Evolution de la biodiversité benthique des vasières subtidales de l'estuaire de la Seine en réponse à la dynamqiue sédimentaire. De l'approche descriptive à l'approche fonctionnelle.

The temporal changes of benthic macrofauna in relation with the dynamic of sediments has been studied through a temporal hierarchical approach. The three selected temporal scales corresponded to three sedimentary events: (i) the pluri-annual silting-up of the Seine estuary, (ii) the seasonal sedimentary cover, and (iii) the short-term sediment reshuffling processes induced by the macrotidal regime. First, this study displayed a strong spatial variability between the upstream and downstream parts of the Seine estuary. The downstream part was characterized by rich, highly diversified and stable benthic communities, in contrast to upstream where benthic communities were less diverse. Indeed, the upstream species composition underlined the ecotonal characteristic of this area, and its unclear and fluctuating boundaries revealed a highly temporal variability in the structure of these communities. In addition, results showed a weak influence of the sediment dynamic on the variability of benthic communities and highlighted the difficulty to estimate a relationship between macrofauna and sediment when the different sedimentary types are defined solely on particle sizes.To assess the role of benthic communities on the geochemical ecosystem functioning, the contribution of these organisms to biogeochemical processes at the water-sediment interface has been studied through the estimation of irrigation fluxes. The strong correlation found between oxygen fluxes and macrofauna descriptors indicate that oxygen fluxes appeared to be a better indicator of benthic macrofauna activities than the measured ammonia fluxes. Nevertheless, depending on macrofauna descriptors (i.e. species richness, trophic guilds, bioturbation groups), three distinct « diversity-functioning » hypotheses could be proposed for the Seine estuary: (i) idiosyncrasy, (ii) rivet-pop, and (iii) diversity-stability. It is therefore difficult to establish a single law in the functioning of the macrobenthic compartment of the estuary.Surprisingly, experimental studies carried out in mesocosms indicate a variable temporal response of macrofauna to sediment deposits. Indeed, whatever the nature, the thichness, the stability and residency time of the deposits were, the disturbance of the habitat significantly induced mortality in winter, whereas the survival of macrofauna was not threatened in spring-summer. The frequency of the sedimentary events undergone by the macrofauna at the mouth of the estuary might be responsible for its fitness and resilicence.La variabilité temporelle de la macrofaune benthique en réponse à son environnement sédimentaire a été étudiée à travers une approche temporelle hiérarchisée, les trois échelles temporelles sélectionnées correspondant à trois constats sédimentologiques : (i) le comblement pluri-annuel de l'estuaire, (ii) la variabilité saisonnière de la couverture sédimentaire, et (iii) les remodelages sédimentaires induits par le système macrotidal. Cette étude a permis dans un premier temps de distinguer un faciès du peuplement des sables fins plus ou moins envasés, riche, diversifié et stable dans la zone la plus avale. En revanche, plus en amont, prennent place des faciès d'appauvrissement dont les cortèges spécifiques soulignent le caractère écotonal de ces secteurs internes, et les frontières imprécises et fluctuantes témoignent d'une forte variabilité temporelle de leurs structures. Cette étude a dans un second temps, mis en évidence la faible influence de la dynamique sédimentaire sur celle des peuplements, soulignant ainsi la difficulté à évaluer les relations « faune - sédiment » sur le seul critère de la taille des particules.En vue de comprendre les relations entre les peuplements macrobenthiques et le fonctionnement du système, la contribution de la faune aux processus géochimiques à l'interface eau-sédiment a été étudiée à travers l'estimation des flux d'irrigation d'ammonium et d'oxygène. Si les premiers sont apparus comme de mauvais marqueurs de l'activité macrobenthique, les seconds ont pu être corrélés aux caractéristiques de la macrofaune. Toutefois, selon les densités et les paramètres faunistiques considérés (richesse spécifique, régime trophique, type de bioturbation), trois hypothèses « diversité biologique – fonctionnement du système » peuvent s'appliquer à l'estuaire de la Seine (idiosyncrasie, rivet-pop et diversité-stabilité). Il est par conséquent difficile d'établir une loi unique de fonctionnement du compartiment macrobenthique de cet estuaire.Les études expérimentales dévelopées en méscosmes ont montré de facon surprenante une réponse temporelle variable de la marofaune à des dépôts sédimentaires. En effet, quels que soient la nature, l'épaisseur, la stabilité et le temps de résidence des dépôts sédimentaires, la perturabation de l'habitat induit une mortalité significative de la macrofaune en période hivernale tandis qu'en période printano-estivale, sa survie n'est pas menacée. La fréquence des modifications sédimentaires que connaît la macrofaune de l'embouchure de l'estuaire de la Seine pourrait être à l'origine de sa réactivité et de ses capacités de résistance

