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SEU Evaluation of Hardened-by-Replication Software in RISC-V Soft Processor
The interest of the space industry around soft processors is increasing. However, the advantages in terms of costs and customizability provided by soft processors are countered by the reliability issues deriving by Single Event
Effects, especially Single Event Upsets. Several techniques have been proposed to tackle these issues, both at the hardware- and software levels. Software approaches rely on replicating data and computations to cope with SEUs affecting the memory where the binary code is stored. Thanks to open licenses, RISCV solutions are steadily growing in popularity among the set of available soft processors. In this works, we present a reliability evaluation of four different benchmarks running on the RI5CY soft processor implemented on SRAM-based FPGAs. The reliability of the baseline and hardened-by-replication versions of the software benchmarks are evaluated against SEUs induced faults both at the software and hardware architecture levels through fault injection campaigns in the microprocessor memory and configuration memory, respectively. Results assess how the adoption of the hardening-by-replication technique at the software level slightly improves reliability against software related faults but degrades reliability against architectural faults, making it an inefficient solution when it is not combined with hardware robustness
Approximate hardening techniques for digital signal processing circuits against radiation-induced faults
RESUMEN NO TÉCNICO.
Se llama radiación al proceso por el cual una partícula o una onda es capaz de
transmitir energía a través del espacio o un medio material. Si la energía transmitida
es suficientemente alta, la radiación puede provocar que algunos electrones se desplacen
de su posición, en un proceso llamado ionización.
La radiación ionizante puede provocar problemas a los seres vivos, pero también a
los diversos materiales que componen los sistemas eléctricos y electrónicos utilizados en
entornos sujetos a radiación. Existen en La Tierra varios procesos que emiten radiación
ionizante, como la obtención de energía en centrales nucleares o ciertos procedimientos
médicos. Sin embargo, las fuentes de radiación más importantes se sitúan más allá de
nuestra atmósfera y afectan fundamentalmente a sistemas aeroespaciales y vuelos de gran
altitud.
Debido a la radiación, los sistemas electrónicos que se exponen a cualquiera de estas
fuentes sufren degradación en sus propiedades a lo largo del tiempo y pueden sufrir fallos
catastróficos que acorten su vida útil. El envejecimiento de los componentes se produce
por acumulación de carga eléctrica en el material, lo que se conoce como Dosis Ionizante
Total (TID por sus siglas en inglés), o por distorsiones en el silicio sobre el que se fabrican
los circuitos, lo que se conoce como Daño por Desplazamiento (DD). Una única partícula
ionizante puede, sin embargo, provocar también diversos tipos de fallos transitorios o
permanentes en los componentes de un circuito, generalmente por un cambio de estado
en un elemento de memoria o fallos destructivos en un transistor. Los diferentes tipos de
fallos producidos en circuitos por la acción de una única partícula ionizante se engloban
en la categoría de Efectos de Evento Único (SEE por sus siglas en inglés).
Para proteger los sistemas electrónicos frente a los efectos de la radiación se suele
recurrir a un conjunto de técnicas que llamamos endurecimiento frente a radiación.
Los procedimientos tradicionales de endurecimiento han consistido en la fabricación de
componentes electrónicos mediante procesos especiales que les confieran una resistencia
inherente frente a la TID, el DD y los SEE. A este conjunto de técnicas de endurecimiento
se lo conoce como Endurecimiento frente a la Radiación Por Proceso (RHBP por sus
siglas en inglés). Estos procedimientos suelen aumentar el coste de los componentes y
empeorar su rendimiento con respecto a los componentes que usamos en nuestros sistemas
electrónicos cotidianos.
En oposición a las técnicas RHBP encontramos las técnicas de Endurecimiento
frente a la Radiación Por Diseño (RHBD por sus siglas en inglés). Estas técnicas
permiten detectar y tratar de corregir fallos producidos por la radiación introduciendo
modificaciones en los circuitos. Estas modificaciones suelen aumentar la complejidad de
los circuitos que se quiere endurecer, haciendo que consuman más energía, ocupen más
espacio o funcionen a menor frecuencia, pero estas desventajas se pueden compensar con la disminución de los costes de fabricación y la mejora en las prestaciones que aportan
los sistemas modernos.
