Um ambiente para a integração de dados de prescrição eletrónica

Mestrado em Engenharia Electrónica e TelecomunicaçõesHoje em dia não é possível, no sistema de saúde português, ter uma visão integrada da prescrição de medicamentos de um utente. O histórico da medicação, por si só, pode dar a um profissional clínico as pistas suficientes para aferir o contexto clínico de um utente que observa pela primeira vez ou num contacto de emergência, por exemplo. Este tipo de informação é frequentemente incluído em iniciativas de redes de partilha de sumários clínicos, como é o caso do projeto epSOS, visando a transmissão transfronteiriça de informação clínica essencial dos utentes, atendidos num país diferente daquele em que recebem cuidados habitualmente. A Rede Telemática da Saúde (RTS) é uma plataforma eletrónica que permite a agregação de informação clínica dos utentes, de forma controlada. É possível, nesta plataforma, obter uma lista de episódios de tratamento para um utente e, a partir de cada um, procurar informação de prescrição de medicamentos. Paralelamente, no contexto da iniciativa nacional para prescrição eletrónica, existe já um repositório de prescrições (mais especificamente, receitas aviadas) de âmbito nacional. Este repositório não inclui, contudo, algumas prescrições resultantes de episódios de tratamento de agudos. No âmbito deste trabalho, propomos uma extensão à RTS, proporcionando uma vista orientada às prescrições. O profissional clínico tem, nesta vista, uma agregação das prescrições encontradas em várias instituições (que participam na RTS) e no repositório nacional (cuja integração foi simulada). Adicionalmente, implementamos os métodos necessários para exportar a vista agregada de prescrições no formato esperado na rede de interoperabilidade do epSOS, segundo as especificações públicas disponíveis.Nowadays, in the Portuguese health care system, it is not possible to have an integrated view of drugs prescribed to a patient. The history of the medication, by itself, can provide to a health care professional enough clues to evaluate the clinical context of a patient who is observed in a first emergency contact, for example. This type of information is often included in networking initiatives for clinical summary sharing, as in the epSOS project, aiming at crossborder transmission of patient’s essential clinical information, receiving care in a country other than the one where he/she usually receives care. The Health Telematic Network RTS is an electronic platform that allows the aggregation of patient clinical information in a controlled manner. It is possible, in this platform, to obtain a list of episodes of treatment to a patient and, from each episode search prescribed medication. Meanwhile, in the context of the portuguese national initiative for electronic prescribing, there is already a repository of prescriptions (more specifically, prescriptions dispensed) nationwide. This repository does not include, however, some prescriptions resulting from treatment of acute episodes. In this work, we propose an extension to the RTS, providing a view oriented to the medication. The medical professional has, in this view, an aggregation of the prescriptions found in several institutions (involved in RTS) and the national repository (which integration was simulated). Additionally, we have implemented the necessary methods to export the aggregated view of prescriptions in the expected format of the epSOS interoperability network, according to public available specifications

