Genetic diversity of the California sea lion assessed by pedigree analysis

Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaThe genetic diversity and population structure of the California sea lion (Zalophus californianus) were assessed based on the pedigree information registered in the European studbook, currently under the management of the Lisbon Zoo, as an EEP programme. Records collected from 1930 until 2020 were used for this analysis, including a total of 1998 individuals, 477 of which represent the current living population. To our knowledge, this is the most comprehensive and up-to-date analysis for this species, assessing the evolution of genetic diversity, inbreeding and relationships, and the genetic contribution of founders, using conventional pedigree analysis procedures and additional software tools commonly used in domestic species, such as ENDOG. The average equivalent complete generations were 1.54 (±1.20) per animal for the overall population. However, there has been an increase in pedigree depth throughout the years, with the reference population reaching 3.37 (±0.76) complete generations, where all animals had maternal grandparents known and nearly 85% to 90% had paternal grandparents known. The whole population had a generation interval of 11.52 (±4.70) years, however the mean ages at which individuals had their progeny has been increasing, particularly in the last decade. Regarding the number of offspring for each parent, dams had an average of 4.05 (±3.16) pups and sires 7.97 (±8.57) pups. The overall mean inbreeding was 2.03% (±5.92), though throughout the years, this has been increasing, with the reference population reaching 3.34% (±6.08). The rate of increase in inbreeding was around 1.6% per generation. The number of inbred animals has also been growing, representing 16.87% and 52.94% of the total and reference populations, respectively. However, the average inbreeding coefficient, of the inbred individuals has shown a significant decrease, with the value for the reference population being nearly half that of the overall population. The mean coancestry among individuals from the same institution of birth, was 0.10, and from different institutions was 0.01, providing the opportunity to maintain inbreeding under control by planned exchange of breeders between institutions. The number of founders contributing to 50% of the gene pool was 36 and 12, for the total and reference populations, respectively, with an effective number of founders of 96 and 34 in the two populations. The effective population size, for the whole population was 36. It is important to maintain a sound program aimed at the genetic management of the population, including management of selection and mating decisions, to avoid further losses of genetic diversity.RESUMO - Diversidade genética do Leão-marinho Californiano avaliada através da análise do pedigree - A diversidade genética e a estrutura da população de leões-marinhos Californianos (Zalophus californianus) foi avaliada com base nos registos de pedigree do studbook Europeu, sob a gestão do Jardim Zoológico de Lisboa, como um programa EEP. Os registos, recolhidos desde 1930 até 2020, que foram utilizados para esta análise, incluem um total de 1998 indivíduos, 477 dos quais representam a população viva atual. Para nosso conhecimento, esta é a análise mais compreensiva e atualizada desta espécie, que avalia a evolução da diversidade genética, consanguinidade, parentescos, e contribuição genética de fundadores, usando métodos convencionais de análise de pedigree e ferramentas de software adicional, tipicamente usadas para espécies domésticas, como o ENDOG. A média de gerações completas equivalentes foi de 1.54 (±1.20) por animal, para a população total. No entanto, tem havido um aumento na profundidade do pedigree, ao longo dos anos, com a população de referência a alcançar as 3.37 (±0.76) gerações completas, e onde todos os animais tinham avós maternos conhecidos e 85% a 90% tinham avós paternos conhecidos. A população total teve um intervalo de geração de 11.52 (±4.70) anos, no entanto a média das idades às quais os indivíduos tiveram filhos tem vindo a aumentar, particularmente na última década. Em relação ao número de filhos por progenitor, para as fêmeas foi 4.05 (±3.16) crias e para os machos 7.97 (±8.57) crias. A consanguinidade média geral foi de 2.03% (±5.92), embora ao longo dos anos, tenha vindo a aumentar, com a população de referência a alcançar um valor de 3.34% (±6.08). A taxa de aumento da consanguinidade foi de 1.6% por geração. O número de animais consanguíneos tem vindo a aumentar, representando 16.87% e 52.94% das populações total e de referência, respetivamente. No entanto, a média do coeficiente de consanguinidade, dos consanguíneos, mostra uma diminuição significativa, com o valor da população de referência a ser metade do da população total. O relacionamento médio, nos indivíduos da mesma instituição de nascimento foi de 0.10 e de diferentes instituições de 0.01, proporcionando a oportunidade de manter a consanguinidade sob controle por meio da troca planeada entre as instituições. O número de fundadores que contribuíram para 50% do pool genético foi de 36 e 12, para as populações totais e de referência, respetivamente, com um número efetivo de fundadores de 96 e 34, nas duas populações. O tamanho efetivo da população total foi de 36. É importante manter um programa apontado para a gestão genética da população, incluindo o maneio da seleção e decisões de acasalamento, para evitar maiores perdas de diversidade genética.N/

