Nucleocytoplasmic shuttling of the rabies virus P protein requires a nuclear localization signal and a CRM1-dependent nuclear export signal

AbstractRabies virus P protein is a co-factor of the viral RNA polymerase. It has been shown previously that P mRNA directs the synthesis of four N-terminally truncated P products P2, P3, P4, and P5 due to translational initiation by a leaky scanning mechanism at internal Met codons. Whereas P and P2 are located in the cytoplasm, P3, P4, and P5 are found in the nucleus. Here, we have analyzed the molecular basis of the subcellular localization of these proteins. Using deletion mutants fused to GFP protein, we show the presence of a nuclear localization signal (NLS) in the C-terminal part of P (172–297). This domain contains a short lysine-rich stretch (211KKYK214) located in close proximity with arginine 260 as revealed by the crystal structure of P. We demonstrate the critical role of lysine 214 and arginine 260 in NLS activity. In the presence of Leptomycin B, P is retained in the nucleus indicating that it contains a CRM1-dependent nuclear export signal (NES). The subcellular distribution of P deletion mutants indicates that the domain responsible for export is the amino-terminal part of the protein. The use of fusion proteins that have amino terminal fragments of P fused to β-galactosidase containing the NLS of SV40 T antigen allows us to identify a NES between residues 49 and 58. The localization of NLS and NES determines the cellular distribution of the P gene products

Real-Time Echocardiography Guidance for Optimized Apical Standard Views

Measurements of cardiac function such as left ventricular ejection fraction and myocardial strain are typically based on 2-D ultrasound imaging. The reliability of these measurements depends on the correct pose of the transducer such that the 2-D imaging plane properly aligns with the heart for standard measurement views and is thus dependent on the operator's skills. We propose a deep learning tool that suggests transducer movements to help users navigate toward the required standard views while scanning. The tool can simplify echocardiography for less experienced users and improve image standardization for more experienced users. Training data were generated by slicing 3-D ultrasound volumes, which permits simulation of the movements of a 2-D transducer. Neural networks were further trained to calculate the transducer position in a regression fashion. The method was validated and tested on 2-D images from several data sets representative of a prospective clinical setting. The method proposed the adequate transducer movement 75% of the time when averaging over all degrees of freedom and 95% of the time when considering transducer rotation solely. Real-time application examples illustrate the direct relation between the transducer movements, the ultrasound image and the provided feedback.publishedVersio

Le transport intracellulaire des herpèsvirus

National audienceLe transport intracellulaire des virus est un processus important du cycle viral de par l’encombrement important du cytoplasme et des distances importantes à couvrir entre les différents organelles nécessaires au cycle viral. Ce transport est actif, régulé et passe par le recrutement de la machinerie cellulaire. La problématique du transport est particulièrement importante pour les alpha-herpèsvirus neurotropes dont la capside de grosse taille doit parcourir de grandes distances dans des types cellulaires très spécialisés et topologiquement très différents tels que les neurones et les cellules épithéliales. Cette revue vise à résumer les données accumulées sur les 15 dernières années concernant le transport intracellulaire de ces virus qui font partie des mieux caractérisés dans ce domaine grâce à leur manipulation génétique aisée et leur très grande efficacité de recrutement de la machinerie cellulaire de transport

Implication de la protéine UL25 des alphaherpesvirinae dans la décapsidation (identification de partenaires cellulaires, viraux et rôle dans l'interaction des capsides avec le noyau)

PARIS7-Bibliothèque centrale (751132105) / SudocSudocFranceF

Rôles de la protéine virale pUL47 dans l’excrétion et la transmission horizontale du Virus de la maladie de Marek-MDV

Le MDV est un virus oncogène aviaire très contagieux ayant la poule pour cible majeure. Il provoque le développement, chez les animaux infectés, de lymphomes mortels. Il est retrouvé dans les élevages de poules où son impact reste majeur dans l’économie avicole (1 à 2 milliards de dollars de pertes économiques liées au MDV chaque année). Une prévention vaccinale contre ce virus est établie depuis les années 1960 et permet de prévenir l’apparition des lymphomes. Cependant, leur utilisation n’empêche pas la dissémination des souches virales dans les élevages, aussi un animal vacciné s’il s’infecte par un virus pathogène réplique et excrète le virus, sans développer la maladie.Le MDV possède un tropisme particulier pour les follicules plumeux à partir desquels le virus est disséminé de manière exclusive dans le milieu extérieur engendrant ainsi la transmission de l’infection entre animaux.L’objectif du projet vise à identifier les mécanismes liés à la transmission horizontale spécifique du MDV. L’étude de ces mécanismes est primordiale afin de définir une stratégie de lutte efficace contre la dissémination du MDV. Ainsi l’axe principal d’étude repose sur l’étude de l’implication de la protéine virale pUL47 au niveau de la dissémination virale du MDV. En effet, cette protéine virale a été récemment identifiée comme essentielle pour la transmission horizontale du virus. La régulation du mécanisme de transmission serait liée étroitement à l’épissage alternatif des transcrits viraux impliqués dans la transmission (gC, pUL47).L’identification de ces mécanismes reliant l’épissage des transcrits viraux à la transmission du virus entre animaux encouragent l’approfondissement des recherches liant les protéines virales identifiées à un rôle déterminant dans la dissémination du MDV.Le potentiel lié aux résultats obtenus permettrait de définir de nouvelles stratégies de lutte via l’optimisation de souches vaccinales ne disséminant pas dans le milieu extérieur permettant ainsi un meilleur contrôle du MDV

La microscopie à super-résolution révèle une organisation différentielle des glycoprotéines virales de HSV-1 à la surface des virions

National audienc

Rôle des protéines PUL47 et PUL48 dans le tropisme viral et la transmission du virus de la maladie de Marek

National audienc

Herpesvirus Capsid Association with the Nuclear Pore Complex and Viral DNA Release Involve the Nucleoporin CAN/Nup214 and the Capsid Protein pUL25▿

After penetrating the host cell, the herpesvirus capsid is transported to the nucleus along the microtubule network and docks to the nuclear pore complex before releasing the viral DNA into the nucleus. The viral and cellular interactions involved in the docking process are poorly characterized. However, the minor capsid protein pUL25 has recently been reported to be involved in viral DNA uncoating. Here we show that herpes simplex virus type 1 (HSV-1) capsids interact with the nucleoporin CAN/Nup214 in infected cells and that RNA silencing of CAN/Nup214 delays the onset of viral DNA replication in the nucleus. We also show that pUL25 interacts with CAN/Nup214 and another nucleoporin, hCG1, and binds to the pUL36 and pUL6 proteins, two other components of the herpesvirus particle that are known to be important for the initiation of infection and viral DNA release. These results identify CAN/Nup214 as being a nuclear receptor for the herpesvirus capsid and pUL25 as being an interface between incoming capsids and the nuclear pore complex and as being a triggering element for viral DNA release into the nucleus