En un intento por reducir el coste de las misiones espaciales y mejorar sus
capacidades, en los últimos años se trata de introducir un mayor número de Componentes
Comerciales (COTS por sus siglas en inglés), endurecidos mediante técnicas RHBD.
Las técnicas RHBD habituales se basan en la adición de elementos redundantes
idénticos al original, cuyos resultados se pueden comparar entre sí para obtener
información acerca de la existencia de un error (si sólo se usa un circuito redundante,
Duplicación Con Comparación [DWC]) o llegar incluso a corregir un error detectado de
manera automática, si se emplean dos o más réplicas redundantes, siendo el caso más
habitual la Redundancia Modular Triple (TMR) en todas sus variantes.
El trabajo desarrollado en esta Tesis gira en torno a las técnicas de endurecimiento
RHBD de sistemas electrónicos comerciales. En concreto, se trata de proponer y
caracterizar nuevas técnicas de endurecimiento que permitan reducir el alto consumo
de recursos de las utilizadas habitualmente. Para ello, se han desarrollado técnicas de
endurecimiento que aprovechan cálculos aproximados para detectar y corregir fallos en
circuitos electrónicos digitales para procesamiento de señal implementados en FPGA
comerciales, dispositivos que permiten implementar circuitos electrónicos digitales a
medida y reconfigurarlos tantas veces como se quiera.
A lo largo de esta Tesis se han desarrollado diferentes circuitos de prueba endurecidos
mediante TMR y se ha comparado su rendimiento con los de otras técnicas de
Redundancia Aproximada, en concreto la Redundancia de Precisión Reducida (RPR),
la Redundancia de Resolución Reducida (RRR) y la Redundancia Optimizada para
Algoritmos Compuestos (ORCA):
• La Redundancia de Precisión Reducida se basa en la utilización de dos réplicas
redundantes que calculan resultados con un menor número de bits que el circuito
original. De este modo se pueden disminuir los recursos necesitados por el circuito,
aunque las correcciones en caso de fallo son menos precisas que en el TMR. En este
trabajo exploramos también la RPR Escalada como un método de obtener un balance
óptimo entre la precisión y el consumo de recursos.
• La Redundancia de Resolución Reducida es una técnica propuesta originalmente en
esta tesis. Está pensada para algoritmos que trabajan con información en forma de
paquetes cuyos datos individuales guardan alguna relación entre sí. Las réplicas
redundantes calculan los resultados con una fracción de los datos de entrada originales,
lo que reduce su tamaño y permite correcciones aproximadas en caso de fallo.
• La Redundancia Optimizada para Algoritmos Compuestos es también una aportación
original de esta tesis. Está indicada para algoritmos cuyo resultado final puede
expresarse como la composición de resultados intermedios calculados en etapas
anteriores. Las réplicas redundantes se forman como bloques que calculan resultados intermedios y el resultado de su composición se puede comparar con el resultado
original. Este método permite reducir recursos y proporciona resultados de corrección
exactos en la mayor parte de los casos, lo que supone una mejora importante con
respecto a las correcciones de los métodos anteriores.
La eficacia de las técnicas de endurecimiento desarrolladas se ha probado mediante
experimentos de inyección de fallos y mediante ensayos en instalaciones de aceleradores
de partículas preparadas para la irradiación de dispositivos electrónicos. En concreto, se
han realizado ensayos de radiación con protones en el Centro Nacional de Aceleradores
(CNA España), el Paul Scherrer Institut (PSI, Suiza) y ensayos de radiación con neutrones
en el laboratorio ISIS Neutron and Muon Source (ChipIR, Reino Unido).RESUMEN TÉCNICO.
Se llama radiación al proceso por el cual una partícula o una onda es capaz de
transmitir energía a través del espacio o un medio material. Si la energía transmitida
es suficientemente alta, la radiación puede provocar que algunos electrones se desplacen
de su posición, en un proceso llamado ionización.
