Identification of yeasts present in artisanal yoghurt and traditionally fermented milks consumed in the northern part of Cameroon

Bacteria generally ferment milk but, sometimes, yeasts are found in fermented milks. The presence of these yeasts in the microbial community of some fermented milks could be intentional or accidental. The Diversity of yeasts in the products was investigated using a molecular technique employing variable regions of 26S rDNA profiles generated by PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Two types of samples: artisanal or handcraft yoghurt and traditionally fermented milks were collected in three towns of the three regions of the northern part of Cameroon. Firstly, a comparison was made between the 16 traditionally fermented milks collected in Maroua, Garoua and Ngaoundre each of the 3 regions. Secondly, it was between 26 artisanal fermented milks of each region and finally, between the two types of products. The different PCR-DGGE 26S rDNA profiles obtained were analyzed and DNA sequencing was used to compare yeasts from each method of production. Twelve (12) species of Yeasts were identified as: Malassezia globosa, Hanseniaspora uvarum, Galactomyces candidum, Candida tropicalis, Aureobasidium pullulans, Torulaspora globosa, Saccharomyces cerevisiae/paradoxus, Pichia kluyveri, Candida parapsilosis, Torulaspora delbrueckii, Kluyveromyces marxianus, Candida orthopsilosis and Pseudozyma sp. Yeast diversity was higher for artisanal fermented milks (yoghurt) with at least 10 species, while for traditionally non packed fermented milks only 5 species were identified with a predominance strain of Galactomyces candidum, Candida parapsilosis, Torulaspora delbrueckii, Saccharomyces cerevisiae/paradoxus and Kluyveromyces marxianus. The different species of yeast might be introduced accidentally in artisanal yoghurt; however, for traditionally fermented milks their presence might be associated to the starter

Application of PCR-DGGE in determining food origin : cases studies of fish and fruits

The determination of geographical origin is a demand of the traceability system of import-export food products. For this purpose, molecular techniques employing 16S, 26S rDNA profiles generated by PCR-DGGE (polymerase chain reaction - denaturing gradient gel electrophoresis) were used to detect the variation in microbial community (bacteria, yeast) structures of Pangasius fish from Viet Nam harvested in different aquaculture farms and during different seasons and two fruits Physalis from Egypt and mandarins from Spain and Morocco. In Physalis case, ecology of yeasts was also studied for the same purpose. Bacterial band profiles of fish and mandarins, and yeast band profiles of Physalis were specific for each location and could be used as a bar code to certify the origin of fish and fruits. This method is a new traceability tool which provides food with a unique biological bar code and makes it possible to trace back the food to their original location. (Résumé d'auteur

Nouvelles stratégies de traçabilité pour déterminer l'origine géographique des fruits : création d'un code barre biologique par PCR-DGGE

