3,025 research outputs found
Quantitative Regular Expressions for Arrhythmia Detection Algorithms
Motivated by the problem of verifying the correctness of arrhythmia-detection
algorithms, we present a formalization of these algorithms in the language of
Quantitative Regular Expressions. QREs are a flexible formal language for
specifying complex numerical queries over data streams, with provable runtime
and memory consumption guarantees. The medical-device algorithms of interest
include peak detection (where a peak in a cardiac signal indicates a heartbeat)
and various discriminators, each of which uses a feature of the cardiac signal
to distinguish fatal from non-fatal arrhythmias. Expressing these algorithms'
desired output in current temporal logics, and implementing them via monitor
synthesis, is cumbersome, error-prone, computationally expensive, and sometimes
infeasible.
In contrast, we show that a range of peak detectors (in both the time and
wavelet domains) and various discriminators at the heart of today's
arrhythmia-detection devices are easily expressible in QREs. The fact that one
formalism (QREs) is used to describe the desired end-to-end operation of an
arrhythmia detector opens the way to formal analysis and rigorous testing of
these detectors' correctness and performance. Such analysis could alleviate the
regulatory burden on device developers when modifying their algorithms. The
performance of the peak-detection QREs is demonstrated by running them on real
patient data, on which they yield results on par with those provided by a
cardiologist.Comment: CMSB 2017: 15th Conference on Computational Methods for Systems
Biolog
Real-time Decision Policies with Predictable Performance
As methods and tools for Cyber-Physical Systems grow in capabilities and use, one-size-fits-all solutions start to show their limitations. In particular, tools and languages for programming an algorithm or modeling a CPS that are specific to the application domain are typically more usable, and yield better performance, than general-purpose languages and tools. In the domain of cardiac arrhythmia monitoring, a small, implantable medical device continuously monitors the patient\u27s cardiac rhythm and delivers electrical therapy when needed. The algorithms executed by these devices are streaming algorithms, so they are best programmed in a streaming language that allows the programmer to reason about the incoming data stream as the basic object, rather than force her to think about lower-level details like state maintenance and minimization. Because these devices are resource-constrained, it is useful if the programming language allowed predictable performance in terms of processing runtime and energy consumption, or more general costs. StreamQRE is a declarative streaming programming language, with an efficient and portable implementation and strong theoretical guarantees. In particular, its evaluation algorithm guarantees constant cost (runtime, memory, energy) per data item, and also calculates upper bounds on the per-item cost. Such an estimate of the cost allows early exploration of the algorithmic possibilities, while maintaining a handle on worst-case performance, on the basis of which hardware can be designed and algorithms can be tuned
Window Expressions for Stream Data Processing
Traditional ways of storing and querying data do not work well in scenarios
where data is being generated continuously and quick decisions need to be
taken. For example, in hospital intensive care units, signals from multiple
devices need to be monitored and the occurrence of any anomaly should raise
alarms immediately. A typical design would take the average from a window of
say 10 seconds (time-based) or 10 successive (count-based) readings and look
for sudden deviations. Existing stream processing systems either restrict the
windows to time or count-based windows or let users define customized windows
in imperative programming languages. These are subject to the implementers'
interpretation of what is desired and hard to understand for others. We
introduce a formalism for specifying windows based on Monadic Second Order
logic. It offers several advantages over ad-hoc definitions written in
imperative languages. We demonstrate four such advantages. First, we illustrate
how practical streaming data queries can be easily written with precise
semantics. Second, we can get different but expressively equivalent formalisms
for defining windows. We use one of them (regular expressions) to design an
end-user-friendly language for defining windows. Third, we use another
expressively equivalent formalism (automata) to design a processor that
automatically generates windows according to specifications. The fourth
advantage we demonstrate is more sophisticated. Some window definitions have
the problem of too many windows overlapping with each other, overwhelming the
processing engine. This is handled in different ways by different engines, but
all the options are about what to do when this happens at runtime. We study
this as a static analysis question and prove that it is undecidable to check
whether such a scenario can ever arise for a given window definition. We
identify a decidable fragment..
