Interaction of anions with a newly characterized alpha carbonic anhydrase from Halomonas sp

The inhibition and characterization of the α-class carbonic anhydrase (CA, EC 4.2.1.1) from the Halomonas sp. are reported for the first time. The enzyme was purified 91-fold with a yield of 39%, and a specific activity of 600 U/mg proteins was obtained. It has an optimum pH at 7.5, an optimum ionic strength at 20 mM and an optimum temperature at 20 °C. The following anions, SCN(-), Br(-), Cl(-), I(-), [Formula: see text], [Formula: see text], [Formula: see text], [Formula: see text], [Formula: see text] and [Formula: see text] showed inhibitory effects on the hydratase activity of the enzyme. Sulfate, sulfide, azide, nitrate, nitrite and iodide exhibited the strongest inhibitory activity, in the micromolar range (KI-s of 5.5-15.5 µM). SCN(-), Br(-), Cl(-), [Formula: see text] were moderate inhibitors, whereas other anions showed only weak activities. Our findings indicate that these anions inhibit the Halomonas sp. CA (HmCA) enzyme in a similar manner to other α-CAs from mammals investigated earlier, but the susceptibility to various anions differs significantly between the Halomonas sp. and other organism CAs

Islamic art and ornamentation: Reflections on the study of art from Alois Riegl to Ernst Gombrich and beyond

Ankara : Department of Graphic Design and the Institute of Fine Arts of Bilkent Univ., 2000.Thesis (Master's) -- Bilkent University, 2000.Includes bibliographical references leaves 76-79In this study certain arguments about two different but related phenomena are presented: Islamic art and ornamentation. The problem of maintaining a relevant definition for both cases is emphasized by giving examples of diverse and even opposing explanations. For ornamentation, the work of two art historians. Alios Riegl and Ernst Gombrich is elaborated and the differences in their approach to ornamentation are tried to be shown. In order to understand the issue of Islamic ornament, first the discussions about the term Islamic art are given, then the place of ornamentation in Islamic art is argued by taking arabesque as an example case. Finally the possibilities of experiencing the artwork in such a situation which the plurality of approaches that may subject to contradict each other exist, are investigated. The ambiguity of Islamic ornamentation is expected 'to give way to an inquiry about the nature of artwork.Şentürk, Murat KenanM.S

Asamblaj Kavramı ile Aktör-Ağ Teorisi Arasındaki Bağlantıların İncelenmesi: Asamblaj Kentçiliği

Bu çalışmada Deleuze ve Guattari’nin asamblaj kavramı ile Bruno Latour’unaktör-ağ teorisi arasındaki bağlantının kent çalışmalarına nasıl yansıdığı ele alınmaktadır. Asamblaj kavramının kent çalışmalarında kullanımının temelde iki farklı versiyonu olsa da (DeLanda’nın asamblaj teorisi ve Latour’un aktör-ağ teorisi) daha ziyade aktör-ağ teorisiyle bağlantılı olarak değerlendirilmektedir. Aktör-ağ teorisi, Deleuze’den beslenmekte ve bu durum kent çalışmaları alanında “asamblaj kentçiliği” olarak nitelendirilen yeni bir araştırma yöntemiyle açığa çıkmaktadır. Asamblaj kentçiliği, etnografik yönteme ağırlık vermekte ve yoğun betimlemeyle birlikte ampirik araştırmaya işaret etmektedir. Bağlam bağımlı klasik ve neo-Marksist kent çalışmalarından önemli farklılıklar barındıran asamblaj kentçiliği, insan olanlar kadar insan olmayan unsurları da aktör olarak tanımlamakta ve tüm ikilikleri reddederek akış, oluş ve sürece önem vermektedir. Bu özellikleri ile birlikte asamblaj kentçiliği, bir araya gelen aktörlerin rol oynadığı yoğunlaşmış ağ veya köksap biçiminde işleyen olağan kent yaşamının ilişkisel olarak incelenmesini mümkün kılabilmektedir

Simple methanesulfonates are hydrolyzed by the sulfatase carbonic anhydrase activity.