Etude de faisabilité pour la Liste Rouge des Ecosystèmes des herbiers de phanérogames marines de France métropolitaine

La Liste Rouge des Ecosystèmes (LRE) de l’Union Internationale pour la Conservation de la Nature (UICN) a été développée afin de pouvoir évaluer le risque d’effondrement des écosystèmes. Avant de pouvoir initier un nouveau chapitre national marin de LRE portant sur les herbiers de phanérogames marines de France métropolitaine, un travail préliminaire est essentiel pour s’assurer de la faisabilité d’une possible évaluation. Cette étude de faisabilité s’appuie sur un bilan de l’existant pour définir un cadre d’évaluation cohérent, proposer les types d’écosystème à évaluer et estimer lapertinence des données existantes pour l’application de la méthodologie d’évaluation UICN. Après consultation des experts, six espèces de phanérogames sont considérées comme constitutives d’herbiers dit « marins » et treize types d’écosystème (en cohérence avec les typologies nationales d’habitats) sont proposés à l’évaluation LRE. Les types d’écosystème se différencient selon le secteur géographique, les espèces constitutives et le milieu mer ouverte/lagunes pour le secteur Méditerranéen ou l’étagement médio-/infralittoral pour le secteur de l’Atlantique, Manche et mer du Nord. Les données cartographiques existantes semblent suffisantes pour initier l’évaluation LRE. Plusieurs sources de données ont été identifiées pour renseigner les critères A et B pour la majorité des types d’écosystème. Des pistes de travail sont proposées pour les critères C et D. Au vu de cette note de faisabilité, nous recommandons de mener les travaux d’évaluation LRE des phanérogames marines de France métropolitaine. En termes de synthèse de connaissances et de valorisation des données existantes, c’est une opportunité unique d’initier ce chapitre de LRE nationale sur ces habitats marins à fort enjeux de conservation. Cette future évaluation constituera ainsi un outil d’aide à la décision et àl’action pour les acteurs de l’environnement, complémentaire aux stratégies de conservation déjà en place

Etude de faisabilité pour la Liste Rouge des Ecosystèmes des herbiers de phanérogames marines de France métropolitaine

La Liste Rouge des Ecosystèmes (LRE) de l’Union Internationale pour la Conservation de la Nature (UICN) a été développée afin de pouvoir évaluer le risque d’effondrement des écosystèmes. Avant de pouvoir initier un nouveau chapitre national marin de LRE portant sur les herbiers de phanérogames marines de France métropolitaine, un travail préliminaire est essentiel pour s’assurer de la faisabilité d’une possible évaluation. Cette étude de faisabilité s’appuie sur un bilan de l’existant pour définir un cadre d’évaluation cohérent, proposer les types d’écosystème à évaluer et estimer lapertinence des données existantes pour l’application de la méthodologie d’évaluation UICN. Après consultation des experts, six espèces de phanérogames sont considérées comme constitutives d’herbiers dit « marins » et treize types d’écosystème (en cohérence avec les typologies nationales d’habitats) sont proposés à l’évaluation LRE. Les types d’écosystème se différencient selon le secteur géographique, les espèces constitutives et le milieu mer ouverte/lagunes pour le secteur Méditerranéen ou l’étagement médio-/infralittoral pour le secteur de l’Atlantique, Manche et mer du Nord. Les données cartographiques existantes semblent suffisantes pour initier l’évaluation LRE. Plusieurs sources de données ont été identifiées pour renseigner les critères A et B pour la majorité des types d’écosystème. Des pistes de travail sont proposées pour les critères C et D. Au vu de cette note de faisabilité, nous recommandons de mener les travaux d’évaluation LRE des phanérogames marines de France métropolitaine. En termes de synthèse de connaissances et de valorisation des données existantes, c’est une opportunité unique d’initier ce chapitre de LRE nationale sur ces habitats marins à fort enjeux de conservation. Cette future évaluation constituera ainsi un outil d’aide à la décision et àl’action pour les acteurs de l’environnement, complémentaire aux stratégies de conservation déjà en place