Arrhythmogenic Hearts in PKD2 Mutant Mice Are Characterized by Cardiac Fibrosis, Systolic, and Diastolic Dysfunctions
Autosomal dominant polycystic kidney disease (PKD) is a hereditary disorder affecting multiple organs, including the heart. PKD has been associated with many cardiac abnormalities including the arrhythmogenic remodeling in clinical evaluations. In our current study, we hypothesized that Pkd2 gene mutation results in structural and functional defects in the myocardium. The structural and functional changes of Pkd2 mutant hearts were analyzed in the myocardial-specific Pkd2 knockout (KO) mouse. We further assessed a potential role of TGF-b1 signaling in the pathology of Pkd2-KO hearts. Hearts from age-matched 6-month-old MyH6•Pkd2wt/wt (control or wild-type) and MyH6•Pkd2flox/flox (mutant or Pkd2-KO) mice were used to study differential heart structure and function. Cardiac histology was used to study structure, and the “isolated working heart” system was adapted to mount and perfuse mouse heart to measure different cardiac parameters. We found that macrophage1 (M1) and macrophage 2 (M2) infiltration, transforming growth factor (TGF-b1) and TGF-b1 receptor expressions were significantly higher in Pkd2-KO, compared to wild-type hearts. The increase in the extracellular matrix in Pkd2-KO myocardium led to cardiac hypertrophy, interstitial and conduction system fibrosis, causing cardiac dysfunction with a predisposition to arrhythmia. Left ventricular (LV) expansion or compliance and LV filling were impaired in fibrotic Pkd2-KO hearts, resulted in diastolic dysfunction. LV systolic contractility and elastance decreased in fibrotic Pkd2-KO hearts, resulted in systolic dysfunction. Compared to wild-type hearts, Pkd2-KO hearts were less responsive to the pharmacological stress-test and changes in preload. In conclusion, Pkd2-KO mice had systolic and diastolic dysfunction with arrhythmogenic hearts
Preface: a special selection on biomechanical applications in medical science - Part II
Electronic version of an article published as Journal of Mechanics in Medicine and Biology, Volume 21, Issue 10, 2021, 2102003:1-7, DOI 10.1142/S0219519421020036 © 2021 World Scientific Publishing Company https://www.worldscientific.com/doi/10.1142/S0219519421020036This special selection on Biomechanical Applications in Medical Science presents the ongoing and active research in the Biomechanics area. The overall goal is to summarize recent discoveries and groundbreaking studies that will account for new challenge research in the broad and relevant area of Biomechanics used for medical science.Peer ReviewedPostprint (published version
Natural language processing to extract medical problems from electronic clinical documents: Performance evaluation
AbstractIn this study, we evaluate the performance of a Natural Language Processing (NLP) application designed to extract medical problems from narrative text clinical documents. The documents come from a patient’s electronic medical record and medical problems are proposed for inclusion in the patient’s electronic problem list. This application has been developed to help maintain the problem list and make it more accurate, complete, and up-to-date. The NLP part of this system—analyzed in this study—uses the UMLS MetaMap Transfer (MMTx) application and a negation detection algorithm called NegEx to extract 80 different medical problems selected for their frequency of use in our institution. When using MMTx with its default data set, we measured a recall of 0.74 and a precision of 0.756. A custom data subset for MMTx was created, making it faster and significantly improving the recall to 0.896 with a non-significant reduction in precision
Non-invasive Detection and Compression of Fetal Electrocardiogram