This study was financed by Turkish Republic Prime Ministry State Planning Organization (DPT), (Project no: 2010K120440) for (MS). Work from Supuran lab was financed by an FP 7 EU grant (Metoxia project)

The spatialization of old age: A qualitative study on an apartment building in Kadiköy’s Moda district of İstanbul

Yaşlılığın mekânsallaşması, apartman, sokak, mahalle vb. mekânlarda yaşlı nüfusun artması sonucu ortaya çıkan yeni bir durumu anlatmaktadır. Bu çalışmada, İstanbul Kadıköy ilçesindeki eski yerleşim bölgelerinden biri olan Moda semtinde yaşayan yaşlıların, kullandıkları mekânlarla ilişkilerini incelemek ve ayrıca yaşlıların gündelik hayatlarını nasıl şekillendirdiklerini bir apartmandan hareketle ortaya koymak amaçlanmaktadır. Bu apartmanın yaşlı nüfusun yoğun olduğu bir semtte ve sokakta yer alması ve kendi içinde de neredeyse tamamının yaşlılara ev sahipliği yapması araştırmaya konu edilmesinde etkili olmuştur. Araştırmada nitel araştırma geleneği içerisinde yer alan durum çalışması deseni kullanılmıştır. Bu çerçevede 14 kişi ile derinlemesine görüşme gerçekleştirilmiş ve apartmanda, sokakta ve semtte gözlemlerde bulunulmuştur. Betimsel analiz yöntemi ile değerlendirilen veriler, Michel De Certeau’nun strateji ve taktik kavramları çerçevesinde değerlendirilmiştir. Yaşlıların, ye rinde yaşlanmanın önemli imkânlarını hâlihazırda kullanabildikleri ancak yaşlılığın mekânsallaşması sürecinde yeni kentleşme dinamiklerinin yaşlıların taktikler geliştirmesini sınırladığı görülmektedir.The spatialization of old age describes a novel situation that has appeared as a result of the increasing number of elderly individuals living in apartment buildings, streets, and neighborhoods. In addition to presenting how the daily lives of elderly individuals are shaped through taking one apartment building as an example located in the Moda district of Kadiköy, Istanbul, this study aims to examine the relationship that the elderly living in this same district have with each other and the greater community. Since the district of Moda has a high population of elderly individuals, this specific apartment building’s location on the street and in the district and the fact that it houses an almost entirely elderly population were influential while choosing it for examination. Following a qualitative case study design, in-depth interviews were conducted with 14 people to collect their observations on the apartment building, the street, and the neighborhood. Descriptive analysis was used to evaluate the data in line with the concepts of strategy and tactics developed by Michel de Certeau. The results of the study indicate that although elderly are able to take advantage of important aging-in-place opportunities, the dynamics that new urbanization brings to the process of spatializing old age is observed to limits their abilities to develop tactics

