 내릴 수 있는 교수-학습 방법은 모든 학습 문제 해결에 적용되므로 환경문제 해결 및 예방 활동에 바람직한 변화의 가능성을 시사하였다. 또한, 의사결정 과정을 통해 환경 윤리를 단계적으로 내면화시키고, 환경 친화적 태도 및 참여도 개선의 지속적인 효과를 위해서는 체계적인 의사결정 환경교육 프로그램이 필요하였다. 그리고 토의 활동 후 환경 친화적 목표 행동 수립과 함께 학습 과정을 통해 학습 전과 후의 환경 활동에 대한 자신의 태도 및 가치관의 변화를 주는 질적 평가인 자기평가가 필요한 것으로 분석되었다. 앞으로 본 연구에서 구안된 Stahl의 에피소드를 통한 의사결정 모형의 실제적 적용을 통해 수업 전략을 구체화시키는 노력이 요구되며, 다양한 협상 대안 의 제시로 학습자가 모든 대안들을 서열화하면서 의사결정 전략을 구체화하는 훈련이 모색되어야 할 것이다.논문개요 = vii Ⅰ. 서론 = 1 A. 연구의 필요성 및 목적 = 1 B. 연구 내용 = 3 C. 연구의 제한점 = 3 Ⅱ. 이론적 배경 = 4 A. 환경 윤리 교육 = 4 1. 환경 윤리 교육의 개념 = 4 2. 환경 윤리 교육의 목표 = 5 3. 우리나라 환경 윤리 교육의 실태와 문제점 = 7 4. 환경 윤리 교육의 중요성과 방향 = 8 B. 환경 윤리의 접근 유형 =11 1. 인간중심주의적(Anthropocentric) 접근 = 12 2. 감각(의식)중심주의적(Pathocentric) 접근 = 14 3. 생명(생물)중심주의적(Biocentric) 접근 = 14 4. 전체론적(Holistic) 접근 = 15 5. 환경 윤리의 접근 유형에 따른 평가 = 18 C. 기존의 환경윤리 교수-학습 모형 = 20 1. 환경 가치 수업 모형 = 21 2. 쟁점중심 모형 = 24 3. 한국교육개발원의 환경 교수-학습 모형 = 29 4. 남상준의 환경 교수-학습 모형 = 31 5. 자기환경화 전략 = 33 D. 환경 윤리적 의사결정 교육 = 37 1. 의사결정의 개념 = 37 2. 환경 윤리적 의사결정 교육의 중요성 = 39 3. 의사결정 학습 모형 = 42 Ⅲ. 연구 방법 및 절차 = 51 A. 연구 방법 = 51 B. 연구 절차 = 52 Ⅳ. 연구 결과 및 논의 = 53 A. 중학교 환경교재 분석 = 53 1. 중학교 환경교육과정의 내용체계 = 53 2. 환경교과서 분석 = 56 B. 수업 모형의 개발 = 62 1. 중학교 환경교육의 의사결정 모델 탐구 = 62 2. 의사결정 모형의 교수-학습과정 = 64 Ⅴ. 결론 및 제언 = 76 A. 결론 = 76 B. 제언 = 78 참고문헌 = 79 Abstract = 83 부 록 = 8

패랭이꽃 리보좀 불활성 단백질 cDNA를 이용한 웅성불임 담배식물체의 개발

Thesis (doctoral)--서울대학교 대학원 :원예학과,1998.Docto