Advances in solar-pumped laser efficiency and brightness

Advances in both solar-pumped laser efficiency and brightness are herein presented. Several solar laser prototypes with both end-side-pumping and side-pumping configurations were studied and developed to efficiently pump small diameter Nd:YAG laser rods, leading to substantial increase in solar laser collection efficiency and brightness, which have gained international recognitions. All the design parameters were optimized in ZEMAX© non-sequential ray-tracing software. LASCAD© laser cavity analysis software was then used to optimize the laser resonator parameters. Based on the numerically optimization of the solar laser system, the solar laser prototypes were designed and built in Lisbon. Solar energy collection and concentration were achieved through the PROMES-CNRS heliostat-parabolic system, NOVA Fresnel lens system, and the recently new NOVA heliostat-parabolic system. Measurements of the solar input / laser output performance, beam quality M2 factors, and laser beam profiles for both multimode and fundamental mode regime were performed and compared with that of the numerical results. 13.9 W/m2 solar laser collection efficiency was achieved in 2013, through PROMES heliostatparabolic mirror system, by end-side-pumping a 5 mm diameter, 25 mm length Nd:YAG laser rod. This result was further increased to 21.1 W/m2, in 2015, within the same solar facility. In 2016, 25 W/m2 collection efficiency was reported, by end-side-pumping a thinner laser rod through NOVA heliostat-parabolic mirror system. In addition to the enhancement of solar laser collection efficiency, the thermal performance of end-side-pumped solar laser was also substantially improved. In 2017, record solar laser collection efficiency of 31.5 W/m2 was reported by end-sidepumping a 4 mm diameter, 35 mm length Nd:YAG laser rod in PROMES-CNRS heliostatparabolic mirror system. Also, record slope efficiency of 8.9% was achieved. A substantial progress in solar laser beam brightness with Fresnel lens was reported in 2013, through the first TEM00-mode solar laser. 1.9 W solar laser brightness was registered, being 6.6 times more than the previous record. The adoption of an asymmetric laser resonator, for maximum extraction of TEM00-mode solar laser, was also essential for improving significantly the solar laser brightness. By side-pumping a 3 mm diameter, 30 mm length Nd:YAG rod with a double-stage rectangular light guide / 2D-CPC concentrator, 4.0 W solar laser brightness was reported in 2015, doubling the previous record with Fresnel lens. TEM00-mode solar laser collection efficiency of 4.0 W/m2 was obtained by side-pumping a Nd:YAG grooved rod in 2016. Most recently, by endside-pumping a 4 mm diameter, 35 mm length, Nd:YAG rod, the TEM00 mode solar laser collection efficiency was almost doubled, reaching 7.9 W/m2. Record-high solar laser brightness of 6.5 W was also achieved. Advances in solar laser beam stability were also achieved by developing sculptured twisted light guides for efficient uniform redistribution of pump light into a thin and long laser rod. In addition to this, we were also able to demonstrate the first emission of doughnut shaped solar laser beam, which may widen the applications areas of solar-pumped lasers. The research efforts performed during this work for enhancing both solar laser efficiency and beam brightness are explained. Experimental results are discussed and future suggestions are proposed