La radiación ionizante puede provocar problemas a los seres vivos, pero también a
los diversos materiales que componen los sistemas eléctricos y electrónicos utilizados en
entornos sujetos a radiación. Existen en La Tierra varios procesos que emiten radiación
ionizante, como la obtención de energía en centrales nucleares o ciertos procedimientos
médicos. Sin embargo, las fuentes de radiación más importantes se sitúan más allá de
nuestra atmósfera y afectan fundamentalmente a sistemas aeroespaciales y vuelos de gran
altitud.
Debido a la radiación, los sistemas electrónicos que se exponen a cualquiera de estas
fuentes sufren degradación en sus propiedades a lo largo del tiempo y pueden sufrir fallos
catastróficos que acorten su vida útil. El envejecimiento de los componentes se produce
por acumulación de carga eléctrica en el material, lo que se conoce como Dosis Ionizante
Total (TID, Total Ionizing Dose), o por distorsiones acumuladas en la matriz cristalina del
silicio en el que se fabrican los circuitos, lo que se conoce como Daño por Desplazamiento
(DD, Displacement Damage). Una única partícula ionizante puede, sin embargo, provocar
también diversos tipos de fallos transitorios o permanentes en los componentes de un
circuito, generalmente por un cambio de estado en un elemento de memoria o la activación
de circuitos parasitarios en un transistor. Los diferentes tipos de fallos producidos en
circuitos por la acción de una única partícula ionizante se engloban en la categoría de
Efectos de Evento Único (SEE, Single Event Effects).
Para proteger los sistemas electrónicos frente a los efectos de la radiación se suele
recurrir a un conjunto de técnicas que llamamos endurecimiento frente a radiación.
Los procedimientos tradicionales de endurecimiento han consistido en la fabricación de
componentes electrónicos mediante procesos especiales que les confieran una resistencia
inherente frente a la TID, el DD y los SEE. A este conjunto de técnicas de endurecimiento
se lo conoce como Endurecimiento frente a la Radiación Por Proceso (RHBP, por sus
siglas en inglés). Estos procedimientos suelen aumentar el coste de los componentes y
empeorar su rendimiento con respecto a los componentes que usamos en nuestros sistemas
electrónicos cotidianos.
En oposición a las técnicas RHBP encontramos las técnicas de Endurecimiento
frente a la Radiación Por Diseño (RHBD, por sus siglas en inglés). Estas técnicas
permiten detectar y tratar de corregir fallos producidos por la radiación introduciendo
modificaciones en los circuitos. Estas modificaciones suelen aumentar la complejidad de
los circuitos que se quiere endurecer, haciendo que consuman más energía, ocupen más espacio o funcionen a menor frecuencia, pero estas desventajas se pueden compensar con
la disminución de los costes de fabricación y la mejora en las prestaciones que aportan
los sistemas modernos.
En un intento por reducir el coste de las misiones espaciales y mejorar sus
capacidades, en los últimos años se trata de introducir un mayor número de Componentes
Comerciales (COTS, por sus siglas en inglés), endurecidos mediante técnicas RHBD.
Las técnicas RHBD habituales se basan en la adición de elementos redundantes
idénticos al original, cuyos resultados se pueden comparar entre sí para obtener
información acerca de la existencia de un error (si sólo se usa un circuito redundante,
Duplicación Con Comparación [DWC, Duplication With Comparison]) o llegar incluso
a corregir un error detectado de manera automática, si se emplean dos o más réplicas
redundantes, siendo el caso más habitual la Redundancia Modular Triple (TMR, Triple
Modular Redundancy) en todas sus variantes.
El trabajo desarrollado en esta Tesis gira en torno a las técnicas de endurecimiento
RHBD de sistemas electrónicos comerciales. En concreto, se trata de proponer y
caracterizar nuevas técnicas de endurecimiento que permitan reducir el alto consumo de
recursos de las técnicas utilizadas habitualmente. Para ello, se han desarrollado técnicas
de endurecimiento que aprovechan cálculos aproximados para detectar y corregir fallos
en circuitos electrónicos digitales para procesamiento de señal implementados en FPGA
(Field Programmable Gate Array) comerciales.
