АНАЛИЗ ДИНАМИКИ КОЭФИЦИЕНТА ПЕРЕХОДА ЦЕЗИЯ-137 В ГРИБЫ ПОСЛЕ АВАРИИ НА ЧАЭС КАК ОСНОВЫ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ПРОГНОЗНОЙ МОДЕЛИ

In the present paper shows the analysis of the available data on levels of concentrations and aggregative transfer factors (TFag) of 137Cs from soil to different species of mushrooms growing in the contaminated areas of the Bryansk region, which is used to improve predictive models for estimation the expected levels and the expected values of TFag and planning of further research.В представленной  статье показан анализ имеющегося массива данных по уровням содержания и коэффициентам перехода (КП) 137Cs из почвы в грибы разных видов, произрастающих на загрязненных территориях Брянской области, который используется для уточнения параметров прогностической модели оценки ожидаемых уровней и ожидаемых значений КП, а также разработки плана дальнейшего исследования

Role of brain natriuretic peptide in the pathogenesis of resistant hypertension

Modern medicine has successfully used the N-terminal pro-brain natriuretic peptide (NT-proBNP) as a biomarker for many cardiovascular diseases (CVDs). According to a number of studies, NT-proBNP may also play a role in the development of resistant hypertension (RH), but the existing work addresses this issue only indirectly. In turn, RH causes serious damage to the economic and social spheres, worsening the quality of life of patients. Thus, the complexity of verification and treatment of RH, the inconsistency of the described associations of NT-proBNP and RH makes this topic more relevant than ever

SNP-Based Chromosomal Microarray Analysis for Detecting DNA Copy Number Variations in Fetuses with a Thickened Nuchal Fold

The aim of the study was to assess the diagnostic potential of SNP-based chromosomal microarray analysis for detecting pathogenic copies number variations (CNVs) in fetuses with a normal karyotype, in which an increase in the nuchal translucence of >2.5 mm was detected by ultrasound at a gestational age of 11 weeks to 13 weeks 6 days. MATERIALS AND METHODS: The study included 225 pregnant women who underwent invasive prenatal diagnostic procedures following the detection of an isolated thickening of the fetal nuchal fold. The fetal material obtained was examined using a cytogenetic test; if a normal karyotype was confirmed, chromosomal microarray analysis was performed as a second-line test. RESULTS: Pathogenic CNVs were detected in 22 of 225 fetuses (9.8%) with a normal karyotype. Of these 22 fetuses, pathogenic CNVs not classified as syndromes were detected in 14 cases (63.6%), and those previously described as syndromes — in 8 cases (36.4%). In 9 fetuses (41%), CNVs in two non-homologous chromosomes were determined; these findings indicated a high likelihood of carrying balanced translocations in the parents. Indeed, when analyzing the parent’s karyotype, in 8 out of 9 couples, balanced translocations were found in one of the parents. CONCLUSION: Using chromosomal microarray analysis in fetuses with a thickened nuchal fold makes it possible to increase the ability to detect chromosomal imbalances, including those caused by pathological meiotic segregation of parental reciprocal translocation

Lipidic cubic phase serial millisecond crystallography using synchrotron radiation.

Lipidic cubic phases (LCPs) have emerged as successful matrixes for the crystallization of membrane proteins.Moreover, the viscous LCP also provides a highly effective delivery medium for serial femtosecond crystallography (SFX) at X-ray free-electron lasers (XFELs). Here, the adaptation of this technology to perform serial millisecond crystallography (SMX) at more widely available synchrotron microfocus beamlines is described. Compared with conventional microcrystallography, LCP-SMX eliminates the need for difficult handling of individual crystals and allows for data collection at room temperature. The technology is demonstrated by solving a structure of the light-driven protonpump bacteriorhodopsin (bR) at a resolution of 2.4 A ° . The room-temperature structure of bR is very similar to previous cryogenic structures but shows small yet distinct differences in the retinal ligand and proton-transfer pathway

Epizootic Activity of Natural Plague Foci in the Territory of the Russian Federation in 2011, and Prognosis for 2012

