Development and Application of Analysis Software for Ion Channel Kinetics

イオンチャンネル動態を解析するソフトウエアを開発した.パッチクランプ法を用い,単チャンネルを解析するプログラムであり,C及びIGORプログラム言語を使用している.イオンチャンネルシミュレータにより,本プログラムの有効性を検討した.open time及びclosed timeの両ヒストグラムムにおいて,理論曲線と良好な相関が認められた.モルモット単心室筋細胞において,心臓内向き整流カリウムイオンチャンネル(IK1)又はATP感受性カリウムイオンチャンネル(KATP)がパッチクランプ法により記録された.IK1及びKATPチャンネル電流は本プログラムにより解析された.本プログラムは信頼性があり,パッチクランプ実験において有用であると考えられたイオンチャンネル動態を解析するソフトウエアを開発した.パッチクランプ法を用い,単チャンネルを解析するプログラムであり,C及びIGORプログラム言語を使用している.イオンチャンネルシミュレータにより,本プログラムの有効性を検討した.open time及びclosed timeの両ヒストグラムムにおいて,理論曲線と良好な相関が認められた.モルモット単心室筋細胞において,心臓内向き整流カリウムイオンチャンネル(IK1)又はATP感受性カリウムイオンチャンネル(KATP)がパッチクランプ法により記録された.IK1及びKATPチャンネル電流は本プログラムにより解析された.本プログラムは信頼性があり,パッチクランプ実験において有用であると考えられたイオンチャンネル動態を解析するソフトウエアを開発した.パッチクランプ法を用い,単チャンネルを解析するプログラムであり,C及びIGORプログラム言語を使用している.イオンチャンネルシミュレータにより,本プログラムの有効性を検討した.open time及びclosed timeの両ヒストグラムムにおいて,理論曲線と良好な相関が認められた.モルモット単心室筋細胞において,心臓内向き整流カリウムイオンチャンネル(IK1)又はATP感受性カリウムイオンチャンネル(KATP)がパッチクランプ法により記録された.IK1及びKATPチャンネル電流は本プログラムにより解析された.本プログラムは信頼性があり,パッチクランプ実験において有用であると考えられたイオンチャンネル動態を解析するソフトウエアを開発した.パッチクランプ法を用い,単チャンネルを解析するプログラムであり,C及びIGORプログラム言語を使用している.イオンチャンネルシミュレータにより,本プログラムの有効性を検討した.open time及びclosed timeの両ヒストグラムムにおいて,理論曲線と良好な相関が認められた.モルモット単心室筋細胞において,心臓内向き整流カリウムイオンチャンネル(IK1)又はATP感受性カリウムイオンチャンネル(KATP)がパッチクランプ法により記録された.IK1及びKATPチャンネル電流は本プログラムにより解析された.本プログラムは信頼性があり,パッチクランプ実験において有用であると考えられ

Spectral Analysis of Epicardial 60-lead Electrograms in Dogs during Acute Myocardial Ischemia