Las FPGA son dispositivos que permiten implementar circuitos electrónicos digitales
diseñados a medida y reconfigurarlos tantas veces como se quiera. Su capacidad de
reconfiguración y sus altas prestaciones las convierten en dispositivos muy interesantes
para aplicaciones espaciales, donde realizar cambios en los diseños no suele ser posible
una vez comenzada la misión. La reconfigurabilidad de las FPGA permite corregir en
remoto posibles problemas en el diseño, pero también añadir o modificar funcionalidades
a los circuitos implementados en el sistema.
La eficacia de las técnicas de endurecimiento desarrolladas e implementadas en
FPGAs se ha probado mediante experimentos de inyección de fallos y mediante
ensayos en instalaciones de aceleradores de partículas preparadas para la irradiación de
dispositivos electrónicos.
Los ensayos de radiación son el estándar industrial para probar el comportamiento de
todos los sistemas electrónicos que se envían a una misión espacial. Con estos ensayos
se trata de emular de manera acelerada las condiciones de radiación a las que se verán
sometidos los sistemas una vez hayan sido lanzados y determinar su resistencia a TID, DD
y/o SEEs. Dependiendo del efecto que se quiera observar, las partículas elegidas para la
radiación varían, pudiendo elegirse entre electrones, neutrones, protones, iones pesados,
fotones... Particularmente, los ensayos de radiación realizados en este trabajo, tratándose
de un estudio de técnicas de endurecimiento para sistemas electrónicos digitales, están
destinados a establecer la sensibilidad de los circuitos estudiados frente a un tipo de SEE conocido como Single Event Upset (SEU), en el que la radiación modifica el valor lógico
de un elemento de memoria. Para ello, hemos recurrido a experimentos de radiación con
protones en el Centro Nacional de Aceleradores (CNA, España), el Paul Scherrer Institut
(PSI, Suiza) y experimentos de radiación con neutrones en el laboratorio ISIS Neutron
and Muon Source (ChipIR, Reino Unido).
La sensibilidad de un circuito suele medirse en términos de su sección eficaz (cross
section) con respecto a una partícula determinada, calculada como el cociente entre el
número de fallos encontrados y el número de partículas ionizantes por unidad de área
utilizadas en la campaña de radiación. Esta métrica sirve para estimar el número de
fallos que provocará la radiación a lo largo de la vida útil del sistema, pero también
para establecer comparaciones que permitan conocer la eficacia de los sistemas de
endurecimiento implementados y ayudar a mejorarlos.
El método de inyección de fallos utilizado en esta Tesis como complemento a la
radiación se basa en modificar el valor lógico de los datos almacenados en la memoria de
configuración de la FPGA. En esta memoria se guarda la descripción del funcionamiento
del circuito implementado en la FPGA, por lo que modificar sus valores equivale a
modificar el circuito. En FPGAs que utilizan la tecnología SRAM en sus memorias de
configuración, como las utilizadas en esta Tesis, este es el componente más sensible a la
radiación, por lo que es posible comparar los resultados de la inyección de fallos y de las
campañas de radiación. Análogamente a la sección eficaz, en experimentos de inyección
de fallos podemos hablar de la tasa de error, calculada como el cociente entre el número
de fallos encontrados y la cantidad de bits de memoria inyectados.
A lo largo de esta Tesis se han desarrollado diferentes circuitos endurecidos mediante
Redundancia Modular Triple y se ha comparado su rendimiento con los de otras
técnicas de Redundancia Aproximada, en concreto la Redundancia de Precisión Reducida
(RPR), la Redundancia de Resolución Reducida (RRR) y la Redundancia Optimizada
para Algoritmos Compuestos (ORCA). Estas dos últimas son contribuciones originales
presentadas en esta Tesis.