Construção de uma matriz de díodos emissores de luz acoplada a um concentrador para fototerapia

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Engenharia BiomédicaO uso de dispositivos de LEDs (Díodos Emissores de Luz) em fototerapia, com luz na gama do espectro do vermelho e infravermelho-próximo (600-950nm), tem vindo a ser ampliado na última década. A sua eficácia, semelhante à do laser de baixa potência, tem sido demonstrada em diversos estudos. Os dispositivos LEDs podem ser utilizados como uma alternativa barata e segura, oferecendo um espectro de acção maior em tecidos-alvo, comparativamente ao laser. No âmbito deste projecto foi proposto a realização de um protótipo simples para utilização de luz emitida por LEDs no tratamento de lesões cutâneas. O protótipo é constituído por uma matriz de 10x10 LEDs com um pico de emissão nos 660nm. Cada LED foi polido lateralmente de modo a criar uma área de emissão mais compacta. Um concentrador com uma área de secção transversal quadrada foi utilizado para acoplar a luz emitida numa dada área de tratamento. Isto permite uma eficaz transmissão, uniformização e concentração da luz não alcançável em dispositivos de LEDs convencionais. O calor emanado pela fonte de luz é dissipado pelo concentrador, o que assegura a temperatura constante do tecido a ser tratado. O protótipo foi optimizado no software de simulação óptica ZEMAX®, obtendo-se na prática uma irradiância de aproximadamente 40mW/cm2, suficientemente elevada para produzir um efeito fotoestimulador num tempo de exposição relativamente curto. Com o objectivo de produzir um efeito fotoestimulador o protótipo foi testado em manchas decorrentes de ventosaterapia. O uso do concentrador acoplado à fonte de LEDs evidenciou uma alteração de coloração da mancha que sugere uma activação do movimento sanguíneo e/ou ocorrência de vasodilatação imediatamente após a exposição à luz, não demonstrada com o uso da mesma fonte sem concentrador

Configuração Familiar, Perceção de Funcionamento Familiar e Autoconceito Adolescente: estudo exploratório sobre a perceção de funcionamento familiar e autoconceito do filho adolescente em famílias nucleares intactas, monoparentais, reconstituídas e alargadas

Tendo em conta as alterações que se observam atualmente na estrutura e nas configurações familiares, tem sido questionado o impacto que estas alterações têm no funcionamento da família e no autoconceito dos adolescentes. O presente estudo tem como objetivo analisar como se relacionam, em distintas configurações familiares, a perceção dos adolescentes e seus pais sobre o tipo de funcionamento familiar e o autoconceito dos filhos adolescentes. Participaram neste estudo 70 agregados familiares, representados por 70 filhos adolescentes, 67 mães e 40 pais. Foi aplicada a Escala de Avaliação da Adaptabilidade e Coesão Familiar II (FACES II) à díade parental e ao filho para avaliar a perceção de funcionamento familiar e a Piers-Harris Children’s Self-Concept Scale 2 (PHCSCS-2) para avaliar o autoconceito dos filhos adolescentes. Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas nas configurações familiares face ao funcionamento familiar percebido, à excepção da perceção de funcionamento familiar do adolescente que é em regra mais negativa do que a dos pais. No entanto, as famílias nucleares intactas revelaram scores de coesão e adaptabilidade médios mais satisfatórios comparativamente com as famílias de outras configurações (incluem-se as monoparentais, as reconstituídas e as alargadas). O autoconceito parece variar nas várias configurações familiares, sendo que são os adolescentes das famílias nucleares intactas que têm perceção de autoconceito superior. Constatou-se, ainda, a existência de associação entre a perceção de funcionamento familiar e o autoconceito do adolescente, no sentido em que quanto mais funcional a família se perceciona, melhor o autoconceito do filho adolescente. Realça-se a pertinência de promoção de intervenções no sentido de potenciar a resiliência individual e familiar perante as adversidades, nomeadamente, as transições familiares. / Bearing in mind the current changes in family structures and configurations, questions have been raised as to how these changes have impacted on the functioning of families and on the adolescents’ self-concept. The aim of this study is to examine how the perception that adolescents and their parents, as part of different family configurations, have on the type of family functioning relates to the self-concept of adolescents or adolescent children. This study involved 70 households represented by 70 adolescents, 67 mothers and 40 fathers. We applied the Family Adaptability and Cohesion Evaluation Scale II (FACES II) to the combination parent and child to assess the perception of family functioning, and the Piers-Harris Children’s Self-Concept Scale 2 (PHCSCS-2) to assess the self-concept of adolescents. No statistically significant differences were observed in the family configurations based on the perceived family functioning, with the exception to how the adolescent perceives the family functioning, which is usually more negative than that of the parents. Nevertheless, the average cohesion and adaptability scores of the unbroken nuclear families were more satisfactory compared to those of families with different configurations (that includes single parent families, reconstituted families, and extended families). The self-concept seems to vary in the different family configurations, with adolescents from unbroken nuclear families having a higher self-concept perception. It also became evident that there was an association between the perceived family functioning and the self-concept of the adolescent, in the sense that the more the family perceives itself as being functional, the better the self-concept of the adolescents. This study stresses the relevance of promoting interventions to encourage individual and family resilience to respond to adversities, in particular family transformations

