Development of monoclonal antibodies specific to ribosomal protein S6 kinase 2

Ribosomal protein S6 kinase 2 (S6K2) is a serine/threonine kinase that belongs to the family of AGC kinases, which includes PKB/Akt, PKC, PDK1, and SGK1. Mammalian cells express two isoforms of S6K, termed S6K1 and S6K2. Each of these has nuclear and cytoplasmic spicing variants, which originate from different initiation start codons. Nuclear isoforms of S6K1 and S6K2 are slightly longer, as they possess additional sequences at the N-terminus with nuclear localization signals. Biochemical and genetic studies implicated S6Ks in the regulation of cell size, growth, and energy metabolism. Deregulation of S6K signaling has been linked to various human pathologies, making them excellent targets for drug discovery. The aim of this study was to produce monoclonal antibodies directed at the N-terminal regulatory region of S6K2, which shows very low homology to S6K1 or other members of the AGC family. To achieve this goal, two S6K2 fragments covering 1-64aa and 14-64aa N-terminal sequences were expressed in bacteria as GST/6His fusion proteins. Affinity purified recombinant proteins were used as antigens for immunization, hybridoma screening, and analysis of generated clones. We produced a panel of S6K2-specific antibodies, which recognized recombinant S6K2 proteins in ELISA and Western blot analysis. Further analysis of selected clones revealed that three clones, termed B1, B2, and B4, specifically recognized not only recombinant, but also endogenous S6K2 in Western blot analysis of HEK293 cell lysates. Specificity of B2 clone has been confirmed in additional commonly used immunoassays, including immunoprecipitation and immunocytochemistry. These properties make B2 MAb particularly valuable for elucidating signal transduction pathways involving S6K2 signaling under physiological conditions and in human pathologies

A cutoff phenomenon in accelerated stochastic simulations of chemical kinetics via flow averaging (FLAVOR-SSA)

We present a simple algorithm for the simulation of stiff, discrete-space, continuous-time Markov processes. The algorithm is based on the concept of flow averaging for the integration of stiff ordinary and stochastic differential equations and ultimately leads to a straightforward variation of the the well-known stochastic simulation algorithm (SSA). The speedup that can be achieved by the present algorithm [flow averaging integrator SSA (FLAVOR-SSA)] over the classical SSA comes naturally at the expense of its accuracy. The error of the proposed method exhibits a cutoff phenomenon as a function of its speed-up, allowing for optimal tuning. Two numerical examples from chemical kinetics are provided to illustrate the efficiency of the method

Особливості транскордонного управління водними ресурсами

Обґрунтовано необхідність охорони, відтворення та використання водних ресурсів у прикордонних територіях. Проаналізовано особливості здійснення управління водними ресурсами в транскордонному регіоні. The necessity of protection, reproduction and use of water resources in the border areas is substantiated. The features of water resource management in the transboundary region are analyzed

Региональные экологические программы развития Болгарии 2007–2013 гг. как составляющая региональной политики ЕС

У роботі досліджуються регіональні програми розвитку Болгарії у 2007 - 2013 рр. Визначено основні напрямки європейської регіональної політики.The paper investigates the regional development programs in Bulgaria in 2007 - 2013 years. The main directions of European regional policy are determined

Особливості управління транскордонними водними ресурсами на території республіки Польща (на прикладі р. Західний Буг)

У роботі досліджуються особливості управління транскордонними водними ресурсами на території Республіки Польща. Автор аналізує динаміку забору та використання вод р. Західний Буг, та їх цілі.The features of the management of transboundary water resources in Poland are studied in the paper. The author analyzes the dynamics of water abstraction and use of the Western Bug, and their goals

Удосконалення процесів управління транскордонними природними ресурсами

У статті автор пропонує шляхи вдосконалення управління транскордонними природними ресурсами. В даній сфері потрібно підписувати угоди про співробітництво, які повинні передбачати створення інституційної структури єврорегіону. Для того, щоб скористатися значним регіональним досвідом і знаннями, необхідно застосовувати регіональний підхід в управлінні транскордонними природними ресурсами з регіональними координаторами та створити мережу експертів в даній сфері. Важливим є створення спільного спостережного пункту для моніторингу та вимірювання змін у навколишньому середовищі з метою розробки спільного бачення в транскордонних масштабах.In the paper author suggests ways of transboundary natural resource management improvement. It is necessary to sign cooperation agreements, which should include the creation of the Euroregion institutional structure. It is necessary to apply a regional approach in the transboundary natural resource management with regional coordinators and to create a network of experts in the field. It is important to create a common observation post for the monitoring and measuring the changes in the environment in order to develop a common vision in transboundary scale

Data for increase of Lymantria dispar male survival after topical application of single-stranded RING domain fragment of IAP-3 gene of its nuclear polyhedrosis virus

This data article is related to the research article entitled “The RING for gypsy moth control: topical application of fragment of its nuclear polyhedrosis virus anti-apoptosis gene as insecticide” [1]. This article reports on significantly higher survival of gypsy moth Lymantria dispar male individuals in response to topical application of single-stranded DNA, based on RING (really interesting new gene) domain fragment of LdMNPV (L. dispar multicapsid nuclear polyhedrosis virus) IAP-3 (inhibitor of apoptosis) gene and acted as DNA insecticide