Displacement based earthquake early warning systems

Yerdeğiştirme tabanlı deprem gözlemleri giderek yaygınlaşmakta ve buna bağlı olarak kullanım alanları genişlemektedir. Deprem başladıktan kısa süre içerisinde meydana gelen depremin nihai büyüklüğünün belirlenmesi, hem Deprem Erken Uyarı Sistemleri (DEU) hem de depremden bittikten sonraki dönemde kayıpların kestirilmesi ve yardım faaliyetlerinin koordinasyonu için büyük önem taşımaktadır. 1999 Chi-Chi (Mw7.6), 1999 Hector Mine (Mw7.1) ve 2003 Tokachi-Oki (Mw8.3) gibi büyük depremler için yapılan testlerde kuvvetli yer hareketi ölçerlerden elde edilen yerdeğiştirmeye dayalı kestirimlerin daha duyarlı olmakla birlikte özellikle büyük depremleri olması gerekenden daha küçük olarak kestirdiği gözlenmektedir (Brown vd. 2011; Crowell vd. 2013). Büyük depremler sırasında kaynağa yakın hızölçerlerin satüre olması, kaynağa uzak olmaları durumunda ise erken uyarı için yeterli zaman kalmaması nedeniyle hızölçerlerin erken uyarı amaçlı kullanımında sorunlar bulunmaktadır. Jeodezik ölçüler ve ivme kayıtlarının birlikte kullanımı ile elde edilen sismojeodezik dalga formları ise satürasyon sorunu içermemeleri nedeniyle kaynağa çok yakın mesafeden veri sağlamakta, GNSS alıcılarının inersiyal olmayan bir sistemde ölçüm yapmaları sayesinde doğrudan kalıcı yerdeğiştirmeler ve buna bağlı deprem büyüklüğü hesaplanabilmesine olanak sağlamaktadırlar. Günümüzde A.B.D. ve Japonya gibi depreme maruz kalan gelişmiş ülkelerde sismojeodezik verilere dayalı erken uyarı sistemleri kurulmuş ve yaygınlaşmaya başlamıştır. Bu çalışmada, ülkemizde yakın dönemde meydana gelen bazı büyük depremler için sadece GNSS dalgaformlarına dayalı olarak deprem büyüklükleri hesaplanmıştır. Gökova, Gökçeada ve Van depremlerinin GNSS yerdeğiştirme dalga formları ile tekrar hesaplanması soncunda sırası ile 6.6, 6.9, 7.2 Mw olan deprem büyüklüğü 6.54, 7.21 ve 7.22 Mw olarak hesaplanmıştır. Bu sonuçlar, özellikle büyük depremler için GNSS dalgaformlarına dayalı olarak hesap edilen deprem büyüklüklerinin yüksek duyarlık sağladığını ve deprem erken uyarı amaçlı kullanımındaki potansiyelini göstermektedir.Displacement based earthquake observations are becoming more common and application fields are becoming larger. The determination of the earthquake magnitude in a short time after the earthquake plays an important role both for Earthquake Early Warning Systems (EEW) and the estimation of the losses and coordinating the rescue efforts. However, magnitude estimation from the displacement waveforms for the 1999 Chi-Chi (Mw7.6), 1999 Hector Mine (Mw7.1) and 2003 Tokachi-Oki (Mw8.3) earthquake shows that while they are more precise, the earthquake magnitudes were underestimated (Brown et al. 2011; Crowell et al. 2013). There are well known bottlenecks with the velocity measuring seismometers due to the fact that they get saturated nearby large earthquakes or they do not provide sufficient time for early warning when they are away from the earthquake source. Geodetic measurements and accelerometer records provide data from the close vicinity of the earthquake source and enable to determine to static offsets and the earthquake magnitude based on displacements since GNSS receivers operate in a non-inertial reference frame. Nowadays, earthquake early warning systems based on seismogeodetic observations are being established and becoming more common in countries subject to earthquake hazard such as USA and Japan. In this study, earthquake magnitudes were estimated for several recent earthquakes in Turkey only by using the GNSS displacement waveforms. GNSS_based Re-estimation of the earthquake magnitudes for Gökova, Gökçeada and Van earthquakes resulted in the magnitudes of 6.54, 7.21 ve and 7.22 Mw, respectively, corresponding to the original magnitudes of 6.6, 6.9, 7.2. These results show that earthquake magnitudes based on GNSS waveforms provide high precision and their potential for use in earthquake early warnin

Carbonic anhydrase inhibitors: in vitro inhibition of α isoforms (hCA I, hCA II, bCA III, hCA IV) by flavonoids

Turkish Republic Prime Ministry State Planning Organization (DPT), [2010K120440]; E

EVALUATION OF THE EFFECT OF SURGICALLY ASSISTED RAPID MAXILLARY EXPANSION ON TEMPOROMANDIBULAR JOINT DISC POSITION WITH MAGNETIC RESONANCE IMAGING*

Objective: To evaluate, by magnetic resonance ımaging (MRI), the effects of surgically assisted rapid maxillary expansion (SARME) on the temporomandibular joint (TMJ) disc position. Methods: Patients with maxillary transversial discrepeancies treated SARME analyzed prospectively. The magnetic resonance imaging assessments of the TMJ were obtained before SARME operation and after expansion process. Retention period, gender and presence of wisdom teeth were the predictor variables. Disc position index (DPI) values were calculated and analyzed as an outcome variable. Results: The study included 13 subjects (4 male, 9 female) with a mean age of 19.5±2.3 years. After treatment there was excess changing position seen in three articular disc relative the condyle in three patient. Retention period, gender and presence of wisdom teeth were not significantly effected TMJ disc in terms of DPI values in mouth opened or closed position (p> 0.05). Conclusion: According to our study TMJ disc position was not effected significantly by SARME (p > 0.05)