Indicateurs et recommandations pour évaluer l'effet de mesures de gestion sur l'état de santé des habitats marins (Pré-étude)

Cette pré-étude s’inscrit dans le contexte d’évaluation de l’efficacité des mesures de gestion à mettre en œuvre sur les habitats marins, comme les zones de protection forte. Il s’agit ici d’un premier inventaire des indicateurs existants et couramment déployés pour les habitats benthiques marins dans un contexte d’évaluation réglementaire. Des recommandations générales pour attester de l’effet des mesures de gestion ont également été formulées pour compléter cette synthèse.Globalement, il y a peu d’indicateurs validés pour qualifier l’état de santé des habitats marins dans les politiques publiques de protection du milieu marin, hormis dans le cadre de la DCE. Beaucoup de travaux sont en cours pour la validation ou le développement d’indicateurs pour la DCSMM et la DHFF. A ce jour, il n’existe pas de publication de référence sur les indicateurs, en dehors des documents de la DCE. Plusieurs initiatives interactives existent, comme le catalogue OFB des indicateurs, mais nécessitent d’être mises à jour. Le besoin d’un document de synthèse de référence sur les indicateurs et protocoles de suivi est fort, couplé à la nécessité d’interactivité pour éviter l’obsolescence d’une telle synthèse.Les éléments développés dans cette pré-étude, à savoir l’état des lieux sur les indicateurs pour l’Hexagone et la Corse et les recommandations générales, devraient faciliter la réalisation d’une étude plus exhaustive et la mise à disposition d’outils pour assister les gestionnaires dans cet exercice d’évaluation des mesures de gestion

Indicateurs et recommandations pour évaluer l'effet de mesures de gestion sur l'état de santé des habitats marins (Pré-étude)

Cette pré-étude s’inscrit dans le contexte d’évaluation de l’efficacité des mesures de gestion à mettre en œuvre sur les habitats marins, comme les zones de protection forte. Il s’agit ici d’un premier inventaire des indicateurs existants et couramment déployés pour les habitats benthiques marins dans un contexte d’évaluation réglementaire. Des recommandations générales pour attester de l’effet des mesures de gestion ont également été formulées pour compléter cette synthèse.Globalement, il y a peu d’indicateurs validés pour qualifier l’état de santé des habitats marins dans les politiques publiques de protection du milieu marin, hormis dans le cadre de la DCE. Beaucoup de travaux sont en cours pour la validation ou le développement d’indicateurs pour la DCSMM et la DHFF. A ce jour, il n’existe pas de publication de référence sur les indicateurs, en dehors des documents de la DCE. Plusieurs initiatives interactives existent, comme le catalogue OFB des indicateurs, mais nécessitent d’être mises à jour. Le besoin d’un document de synthèse de référence sur les indicateurs et protocoles de suivi est fort, couplé à la nécessité d’interactivité pour éviter l’obsolescence d’une telle synthèse.Les éléments développés dans cette pré-étude, à savoir l’état des lieux sur les indicateurs pour l’Hexagone et la Corse et les recommandations générales, devraient faciliter la réalisation d’une étude plus exhaustive et la mise à disposition d’outils pour assister les gestionnaires dans cet exercice d’évaluation des mesures de gestion

