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Genomic Analysis of Immune Response against Vibrio Cholerae Hemolysin in Caenorhabditis elegans
Vibrio cholerae cytolysin (VCC) is among the accessory V. cholerae virulence factors that may contribute to disease pathogenesis in humans. VCC, encoded by hlyA gene, belongs to the most common class of bacterial toxins, known as poreforming toxins (PFTs). V. cholerae infects and kills Caenorhabditis elegans via cholerae toxin independent manner. VCC is required for the lethality, growth retardation and intestinal cell vacuolation during the infection. However, little is known about the host gene expression responses against VCC. To address this question we performed a microarray study in C. elegans exposed to V. cholerae strains with intact and deleted hlyA genes. Many of the VCC regulated genes identified, including C-type lectins, Prion-like (glutamine [Q]/asparagine [N]-rich)-domain containing genes, genes regulated by insulin/ IGF-1-mediated signaling (IIS) pathway, were previously reported as mediators of innate immune response against other bacteria in C. elegans. Protective function of the subset of the genes up-regulated by VCC was confirmed using RNAi. By means of a machine learning algorithm called FastMEDUSA, we identified several putative VCC induced immune regulatory transcriptional factors and transcription factor binding motifs. Our results suggest that VCC is a major virulence factor, which induces a wide variety of immune response- related genes during V. cholerae infection in C. elegans
Rythmes de travail imposés et douleurs aux coudes, effets directs et indirects, rôle des facteurs psycho-sociaux et biomécaniques
Objectifs
Évaluer les effets directs et indirects du rythme de travail imposé sur les douleurs aux coudes (DoulC).
MĂ©thodes
On dispose de données sur 3710 salariés qui ont participé à un programme de surveillance des troubles musculo-squelettiques (TMS) dans la région Pays de la Loire entre 2002 et 2005 (réseau pilote de surveillance des TMS). Lors d’examens cliniques standardisés, 83 médecins du travail ont diagnostiqué les éventuels TMS, dont la présence de douleurs au niveau de l’épicondyle (DoulC). Les expositions professionnelles (rythme de travail imposé, effort important combiné aux mouvements répétitifs aux coudes, tâches répétitives, faible soutien social, faible latitude décisionnelle) et les facteurs personnels (âge, sexe, indice de masse corporel) ont été évalués par auto-questionnaire. Les associations univariées entre les DoulC et les facteurs de risques ont été quantifiées par des odds ratios (ORs) issus de modèles logistiques. La part directe et indirecte de l’association avec le rythme de travail imposé sur les DoulC a été estimée par un modèle à équations structurelles (EQ) et par des calculs causaux basés sur une méthode proposée par Van Der Weele et al. de 2014 (méthode VDW).
RĂ©sultats
L’OR entre le rythme de travail imposé et les DoulC est de 1,49 [1,22;1,82] (en comparaison, l’OR pour « faible soutien social » est 1,30 [1,07;1,58] et pour les efforts combinées aux mouvements aux coudes, 1,94 [1,59;2,36]). La part de l’association entre le rythme de travail imposé et les DoulC médiée par les autres facteurs professionnels est estimée à 36,5 % [14,1 %;59,0 %] par la méthode EQ et à 30,6 % [15,7 %;57,0 %] par la méthode VDW. Dans l’analyse EQ, cette association indirecte est principalement expliquée par l’association passant par les facteurs biomécaniques (correspondant à 82,1 % [44,4 %;119,9 %] de l’effet indirect).
Conclusions
Cette analyse exploratoire basée sur des données transversales donne des pistes pour l’évaluation des différents mécanismes causaux à l’origine des liens entre les facteurs organisationnels et les TMS. L’effet du rythme de travail est certes plus faible que celui des contraintes biomécaniques, il est cependant significatif. Les résultats montrent qu’une intervention visant à diminuer la fréquence de l’exposition aux rythmes de travail imposés aurait un effet direct et aussi indirect sur les douleurs par la diminution des expositions professionnelles psychosociales et biomécaniques
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