Noninvasive detection of fetal electrocardiogram (FECG) from abdominal ECG recordings is highly dependent on typical statistical signal processing techniques such as independent component analysis (ICA), adaptive noise filtering, and multichannel blind deconvolution. In contrast to the previous multichannel FECG extraction methods, several recent schemes for single‐channel FECG extraction such as the extended Kalman filter (EKF), extended Kalman smoother (EKS), template subtraction (TS), and support vector regression (SVR) for detecting R waves on ECG, are evaluated via the quantitative metrics such as sensitivity (SE), positive predictive value (PPV), F‐score, detection error rate (DER), and range of accuracy. A correlation predictor that combines with multivariable gray model (GM) is also proposed for sequential ECG data compression, which displays better percent root mean-square difference (PRD) than those of Sabah’s scheme for fixed and predicted compression ratio (CR). Automatic calculation on fetal heart rate (FHR) on the reconstructed FECG from mixed signals of abdominal ECG recordings is also experimented with sample synthetic ECG data. Sample data on FHR and T/QRS for both physiological case and pathological case are simulated in a 10-min time sequence
LNCS
We introduce in this paper AMT 2.0 , a tool for qualitative and quantitative analysis of hybrid continuous and Boolean signals that combine numerical values and discrete events. The evaluation of the signals is based on rich temporal specifications expressed in extended Signal Temporal Logic (xSTL), which integrates Timed Regular Expressions (TRE) within Signal Temporal Logic (STL). The tool features qualitative monitoring (property satisfaction checking), trace diagnostics for explaining and justifying property violations and specification-driven measurement of quantitative features of the signal
Prediction of the disease course in Friedreich ataxia
We explored whether disease severity of Friedreich ataxia can be predicted using data from clinical examinations. From the database of the European Friedreich Ataxia Consortium for Translational Studies (EFACTS) data from up to five examinations of 602 patients with genetically confirmed FRDA was included. Clinical instruments and important symptoms of FRDA were identified as targets for prediction, while variables such as genetics, age of disease onset and first symptom of the disease were used as predictors. We used modelling techniques including generalised linear models, support-vector-machines and decision trees. The scale for rating and assessment of ataxia (SARA) and the activities of daily living (ADL) could be predicted with predictive errors quantified by root-mean-squared-errors (RMSE) of 6.49 and 5.83, respectively. Also, we were able to achieve reasonable performance for loss of ambulation (ROC-AUC score of 0.83). However, predictions for the SCA functional assessment (SCAFI) and presence of cardiological symptoms were difficult. In conclusion, we demonstrate that some clinical features of FRDA can be predicted with reasonable error; being a first step towards future clinical applications of predictive modelling. In contrast, targets where predictions were difficult raise the question whether there are yet unknown variables driving the clinical phenotype of FRDA
Life style, medicine and anabolic steroids: organ damages, new molecular biomarkers, epidemiology, pathology and toxicology
Introduzione. Anche se l'abuso di steroidi anabolizzanti (SA) è chiaramente associato a un
ampio spettro di effetti collaterali, gli adolescenti e gli atleti usano frequentemente diversi
derivati sintetici di testosterone, sia a fini estetici che per migliorare le loro prestazioni.
L'uso di SA è spesso associato a diverse sostanze come bevande energetiche e integratori
alimentari. L'uso combinato di diverse sostanze, come SA, bevande energetiche e
integratori alimentari, può peggiorare i singoli effetti collaterali di ciascuna sostanza,
aggravando il rischio di diverse patologie correlate alla loro assunzione, come per esempio
le patologie cardiovascolari. Pertanto, l'utilizzo contemporaneo di più sostanze può
incrementare ogni singolo effetto collaterale, divenendo un importante problema per la
salute pubblica, aggravando il costo dell'assistenza sanitaria. Inoltre, l’eventuale presenza
di altri substrati ignoti (ad esempio, la predisposizione genetica alle malattie
cardiovascolari, la presenza della sindrome metabolica o l'inattività fisica) combinata all'uso
di queste sostanze, può rappresentare un mix esplosivo per i consumatori, generando gravi
conseguenze per la salute individuale e, nei casi più gravi, la morte.