Perceção da idade através da voz

Mestrado em Ciências da Fala e da AudiçãoO conhecimento da voz dos idosos, o seu envelhecimento, as características a ela associadas e a forma como esta é percecionada, tem figurado na literatura como uma das áreas de interesse. O seu crescente entendimento tem importância tanto em áreas clínicas e terapêuticas - como é o caso da Terapia da Fala - como na área tecnológica, tendo em vista, entre outros objetivos, a melhoria da qualidade de vida dos indivíduos, por meio do aperfeiçoamento e desenvolvimento de dispositivos de apoio a idosos que vivem, muita vezes, sozinhos e em situação de isolamento. O estudo apresentado tem por objetivo perceber de que forma o género do ouvinte, bem como o comprimento dos estímulos percecionados, determinam a capacidade de julgamento da idade vocal. Para tal, foram apresentados vários estímulos de voz de idosos entre os 60 e os 90 anos, a participantes com idades compreendidas entre os 18 e os 73 anos. Foram selecionados 144 estímulos de voz, classificados em três categorias, em função do comprimento do estímulo: “palavra”, “frase curta” e “frase longa”. Os resultados apresentados registam uma percentagem de acerto na tarefa de perceção na ordem dos 45.6%, sendo que as diferenças verificadas entre participantes do género masculino e feminino não se verificaram estatisticamente significativas. No que concerne ao comprimento do estímulo, foram obtidas diferenças significativas entre as três categorias apresentadas, sendo a “palavra” o estímulo que melhores resultados revela. Foi possível concluir, desta forma, que ao invés do preconizado por vários estudos anteriores, nem sempre a estimação da idade real de falantes idosos se assume como uma tarefa fácil. Aferiu-se ainda, que as diferenças apresentadas entre o género masculino e feminino são pequenas e, ao contrário do que é referido na literatura, estímulos com menor quantidade de informação semântica e acústica estão associados a maiores percentagens de acerto.The knowledge of the elderly’s voice, their aging, the characteristics associated with it and how it is percepted has figured in the literature as one of the areas of interest. Its understanding it is important in clinical and therapeutic areas - such as speech therapy - and technology. The main objetive of these areas, among others, is to improve the quality of life of individuals, through the improvement and development of devices for the elderly who live, many times, alone and in isolation. The present study aims to understand how the gender of the listener as well as the length of the percepted stimuli influences the judgment of vocal age. To study this reality, various elderly voice stimuli (with ages between 60 and 90 years) were presented to participants aged between 18 and 73 years. We selected 144 speech stimuli, classified into three categories, according with the length of the stimulus: "word", "short sentece" and "long sentence". The results showed a correct response rate of 45.6% in the perception task, and the differences between male and female participants responses were no statistically significant. Regarding the length of the stimuli there were significant differences between the three categories displayed. The "word" category showed the best results. These results suggest that estimation of the real age of elderly speakers is not an easy task. It goes against the previous studies. We also showed that the difference in response rates of males and females are not significant. Finally, and contrary to what is reported in the literature we observed that stimuli with less acoustic and semantic information are associated with higher percentages of correct answers