Carried out is the assessment of epizootic activity of natural plague foci in the Russian Federation and in the Republic of Kazakhstan during the period of 2000-2010. It is specified that 38 plague microbe strains have been isolated in the territory of the Russian Federation, the total area of epizooties being 882,5 km2. Plague microbe strains are isolated in the territory of East-Caucasian high-mountain and Altai mountain natural foci. Identified are the reasons of low epizootic activity of plain and low-mountain natural plague foci in the Russian Federation. Outlined is the role of climatic factors in the development of current intense depression in numbers of carriers and vectors of plague. Put forward is the prognosis on the low epizootic activity of the natural plague foci in the Russian Federation in 2012. It is substantiated that the emergence of local epizooties in 2012 is to take place in the territory of Altai mountain, Tuvin mountain and East-Caucasian high-mountain natural plague foci

Comparative review of methods for diagnosing chromosomal abnormalities in fetuses with malformations and / or echographic markers of chromosomal pathology

The article presents a comparative analysis of methods used for the diagnosis of genetic pathology in fetuses with malformations and / or developmental abnormalities. The standard cytogenetic analysis of the karyotype is most widely implemented and used, however, the low resolution of this method in 8Mb does not allow for the detection of microdeletions and microduplications, which in turn in 5-6% of cases are the causes of malformations and / or developmental abnormalities in the fetus. When using chromosomal microarray analysis (CMA) it increases the diagnostic efficacy of prenatal diagnosis, which allows making a diagnosis in a timely manner, determining the prognosis for the life of the child after birth. The choice of method for diagnosing genetic pathology in fetuses with congenital malformations and / or developmental abnormalities is currently not regulated and is often based on the technical capabilities of the laboratory. At the moment, a large amount of data has been accumulated confirming the effectiveness of the use of SNP microarrays compared to classical cytogenetic methods.В статье представлен сравнительный анализ методов, применяемых для диагностики хромосомных аномалий у плодов, имеющих пороки развития и/или эхографические маркеры хромосомной патологии. Наиболее широко внедрен и используется стандартный цитогенетический анализ кариотипа, однако небольшая разрешающая способность данного метода в 8Мb не позволяет выявлять микроделеции, микродупликации, которые в свою очередь в 5-6% случаев являются причинами пороков и/или аномалий развития у плода. Применение хромосомного микроматричного анализа (ХМА) увеличивает диагностическую эффективность пренатальной диагностики, и позволяет своевременно поставить диагноз, определив прогноз для жизни ребенка после рождения. Выбор метода диагностики генетической патологии у плодов с ВПР и/или аномалиями развития на данный момент ничем не регламентирован и зачастую основан на технических возможностях лаборатории. На данный момент, накоплен большой массив данных, подтверждающих эффективность применения SNP-микроматриц по сравнению с классическими цитогенетическими методами

Data-Based Approach to Educational Programs Quality Management

Цель данной статьи – описание и обоснование подхода к управлению качеством образовательных программ, разработанного и апробированного в Университете ИТМО начиная с 2019 года. В статье представлены основные индикаторы оценки и результаты апробации данного подхода в университете. Основной единицей качества является образовательная программа. Она имеет продолжительный жизненный цикл и отвечает запросам большинства стейкхолдеров университета. С учетом всех особенностей образовательной программы предлагается комплексный набор показателей для оценки ее качества, что дает возможность объективно управлять ею на основе полученных данных. Для анализа жизненного цикла образовательной программы разработан внутренний рейтинг и представлены примеры рекомендаций по его итогам. Описаны преимущества подхода управления образовательными программами, представлены пути по дальнейшему развитию. Статья может быть интересна руководителям и управленческим командам высших учебных заведений, а также исследователям в области высшего образования.The purpose of this article is to describe and justify the approach to assessing the quality of educational programs that have been developed and tested at ITMO University since 2019. The article presents the main indicators of assessment and the results of testing this approach at the university. The main unit of quality is an educational program, as it has a long-life cycle and meets the needs of most stakeholders of the educational organization. Taking into account all the features of an educational program, the authors propose a comprehensive set of indicators to assess its quality, which makes it possible to objectively manage it data-based. In conclusion, for completing the task of analyzing the life cycle of an educational program, the authors present an internal rating of educational programs, concise examples of recommendations based on its results. The advantages of the approach to managing educational programs are described, and ways for further development are presented. The article may be of interest to the managers and management teams of institutions of higher education, as well as to the researchers in this field