Infine, un problema comune legato all’utilizzo di queste sostanze è quello relativo al loro
monitoraggio, sia che si tratti di integratori alimentari o che si tratti di SA. Pertanto la messa
a punto di test di rilevazione di ultima generazione è molto importante al fine di contrastare
regimi di doping sempre più sofisticati agevolati anche dal continuo sviluppo di nuove
sostanze dagli effetti simili ma dalla composizione chimica differente.
Obiettivi: questo lavoro di dottorato mirava ad analizzare diversi aspetti importanti legati
all'uso di SA, definendo: 1 - danni d'organo correlati; 2 –determinazione di nuovi potenziali
biomarcatori molecolari; 3 - epidemiologia; 4 - patologia; 5 - tossicologia.
Programma di ricerca: (i) Durante il progetto di dottorato, sono state eseguite due
revisioni complete della letteratura utilizzando i database scientifici più diffusi. (ii) Tutti i
campioni testati in questo lavoro sono stati selezionati analizzando la documentazione di
tutte le autopsie eseguite presso l'Istituto di medicina legale dell’Università degli studi di
Foggia dal 2001 a luglio 2018 (circa 1700 autopsie): - 5 casi di giovani positivi per l'uso di
SA sono stati selezionati per il “gruppo AAS “; - 6 casi di uomini morti per insufficienza
cardiaca sono stati arruolati come "gruppo HF (insufficienza cardiaca)" per la valutazione
del danno cardiaco; - 15 casi hanno composto i tre gruppi arruolati per analizzare il danno
d’organo encefalico: 5 per il gruppo "Stroke (SG)", 5 per il gruppo "Drug (DG)" e 5 per il
gruppo "Aging (AG)"; - sono stati selezionati 5 casi di uomini deceduti per arresto cardiaco
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che avevano sofferto, per un periodo pari o superiore a 10 anni, di cirrosi generata da steatosi
epatica non alcolica (gruppo NAFLD) per la valutazione del danno epatico; - 5 casi di
uomini deceduti per arresto cardiaco dopo un periodo pari o superiore a 10 anni di malattia
renale cronica (gruppo CKD) per la valutazione del danno renale; - infine, 6 casi di uomini
sani, deceduti in incidenti stradali sono stati arruolati come controlli: 4 casi (età media 28 ±
7,4) di soggetti con anamnesi negativa per patologie cardiache e negativi per l'esame
tossicologico sono stati selezionati come gruppo di controllo nei test di alcuni miRNAs nei
tessuti cardiaci e muscoloscheletrici; Inoltre, sono stati arruolati altri 2 casi (età media 41,5
± 2,12 anni) di soggetti deceduti in incidenti, privi di danno encefalico e con esame
tossicologico negativo. Questi ultimi due controlli sono stati utilizzati nelle reazioni di
quantificazione eseguite su cervello, fegato e rene. (iii) Esami istologici ed esami
tossicologici sono stati eseguiti in tutti i casi selezionati; (iv) la quantificazione dei miRNAs
per tutti i gruppi ed i tessuti testati è avvenuta mediante “quantitative real-time PCR” (qRT-
PCR); (v) infine per la predizione degli effetti di ciascun miRNA, sono stati utilizzati diversi
tool per l’analisi in silico, capaci di predire i geni target. Inoltre, il “pathway” di ciascun
miRNA è stato analizzato anche un’attenta revisione della letteratura al fine di identificare
il suo meccanismo di azione all’interno del contesto abusers; (vi) Sono stati inoltre utilizzati
due tipi di questionari come strumenti di raccolta dati mediante moduli on line: 1-
“Multidimensional Body-Self Relations Questionnaire (MBSRQ)”; 2 - questionario “in
house” per definire le abitudini voluttuarie degli intervistati; (vii) Infine l'analisi statistica è
stata effettuata attraverso il software Statistica per Windows.
