Functional analysis and applications of yeast expressed classical swine fever virus glycoprotein E[rns]

豬瘟病毒（classical swine fever virus﹔CSFV）為豬瘟之病原，引起豬之高度傳染性疾病，並造成經濟上相當大的損失。而豬瘟病毒的結構蛋白包括有核蛋白C及3個封套醣蛋白分別是Erns、E1、E2，其中以Erns及E2主要可誘發宿主產生中和抗體。本實驗室在先前已利用酵母菌Pichia pastoris真核系統來表現Erns醣蛋白，並已確定其抗原性。因此本實驗則進一步大量表現Erns醣蛋白並進行其功能分析及其應用。首先先將含Erns表現蛋白的培養上清液進行硫酸銨沉澱，結果發現在硫酸銨最終濃度為40%即可將蛋白沉澱下來，並具有抗原性。再將此蛋白進行RNase之活性分析時發現不論是去醣基後（26 kDa）或是未去醣基的homodimer（74 kDa）及monomer（37 kDa）表現蛋白都具有RNase之活性可將PK-15細胞RNA降解。且將Erns醣蛋白分別與polyU、polyA、polyG、polyC、polyI/C等RNA polymer作用，則顯示polyU最具受質的特異性。而Erns表現蛋白經間接螢光抗體染色證實也能經由translocation方式進入細胞內。酵母菌表現之Erns醣蛋白亦可應用於西方墨點法（Western blotting）能識別感染野外豬瘟病毒株，及施打E2次單位疫苗之豬隻。此外，以酵母菌所表現豬瘟病毒醣蛋白Erns免疫BALB/c小白鼠後進行融合瘤實驗，經西方墨點法測定後篩選到一株融合瘤細胞能分泌特異性單株抗體，且能辨認感染細胞內病毒蛋白。以上這些結果皆顯示酵母菌所表現之Erns蛋白具有正確之蛋白結構與功能，將可提供作為豬瘟病毒致病機制之研究及發展成為診斷試劑之潛力。目錄 頁次 中文摘要-----------------------------------------------------Ⅰ 英文摘要-----------------------------------------------------Ⅱ 目錄---------------------------------------------------------Ⅲ 表次---------------------------------------------------------Ⅴ 圖次---------------------------------------------------------Ⅵ 第一章 緒言-------------------------------------------------1 第二章 文獻探討---------------------------------------------3 第一節 豬瘟之歷史背景-------------------------------------3 第二節 豬瘟病毒之特性-------------------------------------4 第三節 豬瘟病毒基因與蛋白之研究---------------------------4 第四節 豬瘟病毒之致病機轉---------------------------------7 第五節 豬瘟之臨床症狀及病理變化---------------------------8 第六節 豬瘟之流行病學-------------------------------------9 第七節 豬瘟病毒之研究現況---------------------------------9 第八節 豬瘟病毒之診斷------------------------------------10 第九節 嗜甲醇酵母菌Pichia pastoris之特性及表現系統-------11 第三章 材料與方法------------------------------------------14 第一節 豬瘟病毒的Erns醣蛋白的大量製備----------------------14 第二節 酵母菌Pichia pastoris表現系統生產之Erns醣蛋白的純化-------17 第三節 RNase酵素活性之測定-------------------------------18 第四節 Erns表現蛋白之translocation測定-------------------20 第五節 豬隻血清Erns抗體檢測------------------------------21 第六節 融合瘤細胞之製備----------------------------------21 第四章 結果------------------------------------------------25 第五章 討論------------------------------------------------43 參考文獻-----------------------------------------------------4

Planning for walkable urban areas in Hong Kong: evaluate the social impacts of seperation of modes toeliminate pedestrian- vehicle conflicts-form pedestrian'sperspective

published_or_final_versionUrban Planning and DesignMasterMaster of Science in Urban Plannin

Proportional Fair Scheduling for Non-Orthogonal Multiple Access in Multiple Antenna Systems