Локальный туберкулез у детей раннего возраста

The purpose is to study clinical and X-ray manifestations of local tuberculosis in children of the tender age and to detect risk factors promoting the development of the disease and complicating it, thus the analysis included 82 cases of children cases under 3 years old who had been treated in Children TB Hospital in 2013-2015. Tuberculosis of chest lymph nodes was diagnosed in 68.3%of them, and every fifth child had primary tuberculosis complex. Every other child was suffering from the complicated course of local tuberculosis (n = 42). The following forms were registered: bronchial pulmonary lesions (n = 27), lymphogenic progression (n = 13), including development of disseminated tuberculosis and meningitis. Positive results of sputum tests were observed in 14 (17.1%) children, of them 50% had multiple drug resistance. 10% of children suffering from tuberculosis manifested anergy. The predictors of such course of the disease included the absence of BCG vaccination and super infection with Mycobacterium tuberculosis.С целью изучения клинико-рентгенологических проявлений локального туберкулеза у детей раннего возраста и выявления факторов риска, способствующих развитию заболевания и отягощающих течение туберкулезного процесса, проведен анализ 82 историй болезни детей в возрасте до 3 лет, лечившихся в Детской туберкулезной больнице в 2013-2015 гг. Туберкулез внутригрудных лимфатических узлов диагностировали у 68,3%, первичный туберкулезный комплекс - у каждого пятого. Осложненное течение локальных форм - у каждого второго (n = 42). Регистрировались: бронхолегочные поражения (n = 27), лимфогематогенное прогрессирование (n = 13), в том числе с развитием диссеминированного туберкулеза, менингита. Бактериовыделение - у 14 (17,1%) детей, из них с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя - у 50,0%. Туберкулез у 10% детей протекал на фоне анергии. К предикторам такого течения отнесены отсутствие прививки БЦЖ, суперинфекция МБТ

Сопоставление рентгенологической и патоморфологической картины легких у пациентов с COVID-19