Análise qualitativa de entrevistas estruturadas

Monografia realizada no âmbito da unidade de Estágio Curricular do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas, apresentada à Faculdade de Farmácia da Universidade de CoimbraO uso de entrevistas em avaliações qualitativas é um tema recorrente e ainda polémico nas discussões académicas, uma vez que se trata de um procedimento de recolha de informações que muitas vezes é utilizado de forma menos rigorosa do que seria desejável. Cabe aos investigadores que fazem uso de entrevistas explicitar as regras e pressupostos teórico/metodológicos que norteiam o seu trabalho, de modo a ampliar o debate acerca da necessária definição de critérios para avaliação de confiabilidade de pesquisas científicas que lançam mão desse recurso. Algumas características básicas identificam os estudos denominados “qualitativos". Segundo esta perspetiva, um fenómeno pode ser melhor compreendido no contexto em que ocorre e do qual é parte, devendo ser analisado numa perspetiva integrada. Para tal, o investigador identifica o fenómeno em estudo e a partir da perspetiva das pessoas nele envolvidas considera todos os pontos de vista relevantes. Vários tipos de dados são recolhidos, analisados e codificados para que se entenda a dinâmica do fenómeno. Partindo de questões amplas que se vão esclarecendo no decorrer da investigação, o estudo qualitativo pode, no entanto, ser conduzido através de diferentes caminhos. A última década assistiu a um interesse considerável no desenvolvimento e avaliação de complexas intervenções para melhorar a saúde. Essas intervenções só têm impacto significativo na saúde e cuidados de saúde se forem eficazes e capazes de ser largamente implementadas e normalizadas na rotina. No contexto do projeto “SIMPATHY” utilizou-se este tipo de estudo qualitativo, de forma a “estimular, promover e apoiar a inovação em toda a UE na gestão da polimedicação e a adesão adequada em idosos.” Com esta avaliação espera-se contribuir para um sistema de saúde mais eficiente e sustentável e melhorar os resultados do impacto na saúde e qualidade de vida de doentes com multimorbilidade. Após a codificação de várias fontes de informação (entrevistas a intervenientes) realizada no âmbito do projeto SIMPATHY chegou-se à conclusão que Portugal carece de qualquer programa de gestão da polimedicação e não tem perspetivas de existência de qualquer programa num futuro próximo.The use of interviews in qualitative assessments is a recurring theme, and still controversial in academic discussions, once is a procedure of gathering information that is often used less strictly than would be desirable. It is up to researchers who make use of interviews, explaining the rules and theoretical / methodological assumptions that guide their work in order to extend the debate about the necessary definition of criteria for evaluating reliability of scientific research who use this feature. Some basic characteristics identify studies known as "qualitative". According to this perspective, a phenomenon can be better understood in the context which it occurs and of which it is part and should be analyzed in a integrated perspective. To this end, the investigator identifies the phenomenon under study and from the perspective of the people involved, considers all relevant points of view. Various types of data are collected, analyzed and coded in order to understand the dynamics of the phenomenon. Starting from broad questions that will clarify the course of the investigation, qualitative study may, however, be conducted through different paths. The last decade has seen considerable interest in the development and evaluation of complex interventions to improve health. These interventions only have significant impact on health and health care if they are effective and able to be widely implemented and standardized in routine. In the context of the project "SIMPATHY", we used this type of qualitative study, in order to "encourage, promote and support innovation across the EU in the management of polypharmacy and appropriate adherence in the elderly." This evaluation is expected to contribute to a health care system more efficient and sustainable and improve the impact of the results on the health and quality of life in patients with multimorbidity. After encoding several sources of information (interviews with stakeholders) carried out under the project SIMPATHY we came to the conclusion that Portugal lacks any polypharmacy management program and has no existence prospects of any program in the near future