在本篇論文中，我們實踐多天線非正交多工接取之核心概念，在發射端波束重疊多個用戶的信號，並在用戶端使用連續干擾消除的技巧解開信號，在假設傳送端完美的知道整個通道狀況，探討此系統搭配迫零預編碼的表現。由於傳統理想的數學模型計算可達到的資料傳輸量無法準確的反應出連續干擾消除的迭代解碼過程中發生的問題，例如內嵌的誤差傳播，我們建構實體層環境，模擬不同的調變與編碼方式所對應的位元錯誤率，藉此計算出實際可達到的資料傳輸量。 因此，在資源分配上，關鍵的四個問題包括預編碼的設定使一個波束可以服務多個重疊的使用者、波束間與波束內使用者的能量控制、調變與編碼的設定和排程的選定。 同時考慮公平性與整體的傳輸量下，採用比例公平調度的模型作為最佳化的目標函數。我們首先提出基於交叉熵的觀念建立的啟發式排程運算解決優化問題，接著，我們將問題轉換成迭代調度最佳化問題，以滿足蜂巢式網路系統排程架構。我們進一步將用戶根據不同的標準作適當的分群，例如通道的相關性和信噪比差值，使系統在不降低過多的效率下能降低運算的時間作及時的分配。最後，我們亦研究如何將非正交結合多天線之多路接取的系統套入至現今的行動網路例如LTE/LTE-A中。模擬的結果顯示，提出的架構不論是在公平性或是整體的資料傳輸量上，都遠勝於傳統的正交多天線方式約$20\%$至$30\%$，又較複雜的交叉熵排程相較於迭代方式約有$40\%$的增益。當我們適度地將用戶分群，例如使用者的通道相關性高於一定值才有機會重疊在同一波束中，使系統在複雜度減半的情況下，幾乎不損失效率。而當用戶們的平均信噪比高時，提升的效益甚至超越$50\%$。因此，同時利用空間域與能量域資源的多天線非正交多工接取，被視為未來極具發展性的技術。In this thesis, we investigate non-orthogonal multiple access (NOMA) combined with multiple-input multiple-output (MIMO) system with zero-forcing (ZF) beamforming with the assumption of perfect CSIT. The key concept of the NOMA-MIMO is to superpose multiple user signals within a beam at the transmitter and apply successive interference cancellation (SIC) at the user terminal. Rather than using the ideal mathematical capacity model, we construct the physical-layer adaptive modulation and coding scheme (AMC) to accurately reflect the error propagation effect during the iterative decoding process. Therefore, the critical design issues on NOMA-MIMO include the precoding setting, the transmission power control among/within beams, the MCS selection and the scheduling strategy. In terms of fairness and sum rate, the proportional fair (PF) scheduling model is adopted to evaluate system performance. We first propose the metaheuristic scheduling approach based on the cross entropy method to solve the optimization problem of maximizing product of user sum rates. Then, we relax the maximization problem to the iterative scheduling scheme which is applied to the realistic systems such as LTE/LTE-A. To further reduce the computational complexity but not lose performance much, we consider to divide users into groups based on various criteria. In addition, the implementation of the NOMA-MIMO scenario in nowadays communication network is also taken into account. Simulation results show the proposed NOMA-MIMO system significantly outperforms conventional OMA-MIMO in not only system sum rate but also fairness by around $20\%$ to $30\%$. The more complicated cross entropy method improves $40\%$ gains compared with the iterative scheme. If we appropriately group users such as intra-beam correlation threshold, the perforance is almost the same while the complexity reduces by half. In addition, as users'' average SINRs are high, NOMA-MIMO even achieve more than $50\%$ gain. Therefore, NOMA-MIMO is expected to be a promising technique in the next generation of the cellular mobile communication which provides superior spectral efficiency by exploiting not only spatial-domain but also power-domain resources

Estimation of Methane Flux and Identification of Fluid Source in Gas Hydrate Potential Area Offshore Southwestern Taiwan