Risultati: entrambi i lavori di revisione della letteratura scientifica sono stati molto
importanti per definire i principali effetti avversi associati all'uso/abuso di SA e per
identificare i "miRNA candidati"; questi lavori hanno consentito di sviluppare i successivi
steps del lavoro di dottorato. In base ai dati di letteratura scientifica, i principali effetti
avversi legati all’uso di SA sono prevalentemente a carico dei sistemi riproduttivi maschile
e femminile, in particolare nel caso queste sostanze siano assunte da adolescenti. Inoltre,
cuore, rene, fegato e cervello sono risultati essere gli altri organi bersaglio legati all'uso di
SA.
Pertanto, i miRNA sono stati selezionati e testati sugli organi bersaglio: cuore, fegato, rene,
encefalo. Grazie al lavoro di revisione scientifica è stato possibile individuare una batteria
di miRNA candidati legati al relativo danno d’organo. Tali miRNA sono stati testati sia nei
soggetti del gruppo AAS che negli altri gruppi. Per il tessuto cardiaco e muscoloscheletrico,
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sono stati testati i valori di espressione dei seguenti miRNA: hsa-miR-133a-3p, hsa-miR-
208a-3p, hsa-miR-499a-3p e hsa-miR-1-3p. I livelli di espressione di miR-133 nel tessuto
cardiaco nei gruppi HF e AAS e nel tessuto muscolare (solo per il gruppo AAS) sono
risultati aumentati rispetto ai controlli. I livelli di espressione di miR-208 nel tessuto
cardiaco (gruppi HF e AAS) sono risultati up-regolati rispetto ai controlli. Questi risultati
non sono stati confermati nel tessuto muscolare (gruppo AAS), dove i livelli di espressione
rilevati sono risultati essere simili ai controlli. I livelli di espressione di miR-499 sono
risultati up-regolati nel tessuto cardiaco nel gruppo HF. Nel cuore e nei tessuti muscolari
del gruppo AAS, i livelli di espressione erano simili ai controlli. I livelli di espressione di
miR-1_3 nel tessuto cardiaco (gruppi HF e AAS) e nel tessuto muscolare (gruppo AAS)
sono risultati up-regolati rispetto ai controlli. Questo miRNA risultava over espresso nel
muscolo (vastus lateralis) del gruppo AAS.
Nel tessuto renale sono stati testati il miR-21 e il miR-205. I valori di espressione di miR-
21 nei tessuti renali sono risultati up-regolati rispetto ai controlli, anche se i valori nel
gruppo CDK erano significativamente più alti rispetto al gruppo AAS. I livelli di
espressione del miR-205 erano più alti nel gruppo CKD rispetto al gruppo AAS, anche se
erano over espressi in entrambi i gruppi rispetto ai controlli.
Nel tessuto epatico, confrontando i valori di espressione di miR-21 nei due gruppi testati
(AAS vs NAFDL), anche se i valori erano più alti rispetto ai controlli in entrambi i gruppi,
questo miRNA risultava over espresso nel gruppo AAS con una differenza statistica
significativa. Analizzando i livelli di espressione di miR-122 in ciascun gruppo, anche se i
valori erano up-regolati rispetto ai controlli, i valori nel gruppo NAFDL erano
significativamente più alti rispetto al gruppo AAS. Analizzando i livelli di espressione di
miRNA-132, non sono state rilevate differenze significative confrontando il gruppo AAS
con il gruppo NAFDL, anche se entrambi i miRNA erano più alti rispetto ai controlli. Lo
stesso trend è emerso analizzando i dati sui livelli di espressione del miR-155.
Sul tessuto cerebrale sono stati testati diversi miRNA (miR-21, miR-34, miR-124, miR-132
e miR-200b) in quattro gruppi (gruppi SG, AG, DG e AAS). Per miR-21 i valori di
espressione del gruppo AAS erano simili ai valori di espressione dei gruppi SG e AG ed
erano significativamente più alti rispetto al gruppo DG. Per il miR-34, il gruppo AAS ha
mostrato livelli di espressione simili al gruppo DG, risultando inoltre più elevati rispetto ai
gruppi AG e SG. I livelli di espressione tessutale di miR-124 erano più alti nei gruppi AAS
e SG confrontandoli con quelli dei gruppi DG e AG. miR-132 era più alto nei gruppi DG e
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AAS rispetto ai gruppi AG e SG. Infine, miR-200b era significativamente over espresso nel
gruppo AAS, anche se i livelli di espressione tissutale di questo miRNA erano più alti in
tutti i gruppi rispetto ai livelli di espressione tissutale dei controlli.