La détermination de l'origine géographique est une demande du système de traçabilité des denrées alimentaires d'import-export. Une hypothèse de retrouver la source d'un produit est en analysant de façon globale les communautés microbiennes de la nourriture et des liens statistiquement cette analyse à l'origine géographique des produits alimentaires (Montet et al., 2004). La technique moléculaire employant rADN 26S profils générés par PCR-DGGE a été utilisée pour détecter la variation dans les structures communautaires de levure de fruits (El Sheikha et al., 2009). Nous avons appliqué cette nouvelle technique sur des fruits Physalis de trois pays (Égypte, Colombie, Ouganda) et sur le karité à partir de quatre pays (Cameroun, Mali, Sénégal, Ouganda). Les gels DGGE ont montré des différences significatives dans les schémas de migration. Toutefois, les doublons pour chaque point d'échantillonnage donne statistiquement les modèles DGGE similaires à travers l'étude. Nous avons démontré qu'il y avait un lien entre les populations de levures et l'aire géographique. Lorsque rADN 26S des profils ont été analysés par analyse multivariée, distinct des communautés microbiennes ont été détectés. Les profils de bande de différents pays étaient différentes et sont spécifiques pour chaque pays et pourrait être utilisé comme un code-barres de discriminer l'origine des fruits. Cette méthode est un outil de traçabilité qui offre de nouveaux produits fruitiers avec un code-barre unique et permet de retracer les fruits dans leur pays d'origine. Physalis est inclus dans la liste prioritaire de l'horticulture de nombreux gouvernements et d'exportation de fruits. Il est exporté dans plusieurs pays comme la Colombie, l'Egypte, le Zimbabwe et l'Afrique du Sud, mais la Colombie se distingue comme l'un des plus grands producteurs, consommateurs et exportateurs. Les exportations de la Colombie de Physalis en 2004 ont une valeur de 14 millions d'USD (El Sheikha et al., 2008a). En Egypte, l'importance économique de Physalis est en hausse, en raison, la réalisation d'un grand succès en arabe local, et les marchés européens (El Sheikha, 2004). Physalis que la plante a de nombreuses propriétés médicinales, y compris les antipyrétiques, dépuratif, diurétique, pectoral, et vermifuge. Une décoction est utilisée dans le traitement des abcès, toux, fièvre ou mal de gorge (Duke et Ayensu 1985). La pulpe est nutritif, contenant des niveaux particulièrement élevés de caroténoïdes, des minéraux, acides aminés essentiels et en vitamine C (El Sheikha et al., 2008b). En ce qui concerne les fruits des arbres de karité, seuls sept pays ont des statistiques. Nigeria compte plus de 60% de la production de beurre de karité en 2005. Il est suivi par le Mali, le Ghana et le Burkina Faso, qui représentent ensemble un peu moins du tiers de la production mondiale en 2005. En Europe, le beurre de karité est utilisé principalement (95%) par l'industrie du chocolat. Les quantités exportées vers le Japon, les États-Unis ou la Suisse serait principalement utilisé pour les cosmétiques ou pharmacologiques (FAOSTAT, 2007). (Texte intégral

Utilisation de la PCR-DGGE dans la détermination d'origine : exemples d'applications sur les fruits et les poissons

La détermination de l'origine géographique est une exigence du système de traçabilité de l'import-export de produits alimentaires. Pour ce faire, les techniques moléculaires employant 16S, 26S rDNA profils générés par PCR-DGGE ont été utilisés pour détecter la variation de la communauté microbienne (bactéries, levures) structures de Pangasius poisson, du Viet Nam récoltés dans différentes fermes d'aquaculture et au cours des différentes saisons et deux Physalis fruits en provenance d'Égypte et de mandarines en provenance de l'Espagne et le Maroc. En cas Physalis, l'écologie de la levure a aussi été étudiée dans le même but. Bacterial bande profils de poissons et de mandarines, de levure et de la bande de Physalis profils spécifiques pour chaque endroit et peuvent être utilisés comme un code barre afin de certifier l'origine du poisson et des fruits. Cette méthode est un nouvel outil de traçabilité, qui fournit de la nourriture biologique unique avec un code à barres et permet de retracer la nourriture à leur emplacement d'origine. (Texte intégral

Fungal llora and ochratoxin a associated with coffee in Cameroon

Aims: 104 samples were collected from the west region and the coastal plain of Cameroon during two coffee campaigns, 2009 and 2010. Two coffee processes were evaluated (wet and dry processes) at different stages from harvesting to storage. Study Design: Food contaminants. Place and Duration of Study: Food Microbiology Laboratory, Department of Food Science and Nutrition (ENSAI) University of Ngaoundere; UMR 95 Qualisud, CIRAD of Montpellier, between May 2009 and September 2012. Methodology: Fungi profile was evaluated by direct plating techniques and identified using morphological and molecular tools. OTA levels were analyzed using HPLC technique after extraction and filtration using an immunoaffinity column. Results: Results obtained revealed an overall percentage of fungal contamination between 60-92% in 2009 and 70-90% in 2010. There was no ecological difference in the composition of ochratoxigenic species present in five sites. Coffee beans sampled in 2009 had a colonization incidence of 18-40% A. carbonarius, 12-22% A. niger, 3-15% A. ochraceus while those of 2010 had a colonization incidence of 15-30% A. carbonarius, 35-40% A. niger, and 2-7% A. ochraceus. Fungal diversity was not correlated with the geographical origin, coffee cultivar and processing method. There was no difference between the processes studied in terms of occurrence of ochratoxigenic fungi. OTA levels were mostly below the recommended standards although some isolated cases of extreme contamination were observed in 2009. A higher level of OTA was detected in the presence of A. niger, A. carbonarius and A. ochraceus than when only A. niger was present. Conclusion: The important fungi with the potential to produce OTA in Cameroonian coffee beans are A. carbonarius and A. niger. These two species were predominant on each type of coffee beans. It was also observed that once a toxigenic strain was isolated from a coffee sample, the sample contained OTA. (Résumé d'auteur

