İshalli hastalarda Entamoeba histolytica'nın saptanmasında kullanılan yöntemlerin değerlendirilmesi

Giriş ve amaç: Entamoeba histolytica’nın neden olduğu amibiyaztüm dünyada paraziter enfeksiyona bağlı üçüncü ölüm nedenidir. Amibiyazın tanısında yaygın olarak kullanılan yöntem dışkı mikroskopisidir.Ancak E. histolytica ile morfolojk olarak benzer olan diğer amip türleriarasında ayrım yapılması direkt mikroskobik inceleme ile imkansızdır.Bu yüzden dışkıda E. histolytica’ya özgü antijen varlığını araştıran ELISA ve PZR gibi yöntemler tanıda kullanılmaya başlanmıştır.Bu çalışmada; ishal şikayeti ile başvuran ve intestinal amibiyaz ön/ayırıcı tanısı için E. histolytica araştırılması istenen hastaların dışkı örneklerinde, direkt ve boyalı mikroskobik inceleme, dışkıda E. histolytica’yaözgü adezin antijeni saptamaya yönelik ELISA testi ve PZR testinin çalışılması ve bu testlerin tanı değerlerinin araştırılması amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Akdeniz Üniversitesi Hastanesi’nde 1 Ekim 2015-31 Temmuz 2016 tarihleri arasında çeşitli servis ve polikliniklerden Merkez Laboratuvarı’na gelen kanlı ve/veya mukuslu, şekilsiz toplam 546dışkı örneği çalışmaya alınmıştır. Bu örneklerde, E. histolytica varlığınıaraştırmak için direkt ve boyalı mikroskopi, ELISA (Entamoeba CELISA Path, Cellabs, Avustralya) ve PZR (BD Max Enteric Parasite Panel,Becton Dickinson, ABD) yöntemleri uygulanmıştır.Bulgular: Çalışmaya alınan örneklerin 257 (%47)’si kadın, 289(%53)’u erkek hastalara aittir. Hastaların yaş ortalaması 23,77±24,05olarak bulunmuştur. Hastaların %53’ünü çocuk yaş grubu oluşturmaktadır. Direkt mikroskobik inceleme ile örneklerin 198 (%36.3)’inde şüpheli E. histolytica/dispar/moshkovskii kist ve/veya trofozoiti görülmüş vebu örnekler trikrom boyama yapılarak incelenmiştir. Trikrom boyamayapılan örneklerin 49’unda şüpheli E. histolytica/dispar/moshkovskiikist ve/veya trofozoiti saptanmış ve bu örneklerde ELISA ve PZR testleri çalışılmıştır. ELISA yöntemi ile örneklerin hiçbirinde pozitiflik saptanmamıştır. PZR yöntemi ile örneklerin 44’ü negatif bulunmuştur. Üçörnekte PZR inhibitörü nedeniyle, iki örnekte ise sistem hatasına bağlıolarak geçerli sonuç elde edilememiştir.Sonuç: Mikroskobi, spesifik antijen testi ve moleküler yöntemlerinbirlikte kullanıldığı çalışmamızda hasta popülasyonumuzda E. histolytica saptanmamıştır.E. histolytica’nın saptanmasında mikroskobik inceleme yetersiz kalmaktadır.Mikroskobik inceleme ile şüpheli pozitif olarak değerlendirilen örnekler PZR ve E. histolytica‘ya özgü antijen saptanması gibi daha özgülyöntemlerle doğrulanmalıdır.</p

Molecular Epidemiology of Carbapenem-Resistant Enterobacterales Strains Isolated from Blood Cultures in Antalya, Turkey

Objective: The aim of this study was to investigate the prevalence of carbapenemase and CTX-M genes among 330 blood culture isolates of Enterobacterales with reduced susceptibility to at least 1 carbapenem, between 2010 and 2015

Evaluation of the BD Phoenix CPO Detect Test for detection of carbapenemase-producing Enterobacterales

Plain language summaryEnterobacterales are a type of bacteria that usually live harmlessly in the gut of humans. However, if the bacteria get access to the bladder or bloodstream, they can cause infection. Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) are a type of bacteria that can cause carbapenem antibiotic-resistant infections, a group of powerful antibiotics. The rapid spread of CPE will pose an increasing threat to public health and medical treatment practices; therefore, rapid detection of CPE is crucial. This study assessed the performance of the BD Phoenix CPO Detect Test for the detection of carbapenemase-producing Enterobacterales. The BD Phoenix CPO Detect Test offers both the detection of carbapenemase production and antimicrobial susceptibility testing simultaneously and can be clinically useful for determining possible treatment options. Aims: This study aimed to evaluate the performance of the BD Phoenix CPO Detect Test (BD Diagnostic Systems) for the detection and classification of carbapenemase-mediated carbapenem resistance. Methods: A total of 447 Enterobacterales strains were included in the study. All strains were tested with the BD Phoenix CPO Detect Test and the modified carbapenem inactivation method. Results: Carbapenemase production was detected in 157 of 159 carbapenemase producers, including 95.7% of class B and 99.2% of class D isolates using the BD Phoenix CPO Detect Test. BD Phoenix CPO Detect has a sensitivity of 98.7% and a specificity of 95.5% in detecting carbapenemase production. Conclusion: The classification of OXA-48 and class B carbapenemases, the most common carbapenemases circulating in Turkey, was highly accurate