Les espèces dites " autochtones " et " allochtones " au regard de l'archéozoologie : l'exemple de la faune piscicole (Cyprinidae)

Document de travail issu de la thèse : Liarsou A. - Contribution de l'archéologie à la réflexion sur le partage entre nature et culture et mise en perspective des stratégies de gestion de la biodiversité : analyse de quelques interactions entre les sociétés humaines et d'autres espèces animales, Université Paris I-Panthéon Sorbonne, UMR 7041, Archéologies et Sciences de l'Antiquité, Équipe d'archéologies environnementales, 2012.Le législateur prévoit de nombreuses dispositions pour gérer la faune et rendre effective la protection de certaines espèces animales ainsi que des milieux qui y sont associés. Les stratégies de conservation sont en partie impulsées par un inventaire national du patrimoine naturel (INPN) et la détermination des espèces dites autochtones et des espèces dites allochtones, ces dernières étant potentiellement invasives. Cette détermination est délicate à exercer pour la faune piscicole. A l'échelle de l'Europe, les données archéozoologiques tendent à montrer que des espèces allochtones sont présentes depuis longtemps dans nos cours d'eau et souvent considérées comme autochtones, car la question n'a pratiquement pas été problématisée. Par ailleurs, la dispersion sur les principaux hydrosystèmes européens des taxons les plus sédentaires et potamodromes ne peut s'expliquer qu'à la faveur d'introductions multiples effectuées par différents groupes humains ; et ce, avant les périodes antiques, médiévales et modernes habituellement seules considérées

Étude phylogéographique comparée des polymorphismes des génomes chloroplastique et mitochondrial de l'épinette noire

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2008-2009La génogéographie de l'épinette nOIre (Picea mariana) a été étudiée à l'échelle transcontinentale à l'aide de marqueurs microsatellites de l'ADN chloroplastique, puis comparée à celle obtenue par Jaramillo-Correa et al. (2004) à l'aide de marqueurs du génome mitochondrial. Cette approche a permis de confirmer l'existence de lignées génétiques distinctes au sein des populations modernes résultant de l'isolation probable des arbres dans plusieurs populations ancestrales lors du dernier épisode glaciaire. L'intensification de l'échantillonnage a permis de détecter une nouvelle lignée génétique en Alaska. La comparaison de l'étendue des lignées chloroplastiques et mitochondriales a montré que le flux génique par le pollen est beaucoup plus important que celui par les graines et agit préférentiellement de manière unidirectionnelle d'ouest en est. Cette étude a également mis en évidence que certains individus sont caractérisés par des assemblages de génomes chIoroplastique . et mitochondrial probablement apparus sous l'effet du flux génique lors de la recolonisation postglaciaire

Retracer le changement de la répartition géographique d’une espèce grâce aux événements d’hybridation in situ