Vocabulary services for eHealth applications in Portugal

Mestrado em Engenharia Electrónica e TelecomunicaçõesO uso seguro de eSa ude requer que as ferramentas de informa c~ao partilhem a mesma interpreta c~ao de dados mas, no actual estado das implanta c~oes, os sistemas s~ao normalmente heterog eneos e adoptam modelos de informa c~ao locais. A falta de solu c~oes para a comunica c~ao entre diferentes sistemas a n vel t ecnico e especialmente a n vel sem^antico di culta a capacidade de usar a informa c~ao relativa ao mesmo utente de forma continuada entre m ultiplos sistemas. Uma contribui c~ao parcial para facilitar a integra c~ao de fontes de informa c~ao diferentes e o uso de terminologias m edicas, que clari cam o uso pretendido de certos campos da informa c~ao e os respectivos valores. Neste trabalho e proposto o uso de um servidor de vocabul ario como um componente central do sistema com o objectivo de satisfazer dois casos de uso mais pertinentes: (1) criar um servi co de refer^encia para a realidade portuguesa e (2) permitir a transforma c~ao de estruturas de informa c~ao para outros modelos cl nicos (para cen arios de interoperabilidade). A ferramenta proposta, al em de funcionar como um servidor de terminologias relevantes para o sistema de sa ude portugu^es, e tamb em capaz de modelar associa c~oes sem^anticas entre terminologias diferentes, permitindo assim a tradu c~ao e transcodi ca c~ao de conceitos. As especi cidades da rede de interoperabilidade do epSOS foram tomadas em considera c~ao para o desenvolvimento das especi ca c~oes. O sistema possui a capacidade de mapear terminologias carregadas, oferece uma representa c~ao dessa informa c~ao (e.g. vista de um grafo de conceitos relacionada com uma doen ca espec ca) e permite importar essa mesma informa c~ao nos formatos RDF e JSON. Uma interface de programa c~ao de aplica c~oes (API) foi desenvolvida para permitir a um utilizador fazer interroga c~oes sem^anticas de alto n vel, como por exemplo, o mapeamento entre terminologias usadas no sistema de sa ude portugu^es. Os resultados deste trabalho podem facilitar o desenvolvimento de solu c~oes em eSa ude atrav es da disponibiliza c~ao de servi cos b asicos relacionados com terminologias, melhorando assim a interoperabilidade das aplica c~oes.The safe use of eHealth requires that information tools share the same interpretation of the data but, in the current state of the implementations, systems are often heterogeneous and adopt local information models. The lack of interfacing solutions between di erent systems at the technical and, specially, semantic level, hinders the ability to use seamlessly information for the same patient, available at multiple sources. A partial contribution to facilitate the integration of di erent information sources is the use of medical terminologies, which clarify the intended use of certain data elds and the possible value sets. In this work, we propose the use of a vocabulary server as a central component to enable two motivating use cases: (1) enable a reference semantic service for the Portuguese reality and (2) enable the transformation of clinical data structures into other clinical models (for interoperability scenarios). The proposed tool, besides serving terminologies relevant to the Portuguese health system, is also capable of modelling semantic associations between di erent terminology systems to enable translation and transcoding. The speci c requirements of the epSOS interoperability network were used to drive the speci cation. The system is able to link terminologies, o er a visual representation of that information (e.g. the viewing of a graph of concepts related to a speci c disease) and allows that information extraction in RDF and JSON formats. An application programming interface was developed to enable developer to issue high-level semantic interrogations like, for example, mapping between terminology systems used in the Portuguese health system. The results of this work can facilitate eHealth solutions developers on getting basic terminology services to extend their applications towards enhanced interoperability