Planeamento ótimo e determinantes de operacionais: o caso da Neckmolde, moldes e acessáorios para a indústria do vidro de embalagem. Lda

O presente trabalho de projeto pretende abordar a temática do planeamento em contexto industrial e avaliar o compromisso das soluções adotadas com os determinantes operacionais como a agilidade, a flexibilidade ou a versatilidade. O estudo foi aplicado ao setor dos moldes para a indústria do vidro, tendo sido acolhido pela empresa Neckmolde – Moldes e Acessórios para a Indústria do Vidro de Embalagens, Lda. O trabalho de projeto tem por objetivo a análise do layout industrial e das práticas de fabrico em curso na empresa, tendo em vista a oportunidade de melhoria do arranjo físico da instalação e o desenvolvimento de propostas de planeamento ótimo das operações, que permitam avaliar os determinantes operacionais. Para dar resposta às questões de investigação relativas ao arranjo físico da instalação utilizaram-se suplementos de Facility Layout Add-in executados em Microsoft Excel, e que permitiram efetuar uma análise ao layout industrial da Neckmolde. A investigação relativa ao planeamento e aos determinantes operacionais foi conduzida com o desenvolvimento de um modelo, suportado por formulações matemáticas de programação linear inteira e inteira mista, ILP e MILP. As propostas desenvolvidas foram validadas com base num conjunto de testes, tendo como termo de comparação os resultados reais das operações de fabrico em curso na empresa. Os resultados permitiram constatar que o atual arranjo físico tem possibilidade de ser modificado, melhorando desse modo a mobilização interna, o fluxo de materiais e, consequentemente, o tempo não produtivo. Paralelamente, em termos de fabrico, concluiu-se que os produtos com maior representatividade para a Neckmolde são os anéis e as boquilhas, e identificaram-se as etapas limitativas do processo de fabrico. O modelo de otimização permitiu obter várias propostas de planeamento considerando diferentes parametrizações, exigências diárias e requisitos semanais. Com base nestes resultados conclui-se do interesse do tema e da sua pertinência prática e organizaciona

Relação dos níveis de atividade e aptidão física com o rendimento escolar, em adolescentes de ambos os sexos