L'interpretazione dell'espressione dei miRNA è stata eseguita attraverso diversi software di
predizione online (analisi “in silico”) al fine di individuare i possibili meccanismi di azione
derivanti dell'espressione aberrante a livello cellulare dei miRNA testati. In questo modo, è
stato possibile raggiungere l'obiettivo principale di questo progetto, cioè accertare i ruoli
cardine per diversi miRNA, collegandoli al danno d'organo specifico.
Infine, dall'analisi dell’indagine eseguita mediante i due sopracitati questionari è stato
possibile creare la prima mappa italiana sul fenomeno legato all'uso di diverse sostanze (SA,
bevande energetiche e integratori), correlandoli anche allo stato psicologico individuale dei
soggetti intervistati. Tra i dati ottenuti, risulta senza dubbio importante evidenziare
l'esistenza di un'associazione significativa (p <0,05) tra l'uso di steroidi anabolizzanti e il
consumo di altre sostanze (bevande energetiche e integratori). Infatti gli utilizzatori di SA
(circa il 4% degli intervistati) ha dichiarato di utilizzare contemporaneamente anche
integratori e bevande energetiche. Questi dati hanno confermato l’idea già presentata in altri
report realizzati in altri stati europei dell’utilizzo combinato tra SA, integratori e altre
sostanze. In questo contesto, i potenziali rischi per la salute legati al consumo combinato di
questi prodotti sono allo stato attualo ancora pochi investigati. Per tale ragione, dovrebbe
essere migliorato lo sforzo della comunità scientifica per comprendere e comunicare meglio
i rischi legati all'uso di queste sostanze.
Significato e impatto della ricerca: alla luce dei risultati presentati in questo progetto,
emerge che le recenti preoccupazioni della comunità scientifica internazionale in merito ai
potenziali effetti negativi sulla salute dei consumatori legati al consumo di bevande
energetiche, integratori e SA sono ampiamente valide. Come ampiamente discusso, l'uso di
SA non si limita agli atleti, ma riguarda i giovani che usano questo tipo di sostanze anche
per fini estetici. Per questi motivi, questo campo di ricerca è molto impegnativo per la
comunità scientifica, in particolare per il settore forense, che vede coinvolte diverse figure
professionali.
Come dimostrato dai dati ottenuti dal presente progetto di dottorato, i principali organi
bersaglio legato ai danni collaterali derivanti dall'uso di SA sono cuore, rene, fegato e
cervello; in diversi casi, le patologie potrebbero essere fatali per gli utilizzatori come
descritto nei casi presentati in questo lavoro di tesi. L'identificazione di nuovi biomarcatori
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molecolari può essere considerata di interesse per la comunità scientifica, non solo per la
definizione di metodi antidoping innovativi, ma anche per la salute pubblica. In effetti,
considerando i risultati dei questionari, l'uso combinato di SA con altre sostanze come
integratori o bevande energetiche, è significativamente più alto rispetto ai non utilizzatori,
confermando l'idea del “polypharmacy” per gli utilizzatori SA. Queste sostanze possono
essere acquistate anonimamente da Internet, dove vengono vendute con presunti effetti sulle
prestazioni mentali, fisiche e sessuali nonostante non vi siano evidenze scientifiche su tali
effetti. Inoltre, quando gli effetti negativi di ciascuna sostanza sono combinati tra loro,
aumentando i rischi per la salute degli utenti, con la possibilità di incrementare i costi per
l’assistenza sanitaria.