Serviços para integração regional de dados clínicos

Mestrado em Engenharia de Computadores e TelemáticaOs sistemas de informação clínica têm sido reconhecidos como uma tecnologia chave no suporte à prestação de cuidados de saúde. Dada a complexidade do domínio clínico e o largo espectro de requisitos, vários sistemas heterogêneos têm sido introduzidos, criando aquilo a que se chama "silos de informação". A plataforma Rede Telemática da Saúde (RTS) tem vindo a ser desenvolvida por forma a providenciar uma rede regional de informação clínica eletrónica na região de Aveiro, permitindo que instituições parceiras troquem dados clínicos. Ao contrário de protocolos ponto-a-ponto que assentam na troca de mensagens ou documentos, a RTS está desenvolvida numa abordagem arquitetural, disponibilizando um modelo da informação partilhado e coerente, acessível através de um portal web. No presente trabalho, abordamos as necessidades b asicas na expansão da RTS para a colaboração com sistemas externos. Consideram-se para tal dois grandes requisitos: a expansão das ferramentas semânticas aplicadas as correspondências entre conceitos e uma interface estável para a invocação por serviços. O modelo de dados de referencia da RTS assenta num modelo de objetos partilhado. Um novo componente foi introduzido na aplicação empresarial já existente com o intuito de expor este modelo através de serviços SOAP, que implementam a especificação WS-Security. As transformações semânticas na RTS são suportadas na sua maioria por módulos de transformação, conhecidos como "Wrappers". Propusemos e implementamos um componente de semântica capaz de aplicar transformações ao nível dos serviços, tirando partido de uma ferramenta do tipo servidor de vocabulário - LexEVS - essencialmente para mapear correspondências entre diferentes sistemas de classificação de informação clínica. O cenário para a aplicação dos mapeamentos foi escolhido indo ao encontro das necessidades do projeto internacional Smart Open Services for European Patients (epSOS), tendo sido criado para tal um serviço que disponibiliza informação com dados codificados com terminologias usadas no epSOS. As extensões a RTS aqui propostas, nomeadamente a camada de serviços de invocação segura e a adoção de ferramentas para o mapeamento interno de conceitos, foram desenvolvidas com sucesso e integradas na plataforma. Cen arios de teste foram realizados com a ajuda de grupos de alunos. Como prova de conceito (proof of concept), os servi cos foram testados por duas aplicaçõs externas, desenvolvidas em ambiente acad emico. Conseguimos com sucesso implementar um conjunto de serviços, configurados para serem acedidos de forma segurança, e um servidor de vocabulàrio para a interoperabilidade semântica. O que possibilita que no futuro sistemas externos possam consultar dados na RTS.Health information systems have been acknowledged as a key technology to support care work ows. Given the complexity of the health domain and the large spectrum of requirements, many heterogeneous systems have been introduced, originating the so called \information silos". The Rede Telem atica da Sa ude (RTS) platform has been developed to o er a regional electronic health information network in the region of Aveiro, allowing the partner institutions to exchange clinical data. Unlike point-to-point message or documents exchanging protocols, RTS builds on an architectural approach, exposing a coherent shared information model accessible through a Portal system. In this work, we address the needs rooted to extending RTS to collaborate with external systems. Two major capabilities are deemed required: extending semantic tools for concept matching and a stable services invocation interface. RTS reference information model builds on a shared object model. A new component was introduced on the existing enterprise application to expose the existing model though stable SOAP services, implementing the WSSecurity speci cation. The semantic transformations in RTS are mainly supported by the work of adapter modules, called Wrappers. We have proposed and implemented semantic transformation capability on services layer, taking advantage of a vocabulary server tool LexEVS, especially to map di erent medical classi cation systems. The mapping scenarios were demonstrated taking as an example the needs of the Smart Open Services for European Patients (epSOS) international speci cations, by creating a service exposing information with data encoded with epSOS terminologies. The proposed extensions to RTS, namely the secure services invocation layer and the adoption of semantic tools for internal concept mapping, were successfully developed and integrated in the platform. Validation test cases were run with the assistance of student teams. As a proof of concept, the services have been tested by two external applications developed in the academic environment. We successfully implemented a set of services con gured to only be accessed in a safe way, and a vocabulary server to the semantic interoperability. This provide the means for in the future external systems can consult the RTS data

Hope Wounds: system to support clinical practice in Diabetes Mellitus

Mestrado em Engenharia Electrónica e TelecomunicaçõesRecentemente assiste-se a um crescimento da utilização das tecnologias de informação em diversas áreas, em particular dos dispositivos móveis. Na área da saúde é possível encontrar soluções inovadoras para apoio ao diagnóstico e tratamento de patologias que afectam milhares de pessoas em todo o mundo, como é o caso do risco de amputação em pacientes diabéticos. Aproveitando a existência de um ambiente de interligação telemática entre instituições de saúde Região do Baixo Vouga, o presente trabalho visa implementar o sistema HOPE Wounds na rotina diária de trabalho de profissionais de saúde, em especial médicos e enfermeiros, na prática da prestação de cuidados a pacientes diabéticos, com complicações de pé diabético. A interacção do dispositivo móvel e o ambiente web faz com que este sistema possibilite aceder e gravar diversa informação clínica, como por exemplo o registo fotográfico de feridas em escala temporal. O sistema HOPE Wounds integrado na Rede Telemática da Saúde permite ainda estabelecer a ponte entre profissionais do Centro de Saúde, da Consulta de Especialidade e do Internamento Hospitalar. A receptividade dos profissionais de saúde deixa antever a possibilidade de extensão a outras áreas médicas.Recently we are seeing an increasing use of information technologies in various areas, particularly mobile devices. In the health sector can find innovative solutions to support the diagnosis and treatment of diseases affecting millions of people around the world, such as the risk of amputations in diabetic patients. Taking advantage of the existence of a telematics environment interconnection between health institutions of the Baixo Vouga region, this paper aims to implement the system HOPE Wounds in daily routine work of health professionals, especially physicians and nurses in the practice of caring for diabetic foot complications. The interaction of the mobile device and web environment makes this system enables different access and record clinical information, such as the photographic record of wounds in time scale. The HOPE system Wounds integrated Health Telematics Network also allows professionals bridges the gap between the Health Center, Consultation in the specialty and Hospitalization. The responsiveness of health professionals leaves foresee the possibility of extension to other medical fields