台灣西南海域位於歐亞板塊及菲律賓板塊聚合隱沒交界處，地物資料顯示在台灣西南海域或深或淺的分布著「海床仿擬反射」（bottom simulating reflection, BSR），而這些「海床仿擬反射」指示天然氣水合可能分布在700-3000 公尺水深處，地球化學方面的資料也顯示，不論是底部海水或沉積物中的甲烷濃度都相當高；另外硫酸甲烷過度帶（sulfate-methane transition zone, SMTZ）所在深度很淺，皆指出在台灣西南的海床底下可能有很大的甲烷儲藏庫資源，也相當可能有天然氣水合物的存在。本研究利用2010年Marion Dufresne 178 航次中，在台灣西南海域採得的11根長岩心，計算出台灣西南海域活動大陸邊緣與被動大陸邊緣，不同的地質背景區域的甲烷通量，並發現溶解無機碳DIC總通量，可作為更精確推算甲烷通量的工具，可區分出硫酸鹽通量中進行甲烷厭氧氧化反應與有機物氧化反應的比例。結果發現，台灣西南海海域在活動大陸邊緣的甲烷通量，高於被動大陸邊緣的甲烷通量，但所有計算所得的甲烷通量，都高於一些有水合物或湧升流存在的研究區域。 沉積物孔隙水中Cl-、I-與Br-離子濃度隨深度的變化，常用來指示水合物的存在，將本研究的所有孔隙水中Cl-、I-與Br-離子濃度隨深度的變化，與前人研究在存在水合物的研究區域，所得到的結果數據作比較，發現本研究區域沒有明顯記錄到水合物形成或解離，及側向流體進入的現象，且I-與Br-離子濃度的關係圖也指出，沉積物孔隙水中的離子濃度變化主要受控於有機物降解作用。自沉積物孔隙水中離子濃度的變化，本研究結果（< 30 mbsf）無法明確指出水合物存在的證據，分布在台灣西南海域不同地質背景區域的高甲烷通量，可能來自更深處水合物解離出的甲烷，或底下甲烷蘊藏庫以氣體形式往上遷移。Previous studies reported that the widely distribution of BSRs (Bottom Simulating Reflection) and the geophysical modeling indicating a large amount of methane hydrates in offshore Southwestern Taiwan. In this study, we estimate the methane fluxes along passive and active margins from the measured data of the cored sediments collected during Marion Dufresne 178 cruise in 2010. Total changes of the dissolved inorganic carbon (DIC) fluxes (ΔDIC-Prod ) can be used to estimate the methane flux quantitatively, and we confirm that the sulfate depletion is mainly controlled by the anaerobic oxidation of methane (AOM) reaction and/or the sedimentary organic matter. Although BSRs are widely distributed both in the active margin and in the passive margin, the methane fluxes in active margin are greater than in passive margin of the coring sites. All the estimated methane fluxes in offshore SW Taiwan are higher than other gas hydrate and upwelling area. Cl-, I- and Br- concentrations of pore water in cored sediments may be useful to indicate the existence of potential gas hydrates in study area. Compared the data with previous three studied cores in this area, we found that there is no evidence to indicate gas hydrate dissociation, formation or lateral fluid flow in studied area. The results shown in the I- vs. Br- diagrams, which can reflect these dissolved species in pore water, indicate the variations are mainly controlled by marine organic matter degradation. Since dissolved species in pore water can’t indicate the existence of gas hydrate in the studied samples (< 30 m), the high methane flux may result from deep gas hydrate reservoirs and/or free gas zones

Sino-British trade, 1950-1966

published_or_final_versionEconomicsMasterMaster of Art

從慣習理論檢視觀光農園的發展:以台北市木柵觀光茶園為例

[[abstract]]臺灣第一座觀光農園成立至今，已約三十年的時間，本文選擇從文化的角度切入，探討觀光農園的發展狀況。本文以臺灣第一個觀光農園：台北市木柵觀光茶園為研究對象，從慣習理論的觀點，檢驗一個地區中農民們的慣習，與觀光農園發展之間的關係。 透過觀光農園設立時台北市政府所訂定的短程、中程及長程發展目標當作指標，檢驗木柵觀光茶園發展的現況，經過調查，木柵觀光茶園發展現況與發展目標之間產生了差距，發展現況幾乎沒有達到當初設立的發展目標。 研究結果發現，農民的慣習確實對於木柵觀光茶園的發展產生了影響。市政府設立的木柵觀光茶園短程程目標為「希望以現有產業農作，設法吸引市民前往遊憩消費，來增加農民收益為目的」，由於受到茶農欲增加家庭收入的商業慣習影響，短程目標並沒有達成。中程目標為「引導農民改種更高價值作物，及進行多元化綜合經營，讓市民享受田園之樂，確保觀光的特性及增加農產品商品化，增進都市農業的價值」，因為茶葉生產方式制式化的企業慣習影響，並沒有達成中程目標。長程目標為「希望形成具有相當規模之『觀光農區』或專業區，並擁有強勢的集貨運銷及市場競爭能力，使農業經營企業化、現代化」，受到農民們想要維持茶葉的農業生產、商家們強調農村公共利益、茶農們固定的茶葉銷售型態及茶業技術交流模式、對於茶比賽制度的信任、土地傳承制度等人際慣習的影響下，發展現況與長程目標間產生了差距。 在每一個地區中，皆存在著居民們經年累月創造出的慣習，因此，在設立觀光農園的發展目標時，需要以地區內農民們的在地慣習做為發展目標設立的基礎，才能夠提升發展目標的達成成效。