La modification de la répartition géographique des espèces est fortement influencée par les changements climatiques. Dans les régions où les conditions deviennent défavorables, un déclin démographique conduisant souvent à l’extinction des espèces est observé. Au cours de ce déclin, des événements d’hybridation peuvent survenir lorsque les individus d’une espèce rare se reproduisent avec ceux d’une autre espèce plus abondante (principe de Hubbs). Une étude précédente a détecté, dans le sud du Québec (Canada), plusieurs événements d’hybridation in situ impliquant les femelles Chrosomus neogaeus et les mâles Chrosomus eos bien que C. neogaeus soit quasi absent de la région. Ceci a pu être réalisé grâce au mode de reproduction asexuée des hybrides qui conservent alors de façon intacte la diversité génétique des espèces parentales. L’objectif de l’étude est donc d’inférer les changements démographiques de C. neogaeus en fonction de la structure géographique d’événements d’hybridation. Un large échantillonnage latitudinal a été réalisé afin de déterminer la répartition géographique des membres du complexe C. eos-neogaeus et de tester différents scénarios biogéographiques. Alors que C. neogaeus était présent dans tous les bassins versants échantillonnés, une corrélation entre les bassins versants et l’origine glaciaire des individus les ayant colonisés a révélé différents historiques de colonisation postglaciaire. Cependant, un gradient latitudinal a été observé en ce qui concerne la diversité des hybrides. Au sud, les résultats ont révélé une importante quantité d’événements d’hybridation in situ, mais ceux-ci deviennent moins fréquents au nord. Ce gradient latitudinal pourrait être interprété comme étant la conséquence d’un déplacement vers le nord de la répartition géographique de C. neogaeus et constitue une preuve supplémentaire d’un changement environnemental à grande échelle dans les écosystèmes aquatiques d’eau douce depuis la fin de la glaciation.Shifts in the geographical distribution of species are strongly influenced by climate change. In areas where conditions become unfavorable, demographic decline precedes the extinction of a species. During this decline, hybridization events may occur when individuals of a scarce species breed with more abundant heterospecific indivduals (Hubbs principle). A previous study in Southern Quebec (Canada), detected several in situ hybridization events involving females Chrosomus neogaeus and males Chrosomus eos, although C. neogaeus is nearly absent from the region. This has been achieved thanks to the asexual reproduction mode of hybrids which then preserve the genetic diversity of parental species intact. This study aimed to assess the demographic changes of C. neogaeus according to the geographic pattern of hybridization events. A large latitudinal sampling was performed to determine the geographical distribution of members of the C. eos-neogaeus complex and test different biogeographical scenarios. While C. neogaeus was present across all drainage basins sampled, a correlation between drainages and the glacial origin of individuals that colonized them revealed different postglacial colonization histories. However, a latitudinal gradient was observed regarding the hybrid diversity. In the south, results revealed a large occurrence of in situ hybridizations, but these became less common going north. This latitudinal pattern could be interpreted as a northward shift in the C. neogaeus geographical distribution and constitutes additional evidence of a large-scale environmental change in freshwater aquatic ecosystems since the end of glaciation

A contribution to the knowledge of orchids in the Aurès (N.-E. Algeria): inventory, cartography, taxonomy and ecology

À l’occasion de diverses études de la flore et de la végétation du massif de l’Aurès (N.-E. de l’Algérie), les orchidées ont fait l’objet d’un inventaire spécifique accompagné de relevés phytoécologiques conjoints. En quatorze années, seulement neuf taxons répartis sur quinze localités ont été inventoriés : Cephalanthera longifolia, Epipactis helleborine, Himanthoglossum hircinum subsp. hircinum, Ophrys lutea subsp. lutea, Ophrys scolopax subsp. apiformis, Ophrys subfusca subsp. subfusca, Ophrys tenthredinifera subsp. ficalhoana, Orchis olbiensis, Orchis purpurea subsp. purpurea. A ceux-ci s’ajoutent d’autres espèces signalées dans la littérature pour ce même massif ou dans le massif voisin de Belezma. Ces observations nous ont permis de confirmer la taxinomie de certains taxons qui demeurait assez confuse dans la littérature récente. Des analyses multidimensionnelles ont mis en évidence, d’une part la typologie des stations et d’autre part certaines variables environnementales déterminant la distribution de ces espèces dans cette région. En raison de la vulnérabilité alarmante des sites visités et des menaces, notamment anthropiques, auxquelles ils sont soumis, une réflexion sur la protection des habitats et de leurs hôtes apparaît urgente.From various flora and vegetation studies of the Aurès Massif (northeast of Algeria), the orchids have been the subject of a specific inventory coupled with a phytoecological survey. After fourteen years, only nine species in fifteen localities have been recorded, including following taxa: Cephalanthera longifolia, Epipactis helleborine, Himanthoglossum hircinum subsp. hircinum, Ophrys luteasubsp. lutea, Ophrys scolopax subsp. apiformis, Ophrys subfusca subsp. subfusca, Ophrys tenthredinifera subsp. ficalhoana, Orchis olbiensis, Orchis purpurea subsp. purpurea. In addition to those ones, other species are reported in the literature in this massif or in the nearby massif of Belezma. These observations allowed us to confirm the taxonomy of some taxa which are still confused in the recent literature. The multidimensional analyses have revealed the station typology and some environmental variables that determine the distribution of these species in this region. Due to the alarming vulnerability of these sites and the threats, especially anthropogenic, to which they are subjected, a reflection to protect the habitats and their hosts seems to be urgent