• La Redundancia de Precisión Reducida se basa en la utilización de dos réplicas
redundantes que calculan resultados con un menor número de bits que el circuito
original. Para cada dato de salida se comparan el resultado del circuito original y
los dos resultados de precisión reducida. Si los dos resultados de precisión reducida
son idénticos y su diferencia con el resultado de precisión completa es mayor que un
determinado valor umbral, se considera que existe un fallo en el circuito original y se
utiliza el resultado de precisión reducida para corregirlo. En cualquier otro caso, el
resultado original se considera correcto, aunque pueda contener errores tolerables por
debajo del umbral de comparación. En comparación con un circuito endurecido con
TMR, los diseños RPR utilizan menos recursos, debido a la reducción en la precisión
de los cálculos de los circuitos redundantes. No obstante, esto también afecta a la
calidad de los resultados obtenidos cuando se corrige un error. En este trabajo exploramos también la RPR Escalada como un método de obtener
un balance óptimo entre la precisión y el consumo de recursos. En esta variante de
la técnica RPR, los resultados de cada etapa de cálculo en los circuitos redundantes
tienen una precisión diferente, incrementándose hacia las últimas etapas, en las que el
resultado tiene la misma precisión que el circuito original. Con este método se logra
incrementar la calidad de los datos corregidos a la vez que se reducen los recursos
utilizados por el endurecimiento.
Los resultados de las campañas de radiación y de inyección de fallos realizadas sobre
los diseños endurecidos con RPR sugieren que la reducción de recursos no sólo es
beneficiosa por sí misma en términos de recursos y energía utilizados por el sistema,
sino que también conlleva una reducción de la sensibilidad de los circuitos, medida
tanto en cross section como en tasa de error.
• La Redundancia de Resolución Reducida es una técnica propuesta originalmente en
esta tesis. Está indicada para algoritmos que trabajan con información en forma de
paquetes cuyos datos individuales guardan alguna relación entre sí, como puede ser un
algoritmo de procesamiento de imágenes. En la técnica RRR, se añaden dos circuitos
redundantes que calculan los resultados con una fracción de los datos de entrada
originales. Tras el cálculo, los resultados diezmados pueden interpolarse para obtener
un resultado aproximado del mismo tamaño que el resultado del circuito original.
Una vez interpolados, los resultados de los tres circuitos pueden ser comparados para
detectar y corregir fallos de una manera similar a la que se utiliza en la técnica RPR.
Aprovechando las características del diseño hardware, la disminución de la cantidad
de datos que procesan los circuitos de Resolución Reducida puede traducirse en una
disminución de recursos, en lugar de una disminución de tiempo de cálculo. De esta
manera, la técnica RRR es capaz de reducir el consumo de recursos en comparación a
los que se necesitarían si se utilizase un endurecimiento TMR.
Los resultados de los experimentos realizados en diseños endurecidos mediante
Redundancia de Resolución Reducida sugieren que la técnica es eficaz en reducir los
recursos utilizados y, al igual que pasaba en el caso de la Redundancia de Precisión
Reducida, también su sensibilidad se ve reducida, comparada con la sensibilidad del
mismo circuito endurecido con Redundancia Modular Triple. Además, se observa una
reducción notable de la sensibilidad de los circuitos frente a errores no corregibles,
comparado con el mismo resultado en TMR y RPR. Este tipo de error engloba aquellos
producidos por fallos en la lógica de comparación y votación o aquellos en los que un
único SEU produce fallos en los resultados de dos o más de los circuitos redundantes
al mismo tiempo, lo que se conoce como Fallo en Modo Común (CMF). No obstante,
también se observa que la calidad de las correcciones realizadas utilizando este método
empeora ligeramente.
• La Redundancia Optimizada para Algoritmos Compuestos es también una aportación
original de esta tesis. Está indicada para algoritmos cuyo resultado final puede expresarse como la composición de resultados intermedios calculados en etapas
anteriores. Para endurecer un circuito usando esta técnica, se añaden dos circuitos
redundantes diferentes entre sí y que procesan cada uno una parte diferente del conjunto
de datos de entrada. Cada uno de estos circuitos aproximados calcula un resultado
intermedio. La composición de los dos resultados intermedios da un resultado idéntico
al del circuito original en ausencia de fallos.