急性心筋虚血が心全サイクルにわたる各周波数の要素に及ぼす効果を分析した.7犬について冠動脈閉塞前後に60誘導心外膜心電図を記録し,単一平均と高速フーリエ変換を行い,逆変換を5周波数レンジで行った.心サイクル中の再構築した波形の絶対値を積分し,フィルターQRST面積地図として表示した.心筋虚血では初期QRSにおいてのみ低周波数(0-25Hz)の要素が有意に感じるが,これら要素はQRSの後半部とSTで著明に増加した.逆に心筋虚血はQRSの中間部の早期に中および高周波(25-250Hz)の要素を有意に減じるが,終末期QRSでの高周波数(80-250Hz)の要素を著明に増加した急性心筋虚血が心全サイクルにわたる各周波数の要素に及ぼす効果を分析した.7犬について冠動脈閉塞前後に60誘導心外膜心電図を記録し,単一平均と高速フーリエ変換を行い,逆変換を5周波数レンジで行った.心サイクル中の再構築した波形の絶対値を積分し,フィルターQRST面積地図として表示した.心筋虚血では初期QRSにおいてのみ低周波数(0-25Hz)の要素が有意に感じるが,これら要素はQRSの後半部とSTで著明に増加した.逆に心筋虚血はQRSの中間部の早期に中および高周波(25-250Hz)の要素を有意に減じるが,終末期QRSでの高周波数(80-250Hz)の要素を著明に増加した急性心筋虚血が心全サイクルにわたる各周波数の要素に及ぼす効果を分析した.7犬について冠動脈閉塞前後に60誘導心外膜心電図を記録し,単一平均と高速フーリエ変換を行い,逆変換を5周波数レンジで行った.心サイクル中の再構築した波形の絶対値を積分し,フィルターQRST面積地図として表示した.心筋虚血では初期QRSにおいてのみ低周波数(0-25Hz)の要素が有意に感じるが,これら要素はQRSの後半部とSTで著明に増加した.逆に心筋虚血はQRSの中間部の早期に中および高周波(25-250Hz)の要素を有意に減じるが,終末期QRSでの高周波数(80-250Hz)の要素を著明に増加した急性心筋虚血が心全サイクルにわたる各周波数の要素に及ぼす効果を分析した.7犬について冠動脈閉塞前後に60誘導心外膜心電図を記録し,単一平均と高速フーリエ変換を行い,逆変換を5周波数レンジで行った.心サイクル中の再構築した波形の絶対値を積分し,フィルターQRST面積地図として表示した.心筋虚血では初期QRSにおいてのみ低周波数(0-25Hz)の要素が有意に感じるが,これら要素はQRSの後半部とSTで著明に増加した.逆に心筋虚血はQRSの中間部の早期に中および高周波(25-250Hz)の要素を有意に減じるが,終末期QRSでの高周波数(80-250Hz)の要素を著明に増加し

Host jumping onto close relatives and across kingdoms by Tyrannicordyceps (Clavicipitaceae) gen. nov. and Ustilaginoidea_(Clavicipitaceae)

Premise of study: This research seeks to advance understanding of conditions allowing movement of fungal pathogens among hosts. The family Clavicipitaceae contains fungal pathogens exploiting hosts across three kingdoms of life in a pattern that features multiple interkingdom host shifts among plants, animals, and fungi. The tribe Ustilaginoideae potentially represents a third origin of plant pathogenesis, although these species remain understudied. Fungal pathogens that cause ergot are linked morphologically with Clavicipitaceae, but are not yet included in phylogenetic studies. The placement of Ustilaginoideae and ergot pathogens will allow differentiation between the host habitat and host relatedness hypotheses as mechanisms of phylogenetic diversification of Clavicipitaceae. • Methods: A multigene data set was assembled for Clavicipitaceae to test phylogenetic placement and ancestral character-state reconstructions for Ustilaginoidea virens and U. dichromonae as well as the ergot mycoparasite Cordyceps fratricida. Microscopic morphological observations of sexual and asexual states were also performed. • Key results: Phylogenetic placement of U. virens and U. dichromonae represents a third acquisition of the plant pathogenic lifestyle in Clavicipitaceae. Cordyceps fratricida was also placed in Clavicipitaceae and recognized as a new genus Tyrannicordyceps. Ancestral character state reconstructions indicate initially infecting hemipteran insect hosts facilitates subsequent changes to a plant pathogenic lifestyle. The ancestor of T. fratricida is inferred to have jumped from grasses to pathogens of grasses. • Conclusions: The host habitat hypothesis best explains the dynamic evolution of host affiliations seen in Clavicipitaceae and throughout Hypocreales. Co-occurrence in the same habitat has allowed for host shifts from animals to plants, and from plants to fungi.Keywords: Clavicipitaceae, pathogen, host association, Villosiclava, anamorph-teleomorph connection, evolution, adelphoparasit