Tendenze future: i rischi per la salute legati a un aumentato e combinato consumo di questi
prodotti non sono stati completamente chiariti. Per questi motivi, anche alla luce dei risultati
presentati in questo lavoro di tesi di dottorato, gli sforzi della comunità scientifica
internazionale dovrebbero essere aumentati al fine sia di migliorare la comprensione del
fenomeno che la comunicazione relativa ai rischi derivanti dall’uso singolo o combinato di
queste sostanze.Background: To date, even if anabolic androgenic steroid (AAS) abuse is clearly associated
with a broad spectrum of collateral effects, adolescents and athletes frequently use a large
group of synthetic derivatives of testosterone, both for esthetical purposes and for improving
their performance. AAS use is frequently associated with different substances such as energy
drinks and dietary supplements. The combined use of different substances, such as AASs,
energy drinks, and dietary supplements, could worsen each adverse effect, worsening the
risk for several pathologies such as cardiovascular disease. Moreover, the presence of other
silent substrates (for example, the genetic predisposition to cardiovascular diseases, the
presence of the Metabolic Syndrome or physical inactivity) combined with the use of this
kind of substance can represent an explosive mix for the users, causing severe consequences
and, in particular cases, death.
Open questions: One common factor between detecting each of these performance-
enhancing drugs is that the traditional methods of drug testing were taken at a single time
point. An enhanced method of detection has been required to counter the increasingly
sophisticated doping regimens and the ongoing development of new substances.
The contemporary use of these substances could represent an important warning for public
health, worsening the cost of health care.
Aims: The goal of this PhD project was to analyze several important aspects linked to the
use of AASs, defining the following: 1 - organ damage; 2 - new molecular biomarkers; 3 -
epidemiology; 4 - pathology; 5 - toxicology.
Research plan: (i) During the project, two complete literature reviews were performed
using the most used scientific databases. (ii) All samples were selected analyzing the
documentation of all autopsies performed by the Institute of Legal Medicine of Foggia from
2001 to July 2018 (about 1700 autopsies): - 5 cases of young men positive for AAS use were
selected for the “AAS group”; - 6 cases of men who died of heart failure were enrolled as
the "HF (heart failure) group", with the aims to evaluate the heart damages; - 15 cases
composed the three groups enrolled to analyze brain injury (5 for the “Stroke group (SG)”,
5 for the “Drug group (DG)”, and 5 for the “Aging group (AG)”); - 5 cases of men who died
of cardiac arrest who had suffered from cirrhosis caused by non-alcoholic fatty liver disease
(NAFLD group), were selected to evaluate the liver damages; - 5 cases of men who had died
of cardiac arrest after a long period (more than 10 years) of Chronic kidney disease (CKD
group), were enrolled to evaluate kidney damages; - 6 cases of healthy men, who had died
in car accidents were enrolled to compose the control groups: 4 cases (age mean 28 ± 7.4
with negative anamnesis for heart suffering and negative for the toxicological examination
were selected as Control Group in the Quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR) reactions
for the miRNA tested in cardiac and musculoskeletal tissues, and 2 cases (mean age 41.5 ±
2.12 years), who died in car accidents for causes other than brain trauma, NAFLD, CKD and
negative for toxicological examination were selected as Control group in the qRT-PCR
reactions performed on brain, liver, and kidney. (iii) Histological and toxicological
examinations were performed in all groups; (iv) miRNA quantification through qRT-PCR
was performed; (v) for each miRNA the prediction effect analysis was carried out through
both with the literature review and “in silico”, using several informatics tools; (vi) two
surveys using online data collection tools were performed: “Multidimensional Body-Self
Relations Questionnaire (MBSRQ)” and “in house” questionnaire to define the voluptuary
habits of the interviewees; (vii) Statistical analysis was carried out through the software
Statistica for Windows.