Note technique. Définition des modalités de l’évaluation qualitative appliquée à certains habitats benthiques dans le cadre de l’évaluation DCSMM cycle 3. Thématique D1 - habitats benthiques

L’objectif du présent document est de fournir un cadrage méthodologique pour la mise en oeuvre d’une évaluation qualitative, c’est-à-dire fondée sur du dire d’expert, de certains habitats benthiques lors de l'évaluation DCSMM - cycle 3 du Bon État Écologique du Descripteur 1-Habitats benthiques. Sont concernés par ces évaluations : - deux habitats équivalant à la catégorie Grands Types d’Habitats : - les roches intertidales ; - les roches infralittorales ; - trois habitats équivalant à la catégorie Autres Types d’habitats : - les récifs intertidaux à Sabellaria alveolata ; - les bancs de maërl ; - les herbiers de Zostera marina et Z. noltei. Les éléments de cadrage explicités dans la suite du document doivent garantir une certaine homogénéité/cohérence dans le rendu des résultats finaux et la traçabilité du dire d’expert. Ils doivent également permettre à un large public (gestionnaires, citoyens, politiques publiques, etc) de mieux appréhender la méthode d’évaluation utilisée pour les habitats mentionnés ci-dessus. Ce document de cadrage s’inspire largement du guide de lecture rédigé par le groupe de travail ICG-POSH (Intersessional Correspondence Group on the implementation and follow up of measures for the protection and conservation of species and habitats) d’OSPAR [documents (ospar.org)]

DCSMM - Descripteur n°1 - BIODIVERSITE Habitats benthiques

Ce rapport constitue un préalable à l'atelier S&T du 28 septembre 2021. Il présente les méthodes envisagées, ou en cours de réflexion, pour l'évaluation du cycle 3 de la DCSMM au titre de la thématique D1 habitats benthiques. Ce rapport s'efforce de rendre cette note aussi complète et pédagogique que possible.  Il présente d’abord la philosophie générale et les grandes orientations communes à tous les grands types d’habitats à évaluer. Le rapport décrit ensuite, pour chaque habitat, les indicateurs existants ou en développement et les options envisagées en matière d’évaluation. Enfin, ce rapport dresse un état des lieux concernant les objectifs environnementaux et le programme de surveillance. A travers ce rapport l'équipe D1-HB souhaite 1/ présenter l’état d’avancement des travaux d’évaluation assortis des perspectives de développement, 2/ recueillir l’avis des participants concernant les scenarii d’évaluation, afin de définir s’il est utile de poursuivre les travaux dans telle ou telle direction. A la fin de chaque paragraphe, des tableaux de synthèse et des encarts permettent de faciliter la lecture et les points à retenir.

Note d’accompagnement des tables de correspondances entre les Habitats d’Intérêt Communautaire (HIC) marins et les autres systèmes de classification d’habitats benthiques marins

Ce travail avait pour objectif d’identifier les correspondances possibles entre Habitats d’Intérêt Communautaire (HIC) marins (Tableau 1) et unités d’habitats des typologies nationales (NatHab-Med et NatHab-Atl), typologies EUNIS (EUNIS version 2022) et listes des conventions de mers régionales (OSPAR et Barcelone) en se basant sur la réinterprétation nationale des Habitats d’Intérêt Communautaire (HIC) marins (de Bettignies et al., 2021) et les descriptions des unités d’habitats des typologies nationales (La Rivière et al., 2021 ; 2022). Il constitue une mise à jour du travail d’établissement des correspondances réalisé en 2012 (Michez et al., 2012) en suivant globalement la même méthodologie. Cette note apporte des précisions sur le cadre méthodologique suivi pour établir ces correspondances et sur la structuration des données. Pour chaque HIC, des explications sont données pour assurer une bonne compréhension des correspondances établies, notamment en ce qui concerne les conditions de correspondances résultant du travail de réinterprétation