Ceviz meyvesinde demir ve mangan konsantrasyonunu belirleyen genlerin GWAS metodu ile belirlenmesi

Abstract

Ceviz, düşük glisemik indeksi ile insan sağlığına fayda sağlayan önemli bitkisel protein kaynaklarından biridir. Demir (Fe) ve Manganez (Mn), cevizin önemli besin bileşenlerinden ikisidir. Bu çalışmada ceviz meyvesindeki Mn ve Fe konsantrasyonlarıyla ilişkili SNP (Tek nükleotid polimorfizmleri) markörlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. 154 ceviz genotipinden oluşturulan populasyon iki farklı yıl boyunca değerlendirilmiş ve 16.473 SNP markörü ile genotipleme yapılmıştır. Toplam 154 genotip için GWAS (genom çapında ilişkilendirme çalışmaları) yapılmış ve sırasıyla beş ve 15 SNP'nin, ceviz genotiplerinde Fe ve Mn elementlerinin birikimini kontrol eden genlerle ilişkili olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma, ceviz meyvelerindeki mikro besin elementlerinin besin değeri konsantrasyonlarındaki farklılığın genetik temeline ışık tutmaktadır. Biyofortifikasyon stratejilerinde cevizin besin değeri bileşenlerini arttırmak için belirlenen markörler, markör destekli seçim (MAS) yapmak için kullanılabilir