Este estudo teve como objetivos relacionar os níveis de atividade física e aptidão física com o rendimento escolar em adolescentes, assim como comparar a atividade física e aptidão física por sexo e ainda relacioná-las com a percentagem de massa gorda, perímetro da cintura e IMC.A amostra foi composta por 373 adolescentes da região norte de Portugal continental com idades compreendidas entre os 10 e os 18 anos (M=13.24, DP=2.44), 209 (56.0%) do sexo feminino e 164 (44.0%) do sexo masculino.Os instrumentos utilizados foram um questionário, com o propósito de recolher informação relativa às características sociodemográficas e antropométricas dos adolescentes, a grelha de classificações finais para determinar o rendimento escolar, a balança Tanita BC 545 que permitiu obter o peso, IMC e percentagem de massa gorda, um estadiómetro portátil (SECA 217) para determinar a altura, acelerómetros (GT3Xs) para determinar o nível de atividade física (AF) durante sete dias e o teste Fitnessgram para determinar a aptidão física (AP).Os resultados encontrados sugerem a existência de uma relação entre o rendimento escolar e a prática de AF, principalmente do tipo vigorosa, assim como entre a AP e o rendimento escolar. A prática média diária da prática de AF vigorosa a moderada não acompanha as recomendações mais recentes da OMS (≥ 60min/dia). Apesar disso este tipo de prática foi mais frequente nos adolescentes do sexo masculino comparativamente aos adolescentes do sexo feminino, sendo esta diferença encontrada também ao nível da aptidão física. Foi ainda encontrada uma relação entre a prática de AF, principalmente a AF vigorosa e a AF média a vigorosa com uma menor percentagem de massa gorda e ainda entre a AP e uma menor percentagem de massa gorda, menor perímetro da cintura e menor IMC.This study goals intended to relate physical activity and physical fitness with academic achievements in adolescents, along with the comparison of physical activity and physical fitness by gender and also relate the referred variables with the body fat percentage, waist perimeter and body mass index.Sample was composed by 373 teenagers of Portugal northern region aged between 10 and 18 years old (M=13.24, DP=2.44), 209 (56.0%) females and 164 (44.0%) males.Instruments included a questionnaire to assess adolescents' socio-demographic and anthropometric characteristics, an academic evaluation sheet for determining academic achievements, a Tanita's BC 545 weight scale for assessing weight, body mass index and body fat percentage, a portable stadiometer (SECA 217) for assessing height, accelerometers (GT3Xs) for determining physical activity and fitnessgram for assessing physical fitness.Results suggest the existence of a relation between academic achievements and physical activity, especially the vigorous type, and between academic achievements and physical fitness. The average result of the physical activity practice falls short of WHO recommendations (≥ 60min/day). Nevertheless vigorous activities were more frequently engaged by male adolescents, when compared with female adolescents; the same was observed regarding physical fitness. Finally we also found a relation between physical activity, especially the vigorous type, but also the moderate to vigorous type and with lower percentage of body fat, and physical fitness with lower percentage of body fat, lower waist perimeter and lower body mass index

Uma nova centralidade para a cidade de Luanda

Dissertação de Mestrado Integrado em Arquitetura, com a especialização em Arquitetura apresentada na Faculdade de Arquitetura da Universidade de Lisboa para obtenção do grau de Mestre.N/

Caracterização da paleta de Diogo de Torres. Quatro pinturas Retabulares do séc. XVI. Estudo da descoloração do azul de esmalte

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Conservação e RestauroEste trabalho pretende ser um estudo preliminar sobre a caracterização da paleta de Diogo de Torres, pintor maneirista, cujas pinturas forma intervencionadas recentemente. Para tal foram analisados os materiais constituintes das camadas cromáticas, presentes nas quatro pinturas retabulares do século XVI de Diogo de Torres Vedras e expostas na Igreja de S. Pedro em Dois Portos, bem como a sua técnica artística. Verificou-se a existência de uma preparação à base de gesso e a utilização de pigmentos comuns à época, como o branco de chumbo, goetite, terra de sombra, vermelhão, mínio, azurite, azul de esmalte, carvão e corante vermelho cochonilha nas quatro pinturas, através da análise por microscopia óptica, μ-EDXRF, μ-Raman, μ-FTIR, HPLC-DAD e μ-EDX-SEM. Foi identificado por μ-FTIR, a presença de aglutinante oleoso em todos os estratos analisados. Foi ainda iniciado um projecto para o estudo da descoloração do azul esmalte, um dos pigmentos utilizados pelo artista. Este estudo teve como motivação a descoloração total das partículas de azul de esmalte, observada em todas as amostras analisadas das pinturas de Diogo de Torres. Com o intuito de compreender qual ou quais as causas e tendo presente dois factores que podem afectar a descoloração das partículas, a humidade relativa e o envelhecimento do óleo, estas amostras reais do séc. XVI foram analisadas por microscopia óptica, EDX-SEM e μ-FTIR e comparadas com amostras sintetizadas e reconstruções de camadas cromáticas de composição semelhante. A exposição durante quatro meses a 80% de humidade relativa das reconstruções cromáticas não revelou degradação do pigmento, apresentando apenas, por exame de colorímetria, alteração da cor nas superfícies para valores mais amarelos, originados pelo óleo. Foi ainda analisado o pigmento antes e após ensaios de imersão, verificando-se uma variação de pH consistente com a sua degradação