Melhoria das práticas de construção de software: um caso de estudo

Mestrado em Engenharia de Computadores e TelemáticaEm muitos projetos de desenvolvimento de software não são utilizados processos e práticas explícitos com o intuito de garantir a qualidade do produto final. Nesses casos, a organização do ambiente de construção nasce das acções imediatas do dia-a-dia da equipa de desenvolvimento de forma não estruturada e não escalável. No contexto dos projetos de investigação com desenvolvimento de software, em que as equipas são marcadamente mutáveis, a definição de estratégias para o processo de construção de software é essencial para agilizar o desenvolvimento, aumentar a produtividade e controlar a evolução do produto. Este trabalho visa a análise e definição de estratégias para a construção de software usando como caso de estudo o projeto Rede Telemática Saúde (RTS) do Instituto de Engenharia Eletrónica e Telemática de Aveiro, e a sua implementação, através da introdução de boas práticas e ferramentas que permitem melhorar a evolução do sistema. A implementação dessas estratégias inclui disciplinas de gestão de configurações, que asseguram a consistência das versões do projeto e respetivas dependências, e um ambiente de integração contínua que controla todo o código-fonte produzido pela equipa de programadores usando testes automatizados. Cada versão é composta por um conjunto de tarefas ou tópicos atribuídos a cada colaborador que são geridos por critérios de prioridade, alavancando a agilidade do processo de desenvolvimento. Todo o ciclo é representável numa plataforma de gestão dessas tarefas, essencial à gestão de alto nível. Complementarmente, realizou-se um estudo para caracterizar as práticas correntes no processo de construção de software, através de um inquérito à indústria de software portuguesa. As estratégias propostas e implementadas permitiram redefinir o processo de construção no projeto RTS, introduzindo um maior controlo sobre a linha de produção, especialmente na identificação antecipada de defeitos e controlo de versões. Estes resultados estão alinhados com as necessidades prioritárias identificadas no inquérito à indústria.Software projects often neglect the use explicit processes and practices to ensure final product quality are. On those cases, the arrangement of the construction environment arises from pressing needs of the development team daily routine in a non-structured and non-scalable way. In the context of research projects that need software development, in which teams are strongly mutable, the definition of strategies for software construction practices is essential to streamline development, increase productivity and to control the product evolution. This study aims at analyzing and define software construction strategies using as a case study the Rede Telemática Saúde project (RTS) of the Institute of Electronics and Telematics Engineering of Aveiro (IEETA), and their implementation, by introducing best practices and tools that help improving the system evolution. Such strategies include particular topics of configuration management, which ensure consistency of versions and their dependencies, and a continuous integration environment by validating the source-code produced by developers using automated testing. Every version is composed of a set of tasks or topics particularly assigned to each team member and managed by priority criteria to leverage the agility of the development process. Such tasks and the whole development cycle are mapped on a management platform, which is essential to high-level management. Additionally, an industry study was carried out to characterize current practices on software construction process, through a survey to the Portuguese software industry. The proposed and implemented strategies allowed redefining the construction process on the RTS project, introducing more control over the production line, especially on version control and early identification of defects. Those results are aligned with identified priority needs in the industry survey

