Historical Contingencies Modulate the Adaptability of Rice Yellow Mottle Virus

The rymv1-2 and rymv1-3 alleles of the RYMV1 resistance to Rice yellow mottle virus (RYMV), coded by an eIF(iso)4G1 gene, occur in a few cultivars of the Asiatic (Oryza sativa) and African (O. glaberrima) rice species, respectively. The most salient feature of the resistance breaking (RB) process is the converse genetic barrier to rymv1-2 and rymv1-3 resistance breakdown. This specificity is modulated by the amino acid (glutamic acid vs. threonine) at codon 49 of the Viral Protein genome-linked (VPg), a position which is adjacent to the virulence codons 48 and 52. Isolates with a glutamic acid (E) do not overcome rymv1-3 whereas those with a threonine (T) rarely overcome rymv1-2. We found that isolates with T49 had a strong selective advantage over isolates with E49 in O. glaberrima susceptible cultivars. This explains the fixation of the mutation T49 during RYMV evolution and accounts for the diversifying selection estimated at codon 49. Better adapted to O. glaberrima, isolates with T49 are also more prone than isolates with E49 to fix rymv1-3 RB mutations at codon 52 in resistant O. glaberrima cultivars. However, subsequent genetic constraints impaired the ability of isolates with T49 to fix rymv1-2 RB mutations at codons 48 and 52 in resistant O. sativa cultivars. The origin and role of the amino acid at codon 49 of the VPg exemplifies the importance of historical contingencies in the ability of RYMV to overcome RYMV1 resistance

Mécanismes de contournement des résistances et évaluation "a priori" de leur durabilité dans l'interaction piment ("capsicum annuum L.") - virus Y de la pomme de terre (PVY)

MONTPELLIER-BU Sciences (341722106) / SudocSudocFranceF

Influence of salinity on growth and mineral nutrition of pepper

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Impact of substrate salinity and root temperature on pepper growth and nutrition

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Introgression d'une résistance polygénique à l'oïdium chez le pêcher Prunus persica à partir d'une espèce sauvage Prunus davidiana

AIX-MARSEILLE2-BU Sci.Luminy (130552106) / SudocSudocFranceF

Influence of sodium chloride on the growth and mineral nutrition of pepper cultivars

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Pressions de sélection exercées par les résistances génétiques du melon sur les populations d'Aphis gossypii

La réponse adaptative de populations de bioagresseurs aux pressions de sélection exercées par les activités agricoles détermine la durabilité des moyens de lutte. Chez le melon, le gène Vat qui confère la résistance à Aphis gossypii étant déployé depuis plus de 10 ans, on craint son contournement. L enjeu est de proposer des éléments stratégiques aux semenciers sur le risque d évolution des pucerons vers la virulence, pour développer de nouvelles variétés avec des résistances durables. Dans le cadre de cette thèse, nous avons : i) Estimé la diversité génétique disponible dans des populations d A. gossypii de différentes régions de production de melon. Elle est structurée géographiquement. La grande diversité observée en France aurait en partie pour origine des évènements de reproduction sexuée suggérant un potentiel évolutif élevé d A. gossypii. ii) Estimé la pression de sélection exercée par différentes combinaisons de résistance (gène Vat et QTL) sur ces populations. Les densités de population sont plus faibles sur les plantes Vat que sur les plantes non Vat et la structure génétique des populations est modifiée dans certaines régions de production quand le gène Vat est présent. Les clones se multipliant sur les plantes Vat ont une forte fitness et le risque de leurs extensions est grand. Aucun effet de QTL de résistance n a été mis en évidence en plein champ. iii) Caractérisé les clones contournant le gène Vat. Nos résultats suggèrent que l adaptation des clones s effectue soit par modification du gène d avirulence du puceron soit par l adaptation du puceron aux effecteurs de la résistance. De nouvelles stratégies de gestion de la résistance Vat sont proposéesThe adaptive response of pest populations to selection pressures exerted by agricultural activities determines the sustainability of control methods. In melon, the Vat gene that confers resistance to Aphis gossypii has been deployed for over 10 years, so there are fears it will be overcome. The challenge is to provide strategic elements to plant breeders, concerning the risk of development of virulent aphids, in order to develop new varieties with durable resistances. In the context of this PhD, we have : i) Estimated the available genetic diversity in populations of A. gossypii from different melongrowing areas. The diversity is structured geographically. The great diversity observed in France would have its origine in part from the events of sexual reproduction, suggesting a high evolutionary potential of A. gossypii. ii) Estimated the selection pressure exerted by different resistance combinations (Vat gene and QTLs) on these populations. Population densities are lower on VatR plants than VatS plants and population genetic structure is altered in certain growing areas when the VatR gene is present. The clones multiplying on VatR plants have good fitness and the risk of their spreading is great. No effect of QTLs has been identified in the field. iii) Characterized the clones overcoming the VatR gene. Our results suggest that the adaptation of clones made either by alteration of the avirulence gene of aphids or by adaptation of aphids toresistance effectors. New strategies for Vat resistance management are proposedAVIGNON-Bib. numérique (840079901) / SudocSudocFranceF

Construction de résistance polygénique assistée par marqueurs (application à la résistance quantitative du piment (Capsicum annuum L.) à phytophthora capsici)

PARIS-AgroParisTech Centre Paris (751052302) / SudocSudocFranceF