La detección de fallos se realiza comparando el resultado del circuito original con el
de la composición de los circuitos aproximados. En caso de ser diferentes, se puede
determinar el origen del fallo comparando los resultados aproximados intermedios
frente a un umbral. Si la diferencia entre los resultados intermedios supera el umbral,
significa que el fallo se ha producido en uno de los circuitos aproximados y que el
resultado de la composición no debe ser utilizado en la salida. Al igual que ocurre
en la Redundancia de Precisión Reducida y la Redundancia de Resolución Reducida,
utilizar un umbral de comparación implica la existencia de errores tolerables. No
obstante, esta técnica de endurecimiento permite realizar correcciones exactas, en
lugar de aproximadas, en la mayor parte de los casos, lo que mejora la calidad de
los resultados con respecto a otras técnicas de endurecimiento aproximadas, al tiempo
que reduce los recursos utilizados por el sistema endurecido en comparación con las
técnicas tradicionales.
Los resultados de los experimentos realizados con diseños endurecidos mediante
Redundancia Optimizada para Algoritmos Compuestos confirman que esta técnica de
endurecimiento es capaz de producir correcciones exactas en un alto porcentaje de los
eventos. Su sensibilidad frente a todo tipo de errores y frente a errores no corregibles
también se ve disminuida, comparada con la obtenida con Redundancia Modular Triple.
Los resultados presentados en esta Tesis respaldan la idea de que las técnicas de
Redundancia Aproximada son alternativas viables a las técnicas de endurecimiento frente
a la radiación habituales, siempre que
New reconstruction strategies for polyenergetic X-ray computer tomography
Mención Internacional en el título de doctorX-ray computed tomography (CT) provides a 3D representation of the attenuation coefficients
of patient tissues, which are roughly decreasing functions of energy in the usual
range of energies used in clinical and preclinical scenarios (from 30 KeV to 150 KeV).
Commercial scanners use polychromatic sources, producing a beam having a range of
photon energies, because no X-ray lasers exist as a usable alternative. Due to the energy
dependence of the attenuation coefficients, low-energy photons are preferably absorbed,
causing a shift of the mean energy of the X-ray beam to higher values; this effect is known
as beam hardening. Classical reconstruction methods assume a monochromatic source
and do not take into account the polychromatic nature of the spectrum, producing two
artifacts in the reconstructed image: 1) cupping in large homogeneous areas and 2) dark
bands between dense objects such as bone. These artifacts hinder a correct visualization
of the image and the recovery of the true attenuation coefficient values.
A fast correction of the beam-hardening artifacts can be performed with the so-called
post-processing methods, which use the information of a segmentation obtained in a preliminary
reconstruction. Nevertheless, this segmentation may fail in low-dose scenarios,
leading to an increase of the artifacts. An alternative for these scenarios is the use of
iterative methods that incorporate a beam-hardening model, at a cost of higher of computational
time compared to post-processing methods. All previously proposed methods
require either knowledge of the X-ray spectrum, which is not always available, or the
heuristic selection of some parameters, which have been shown not to be optimal for the
correction of different slices in heterogeneous studies.
This thesis is framed in a research line focused on improving radiology systems of
the Biomedical Imaging and Instrumentation Group (BiiG) from the Bioengineering and
Aerospace Department of Universidad Carlos III de Madrid. This research line is carried
out in collaboration with the Unidad de Medicina y Cirugía experimental of Hospital
Gregorio Marañón through Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón, the
Electrical Engineering and Computer Science (EECS) department of the University of
Michigan and SEDECAL, a Spanish company among the ten best world companies in
medical imaging that exports medical devices to 130 countries. As part of this research
line, a high-resolution micro-CT was developed for small-animal samples, which operates at low voltages, leading to strong beam-hardening artifacts. This scanner allows preclinical
studies to be carried out, which can be divided into cross-sectional and longitudinal
studies. Since cross-sectional studies consist of one acquisition at a specific point in time,
radiation dose is not an issue, allowing for the use of standard-dose protocols with good
image quality. In contrast, longitudinal studies consist of several acquisitions over time,
so it is advisable to use low-dose protocols, despite the reduction of signal to noise ratio
and the risk of artifacts in the image. This thesis presents a bundle of reconstruction
strategies to cope with the beam-hardening effect in different dose scenarios, overcoming
the problems of methods previously proposed in the literature.