Application de la PCR - DGGE dans la détermination des aliments d'origine cas : Pangasius du poisson en provenance du Viet Nam et graines de karité de l'Afrique Sub saharienne. [Présentation orale]

La détermination de l'origine géographique est une exigence du système de traçabilité lors de l'importation-exportation des produits alimentaires. Une hypothèse pour localiser la source d'un produit est d'analyser de façon globale les communautés microbiennes présentes sur l'aliment et de relier cette analyse à l'origine géographique des aliments. La technique moléculaire utilisant les profils générés par PCR-DGGE du rADN 16S, 26S ont été optimisée pour détecter les variations communautaires des (bactéries, levures) structures de Pangasius poisson du Viet Nam récoltés dans différentes fermes d'aquaculture et au cours des différentes saisons et de graines de karité provenant de trois régions du Sénégal. Les profils ADN des différents locations sont différents et suffisamment spécifiques de chaque lieu de prélèvements pour être utilisés comme un code-barre de discrimination de l'origine des poissons et fruits. Cette méthode est un nouvel outil de traçabilité qui offre aux produits fruitiers un code-barre unique et permet donc de relier l'environnement microbien des poissons et fruits à leur origine géographique. (Texte intégral

Evaluation of an alternative spectroscopic approach for aflatoxin analysis: Comparative analysis of food and feed samples with UPLC-MS/MS

Increasing research has highlighted the effects of changing climates on the occurrence and prevalence of toxigenic Aspergillus species producing aflatoxins. There is concern of the toxicological effects to human health and animal productivity following acute and chronic exposure that may affect the future ability to provide safe and sufficient food globally. Considerable research has focused on the detection of these toxins, based on the physicochemical and biochemical properties of the aflatoxin compounds, in agricultural products for human and animal consumption. As improvements in food security continue more regulations for acceptable levels of aflatoxins have arisen globally; the most stringent in Europe. These regulations are important for developing countries as aflatoxin occurrence is high significantly effecting international trade and the economy. In developed countries analytical approaches have become highly sophisticated, capable of attaining results with high precision and accuracy, suitable for regulatory laboratories. Regrettably, many countries that are affected by aflatoxin contamination do not have resources for high tech HPLC and MS instrumentation and require more affordable, yet robust equally accurate alternatives that may be used by producers, processors and traders in emerging economies. It is especially important that those companies wishing to exploit the opportunities offered by lucrative but highly regulated markets in the developed world, have access to analytical methods that will ensure that their exports meet their customers quality and safety requirements. This work evaluates the ToxiMet system as an alternative approach to UPLC–MS/MS for the detection and determination of aflatoxins relative to current European regulatory standards. Four commodities: rice grain, maize cracked and flour, peanut paste and dried distillers grains were analysed for natural aflatoxin contamination. For B1 and total aflatoxins determination the qualitative correlation, above or below the regulatory limit, was good for all commodities with the exception of the dried distillers grain samples for B1 for which no calibration existed. For B1 the quantitative R2 correlations were 0.92, 0.92, 0.88 (<250 μg/kg) and 0.7 for rice, maize, peanuts and dried distillers grain samples respectively whereas for total aflatoxins the quantitative correlation was 0.92, 0.94, 0.88 and 0.91. The ToxiMet system could be used as an alternative for aflatoxin analysis for current legislation but some consideration should be given to aflatoxin M1 regulatory levels for these commodities considering the high levels detected in this study especially for maize and peanuts. (Résumé d'auteur

The success story of the implementation of the national food safety agency in Ivory Coast

The 3C Ivoire EuropeAid project (2011–2015), set up a coordination committee in Ivory Coast to evaluate the effectiveness of sanitary controls, prevent sanitary risks and coordinate nationwide actions on food safety [1]. This paper reports main findings: difficulties to apply regulations in Ivory Coast, to establish a national food safety agency, to implement a national health surveillance system, to set up a potential food safety label, training on food safety systems (HACCP, traceability, good hygiene practices), first experimental committee of national experts. Ivoirians are concerned by food safety hazards. All food samples collected in markets were contaminated by pathogens. Three of the main food consumed in the country: rice, maize, peanut were contaminated with mycotoxins, and aflatoxin levels in peanut paste were well above the EU limits. The decree creating the Ivorian agency was signed in late June 2016. (Résumé d'auteur