Uma rede telemática para a prestação regional de cuidados de saúde

Doutoramento em Engenharia InformáticaAs tecnologias de informação e comunicação na área da saúde não são só um instrumento para a boa gestão de informação, mas antes um fator estratégico para uma prestação de cuidados mais eficiente e segura. As tecnologias de informação são um pilar para que os sistemas de saúde evoluam em direção a um modelo centrado no cidadão, no qual um conjunto abrangente de informação do doente deve estar automaticamente disponível para as equipas que lhe prestam cuidados, independentemente de onde foi gerada (local geográfico ou sistema). Este tipo de utilização segura e agregada da informação clínica é posta em causa pela fragmentação generalizada das implementações de sistemas de informação em saúde. Várias aproximações têm sido propostas para colmatar as limitações decorrentes das chamadas “ilhas de informação” na saúde, desde a centralização total (um sistema único), à utilização de redes descentralizadas de troca de mensagens clínicas. Neste trabalho, propomos a utilização de uma camada de unificação baseada em serviços, através da federação de fontes de informação heterogéneas. Este agregador de informação clínica fornece a base necessária para desenvolver aplicações com uma lógica regional, que demostrámos com a implementação de um sistema de registo de saúde eletrónico virtual. Ao contrário dos métodos baseados em mensagens clínicas ponto-a-ponto, populares na integração de sistemas em saúde, desenvolvemos um middleware segundo os padrões de arquitetura J2EE, no qual a informação federada é expressa como um modelo de objetos, acessível através de interfaces de programação. A arquitetura proposta foi instanciada na Rede Telemática de Saúde, uma plataforma instalada na região de Aveiro que liga oito instituições parceiras (dois hospitais e seis centros de saúde), cobrindo ~350.000 cidadãos, utilizada por ~350 profissionais registados e que permite acesso a mais de 19.000.000 de episódios. Para além da plataforma colaborativa regional para a saúde (RTSys), introduzimos uma segunda linha de investigação, procurando fazer a ponte entre as redes para a prestação de cuidados e as redes para a computação científica. Neste segundo cenário, propomos a utilização dos modelos de computação Grid para viabilizar a utilização e integração massiva de informação biomédica. A arquitetura proposta (não implementada) permite o acesso a infraestruturas de e-Ciência existentes para criar repositórios de informação clínica para aplicações em saúde.Modern health information technology is not just a supporting instrument to good information management but a strategic requirement to provide more efficient and safer health care. Health information technology is a cornerstone to build the future patient-centric health care systems in which a comprehensive set of patient data will be available to the relevant care teams, in spite of where (system or service point) it was generated. Such secure and efficient use of clinical data is challenged by the existing fragmentation of health information systems implementation. Several approaches have been proposed to address the limitations of the so called “information silos” in healthcare, ranging from full centralization (a single system) to full-decentralized clinical message exchange networks. In this work we advocate the use of a service-based unification layer, by federating distributed heterogeneous information sources. This clinical information hub provides the basis to build regional-level applications, which we have demonstrated by implementing a virtual Electronic Health Record system. Unlike the message-driven, point-to-point approaches popular in health care systems integration, we developed a middleware layer, using J2EE architectural patterns, in which the common information is represented as an object model, accessible through programming interfaces. The proposed architecture was instantiated in the Rede Telemática da Saúde network, a platform deployed in the region of Aveiro connecting eight partner institutions (two hospitals and six primary care units), covering ~ 350,000 citizens, indexing information on more than 19,000,000 episodes of care and used by ~350 registered professionals. In addition to the regional health information collaborative platform (RTSys), we introduce a second line of research towards bridging the care networks and the science networks. In the later scenario, we propose the use of Grid computing to enable the massive use and integration of biomedical information. The proposed architecture (not implemented) enables to access existing e-Science infrastructures to create clinical information repositories for health applications