Since image quality is not an issue in the standard-dose scenarios, the speed of the
strategies becomes a priority, advising for post-processing strategies. The main advantage
of the proposed post-processing strategy is the inclusion of empirical models of the
beam-hardening effect, either through a simple calibration phantom or through the information
provided by the sample, which eliminates the need of the knowledge of the
spectrum or tunning parameters. The evaluation against previously proposed correction
methods with real and simulated data showed a good artifact compensation for a standarddose
scenario (cross-sectional studies), while not optimum in a low-dose scenario, as expected.
For longitudinal studies, where the reduction of dose delivered to the sample is
advisable, this thesis presents an iterative method that incorporates the mentioned experimental
beam-hardening models. The evaluation with real and simulated data and different
dose scenarios showed excellent results but with the known drawback of high computational
time. Finally, a deep-learning approach was explored with the idea of looking for a
joint solution that would require low-computational time and, at the same time, compensate
the beam-hardening artifacts regardless the dose scenario. The chosen architecture is
U-net++, based on an encoder-decoder, with the mean-squared error as the cost function.
Results in real data showed a good compensation of the beam-hardening and low-dose
artifacts with a considerable reduction of time, rising the interest of further exploring this
path in the future.
The incorporation of these reconstruction strategies in real scanners is straightforward,
only requiring a small modification of the calibration step already implemented in commercial
scanners. The methods are being transferred to the company SEDECAL for their
implementation in the new generation of micro-CT scanners for preclinical research and
a multipurpose C-arm for veterinary applications.Programa de Doctorado en Multimedia y Comunicaciones por la Universidad Carlos III de Madrid y la Universidad Rey Juan CarlosPresidente: Jorge Ripoll Lorenzo.- Secretario: José Vicente Manjón Herrera.- Vocal: Adam M. Alessi
ICLabel: An automated electroencephalographic independent component classifier, dataset, and website
The electroencephalogram (EEG) provides a non-invasive, minimally
restrictive, and relatively low cost measure of mesoscale brain dynamics with
high temporal resolution. Although signals recorded in parallel by multiple,
near-adjacent EEG scalp electrode channels are highly-correlated and combine
signals from many different sources, biological and non-biological, independent
component analysis (ICA) has been shown to isolate the various source generator
processes underlying those recordings. Independent components (IC) found by ICA
decomposition can be manually inspected, selected, and interpreted, but doing
so requires both time and practice as ICs have no particular order or intrinsic
interpretations and therefore require further study of their properties.
Alternatively, sufficiently-accurate automated IC classifiers can be used to
classify ICs into broad source categories, speeding the analysis of EEG studies
with many subjects and enabling the use of ICA decomposition in near-real-time
applications. While many such classifiers have been proposed recently, this
work presents the ICLabel project comprised of (1) an IC dataset containing
spatiotemporal measures for over 200,000 ICs from more than 6,000 EEG
recordings, (2) a website for collecting crowdsourced IC labels and educating
EEG researchers and practitioners about IC interpretation, and (3) the
automated ICLabel classifier. The classifier improves upon existing methods in
two ways: by improving the accuracy of the computed label estimates and by
enhancing its computational efficiency. The ICLabel classifier outperforms or
performs comparably to the previous best publicly available method for all
measured IC categories while computing those labels ten times faster than that
classifier as shown in a rigorous comparison against all other publicly
available EEG IC classifiers.Comment: Intended for NeuroImage. Updated from version one with minor
editorial and figure change
- …