mplot: An R Package for Graphical Model Stability and Variable Selection Procedures

The mplot package provides an easy to use implementation of model stability and variable inclusion plots (M\"uller and Welsh 2010; Murray, Heritier, and M\"uller 2013) as well as the adaptive fence (Jiang, Rao, Gu, and Nguyen 2008; Jiang, Nguyen, and Rao 2009) for linear and generalised linear models. We provide a number of innovations on the standard procedures and address many practical implementation issues including the addition of redundant variables, interactive visualisations and approximating logistic models with linear models. An option is provided that combines our bootstrap approach with glmnet for higher dimensional models. The plots and graphical user interface leverage state of the art web technologies to facilitate interaction with the results. The speed of implementation comes from the leaps package and cross-platform multicore support.Comment: 28 pages, 9 figure

Recherche d’informations médicales sur mobile

MedSearch Mobile est un système de recherche basé tant sur de la recherche textuelle que visuelle d’informations issues de la littérature scientifique de BioMedCentral. Cette solution a été développée pour permettre d’accéder à cette littérature depuis un smartphone. Un scénario basé sur le Web a été choisi pour permettre l’utilisation de cette application indépendamment de sa plateforme. Plusieurs contraintes liées à la taille de l’écran à la navigation avec un écran tactile ont été étudiées et prisent en compte lors du développement

Ist GMI bei CRPS Typ I bezüglich des Leitsymptoms Schmerz besser geeignet als herkömmliche Therapieformen?

Darstellung des Themas: CRPS ist eine facettenreiche Krankheit mit Schmerz als Leitsymptom. So vielfältig die Erscheinungsformen von CRPS sind, so unterschiedlich sind auch die physiotherapeutischen Behandlungsmöglichkeiten. Eine Gruppe um Lorimer Moseley hat das Rehabilitationsprogramm GMI entwickelt. Ziel: Das Ziel der Studie ist es, die Anwendbarkeit von GMI auf Patientinnen und Patienten mit CRPS Typ I und dem Leitsymptom Schmerz darzustellen, einen Vergleich zu herkömmlichen Therapieformen zu ziehen und einen Ausblick auf die Weiterentwicklung möglicher therapeutischer Ansätze zu geben. Als Leitfaden zur praktischen Anwendung von GMI wurde ein Handout in deutscher Sprache erstellt. Methode: In den Datenbanken PubMED, CINAHL, AMED, PEDro und Cochrane wurde nach geeigneten Studien gesucht. Nach Berücksichtigung von Ein- und Ausschlusskriterien wurden sieben Studien zur Beantwortung der Fragestellung verwendet. Die Studien wurden mit dem Arbeitsinstrument AICA analysiert und mit PEDro und Letts & Law evaluiert. Relevante Ergebnisse: Bei der Anwendung von GMI als Zusatz zu herkömmlichen Therapiemethoden zeigt sich ein signifikant höheres Outcome bezüglich des Leitsymptoms Schmerz. Schlussfolgerung: Aufgrund limitierter Studienzahl und Studiendiversität sollten die Ergebnisse jedoch kritisch betrachtet werden. Es braucht weitere Forschung, um das Verständnis der Thematik zu verbessern und die Evidenz zu bestätigen. Wichtig erscheint auch zusätzliche Forschung im praktischen Setting.Background: CRPS is a multifaceted disease with pain as a cardinal sign. Equally diverse as the manifestations of CRPS are the physiotherapeutic treatment options. A group working with Lorimer Moseley developed the GMI rehabilitation programme. Objectives: The aim of the study is to demonstrate the applicability of GMI on patients with CRPS type I and pain as a cardinal sign, to draw a comparison to conventional forms of therapy and to give an outlook on future developments in therapeutic approaches. As a practical guideline for GMI, a handout was produced. Methods: The research of suitable studies was conducted in the PubMED, CINAHL, AMED, PEDro and Cochrane databases. With the application of inclusion and exclusion criteria, seven studies were selected to answer the question. The studies were analysed with AICA and evaluated with PEDro and Letts & Law. Main results: When GMI was used as an adjunct to conventional therapy methods, the outcome variable ‘pain’ was significantly reduced. Conclusion: Due to the limited number of studies and their lack of diversity, the results have to be viewed critically. Further research is needed to better understand the subject and to confirm the evidence. Additional research in a practical environment is considered to be of importance

Iterative Estimation of the Extreme Value Index

Let {Xn, n ≥ 1} be a sequence of independent random variables with common continuous distribution function F having finite and unknown upper endpoint. A new iterative estimation procedure for the extreme value index γ is proposed and one implemented iterative estimator is investigated in detail, which is asymptotically as good as the uniform minimum varianced unbiased estimator in an ideal model. Moreover, the superiority of the iterative estimator over its non iterated counterpart in the non asymptotic case is shown in a simulation stud

Structural studies of hydrated samples of amorphous calcium phosphate and phosphoprotein nanoclusters

There are abundant examples of nanoclusters and inorganic microcrystals in biology. Their study under physiologically relevant conditions remains challenging due to their heterogeneity, instability, and the requirements of sample preparation. Advantages of using neutron diffraction and contrast matching to characterize biomaterials are highlighted in this article. We have applied these and complementary techniques to search for nanocrystals within clusters of calcium phosphate sequestered by bovine phosphopeptides, derived from osteopontin or casein. The neutron diffraction patterns show broad features that could be consistent with hexagonal hydroxyapatite crystallites smaller than 18.9 Å. Such nanocrystallites are, however, undetected by the complementary X-ray and FTIR data, collected on the same samples. The absence of a distinct diffraction pattern from the nanoclusters supports the generally accepted amorphous calcium phosphate structure of the mineral core