Aim. Compare radiological patterns of COVID-19 pneumonia with pulmonary histology in deceased patients.Materials and methods. The analysis of recent lifetime CT studies of deceased patients was performed with the identification of all existing and leading CT symptoms, including “ground glass”, “crazy paving”, consolidation, as well as the symptom complex (pattern) of organizing pneumonia. Based on the CT symptoms, we selected the target points for taking the specimens by 3-D reconstructions. At the autopsy the lungs were entirely fixed into the front and then marked on CT sections cut from 1 to 3 pieces that were placed in paraffin and processed according to the standard technique, stained with hematoxylin and eosin and fuchsin-facelina. The specimens were analyzed by identifying all available histology changes and selecting the leading one.Results. 45 targeted pieces of lung tissue were obtained from 14 deceased COVID-19 patients (7 men/ 7 women), with an average age of 77.1 ± 12.9 (49–90 years). In deceased patients with the presence of the "ground glass" symptom, in most cases (57.1%) revealed an increase in intra-alveolar cellularity, hyaline membranes, desquamation of the alveolar epithelium and infiltration of the interalveolar septum by lymphocytes, which corresponds to the exudative phase of diffuse alveolar damage (DAP). Mosaic histological changes with alternation of filled alveoli (intraalveolar edema, clusters of red blood cells, macrophages, lymphocytes) and air alveoli were detected from the areas of “crazy paving” zones. Several cases demonstrated interstitial edema and lymphoid infiltration of interalveolar partitions of different severity without their thickening. Areas of consolidation were histologically represented by extensive intraalveolar hemorrhages and / or typical zones of hemorrhagic infarcts in 45.5% of cases. Perilobular consolidation, subpleural cords, symptoms of “halo” and “reverse halo”, which we considered as part of the symptom complex of organizing pneumonia in 43% of cases, morphologically corresponded to organizing pneumonia (the proliferative phase of DAP), as well as to distelectases.Conclusion. Comparison of CT patters and post-mortem pulmonary histology in COVID-19 deceased patients demonstrated that CT symptoms and patterns correspond to certain morphological changes of different phases of DAP.Цель исследования: сопоставить рентгенологические паттерны COVID-19 с гистологическими изменениями у умерших.Материал и методы. Проведен анализ последних прижизненных КТ-исследований умерших пациентов с выделением всех имеющихся и ведущего КТ-симптомов, включая “матовое стекло”, “булыжная мостовая”, консолидация, а также симптомокомплекс (паттерн) организующейся пневмонии. На основании выделенных КТ-симптомов были выбраны прицельные точки взятия материала при помощи построения трехмерных реконструкций. На аутопсии фиксированные целиком легкие разрезались фронтально, далее из обозначенных на компьютерной томограмме участков вырезали от 1 до 3 кусочков, которые заливались в парафин и обрабатывались по общепринятой методике с последующей окраской срезов толщи- ной 3–5 мкм гематоксилином и эозином, пикрофуксин-фукселином. Анализ материала проводили путем выявления всех имеющихся патоморфологических изменений с выделением ведущего из них.Результаты. Были получены 45 прицельно взятых кусочков ткани легкого от 14 умерших (7 мужчин/ 7 женщин), средний возраст 77,1 ± 12,9 (49–90) года. У умерших пациентов с наличием симптома “матово- го стекла” при КТ в большинстве случаев (57,1%) были выявлены увеличение числа клеток в просветах альвеол (внутриальвеолярная клеточность), гиалиновые мембраны, десквамация альвеолярного эпителия и инфильтрация лимфоцитами межальвеолярных перегородок, что может соответствовать признакам экссудативной фазы диффузного альвеолярного повреждения (ДАП). Из участков, обозначенных как зоны “булыжной мостовой”, были выявлены мозаичные гистологические изменения с чередованием заполненных альвеол (внутриальвеолярный отек, скопления эритроцитов, макрофагов, лимфоцитов) и воздушных альвеол, местами при наличии интерстициального отека и лимфоидной инфильтрации межальвеолярных перегородок разной степени выраженности без их утолщения. Участки консолидации гистологически были представлены обширными внутриальвеолярными кровоизлияниями и/или типичными зонами геморрагических инфарктов в 45,5% случаев. Перилобулярная консолидация, субплевральные тяжи, симптомы “ободка” и “обратного ободка”, которые мы расценивали в рамках симптомокомплекса организующейся пневмонии, на компьютерной томограмме в 43% случаев морфологически соответствовали организующейся пневмонии (пролиферативная фаза ДАП), а также дистелектазам.Заключение. При попытке рентгенопатоморфологического сопоставления у пациентов с COVID-19 с поражением легких нами было показано, что различные симптомы и паттерны при КТ соответствуют определенным морфологическим изменениям в различные фазы ДАП

Functional Conservation of Cis-Regulatory Elements of Heat-Shock Genes over Long Evolutionary Distances

Transcriptional control of gene regulation is an intricate process that requires precise orchestration of a number of molecular components. Studying its evolution can serve as a useful model for understanding how complex molecular machines evolve. One way to investigate evolution of transcriptional regulation is to test the functions of cis-elements from one species in a distant relative. Previous results suggested that few, if any, tissue-specific promoters from Drosophila are faithfully expressed in C. elegans. Here we show that, in contrast, promoters of fly and human heat-shock genes are upregulated in C. elegans upon exposure to heat. Inducibility under conditions of heat shock may represent a relatively simple “on-off” response, whereas complex expression patterns require integration of multiple signals. Our results suggest that simpler aspects of regulatory logic may be retained over longer periods of evolutionary time, while more complex ones may be diverging more rapidly