Assessment of the risk factors associated to aflatoxin contamination during the marketing of peanuts in Côte d'Ivoire

This study was conducted to assess the different risk factors related to practices of sale of peanuts for better control of aflatoxin contamination and also to improve the safety of peanuts during marketing. The sales practices are similar regardless of the area surveyed. Of all the respondents in this survey, 61.7% were men as against 38.3% women and 70% of the respondents do not have any formal education. The marketing of peanut seeds is generally an activity done by men (100%) while that of peanut paste is assigned to women (100%). The unsold peanut paste is kept from 1 day to 3 months at room temperature until sale, mainly in market stalls used to sell it (42.4%) or in stores (39.4%). The losses are mainly due to fungi (37.9%) and insects (13.6%) followed by humidity and high temperature (4.5%). During sale of peanut paste, the site, the surroundings of sales points and the storage containers are potential fungi growth factors and eventual risk points for mycotoxin contamination. Proper handling and hygiene might reduce the aflatoxin contamination of peanut to ensure better sanitary quality of peanuts and protect consumer's heath

Évaluation des pratiques post récolte favorables à la contamination de l’arachide par les mycotoxines dans trois régions de Côte d’Ivoire

Objectif: Les techniques post récoltes jouent un rôle déterminant dans la contamination de l’arachide par les aflatoxines. Cette étude a pour objectif de contribuer à réduire la contamination de l’arachide par les aflatoxines en Côte d’Ivoire par l’identification des pratiques post récoltes à risque.Méthodologie et résultats: Un questionnaire a permis de recueillir les renseignements sur lesdites pratiques dans trois régions : nord, centre et ouest. Le séchage de l’arachide se fait au soleil quel que soit la localité et dure en moyenne 4 à 14 jours. Les arachides sont séchées et conservées en coques dans le nord. Dans les zones de centre et ouest, les gousses sont soit séchées puis décortiquées, soit décortiqués avant séchage. Le stockage des graines ou des gousses se fait dans des sacs en polyéthylène dans les maisons (86%) ou en vrac dans des greniers (14%). La récolte peut être conservée jusqu’à 9 mois avant consommation ou vente. 58,1% des productrices ont des pertes dues à l’effet des moisissures. La contamination fongique de l’arachide s’opère dans 55,8 % des cas, durant le séchage et le stockage, et dans 34,9 % des cas au cours de l’apparitiondes fleurs au champ.Conclusion et application des résultats: Les étapes de séchage et de stockage représentent un risque de contamination par les aflatoxines. Une maitrise des techniques post récolte permettrait de réduire la contamination par les aflatoxines. Il ressort de cette étude qu'une formation des productrices aux bonnes pratiques de production réduirait la contamination parcours aflatoxines.Mots clés: post-récolte, séchage, conservation, arachide, aflatoxinesEnglish Title: Evaluation of post-harvest practices favorable to the contamination of peanut by mycotoxins in three regions of Côte d'IvoireEnglish AbstractObjective: Post harvest techniques take a decisive role in peanuts by aflatoxins contamination. The aim of this study is to help to reduce aflatoxin contamination of groundnuts in Côte d'Ivoire by identifying post-harvest practices at risk.Methodology and results: A survey permit to collect information on post-harvest practices in three regions: north, center and west. Peanuts are dried at sun whatever the locality and lasts on average 4 to 14 days. Peanuts are dried and kept in pods in the north. In the central and western areas, pods are either dried and then shelled, or shelled before drying. The storage of seeds or pods is done in polythene bags in homes (86%) or bulk in granaries (14%). Peanuts can be kept until 9 months before consumption or sale. 58.1% of producers have losses due to effect of molds. Fungal contamination of peanuts occurs in 55.8% of cases, during drying and storage, and in 34.9% of cases during flowering in the field.Conclusion and application of results: Drying and storage stages represent a risk of contamination by aflatoxins. Mastering post-harvest techniques would reduce aflatoxin contamination. This study shows that training producers in good production practices would reduce aflatoxin contamination.Keywords: post-harvest, drying, storage, peanut, aflatoxin