Study of the Carnitine Metabolism in Pregnancy, Rheumatoid Arthritis, Systemic Sclerosis and IBD by Tandem Mass Spectrometry

5

A karnitin észterek profilszerű meghatározásának jelentősége a humán karnitin metabolizmus vizsgálatában = Determination of the carnitine ester profiles as a tool in study of human carnitine metabolism

Primer karnitin hiányban megfigyeltük, hogy a drámaian csökkent karnitin észter szintek a karnitin kezelés hatására csak mérsékelten emelkedtek. Heterozigóta családtagokban egy közel proporcionális csökkenés volt az észterekben. Az SLC22 TC haplotípust nem találtuk hajlamosító tényezőnek. Vizsgáltuk a karnitin észter profilt tünetmenetes celiákiásokban, ulceratív colitisben és felnőtt Crohn betegekben. Beteganyagunkban az IGR2096a_1T és IGR2198a_1 C ellélok hajlamosítónak adódtak Crohn betegségre. A karnitin profil vizsgálata a IGR2230a_1 genotípusban nem mutatott eltérést. Elsőként vizsgáltuk az irodalomban a karnitin észterek profiljának alakulását a terhesség folyamán egészen a szülésig. A vizsgálatok dinamikus rendszert fedtek fel: átalakult a terhes nő karnitin profilja a graviditás során nem-terhes nőkhöz viszonyítva. Vizsgáltuk az SLC22A4 C6607T és a RUNX1 G24658C variánsokat rheumatoid arthritisben. Nem találtunk hajlamosító polimorfizmust vagy specifikus eltérést a karnitin észter profilban sem. Interleukin 23 receptor variánsokat tanulmányoztuk rheumatoid arthritises betegekben és megfigyeltük az allélok megosztott hajlamosító természetét. Megfigyeltük, hogy a gén 3?UTR C2370A allélikus variánsa hajlamosító gén relabáló-remittáló típusú multiplex sclerosisban. Vizsgáltuk az apolipoprotein A 5 gén T-1131C, T1259C, IVS3-476A, és C56G variánsai és a triglicerid szintek alakulását, megfigyeltük, hogy több allél hajlamosító variáns strokeban és metabolikus szindrómában | We observed dramatic decrease of the carnitine esters in primary carnitine deficiency which underwent a moderate increase on the effect of carnitine supplementation. In heterozygous relatives a proportional decrease of carnitine esters could be observed. We did not found the SLC22 TC haplotypes to confer risk. The carnitine ester profile was investigated n asymptomatic celiac disease patients, ulcerative colitis, and adult Crohn subjects. In our patients IGR2096a_1T and IGR2198a_1 C alleles were susceptibility genes for Crohn disease; the carnitine profile was normal in IGR2230a_1 genotype. We examined the carnitine ester profile during pregnancy first in the literature. We found a very dynamic system: in pregnant woman the carnitine ester profile was changed comparing with non-pregnants, and was further modified during the progress of pregnancy. We studied the SLC22A4 C6607T and RUNX1 G24658C variants in rheumatoid arthritis and could not establish their susceptibility nature, nor we could detect change in the carnitine ester profiles. In rheumatoid arthritis and in remitting-relapsing form of multiple sclerosis we found the functional variants of the interleukin 23 receptor as shared susceptibility factors. We studied the association of T-1131C, T1259C, IVS3-476A, and C56G variants with the plasma triglycerides, and could verify a susceptibility nature for some of the in stroke and metabolic syndrome

A középkorú lakosság morbiditásának és mortalitásának összefüggése az MHC centrális régiójában található egyes génvariánsokkal és haplotipusokkal = Relationship between the morbidity and mortality of the middle-age people with some gene variants and haplotypes in the central region of MHC

A projekt keretében -korábbi adataink utánvizsgálat céljából - a középkorú lakosság morbiditásának és mortalitásának összefüggéseit tanulmányoztuk az MHC centrális régiójában található egyes génvariánsokkal és haplotipusokkal. Fontosabb új eredményeink: 1. Új módszert dolgoztunk ki a C4A és C4B gének kópiaszámának meghatározására 2. A C4B*Q0 (a C4B gén alacsony kópia száma) és a fokozott cardiovascularis morbiditás és mortalitás között kapcsolatot sikerült megerősítenünk az új genotipizálási módszer segítségével, 3. Elsőként sikerült feltérképezni az ősi kiterjesztett MHC haplotípusok előfordulását a magyar populációban és bizonyítottuk, hogy a leggyakoribb, 8.1 j. ősi haplotípus hordozóinak colorectalis carcinoma kockázata lényegesen nagyobb, mint a nem-hordozóké. 4. A C4B*Q0 genotípus és a fokozott cardiovascularis morbiditás és mortalitás között összefüggés egyik lehetséges magyarázata az, hogy a 21-hidroxiláz enzimet kódoló CYP-21 gén funkcionális rendellenessége és a C4A/C4B génszán közötti összefüggés áll fenn. Közel 100 egyén CYP-21 génjének szekvenálása segítségével találtunk ilyen összefüggést: a gén 4-es intronjában taláható két SNP ritka allélje csak a C4B*Q0 hordozókban fordult elő. Projektünk célkitűzéseit sikerült teljesíteni, a kapott eredményeinket 15, rangos nemzetközi folyóiratokban megjelent közleményben publikáltuk. | In order to reexamine our previous findings we studied the possible relationship between the cardiovascular morbidity/mortality of the middle-aged people and some alleles and haplotypes encoded in the central MHC region. Main results of the project: 1. A new method was worked out for direct counting of the copy number of the C4A and C4B genes. 2. Using this new method we have supported by new findings the strong association between the low copy number of the C4B genes (C4B*Q0) and the high rate of cardiovascular morbidity and mortality. 3. We were the first to map the occurrence of the ancestral extended MHC haplotypes in the Hungarian population and found that the carriers of the so-called 8.1 ancestral haplotype have an increased risk to develop colorectal cancer. 4. One of the possible explanation of the strong correlation between the C4B*Q0 genotype and the increased cardiovascular morbidity and mortality could be an association of the functional abnormalities of the CYP-21 gene (that encodes the 21-hydroxylase enzyme) and the C4A/C4B gene counts. We have examined this possibility by sequencing the CYP-21 gene in almost 100 subjects and found that the rare alleles of two SNPs in intron 4 of the gene occurs only in the C4B*Q0 carriers. Aims of the project were satisfied, the results were published in 15 papers in high-ranked international journals