植物由来乳酸菌 Lactobacillus sakei 発酵野菜と利用

　Vegetables fermented with lactic acid bacteria have particular flavor and tastes contributed by the bacteria. This report deals with the isolation of a plant origin Lactobacillus sakei HS-１ from a well know fermented food called as Kimchi and the application as a starter culture in the productions of fermented vegetables and typical Japanese tsukemono to determine the improvement in taste and probiotic properties of the strain.　In addition to the known organoleptic properties of the fi ber and umami flavor found in fermented vegetables tsukemono, the　metabolic products from the L. sakei starter culture will make possible the production of low 1.5 % salt fermented vegetables. The lactic acid fermentation will result in a low salt product with improved umami flavor making it possible to consume the product like a fresh salad. The viable L. sakei will also act as a probiotic to reduce the unwanted bacteria in the intestinal tract. This report shows some of the results.（１） L. sakei HS-１ was used to ferment white chinese cabbage kimchi. The microbial growth was rapid and a pH change was seen.　On the ４th day of fermentation the level of coliforms was negative. （ ２） Three types of fermented vegetables; Asazuke cucumber, diced cabbage and diced chinese cabbage kimchi were made with L.sakei and without.（３） The consumption of L. sakei fermented vegetables will improve bowel movement and there was a tendency to lose weight. Stools were tested for viable lactic acid bacteria and found in 88% order. This L. sakei is a homofermentative bacteria so no gas is formed in the intestine

Development and Application of the Original Software for Continous High-Speed Data Acquisition of Ion Channel Current.

パッチクランプ実験において連続高速データを得るソフトプログラム(A)を開発した.Aは高品質科学ディジタイザを用いて,多入力データチャネル記録を行うように設計した.AのソースコードはCプログラム言語及びIGORプログラム言語で書き記した.パッチクランプ手技のモルモット心室筋細胞接触配置における心内部整流Kイオンチャネルの電流を記録する実験で,ハードディスクに連続的に信号の入力データチャネルを習得させたところ,Aはミス無しで最大サンプリング率200kHzでデータを獲得することができた.Aはディジタイザ及びコンピュータの能力の利点をフルに有しており,ほとんどのパッチクランプ実験において得られる最大サンプリング率は,たとえ高速動力学を有するイオンチャネルであっても単イオンチャネル分析に行うに当たり,十分高いものといえるパッチクランプ実験において連続高速データを得るソフトプログラム(A)を開発した.Aは高品質科学ディジタイザを用いて,多入力データチャネル記録を行うように設計した.AのソースコードはCプログラム言語及びIGORプログラム言語で書き記した.パッチクランプ手技のモルモット心室筋細胞接触配置における心内部整流Kイオンチャネルの電流を記録する実験で,ハードディスクに連続的に信号の入力データチャネルを習得させたところ,Aはミス無しで最大サンプリング率200kHzでデータを獲得することができた.Aはディジタイザ及びコンピュータの能力の利点をフルに有しており,ほとんどのパッチクランプ実験において得られる最大サンプリング率は,たとえ高速動力学を有するイオンチャネルであっても単イオンチャネル分析に行うに当たり,十分高いものといえるパッチクランプ実験において連続高速データを得るソフトプログラム(A)を開発した.Aは高品質科学ディジタイザを用いて,多入力データチャネル記録を行うように設計した.AのソースコードはCプログラム言語及びIGORプログラム言語で書き記した.パッチクランプ手技のモルモット心室筋細胞接触配置における心内部整流Kイオンチャネルの電流を記録する実験で,ハードディスクに連続的に信号の入力データチャネルを習得させたところ,Aはミス無しで最大サンプリング率200kHzでデータを獲得することができた.Aはディジタイザ及びコンピュータの能力の利点をフルに有しており,ほとんどのパッチクランプ実験において得られる最大サンプリング率は,たとえ高速動力学を有するイオンチャネルであっても単イオンチャネル分析に行うに当たり,十分高いものといえるパッチクランプ実験において連続高速データを得るソフトプログラム(A)を開発した.Aは高品質科学ディジタイザを用いて,多入力データチャネル記録を行うように設計した.AのソースコードはCプログラム言語及びIGORプログラム言語で書き記した.パッチクランプ手技のモルモット心室筋細胞接触配置における心内部整流Kイオンチャネルの電流を記録する実験で,ハードディスクに連続的に信号の入力データチャネルを習得させたところ,Aはミス無しで最大サンプリング率200kHzでデータを獲得することができた.Aはディジタイザ及びコンピュータの能力の利点をフルに有しており,ほとんどのパッチクランプ実験において得られる最大サンプリング率は,たとえ高速動力学を有するイオンチャネルであっても単イオンチャネル分析に行うに当たり,十分高いものといえ