Results: The literature reviews were very important to define the main adverse effects linked
to AAS use/abuse and to identify the “candidate miRNAs” to test on the tissue samples of
the selected cases. The main adverse effects concerning AAS use were strictly linked to the
reproductive systems, particularly in adolescents. Moreover, other organs that are severely
damaged by AAS use were heart, kidney, liver, and brain. For these reasons, several
miRNAs related to these organs were selected and tested in the selected groups. For heart
and musculoskeletal tissues, the miRNA expression values of miRNA has-133a-3p, hsa-
miR-208a-3p, hsa-miR-499a-3p, and hsa-miR-1-3p were tested. The expression levels of
miR-133 in heart tissue (HF and AAS groups) and muscle tissue (AAS group) resulted
upregulated compared to controls. The expression levels of miR-208 in heart tissue (HF and
AAS groups) resulted upregulated compared to controls. These results were not confirmed
in muscle tissue (AAS group), where expression levels were similarly to controls. The
expression levels of miR-499 resulted upregulated in the HF group, while in the AAS group,
the expression levels of this miRNA were similar to controls. The expression levels of miR-
1_3 both in HF and AAS groups resulted upregulated compared to controls. Moreover, this
miRNA resulted overexpressed in the muscle (vastus lateralis) of the AAS group.
In kidney tissue, miR-21 and miR-205 were tested. The expression values of miR-21 in
kidney tissues were upregulated compared to controls, even if the CDK values were
significantly higher than the AAS group. The expression levels of miR-205 were higher in
the CKD group compared to the AAS group, even if they were overexpressed in both groups
compared to controls.
Analyzing the results on the liver tissue, comparing the expression values of miR-21 in the
two tested groups (AAS vs NAFDL), even if the values were higher compared to controls,
this miRNA resulted overexpressed in the AAS group with a statistical significant difference.
Concerning the expression levels of miR-122 in each group, even if the values were
overexpressed compared to controls, the NAFDL values were significantly higher than the
AAS group. Analyzing the expression levels of miRNA-132, there were no significant
differences comparing the AAS group to the NAFDL group, even if both miRNAs were
higher compared to controls. The same results were obtained analyzing the data about miR-
155.
On brain tissue, several miRNAs were tested (miR-21, miR-34, miR-124, miR-132, and
miR-200b) in four groups (SG, AG, DG, and AAS groups). For miR-21 the expression
values of the AAS group were similar to the expression values of the SG and AG groups and
was significantly higher compared to DG. For miR-34, the AAS group showed expression
levels of this miRNA similar to the DG group, resulting higher compared to the AG and SG
groups. The tissue levels of miR-124 were higher in the AAS and SG groups compared to
the DG and AG groups. miR-132 was higher in the DG and AAS groups compare to the AG
and SG groups. Finally, miR-200b was significantly overexpressed in the AAS group, even
if this miRNA was higher in all groups than in controls.
The interpretation of miRNA expression was performed through several web tools (“in
silico” analysis) ascertaining the possible effects of the aberrant expression at cellular
levels. In this way, it was possible to achieve the main goal of this project, to ascertain the
pivotal roles for several miRNAs expressed in specific tissue, linking them to specific
organ damage.
Finally, from the analysis of the questionnaires it was possible to create the first Italian
map on the phenomenon linked to the use of several substances, such as AASs, Energy
Drinks and Supplements. The collected data demonstrated that there was a significant
association (p < 0.05) between the use of anabolic steroids and consumption of other
substances, such as energy drinks and supplements. The potential health risks related to
heavy consumption of these products have largely gone unaddressed. For these reasons,
the effort of the scientific community both for a better understand and to better
communicate the risks linked to the use of these substances should be improved.
Significance and Impact of research: In the light of the results discussed in this project,
it would appear that concerns in the scientific community and among the public regarding
the potential adverse health effects of the increased consumption of energy drinks,
supplements and AASs are broadly valid. As extensively discussed, AAS use is not limited
to athletes, but concerns young people who use these kinds of substances for esthetical
purposes. For these reasons, this ongoing field of research is very challenging for the
scientific com
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