Open Data Platform for Knowledge Access in Plant Health Domain : VESPA Mining

Important data are locked in ancient literature. It would be uneconomic to produce these data again and today or to extract them without the help of text mining technologies. Vespa is a text mining project whose aim is to extract data on pest and crops interactions, to model and predict attacks on crops, and to reduce the use of pesticides. A few attempts proposed an agricultural information access. Another originality of our work is to parse documents with a dependency of the document architecture

Living Knowledge

Diversity, especially manifested in language and knowledge, is a function of local goals, needs, competences, beliefs, culture, opinions and personal experience. The Living Knowledge project considers diversity as an asset rather than a problem. With the project, foundational ideas emerged from the synergic contribution of different disciplines, methodologies (with which many partners were previously unfamiliar) and technologies flowed in concrete diversity-aware applications such as the Future Predictor and the Media Content Analyser providing users with better structured information while coping with Web scale complexities. The key notions of diversity, fact, opinion and bias have been defined in relation to three methodologies: Media Content Analysis (MCA) which operates from a social sciences perspective; Multimodal Genre Analysis (MGA) which operates from a semiotic perspective and Facet Analysis (FA) which operates from a knowledge representation and organization perspective. A conceptual architecture that pulls all of them together has become the core of the tools for automatic extraction and the way they interact. In particular, the conceptual architecture has been implemented with the Media Content Analyser application. The scientific and technological results obtained are described in the following

Named Entity Recognition for Monitoring Plant Health Threats in Tweets: a ChouBERT Approach

An important application scenario of precision agriculture is detecting and measuring crop health threats using sensors and data analysis techniques. However, the textual data are still under-explored among the existing solutions due to the lack of labelled data and fine-grained semantic resources. Recent research suggests that the increasing connectivity of farmers and the emergence of online farming communities make social media like Twitter a participatory platform for detecting unfamiliar plant health events if we can extract essential information from unstructured textual data. ChouBERT is a French pre-trained language model that can identify Tweets concerning observations of plant health issues with generalizability on unseen natural hazards. This paper tackles the lack of labelled data by further studying ChouBERT's know-how on token-level annotation tasks over small labeled sets.Comment: 2022 6th International Conference on Universal Village (UV), Oct 2022, Boston, United State

Site-Specific Rules Extraction in Precision Agriculture

El incremento sostenible en la producción alimentaria para satisfacer las necesidades de una población mundial en aumento es un verdadero reto cuando tenemos en cuenta el impacto constante de plagas y enfermedades en los cultivos. Debido a las importantes pérdidas económicas que se producen, el uso de tratamientos químicos es demasiado alto; causando contaminación del medio ambiente y resistencia a distintos tratamientos. En este contexto, la comunidad agrícola divisa la aplicación de tratamientos más específicos para cada lugar, así como la validación automática con la conformidad legal. Sin embargo, la especificación de estos tratamientos se encuentra en regulaciones expresadas en lenguaje natural. Por este motivo, traducir regulaciones a una representación procesable por máquinas está tomando cada vez más importancia en la agricultura de precisión.Actualmente, los requisitos para traducir las regulaciones en reglas formales están lejos de ser cumplidos; y con el rápido desarrollo de la ciencia agrícola, la verificación manual de la conformidad legal se torna inabordable.En esta tesis, el objetivo es construir y evaluar un sistema de extracción de reglas para destilar de manera efectiva la información relevante de las regulaciones y transformar las reglas de lenguaje natural a un formato estructurado que pueda ser procesado por máquinas. Para ello, hemos separado la extracción de reglas en dos pasos. El primero es construir una ontología del dominio; un modelo para describir los desórdenes que producen las enfermedades en los cultivos y sus tratamientos. El segundo paso es extraer información para poblar la ontología. Puesto que usamos técnicas de aprendizaje automático, implementamos la metodología MATTER para realizar el proceso de anotación de regulaciones. Una vez creado el corpus, construimos un clasificador de categorías de reglas que discierne entre obligaciones y prohibiciones; y un sistema para la extracción de restricciones en reglas, que reconoce información relevante para retener el isomorfismo con la regulación original. Para estos componentes, empleamos, entre otra técnicas de aprendizaje profundo, redes neuronales convolucionales y “Long Short- Term Memory”. Además, utilizamos como baselines algoritmos más tradicionales como “support-vector machines” y “random forests”.Como resultado, presentamos la ontología PCT-O, que ha sido alineada con otras ontologías como NCBI, PubChem, ChEBI y Wikipedia. El modelo puede ser utilizado para la identificación de desórdenes, el análisis de conflictos entre tratamientos y la comparación entre legislaciones de distintos países. Con respecto a los sistemas de extracción, evaluamos empíricamente el comportamiento con distintas métricas, pero la métrica F1 es utilizada para seleccionar los mejores sistemas. En el caso del clasificador de categorías de reglas, el mejor sistema obtiene un macro F1 de 92,77% y un F1 binario de 85,71%. Este sistema usa una red “bidirectional long short-term memory” con “word embeddings” como entrada. En relación al extractor de restricciones de reglas, el mejor sistema obtiene un micro F1 de 88,3%. Este extractor utiliza como entrada una combinación de “character embeddings” junto a “word embeddings” y una red neuronal “bidirectional long short-term memory”.<br /